• Animal cells and systems
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• 제16권1호
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• pp.11-19
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• 2012

A major concern regarding the collection and storage of biodiversity information is the inefficiency of conventional taxonomic approaches in dealing with a large number of species. This inefficiency has increased the demand for automated, rapid, and reliable molecular identification systems and large-scale biological databases. DNA-based taxonomic approaches are now arguably a necessity in biodiversity studies. In particular, DNA barcoding using short DNA sequences provides an effective molecular tool for species identification. We constructed a large-scale database system that holds a collection of 5531 barcode sequences from 2429 Korean species. The Korea Barcode of Life database (KBOL, http://koreabarcode.org) is a web-based database system that is used for compiling a high volume of DNA barcode data and identifying unknown biological specimens. With the KBOL system, users can not only link DNA barcodes and biological information but can also undertake conservation activities, including environmental management, monitoring, and detecting significant organisms.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제53권3호
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• pp.299-305
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• 2015

Tapeworms of the genus Spirometra are pseudophyllidean cestodes endemic in Korea. At present, it is unclear which Spirometra species are responsible for causing human infections, and little information is available on the epidemiological profiles of Spirometra species infecting humans in Korea. Between 1979 and 2009, a total of 50 spargana from human patients and 2 adult specimens obtained from experimentally infected carnivorous animals were analyzed according to genetic and taxonomic criteria and classified as Spirometra erinaceieuropaei or Spirometra decipiens depending on the morphology. Morphologically, S. erinaceieuropaei and S. decipiens are different in that the spirally coiled uterus in S. erinaceieuropaei has 5-7 complete coils, while in S. decipiens it has only 4.5 coils. In addition, there is a 9.3% (146/1,566) sequence different between S. erinaceieuropaei and S. decipiens in the cox1 gene. Partial cox1 sequences (390 bp) from 35 Korean isolates showed 99.4% (388/390) similarity with the reference sequence of S. erinaceieuropaei from Korea (G1724; GenBank KJ599680) and an additional 15 Korean isolates revealed 99.2% (387/390) similarity with the reference sequences of S. decipiens from Korea (G1657; GenBank KJ599679). Based on morphologic and molecular databases, the estimated population ratio of S. erinaceieuropaei to S. decipiens was 35: 15. Our results indicate that both S. erinaceieuropaei and S. decipiens found in Korea infect humans, with S. erinaceieuropaei being 2 times more prevalent than S. decipiens. This study is the first to report human sparganosis caused by S. decipiens in humans in Korea.

• 생태와환경
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• 제48권3호
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• pp.195-202
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• 2015

본 연구는 국내 담수외래종의 연구동향을 파악하기 위해서 비정형 데이터로부터 키워드 간의 연계성을 파악하는 데 적합한 텍스트마이닝 (text-mining)기법을 이용하였다. 환경부가 지정한 담수외래종 17종 (포유류 1종, 양서 파충류 3종, 어류 11종, 식물 2종)의 학명과 국명 또한 일반 검색어로 이용하여 56개의 국내 학회 및 기관에서 발행된 총 245편 논문을 개체군 수준에서 분석하였다. 담수외래종에 대한 연구는 90년대에 증가하여 2000년대 이후 감소하는 양상을 보였으며 외래종의 생리 및 발생에 대한 연구가 분류, 생태에 대한 연구보다 유의하게 많았다. 특히, 무지개 송어 (44%/전체 논문편수), 나일틸라피아 (19%), 이스라엘 잉어 (8%), 은연어 (4%)와 같이 수산자원으로 이용하기 위해 도입된 종들에 대한 연구가 많았다. 하지만 담수외래종의 생태적 특성과 분포, 행동에 대한 연구는 뉴트리아와 큰입우럭, 황소개구리로 제한되어 있고 연구 수 역시 생리 및 발생 관련 연구에 비해 적었다. 지금까지 담수외래종들의 위해성과 문제점은 계속 제기되고 있지만, 분석 결과 연구 주제가 편향되어있어 그들의 생태적인 문제를 해결하기에는 정보가 부족한 것으로 보인다. 담수외래종의 효과적인 관리를 위해서는 그들에 대한 다각적인 접근과 폭넓은 연구주제의 설정이 필요하다.