• 한국균학회소식:학술대회논문집
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• 한국균학회 2018년도 춘계학술대회 및 임시총회
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• pp.51-51
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• 2018

The application of recombinant DNA technology has been remarkable and nearly replaced commonly used traditional methods. Traditional industrial microbiology long depended on the discovery of valuable strains and mutagenesis of such strains to improve its secretion capacity of enzymes and secondary metabolites on the industrial scale. Commodities included industrial enzymes and biopharmaceuticals. The purpose of genome manipulation by the crossing of different strains or genetic recombination of naked DNA to the genome is of increased production of valuable metabolites. We optimized a transformation method to either for removal of innate genes, introduction of heterologous genes, or combination of both. We have been used selected whole or partial genes to manipulate target fungi toward the development of strains overproducing invaluable proteins. We have also used the whole genome sequence information of fungal genomes in public databases and functional genomics approach to select genes to manipulate and eventually contributing greatly to the development of overproducing industrial strains overproducing proteins or secondary metabolites. I will briefly review 1) filamentous fungi as a host for production of recombinant proteins and secondary metabolites, 2) markets of industrial metabolites, 3) a new approach to manipulate up to five genes at the same time in the system that ProxEnrem uses.

• Genomics & Informatics
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• 제7권4호
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• pp.208-211
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• 2009

We developed an identifier mapping application for bioinformatics research in Java programming language. It is easy to use and provides many usability functionalities that are expected as essentials for a professional application. It supports three widely used mapping services and can convert many ids from one source database into many target databases at once. Id mapping across service providers is possible by remapping the resultant ids. Because it adheres to the NetBeans platform architecture, it can be incorporated into other NetBeans platform applications as an id mapping provider without adaption or modification.

• 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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• 제35권1호
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• pp.44-53
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• 2008

온톨로지 기반의 애플리케이션에 대한 사용이 증가함에 따라 시맨틱 정보를 효율적으로 저장 및 처리하는 것이 중요하게 다루어지고 있다. 비록 몇몇의 관련된 시스템들이 개발되어왔지만, 이들은 시맨틱 데이타의 크기, 시맨틱 질의 처리의 성능 시맨틱 데이타 유지관리의 관점에서 몇몇 제한을 가지고 있다. 본 논문에서는 온톨로지 관리 시스템을 위한 OWL 인지 관계형 모델을 제안하고 이를 이용하는 SQL 기반의 시맨틱 질의 처리 메커니즘을 제안한다. 또한 질의 처리 성능에 대한 검증을 위해 Sesame와 비교를 통해서 좀 더 효율적임을 보여준다.

• Proceedings of the National Institute of Ecology of the Republic of Korea
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• 제3권3호
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• pp.178-186
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• 2022

In order to support biomimicry technology development, it is necessary to develop an omnidirectional service platform which can recommend principles of biomimicry and business ideas, providing experts' networks and carrying out their relevant education and promotion on the ground of baseline data and application research materials related to biomimicry. This study was conducted to establish any probable plans for construction and utilization of the future open-platform which will collect and serve the technology of biomimicry. Accordingly, biological and ecological information databases were examined along with the appreciation of construction and management of major biomimicry DB, and, based on the materials from the interview of related experts, a customer journey map was schematized. Lastly, in order to suggest a mid-to-long-term target-model, the roles of a future biomimicry knowledge service-platform were determined along with the potential plans for its construction and management based on case analysis and customers' needs.

• Journal of Acupuncture Research
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• 제40권2호
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• pp.129-134
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• 2023

In this review, we searched for clinical and experimental studies related to acupuncture-related therapy (ART) on the microbiome in musculoskeletal disorders (MSDs) through the electronic databases of MEDLINE via PubMed, EMBASE, and Oriental Medicine Advanced Searching Integrated System up to May 2023, without language restriction, and after the selection/exclusion process, the study design, target disease, intervention details, treatment period, outcomes, and study results were extracted. A total of 8 articles were selected. Two randomized controlled trials and 6 animal studies evaluated knee osteoarthritis, rheumatoid arthritis, spinal cord injury, ankylosing spondylitis, and osteoporosis. ART, including electroacupuncture, thread-embedding acupuncture, and moxibustion, affected microbiome modulation in MSDs. The results reveal that ART could be a potential treatment for regulating the microbiome in MSDs. However, further high-quality studies are needed.

• 대한한방소아과학회지
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• 제34권2호
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• pp.75-85
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• 2020

Objectives Although clinical practice guidelines (CPGs) are becoming crucial in medical decision-making worldwide, there are very few development guidelines for children. Therefore, this preliminary study aimed to assess the status of worldwide except east asia-CPGs recommending complementary and alternative medicine interventions (CAM-i) in children worldwide except east asia in order to help developing Korean medicine CPGs (KMCPGs) for children. Methods To identify the current status of CPGs including CAM-i that have been developed so far, the author searched the related databases, and selected CPGs for children. The data related to the status of evidence-based CPGs, the materials related to the characteristics of CAM-i, and the details of recommendations for CAM-i were selected from the obtained findings. Results A total of 106 CPGs were identified based on the searches, of which 11 were finally selected as pediatric CPGs. These pediatric CPGs have been developed since 2007 to target various diseases. The countries developing these CPGs include the United Kingdom, Scotland, Australia, and the United States, with the U.K. having the largest share. The majority of CPGs used MEDLINE, Embase, and Cochrane library as databases. The most frequently recommended topic was acupuncture, followed by herbal medicine. Many CPGs suggested that more research was needed. Conclusions Through this study, the author was able to identify the characteristics of the developed pediatric CPGs that include CAM-i. More preceding studies are needed for the development of pediatric KMCPGs. It is hoped that this report can be used as the foundation for future development of pediatric KMCPGs.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제7권7호
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• pp.859-876
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• 2004

본 논문에서는 객체 데이타베이스에서 객체지향 질의의 효율적 처리를 위한 다차원 경로 색인구조(Multidimensional Path Indexes: MPIs)의 최적 구성방법을 제시한다. MPI는 중포속성과 여러 클래스 계층이 포함된 중포술어를 효율적으로 지원하기 위하여 다차원 색인구조를 이용한다. $B^+$-tree와 같은 일차원 색인구조를 이용한 중포속성 색인구조로서는 이와 같은 술어를 잘 지원할 수 없다. 본 논문에서는 타겟 클래스 또는 도메인 클래스의 대치가 있는 경로식으로 표현된 여러 중포술어들의 접속으로 구성된 복합질의의 관점에서 MPI 색인들의 구성에 관하여 분석한다. 먼저, 데이타베이스의 변경에 따른 MPI 색인구조의 운용과 하나의 중포술어를 가지는 질의의 경우에 대한 MPI 색인의 사용에 대하여 색인구성을 분석한다. 그리고 겹침 경로와 비겹침 경로 상에 주어지는 여러 개의 중포술어들로 구성된 보다 일반적인 질의의 관점에서 MPI 색인의 구성에 관하여 분석한다. 겹침 경로는 경로들 사이에 공통의 부경로가 있는 것이고, 비겹침 경로는 공통의 부경로가 없는 것이다.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제15권9호
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• pp.1133-1148
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• 2012

본 논문에서는 XML 데이터베이스에서 XML 질의처리를 효율적으로 지원하기 위한 다차원 타입상속 색인구조(MD-TIX)들의 계층적 구성기법을 제시한다. MD-TIX는 중첩요소와 여러 타입상속 계층으로 이루어진 중첩술어의 조상-자손 관계 탐색을 효율적으로 지원하기 위하여 다차원 색인구조를 이용하는 색인기법이다. 그러나 이러한 MD-TIX는 질의에 주어진 Xpath의 길이가 긴 경우에 색인 엔트리의 구성문제 때문에 색인구조의 구축과 유지관리에 어려움이 있다. 이를 극복하기 위해서, 본 논문에서는 먼저 주어진 Xpath에서 인접한 두 타입 사이의 직접 관계 탐색을 지원하는 기본 색인구조들을 구축하고, 이들을 바탕으로 Xpath상의 임의의 두 타입 사이의 간접 관계 탐색을 지원하는 유도 색인구조들을 구축한다. 이러한 과정을 전체 길이의 Xpath를 지원하는 하나의 목표 색인구조를 구축하기까지 계층적으로 구성하는 방법을 제시한다. 또한 Xpath 상에 주어진 몇 개의 부경로 탐색만을 지원하기 위한 부분적인 색인계층을 효율적으로 구축하기 위한 알고리즘을 제안한다.

• 한국지역지리학회지
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• 제3권2호
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• pp.105-120
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• 1997

객체지향 지리정보 데이타베이스 시스템의 설계시 중요한 고려 사항은 저장된 데이타에 대한 좋은 접근 전략을 갖도록 하는 것이다. 객체지향 시스템에서는 이러한 목적으로 여러가지 색인 기법이 개발되었으나, 이러한 기법들은 객체지향 데이타 모델의 집단화 계층이나 상속 계층 중 어느 한 가지만을 고려하는 경우가 대부분이었다. 본 연구에서는 포인터 체인 디렉토리를 이용하여 객체지향 지리 데이터베이스의 집단화 및 상속 계층을 접근하는 데 효율적인 색인 기법을 제안하였다. 제안된 기법의 효용성을 기존의 색인 기법들과 다양하게 비교하였으며, 저장비용과 검색비용 측면에서 그 성능을 시뮬레이션한 결과를 제시하였다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제21권2호
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• pp.333-338
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• 2017

최근 모바일 기기의 보편화로 인하여 모바일 데이터베이스를 필요로 하는 많은 새로운 모바일 응용들이 나타나고 있다. 대표적인 모바일 데이터베이스로는 SQLite, Realm 등이 있는데, 이들은 리소스 제약이 큰 소형기기에 적합한 데이터베이스 엔진들이며 리눅스 기반 모바일 기기에 많이 사용되고 있다. 이 엔진들은 대부분 오픈소스 프로그램들이며 범용 데이터베이스에 비해 가볍고 속도가 빠른 장점을 지닌다. 이 논문에서는 모바일 데이터베이스의 선두 주자인 SQLite의 성능 실험과 분석에 초점을 맞춘다. 대상인 모바일 환경을 고려하여 리눅스 기반 환경에서 실험한다. 그리고, SQLite 데이터베이스의 검색 성능을 파악하기 위한 테스트 프로그램을 구현하고 성능 실험을 실시한다. 실험은 같은 환경에서 실행되는 Oracle 데이터베이스와 비교하여 진행한다.