Understanding the tumor heterogeneity due to differences in the growth pattern of metastatic tumors and rate of change is important for understanding the sensitivity of tumor cells to drugs and finding appropriate therapies. It is often possible to test for differences in population means using t-test or ANOVA when the group of N samples is distinct. However, these statistical methods can not be used unless the groups are distinguished as the data covered in this paper. Statistical methods have been studied to test heterogeneity between samples. The minimum combination t-test method is one of them. In this paper, we propose a maximum combinatorial t-test method that takes into account combinations that bisect data at different ratios. Also we propose a method based on the idea that examining the heterogeneity of a sample is equivalent to testing whether the number of optimal clusters is one in the cluster analysis. We verified that the proposed methods, maximum combination t-test method and gap statistic, have better type-I error and power than the previously proposed method based on simulation study and obtained the results through real data analysis.
A case study to show MS Excel's convenient and powerful functions was conducted to test hypotheses with subway data. Quantitative variables were described using descriptive menu, and qualitative variables were described using histogram menu of a MS Excel software. Relationships were tested using regression menu, differences were tested using t-test menu, and factors were tested using variance-layout menu of a Excel software. Data input, management, and statistical analysis were done successfully with only a MS Excel software.
In this paper we employ two-sample location tests such as Wilcoxon test and T test for detecting edges in noisy images. For this, we compute a test statistic on pixel gray levels obtained using an edge-height parameter and compare it with a threshold determined by a significance level. Experimental results applied to sample images are given and performances of these tests in terms of the objective measure are compared.
The analysis of gene sets in microarray has advantages in interpreting biological functions and increasing statistical powers. Many statistical methods have been proposed for detecting significant gene sets that show relations between genes and phenotypes, but there is no consensus about which is the best to perform gene sets analysis and permutation based tests are considered as standard tools. When many gene sets are tested simultaneously, a large number of random permutations are needed for multiple testing with a high computational cost. In this paper, several parametric approximations are considered as alternatives of the permutation distribution and the moment based gene set test has shown the best performance for providing p-values of the permutation test closely and quickly on a general framework.
Communications for Statistical Applications and Methods
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v.17
no.1
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pp.79-88
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2010
Introductory statistic class proposes two tests for the equality of two population means according to the homogeneity of their variances. However, in practice, the variances are also unknown and practitioners often test their homogeneity before they do two sample t-test. This is also true in many popular statistical packages such as SAS and SPSS. In this paper, we study the type I error of this two stage procedure and propose a procedure to control it at a given significance level.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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v.25
no.5
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pp.971-986
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2014
When thousands of hypotheses are tested simultaneously, the probability of rejecting any true hypotheses increases, and large multiplicity problems are generated. To solve these problems, researchers have proposed different approaches to multiple testing methods, considering family-wise error rate (FWER), false discovery rate (FDR) or false nondiscovery rate (FNR) as a type I error and some test statistics. In this article, we discuss Bonferroni (1960), Holm (1979), Benjamini and Hochberg (1995) and Benjamini and Yekutieli (2001) procedures based on T statistics, modified T statistics or local-pooled-error (LPE) statistics. We also consider Sun and Cai (2007) procedure based on Z statistics. These procedures are compared in the simulation and applied to Arabidopsis microarray gene expression data to identify differentially expressed genes.
With the ease availability of statistical software and powerful computers the application of statistical methods in domestic veterinary journals is on the increase. In parallel with this benefit, statistical errors are not uncommon even in renowned scientific and medical journals. These errors may lead to misinterpretation of the data, thereby, subjected to faulty conclusions. A systematic review of articles published in 8 issues of the Journal of Veterinary Clinics during 2006-2007 was performed to assess the statistical methodology and reporting. Ninety-four (72.9%) articles of the 129 original articles screened included any inferential statistical analysis in the article, including comparison of 3 or more groups (53 or 56.4%), comparison of independent 2 groups (40 or 42.6%), and paired t-test (9 or 9.6%) in order. Of the 94 articles in which statistical analysis was done 62 (or 66.0%) had at least 1 statistical error. Errors included failure to apply or incorrectly applying independent Student's t-test for paired data or vice versa, inappropriate use of t-test for more than 3 groups and failure in chi-square test to consider continuity-correction for small expected frequencies. The common errors in ANOVA were failure to validate assumption of the test, inappropriate post-hoc multiple-comparison and incorrect assumption of independence of data in repeated measures design. Reporting errors included failure to state statistical methods and failure to state specific test if more than 1 test was done. It is suggested that an editorial effort would be necessary to achieve the improvement of appropriate statistical procedures through the publication of statistical guidelines to author(s).
This study analyzed the satisfaction and utilization of the institutional applications used by child-education institutions from a parent's perspective. The research target is a parent who enlisted their children in private kindergarten institution located in Gyeong-gi province and final research outcomes are 443 in total. The difference in satisfaction and utilization have been identified with demographic descriptive statistics, students t-test, and F-test statistics analysis method. First, the result of T-test on the difference in satisfaction and utilization based on parents' employment status shows that statistically significant difference was found in convenience from overall satisfaction, communication from overall utilization and child-parent relationship. Second, the F-test of differences in satisfaction and utilization showed a statistically significant difference in education utilization variables, with all variables in educational background and motivation. In terms of utilization, parents' educational background and overall utilization, and children's age were confirmed to have significant differences in communication, children's relationship, and motivation in basic life. Third, the result of multiple regression analysis shows that all predictors, including ease of use, communication, and satisfaction with educational activities, have a statistically significant impact on utilization standard variables, relative contributions showed the highest level of communication satisfaction. Therefore this paper implicates that institutional applications can maximize educational effectiveness by checking the applicability of active communication and educational activities with parents and actively communicating with parents in early childhood through various educational content applications.
연구목적 이 연구의 목적은 피로유발수축후 장딴지근과 가자미근의 근전도 power spectrum 중앙경항치를 비교 검사하는 것이다. 실험대상 열 여섯명의 자원자(남자 10, 여자 6)를 대상으로 하였다. 남자 대상자의 연령범위는 25세에서 33세(평균 $28.6{\pm}2.5$)였고 여자 대상자의 연령범위는 26세에서 31세($27.8{\pm}1.9$)였다. 실험방법 실험대상자는 피로유발수축전후 50% 최대등척성근수축을 수행하였다. 자료수집과 분석을 위해 LabVIEW 소프트웨어를 사용하였다. 결과 t-검정결과 내측 장딴지근에서는 피로유발수축후 주파수의 중위값과 평균이 통계적으로 유의하게 감소하였으나 가자미근에서는 통계적으로 유의한 차이가 없었다. t-검정결과 두 근육간 주파수 감소의 차이는 통계적으로 유의한 차이가 있었다. 토의 및 결론 이 결과들은 피로유발수축후 근전도 power spectrum 중앙경향치가 저주파대역으로 감소함을 나타내었다. 이 연구는 중앙주파수와 평균주파수가 피로지수로서의 신뢰도와 타당도가 뛰어나며 객관적 측정과 훈련효과 평가로 사용할수 있음을 보였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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