• Bioinformatics and Biosystems
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• 제1권1호
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• pp.82-87
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• 2006

현재 가장 많이 사용되는 단백질 구조 예측 방법은 비교 모델링 (comparative modeling) 방법이다. 비교 모델링 방법에서의 정확도를 높이기 위해서는 alignment의 정확도 역시 매우 필수적으로 필요하다. 비교 모델링 과정 중의 fold-recognition 단계에서 alignment의 정확도에 의해 template을 고르는 방법은 단지 가장 비슷한 template을 선택하는 방법에 비해 주목을 받지 못하고 있다. 최근에는 두 가지의 alignment에 사이의 shift 정보를 바탕으로 한 shift score라는 수치가 alignment의 성능을 표현하기 위해서 개발되었다. 우리는 더 정확한 구조 예측의 첫걸음이 될 수 있는 shift score를 예측하는 방법을 개발하였다. Shift score를 예측하기 위해 support vector regression (SVR)이 사용되었다. 사전에 구축된 라이브러리 안의 길이가 n 인 template과 구조를 알고 싶은 query 단백질 사이의 alignment는 n+2 차원의 input 벡터로 변환된다. Structural alignment가 가장 좋은 alignment로 가정되었고 SVR은 query 단백질과 template 단백질의 structural alignment과 profile-profile alignment 사이의 shift score를 예측하도록 training 되었다. 예측 정확도는 Pearson 상관계수로 측정되었다. Training 된 SVR은 실제의 shift score와 예측된 shift score 사이에 0.80의 Pearson 상관계수를 갖는 정도로 예측하였다.

• International Journal of Aeronautical and Space Sciences
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• 제2권1호
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• pp.44-54
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• 2001

This paper describes the antenna alignment method of the tracking antenna system for LEO satellite. The purpose of the antenna alignment is to reduce the angular error due to the structural alignment and the monopulse null point alignment error. The angular error of 3 axis tracking system is the key performance parameter that should be minimized to accurately track satellite movement. The angular error is analyzed via a simulation and boresight measurement. The simulation is done with formulas to be derived from vector concept for 3-axis movement. The formulas of the structural alignment are verified by comparing the formula result with the field measurement. Also, the angular error due to monopulse null shift is obtained via boresight measurement. Based on the analyzed and measured results, the antenna alignment was performed and was verified via tracking test of operating LEO satellite.

• 가정과삶의질연구
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• 제9권2호
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• pp.345-366
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• 1991

The concrete purpose of this study is to examine the possibility of applying S.Minuchin's structural family therapy theory to each clinical families so that it can solve efficiently the clinical problems Korean family. The test results are as follows: 1)The Results of Question I : Types of Korean family problems can be divide into six. Then the most frequent type of problem was marital problem. 2) The Results of Question II: Korean normal family showed rater difussed boundary and higher rate of wife dominant type than that of husband dominant type in aspect of boundary and power, and had low tendency toward alignment and neutral adjustment. 3)The Results of Quesion III; Amidst the clinical families, family structural traits of the families which have marital problems showed a clear boundary, the tendency toward alignment, and higher tate of husband dominant type than that of wife dominant type. And family structural traits of children problem family had the tendency of alignment and showed little wife-dominanted families in power. Finally, mother-in -law and daughter-in-law problemed family had several characters such as diffused boundary, the tendency of alignment and high adjustment. 4)The Results of Question IV : As a result of camparing problemed families with normal families in family structure, there was high adaptability of S.Minuchin's structural theory to the two family groups; the groups of marital problems and those of children problem.

• 한국경영과학회지
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• 제31권4호
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• pp.13-33
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• 2006

Using structural equation modeling, this study empirically examined the causal relationships among the level of advanced manufacturing technology (AMT), facilitation of alignment, the degree of strategic alignment of management eccounting Information systems (MAIS), and the improvement of production performance. The causal relationships between MAIS strategic alignment and information characteristics of MAIS were also investigated. The results showed that the level of AMT has a significant and positive impact on alignment facilitation. A significant causal relationship between alignment facilitation and MAIS strategic alignment was also found. It was shown that under high degrees of MAIS strategic alignment, MAIS must provide broad-scope and integrated types of Information. The causal relation-ships between MAIS strategic alignment and organizational performance were significant and positive. Thus, it is concluded that under high levels of AMT, a high degree of MAIS strategic alignment positively contributes to the improvement of production performance.

• Journal of Information Processing Systems
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• 제13권4호
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• pp.834-851
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• 2017

The amount of sources of information available on the web using ontologies as support continues to increase and is often heterogeneous and distributed. Ontology alignment is the solution to ensure semantic interoperability. In this paper, we describe a new ontology alignment approach, which consists of combining structure-based and reasoning-based approaches in order to discover new semantic correspondences between entities of different ontologies. We used the biblio test of the benchmark series and anatomy series of the Ontology Alignment Evaluation Initiative (OAEI) 2012 evaluation campaign to evaluate the performance of our approach. We compared our approach successively with LogMap and YAM++ systems. We also analyzed the contribution of our method compared to structural and semantic methods. The results obtained show that our performance provides good performance. Indeed, these results are better than those of the LogMap system in terms of precision, recall, and F-measure. Our approach has also been proven to be more relevant than YAM++ for certain types of ontologies and significantly improves the structure-based and reasoningbased methods.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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• 제36권4호
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• pp.329-334
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• 2009

기존 온톨로지 정렬 기법은 두가지 문제점을 가지고 있다. 먼저 자질을 해당 분야 전문가가 정의하기 때문에 중요한 자질들이 자질셋에 포함되지 않을 수 있다는 것이다. 다음으로는 온톨로지의 의미 정보와 구조 정보를 이용하여 유사도를 따로 계산한 후, 각각의 실험에 의해 정의된 가중치를 이용하여 전체 유사도를 계산한다. 하지만 온톨로지 상에 나타나는 의미 정보와 구조정보의 상대적인 가중치가 실험적인 방법 혹은 사용자에 의해 결정되기 때문에 시스템이 특정 온톨로지에 한정되거나 성능이 떨어질 수 있어 문제이다. 본 논문에서는 온톨로지 정렬을 위한 파스 트리 커널을 제안한다. 온톨로지 상의 개체에 대한 유사도를 계산하기 위해 먼저 온톨로지를 트리 구조로 변환한다 그 후, 변환된 트리 간의 유사도는 온톨로지 정렬을 위해 수정된 파스트리 커널을 이용하여 계산한다. 이때 자질은 명시적으로 나열하지 않는다. 유사도 계산시, 파스 트리 커널에 근사 스트링 매칭 기법을 적용하여 의미 정보를 반영한다. 검증 위한 실험에서 제안한 방법은 기존의 온톨로지 정렬 기법보다 나은 성능을 보였다.

• Genomics & Informatics
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• 제11권3호
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• pp.155-160
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• 2013

Structural information has been a major concern for biological and pharmaceutical studies for its intimate relationship to the function of a protein. Three-dimensional representation of the positions of protein atoms is utilized among many structural information repositories that have been published. The reliability of the torsional system, which represents the native processes of structural change in the structural analysis, was partially proven with previous structural alignment studies. Here, a web server providing structural information and analysis based on the backbone torsional representation of a protein structure is newly introduced. The web server offers functions of secondary structure database search, secondary structure calculation, and pair-wise protein structure comparison, based on a backbone torsion angle representation system. Application of the implementation in pair-wise structural alignment showed highly accurate results. The information derived from this web server might be further utilized in the field of ab initio protein structure modeling or protein homology-related analyses.

• 한국전산구조공학회:학술대회논문집
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• 한국전산구조공학회 2004년도 봄 학술발표회 논문집
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• pp.185-192
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• 2004

The goal of this paper is to determine the accurate effective length factor(K factor) for buckling design of plane frames and to point out the practical limitations of the alignment chart which provides the approximate effective length factor. At present, the most general method to obtain K factors is to use the alignment chart which is given in the form of nomograph in LRFD-AISC specification commentaries. However it should be realized that various simplifications and assumptions were used in obtaining the alignment chart. Therefore, a simple but effective method to obtain accurate K-factors through the stability analysis of plane frames is developed in this study. To demonstrate the accuracy and effectiveness of the present scheme, K-factors by system buckling analysis of frames are calculated and compared with those calculated by the alignment chart.

• 인지과학
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• 제17권1호
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• pp.53-74
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• 2006

유사성은 인지구조와 그 처리과정을 설명하는 중요한 개념으로 알려져 있으며 유사성 비교과정을 설명하기 위해 제안된 대표적인 초기모형으로는 다차원 척도모형(Shepard, 1964; Nosofsky, 1991)과 대비모형(Tversky, 1977)이 있다. 그러나 초기 모형에 의해 설명되기 어려운 경험적 연구결과들이 발표되면서 유사성의 개념적 타당성에 대한 의문이 제기되었다. Goldstone(1994)은 유사성이 속성차원간의 정렬과정에서 정의된다고 가정하고, 구조적 정렬 개념을 유사성을 둘러싼 개념적 논쟁들을 해결할 수 있는 유망한 대안으로 제안하였다. 본 연구에서는 우선 초기 유사성모형들의 기본 가정과 알고리즘을 개관한 후 속성차원에 대한 선택적 주의의 임의성이나 속성차원들 사이에 존재하는 상관적 구조와 같이 초기 유사성 모형들에 의해 설명되기 어려운 개념적 문제들을 살펴보았다. 그리고 SIAM(Goldston,, 1994)의 개념적 특징과 알고리즘을 알아본 후 구조적 정렬 개념이 범주화, 명사결합, 유추 추리 등의 인지심리학 분야들에 어떻게 적용되었는지를 개관하였다. 끝으로 자료 주도적 처리와 대안적 처리과정의 가능성과 관련된 SIAM의 한계점을 검토하고 가능한 발전방향에 대해 논의하였다.

• 정보처리학회논문지B
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• 제16B권5호
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• pp.359-366
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• 2009

구조적 생물 정보학 분야는 단백질의 3차원 구조를 대상으로 단백질을 연구하는 분야이며, 본 논문에서는 구조적 생물 정보학 분야의 핵심 연구 주제중의 하나인 Flexible 단백질 구조 정렬에 관한 새로운 알고리즘을 제시한다. Flexible 단백질 구조 정렬을 위하여, 단백질의 3차원 구조의 지역적인 유사성을 이용하여 두 단백질의 유사한 부분 구조를 추출해 내고, 이 추출된 유사 구조간에 연결 가능성을 검색하여 정렬이 가능한 모든 유사 구조를 찾고, 이 유사 구조에 꺽임점을 도입하여 Flexible 단백질 구조 정렬을 수행하였다. 이 과정에서 단백질의 지역적 유사성을 정확히 비교하기 위하여 RDA를 이용한 방법을 제안하였고, Flexible 단백질 구조 정렬시 신뢰성 있는 꺽임점 위치 선정 방법과 그래프를 이용한 최적화 방법을 제안하였다. 성능 평가를 위하여 다양한 방법으로 Flexible 단백질 구조 정렬의 성능 평가를 수행하였고, 기존의 방법인 DALI, CE, FATCAT 보다 성능의 우수함을 나타내었다.