The Journal of the Korean Society for Microbiology
/
v.35
no.2
/
pp.109-115
/
2000
FtsH is a membrane-bound, ATP-dependent metalloprotease that is involved in a variety of cellular functions including the regulation of responses to heat and stress shock. Previously, we had cloned and sequenced pneumococcal ftsH gene whose deduced amino acid sequence was very similar to those of several gram-positive bacteria and Escherichia coli, except for the N-terminal domain that was responsible for membrane anchoring. In order to better understand the role of Streptococcus pneumoniae FtsH, we expressed pneumococcal ftsH gene in Escherichia coli. When it was expressed from a strong promoter, $P_{tac}$, a considerable amount of the recombinant FtsH was produced, although the prolonged induction resulted in not only accumulation of breakdown products but also ceasing of the further growth of E. coli host. This indicated that the expression of the exogenous ftsH gene was tightly regulated since the excessive FtsH appeared detrimental to bacterial cells. In Western blotting, the pneumococcal FtsH protein, whether native or recombinant, was reactive to anti-E. coli FtsH serum. The observation that FtsH proteins were well conserved throughout the bacterial kingdom and its expression level was fine-tuned suggests an important role for this protein in the stress adaptation which may be related to infecting process by pneumococci.
This study addresses the physiological functions of the Ran-binding protein homolog NbRanBP1 in Nicotiana benthamiana. Virus-induced gene silencing (VIGS) of NbRanBP1 caused stunted growth, leaf yellowing, and abnormal leaf morphology. The NbRanBP1 gene was constitutively expressed in diverse tissues and an NbRanBP1:GFP fusion protein was primarily localized to the nuclear rim and the cytosol. BiFC analysis revealed in vivo interaction between NbRanBP1 and NbRan1 in the nuclear envelope and the cytosol. Depletion of NbRanBP1 or NbRan1 reduced nuclear accumulation of a NbBTF3:GFP marker protein. In the later stages of development, NbRanBP1 VIGS plants showed stress responses such as reduced mitochondrial membrane potential, excessive production of reactive oxygen species, and induction of defense-related genes. The molecular role of RanBP1 in plants is discussed in comparison with RanBP1 function in yeast and mammals.
Blasi, Barbara;Peca, Loredana;Vass, Imre;Kos, Peter B.
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.22
no.2
/
pp.166-169
/
2012
In several biotechnological applications of living bacterial cells with inducible gene expression systems, the extent of overexpression and the specificity to the inducer are key elements. In the present study, we established the concentration ranges of $Zn^{2+}$, $Ni^{2+}$, $Co^{2+}$, ${AsO_2}^-$, and $Cd^{2+}$ ions that caused significant activation of the respective promoters of Synechocystis sp. without concomitant unspecific stress responses. The low expression levels can be increased up to 10-100-fold upon treatments with $Cd^{2+}$, ${AsO_2}^-$, $Zn^{2+}$, and $Co^{2+}$ ions and up to 800-fold upon $Ni^{2+}$ treatment. These results facilitate the development of conditional gene expression systems in cyanobacteria.
We have cloned an LTP gene (PoLTP1) from poplar (Populus alba ${\times}$ P. tremula var. glandulosa) suspension cells and examined changes in its expression levels in response to various stresses and ABA treatment. The full-length PoLTP1 cDNA clone encodes a polypeptide of 116 amino acids with typical characteristics of LTPs, notably a conserved arrangement of cysteine residues. Southern blot analysis indicate that two or three copies of the PoLTP1 are present in the genome of the investigated hybrid poplar. In addition, northern analysis of samples from soil-grown plants indicate that PoLTP1 is tissue-specifically expressed in the leaves and flowers. The gene is significantly up-regulated by treatment with mannitol, NaCl and ABA, but not by either cold or wounding. These results indicate that PoLTP1 is involved in osmotic stress responses in poplar plants and suspension cells.
Rock bream iridovirus (RBIV) causes high mortality and economic losses in rock bream (Oplegnathus fasciatus) aquaculture industry in Korea. Although, the immune responses of rock bream under RBIV infection have been studied, there is not much information at the different stages of infection (initial, middle and recovery). Gene expression profiling of rock bream under different RBIV infection stages was investigated using a microarray approaches. In total, 5699 and 6557 genes were significantly up- or down-regulated over 2-fold, respectively, upon RBIV infection. These genes were grouped into categories such as innate immune responses, adaptive immune responses, complements, lectin, antibacterial molecule, stress responses, DNA/RNA binding, energy metabolism, transport and cell cycle. Interestingly, hemoglobins (α and β) appears to be important during pathogenesis; it is highly up-regulated at the initial stage and is gradually decreased when the pathogen most likely multiplying and fish begin to die at the middle or later stage. Expression levels were re-elevated at the recovery stage of infection. Among up-regulated genes, interferon-related genes were found to be responsive in most stages of RBIV infection. Moreover, X-linked inhibitor of apoptosis (XIAP)-associated factor 1 (XAF1) expression was high, whereas expression of apoptosis-relate genes were low. In addition, stress responses were highly induced in the virus infection. The cDNA microarray data were validated using quantative real-time PCR. Our results provide novel inslights into the broad immune responses triggered by RBIV at different infection stages.
We investigated changes in photosynthesis and activity of ascorbate peroxidase (APX) that scavenges ROS as responses to oxidative stress induced by salinity in rice (Oryza sativa L.). Photosynthetic efficiency of rice leaves, monitored in terms of Fv/Fm, declined with the increase of salt concentration (100-300 mM NaCl). Salinity caused an increase of $H_2O_2$ in leaves of rice, with an increase of APX activity. Among total APX isoforms, an isoform of stromal-APX 1 in leaves of rice was completely inactivated by 300 mM NaCl, but was not affected by chilling or drought. The results suggest that salt stress acts in quite a different mechanism in relation to the activity of stromal-APX from that of other stresses such chilling and drought. We carried out RT-PCR for analysis of genes expression of APX isoforms as affected by salt stress. The expression of cytosolic APX/thylakoid-bound APX genes in leaves of rice exposed to salt stress was increased, while stromal APX gene expression rapidly declined.
Dimethylation of the histone H3 protein at lysine residue 9 (H3K9) is mediated by euchromatin histone methyltransferase II (EHMT2) and results in transcriptional repression of target genes. Recently, chemical inhibition of EHMT2 was shown to induce various physiological outcomes, including endoplasmic reticulum stress-associated genes transcription in cancer cells. To identify genes that are transcriptionally repressed by EHMT2 during apoptosis, and cell stress responses, we screened genes that are upregulated by BIX-01294, a chemical inhibitor of EHMT2. RNA sequencing analyses revealed 77 genes that were upregulated by BIX-01294 in all four hepatic cell carcinoma (HCC) cell lines. These included genes that have been implicated in apoptosis, the unfolded protein response (UPR), and others. Among these genes, the one encoding the stress-response protein Ras-related GTPase C (RRAGC) was upregulated in all BIX-01294-treated HCC cell lines. We confirmed the regulatory roles of EHMT2 in RRAGC expression in HCC cell lines using proteomic analyses, chromatin immune precipitation (ChIP) assay, and small guide RNA-mediated loss-of-function experiments. Upregulation of RRAGC was limited by the reactive oxygen species (ROS) scavenger N-acetyl cysteine (NAC), suggesting that ROS are involved in EHMT2-mediated transcriptional regulation of stress-response genes in HCC cells. Finally, combined treatment of cells with BIX-01294 and 5-Aza-cytidine induced greater upregulation of RRAGC protein expression. These findings suggest that EHMT2 suppresses expression of the RRAGC gene in a ROS-dependent manner and imply that EHMT2 is a key regulator of stress-responsive gene expression in liver cancer cells.
The Dps protein, which is overexpressed in harsh environments, is known to playa critical role in the protection of DNA against oxidative stresses. In this study, the roles of Fur in the expression of the dps gene in Salmonella and the protection mechanisms against oxidative stress in Salmonella cells preexposed to iron-stress were investigated. Two putative Fur boxes were predicted within the promoter region of the S. typhimurium dps gene. The profile of dps expression performed by the LacZ reporter assay revealed growth-phase dependency regardless of iron-status under the culture conditions. The fur mutant, $_X4659$, evidenced a reduced level of ${\beta}$-galactosidase as compared to the wild-type strain. The results observed after the measurement of the Dps protein in various Salmonella regulatory mutants were consistent with the results acquired in the reporter assay. This evidence suggested that Fur performs a function as a subsidiary regulator in the expression of dps. The survival ability of Salmonella strains after exposure to oxidative stress demonstrated that the Dps protein performs a pivotal function in the survival of stationary-phase S. typhimurium against oxidative stress. Salmonella cells grown in iron-restricted condition required Dps for full protection against oxidative stress. The CK24 (${\Delta}dps$) cells grown in iron-replete condition survived at a rate similar to that observed in the wild-type strain, thereby suggesting the induction of an unknown protection mechanism(s) other than Dps in this condition.
Lim, Chae Eun;Choi, Jung Nam;Kim, In A;Lee, Shin Ae;Hwang, Yong-Sic;Lee, Choong Hwan;Lim, Jun
Molecules and Cells
/
v.25
no.3
/
pp.368-375
/
2008
Approximately 120 UDP-glycosyltransferases (UGTs), which are classified into 14 distinct groups (A to N), have been annotated in the Arabidopsis genome. UGTs catalyze the transfer of sugars to various acceptor molecules including flavonoids. Previously, UGT71C1 was shown to glycosylate the 3-OH of hydroxycinnamates and flavonoids in vitro. Such secondary metabolites are known to play important roles in plant growth and development. To help define the role of UGT71C1 in planta, we investigated its expression patterns, and isolated and characterized a loss-of-function mutation in the UGT71C1 gene (named ugt71c1-1). Our analyses by quantitative real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (qRT-PCR), microarray data mining, and histochemical detection of GUS activity driven by the UGT71C1 promoter region, revealed the tissue-specific expression patterns of UGT71C1 with highest expression in roots. Interestingly, upon treatment with methyl viologen (MV, paraquat), ugt71c1-1 plants displayed enhanced resistance to oxidative stress, and ROS scavenging activity was higher than normal. Metabolite profiling revealed that the levels of two major glycosides of quercetin and kaempferol were reduced in ugt71c1-1 plants. In addition, when exposed to MV-induced oxidative stress, eight representative ROS response genes were expressed at lower levels in ugt71c1-1 plants, indicating that ugt71c1-1 probably has higher non-enzymatic antioxidant activity. Taken together, our results indicate that ugt71c1-1 has increased resistance to oxidative stress, suggesting that UGT71C1 plays a role in some glycosylation pathways affecting secondary metabolites such as flavonoids in response to oxidative stress.
Cells consistently face stressful conditions, which cause them to modulate a variety of intracellular processes and adapt to these environmental changes via regulation of gene expression. Hyperosmotic and oxidative stresses are significant stressors that induce cellular damage, and finally cell death. In this study, oligonucleotide microarrays were employed to investigate mRNA level changes in cells exposed to hyperosmotic or oxidative conditions. In addition, since heat shock protein 70 (HSP70) is one of the most inducible stress proteins and plays pivotal role to protect cells against stressful condition, we performed microarray analysis in HSP70-overexpressing cells to identify the genes expressed in a HSP70-dependent manner. Under hyperosmotic or oxidative stress conditions, a variety of genes showed altered expression. Downregulation of protein phosphatase1 beta (PP1 beta) and sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 (SPPase1) was detected in both stress conditions. Microarray analysis of HSP70-overexpressing cells demonstrated that diverse mRNA species depend on the level of cellular HSP70. Genes encoding Iysyl oxidase, thrombospondin 1, and procollagen displayed altered expression in all tested conditions. The results of this study will be useful to construct networks of stress response genes.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.