• 제목/요약/키워드: stacking interaction

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Benzo(a)pyrene 과 Cytochrome P-450의 대한 상호작용에 대한 이론적 연구 (Theoretical Study on The Interaction Between Benzo(a)pyrene and Cytochrome P-450)

  • 도성탁
    • 대한의생명과학회지
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    • 제1권1호
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    • pp.89-94
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    • 1995
  • B(a)P와 cytochrome P-450의 heme부분은 구조가 평면이므로 겹침 상호작용이 가능하다. 가능성이 큰 겹침 상호작용모형을 결정하기 위해 이들 분자에 대해 MO계산을 행하였다. 이 경우 궤도함수 상호작용이 가장 중요하므로, 프론티어궤도함수의 eigen vetor값이 크며 상호 결합성을 보여야 한다. 이를 바탕으로 다섯가지 가능성이 있는 모형을 선택한 수 MN2와 MO방법을 실행하였다. 이중 B(a)P의 4, 5, 6번 위치와 heme group의 Y탄소와 III pyrrole환이 포개어지는 형태가 가장 안전하였다.

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Stacking 방법과 층수에 따른 2 차원 화합물 반도체인 GaS 의 전자구조 변화

  • 양하늘;차선경
    • EDISON SW 활용 경진대회 논문집
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    • 제5회(2016년)
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    • pp.313-318
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    • 2016
  • 2차원 화합물 반도체인 Metal monochalcogenides (MMC)는 원자 4층으로 이루어진 tetralayer (TL)가 층상으로 쌓여진 구조이다. 서로 이웃한 tetralayer들이 쌓이는 방법에 따라 4가지의 stacking sequence를(${\beta}$, ${\varepsilon}$, ${\gamma}$, ${\delta}$) 고려할 수 있으며 물질에 따라 상대적인 안정성이 달라진다. GaS는 ${\beta}-type$이 가장 안정하다고 알려져 있다. 이 연구에서는 GaS의 층수를 4층까지 쌓으며, ${\beta}$${\varepsilon}$의 stacking sequence의 모든 경우를 다루어 van der Waals interaction을 고려한 LCAO-DFT 제일원리 계산을 수행하였다. 그 결과를 원자구조의 변화, 에너지 안정성, 전자구조의 변화로 나누어 분석하였다. TL 층이 많을수록 TL의 thickness가 감소하고 더 높은 에너지 안정성을 나타냈다. 또한 stacking sequence를 고려하였을 때 ${\varepsilon}$ stacking을 한 결과가 더 안정한 에너지가 나왔다. 이후 ${\varepsilon}$ stacking을 하였을때의 전자구조 변화를 energy band와 projected density of states를 이용해 관찰하였다.

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Synthesis and Photophysical Properties of Bispsoralen Derivatives Linked by a Bisamide-polymethylene Chain

  • Yoo, Dong-Jin
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제28권10호
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    • pp.1715-1719
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    • 2007
  • New bispsoralen derivatives 5-10, 8-MOP-NHCO(CH2)nCONH-8-MOP (BPSBA-Cn, n = 0, 1, 2, 3, 4 and 5) in which 5 position of an 8-methoxypsoralen (8-MOP) is linked by various lengths of bisamide polymethylene chain to 5 position of the other 8-MOP, have been synthesized by the amidation of 5-amino-8-methoxypsoralen (12) with α,ω-alkanoyl dichloride. Photophysical properties of their derivatives including π?π stacking interaction between the two aromatic moieties were investigated by UV absorption and fluorescence emission spectra. Efficient ring-ring stacking interactions have been observed in BPSBA-C4 (9) from the percent hypochromism (%H) of the models.

Transmission Electron Microscopy Study of Stacking Fault Pyramids Formed in Multiple Oxygen Implanted Silicon-on-Insulator Material

  • Park, Ju-Cheol;Lee, June-Dong;Krause, Steve J.
    • Applied Microscopy
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    • 제42권3호
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    • pp.151-157
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    • 2012
  • The microstructure of various shapes of stacking fault pyramids (SFPs) formed in multiple implant/anneal Separation by Implanted Oxygen (SIMOX) material were investigated by plan-view and cross-sectional transmission electron microscopy. In the multiple implant/anneal SIMOX, the defects in the top silicon layer are confined at the interface of the buried oxide layer at a density of ${\sim}10^6\;cm^{-2}$. The dominant defects are perfect and imperfect SFPs. The perfect SFPs were formed by the expansion and interaction of four dissociated dislocations on the {111} pyramidal planes. The imperfect SFPs show various shapes of SFPs, including I-, L-, and Y-shapes. The shape of imperfect SFPs may depend on the number of dissociated dislocations bounded to the top of the pyramid and the interaction of Shockley partial dislocations at each edge of {111} pyramidal planes.

Theoretical Mechanism Studies on the Enantioselectivity of aza-MBH-type Reaction of Nitroalkene to N-tosylimine Catalyzed by Thiourea-tertiary Amine

  • Lu, Nan;Wang, Huatian;Wang, Yangping
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제34권12호
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    • pp.3591-3596
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    • 2013
  • The enantioselective aza-Morita Baylis Hillman reaction of nitroalkene and N-tosylimine catalyzed by thiourea-tertiary amine has been investigated using density functional theory. Enantioselectivity is dominated by the cooperative effect of non-covalent and weak covalent interactions imposed by different units of catalyst. As Lewis base, the tertiary amine unit activates nitroalkene via weak covalent bond. The weak covalent interaction orients the reaction in a major path with smaller variations of this bond. The aromatic ring unit activates N-tosylimine via ${\pi}-{\pi}$ stacking. The non-covalent interaction selects the major path with smaller changes of the efficient packing areas. Thiourea unit donates more compact H-bonded network for species of the major path. The calculated ee value in xylene solution phase (97.6%) is much higher than that in N,N-Dimethylformamide (27.2%). Our conclusion is also supported by NBO analysis.

Intramolecular Ring-Ring Stacking Interartions between 8-Methoxypsoralen and Adenine Induced by Polymethylene Bridges.

  • 유동진;현승학;심상철
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제22권6호
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    • pp.575-580
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    • 2001
  • Intramolecular ring-ring interactions in the model compounds, $8-methoxypsoralen-CH_2O(CH_2)n-adenine(MOPCH_2OCnAd$, n=2, 3, 5, and 6) in which 5' position of 8-methoxypsoralne (8-MOP) is linked by different polymethylene bridges to N9 of adenine, have been investigated by hypochromism measurements. Efficient ring-ring stacking interactions have been observed in $MOPCH_2CO2Ad$ (7) from the percent hypochromism(%H) and fluorescence spectra of the models and a reference molecule. The 8-methoxyposralen-adenine systems have shown stronger ring-ring stacking interaction than the psoralen-adenine system.

항공기 주익용 하이브리드 복합재의 섬유배향각과 층간분리 성장과의 관계 (The Relationship between Fiber Stacking Angle and Delamination Growth of the Hybrid Composite Material on an Aircraft Main Wing)

  • 송삼홍;김철웅;김태수;황진우
    • 한국정밀공학회:학술대회논문집
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    • 한국정밀공학회 2003년도 춘계학술대회 논문집
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    • pp.1402-1405
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    • 2003
  • The main object of this study was evaluated by the delamination damage for fiber stacking angle. Therefore, this work need to compare the shape of delamination for a different fiber stacking angie. So this study uses a method of fatigue test which was created [0]$_2$,[+45]$_2$[90]$_2$. The extension of the delamination zone formed between aluminium alloy and glass fiber-adhesive layer were measured by an ultrasonic C-scan image. As a result, the shapes of delamination zone don't depend upon the crack propagation. We could know that the delamination zone grew interaction between stress flow of fiber layer and crack driving force. Hence, the existing study were applied to the stress transfer, fiber bridging effect, delaminantion growth rate should need to the develop useful factor because of change of fiber stacking angle.

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유기색소분자와 고분자전해질 사이의 상호작용 효과에 관한 구조론적 연구 (II). Methylene Blue 및 Acridine Orange의 Chondroitin Sulfate와의 상호작용 (Structural Studies upon the Interactive Effects between Organic Dyestuffs and Polyelectrolytes (Ⅱ). The Interaction of Methylene Blue and Acridine Orange with Chondroitin Sulfate)

  • 박종회;박무순;이홍
    • 대한화학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.295-300
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    • 1987
  • 고분자전해질인 Chondroitin sulfate A(CSA) 및 Chondroitin sulfate C(CSC) 존재하에서의 methylene blue(MB) 및 acridine orange(AO)의 metachromasy 현상에 관하여 각각 분광학적 방법으로 연구하였다. P/D값의 변화에 따르는 meta-band의 특성적 변화를 stacking 이론에 의하여 설명하였으며, staking 효과의 정량적 고찰에 의하여 고분자의 반복단위당 결합하는 색소분자의 수를 계산한 결과 MB가 AO보다 강한 stacking 효과를 나타냄이 발견되었다. CAS의 안정한 형태의 골격구조와 dimension을 발견하고 평면 방향색소의 free dimer의 모형을 근거로 CSA의 골격표면에 결합한 색소분자의 stacking모형과 dimension을 제안하였다.

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Amberlite XAD 수지에 대한 일치환 할로 페놀들의 흡착거동에 관한 연구 (Adsorption Behavior of Monosubstituted-Halophenols by Amberlite XAD Resins)

  • 이택혁;이대운
    • 대한화학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.267-279
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    • 1990
  • Amberlite XAD-2 및 XAD-7 수지에 대한 페놀과 그 할로겐 일치환체들에 대한 흡착성을 분포계수를 측정하여 조사하였다. XAD 수지에 대한 페놀의 흡착은 Langmuir 등온흡착으로 설명될 수 있었으며, 이 때의 흡착은 분자의 크기에 따르는, 즉 분산상호작용에 기인하는 전형적인 물리흡착임을 알았다. 고분자 합성수지에 대한 페놀류의 흡착에너지는 Lennard-Jones potential로 계산하였다. 이 때 고분자 수지의 반지름은 수지의 최소기본단위의 van der Waals 부피로부터 계산하였으며 페놀류의 분자 반지름도 같은 방법으로 구하였다. 페놀유도체들의 흡착성은 각 수지에 대한 시료의 Stacking factor (F)-고분자 수지와 페놀류사이의 van der Waals 부피로부터 구한 평형거리의 보정인자-로부터 흡착에너지를 구하고 뱃치법으로 측정한 흡착엔탈피값과 비교함으로써 설명할 수 있었다. 각 수지에 대한 페놀이온의 흡착엔탈피는 쌍극자 작용력이나 하전-쌍극자 상호작용보다 분산상호작용이 주 요인인 것으로 나타났다.

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