• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제18권1호
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• pp.73-80
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• 2015

To examine the interrelationship between transgenic insertion patterns and transgene expression profiles in established transgenic fish lines, four stable transgenic marine medaka Oryzias dancena germlines harboring ${\beta}$-actin regulator-driven RFP reporter constructs were selected. The established transgenic strains were characterized with regard to their transgenic genotypes (insertion pattern, concatemer formation, and transgene copy number based on genomic Southern blot hybridization and qPCR assay) and expression characteristics at the mRNA (qRT-PCR), protein (western blot), and phenotypic (fluorescent appearance) levels. From comparative examinations, it was found that transgenic expression at both the transcription and translation levels could be significantly downregulated in transgenic strains, potentially through methylation-mediated transgene silencing that was particularly associated with the formation of a long tail-to-head tandem concatemer in the chromosomal integration site(s). When this occurred, an inverse relationship between the transgene copy number and fluorescence intensity was observed in the resultant transgenic fish. However, with the other transgenic genotype, transgenic individuals with an identical Southern blot hybridization pattern, containing a tandem concatemer(s), had very different expression levels (highly robust vs. low expression strengths), which was possibly related to the differential epigenetic modifications and/or degrees of methylation. The concatemer-dependent downregulation of transgene activity could be induced in transgenic fish, but the overall pattern was strain-specific. Our data suggest that neither a low (or single) transgene copy number nor tandem transgene concatemerization is indicative of strong or silenced transgene expression in transgenic fish carrying a ubiquitous transgene. Hence, a sufficient number of transgenic lineages, with different genotypes, should be considered to ensure the establishment of the best-performance transgenic line(s) for practical applications.

• 식물조직배양학회지
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• 제22권6호
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• pp.351-355
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• 1995

국내 재배종 토마토 서광 품종으로부터 분리한 Polygalacturonase 유전자(PG2)의 3'측 1.1 kb cDNA 단편을 식물 형질전환용 운반체에 antisense 방향으로 삽입한 후 자엽을 이용하여 토마토내 도입하여 형질전환 토마토를 획득하였다. 형질전환 토마토(T$^{0}$ )를 도입시켜 그 종자를 1 mg/mL 농도의 kanamycin 함유 MS 배지에서 발아시켜 분리 집단 중에서 T$_1$9 식물체를 얻었다. T$_1$9의 Genomic Southern blot 분석 결과, antisense PG 유전자 1개가 염색체 내로 삽입되었음을 확인하였고 RNA gel blot 분석으로 endogenous PG mRNA보다 antisense PG RNA가 강하게 발현됨을 확인하였다. T$_1$9 계통 10개체의 성숙 토마토 과피조직내의 PG 효소 활성도 4~60%까지 저해되었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제43권3호
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• pp.341-346
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• 2016

The objectives of this study were to 1) evaluate the efficiency of the protocol of Agrobacterium-mediated transformation of cucumber to introduce phytoene synthase-2a carotene desaturase (PAC genes); 2) demonstrate the integration of PAC genes into the genome of putative transgenic cucumber based on growth on selection medium, PCR and Southern analysis; 3) evaluate the expression of PAC genes in transgenic cucumber based on the analysis of RT-PCR and Northern blot hybridization. Out of 5,945 cotyledonary-node explants inoculated with Agrobacterium, 65 (1.1%) explants produced 238 shoots. Integration of PAC genes into the genome of the cucumber was demonstrated based on the analysis of gDNA-PCR, 21 out of the 238 plants regenerated; while 6 plants proved positive for Southern blot hybridization. Transgene expression was demonstrated based on analysis of RT-PCR, 6 plants proved positive out of the 6 plants analyzed; while 4 plants out of 6 proved positive during Northern blot hybridization. This study successfully demonstrated the production of transgenic cucumber, integration, and expression of the PAC gene in cucumber.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제37권1호
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• pp.89-95
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• 2010

Dihydroflavonol 4-reductase(DFR)는 flavonoid 생합성 경로의 가장 중심부에 작용하는 효소로 2R,3R-trans-dihydroflavonols로부터 leucoanthocyanidins 으로의 변환을 촉매한다. 본 연구에서는 색소유전자의 전이를 통하여 새로운 색소발현체계를 가진 품종을 육종하기 위한 기초연구로 안개초 (Gypsophila paniculata L.)의 꽃봉오리로부터 cDNAlibrary를 합성하였고 카네이션의 DFR 유전자를 probe로 사용하여 anthocyanin 합성경로의 중요 효소의 하나인 DFR 유전자를 분리하였다. 염기서열분석을 수행하여 분리유전자의 크기가 1279 bp이며 이 중 coding region은 1063 bp임을 확인하였다. 이미 밝혀진 다른 식물체의 DFR 유전자와 서로 염기서열의 일치성을 비교해 본 결과 Cheddar pink, 카네이션, 양배추, 개나리, 페튜니아, cup flower, 장미, 과꽃 및 거베라에서 각각 62% 이상을 나타내었다. 분리유전자의 발현을 확인하기 위하여 Northern blot 분석 및 인위적으로 기내에서의 transcription과 translation을 수행하였고, 분리한 유전자의 효소활성을 측정해 본 결과 leucopelargonidin의 작은 peak를 확인하였다. Southern blot 분석 결과 안개초의 DFR 유전자는 다른 대부분의 식물체와 유사하게 한 개가 존재함을 확인하였다.

• 한국버섯학회지
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• 제9권3호
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• pp.91-95
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• 2011

느타리버섯은 가장 중요한 식용버섯 중 하나이다. 느타리버섯은 Pseudomonas tolaasii에 의한 세균성 갈변병에 매우 감수성이므로, 저항성 품종을 만들기 위한 노력의 하나로 누에에서 분리된 항 세균성 단백질인 누에신을 느타리버섯에서 과발현시키고자 하였다. 누에신 cDNA는 여름 느타리버섯의 ${\beta}$-tubulin 프로모터에 결합되어 pTRura3-2 vector와 함께 우라실 영양요구성 돌연변이 균주에 형질전환되었다. 누에신 cDNA가 형질전환된 느타리버섯을 genomic PCR과 Southern blot을 통하여 분리할 수가 있었으며, 이들 중 3개의 형질전환체가 누에신 유전자를 발현시킴을 확인하였다. 그러나 이들 형질전환체들에서 누에신 단백질을 검출할 수 없었으며, 또한 항 세균 효과도 확인할 수 없었다. 이들 결과는 형질전환기술을 이용한 병 저항성 개발 가능성을 보여주고 있다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제38권3호
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• pp.209-214
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• 2011

본 실험에서는 상추 연산홍에 apoptosis 관련 유전자인 Bcl-2 유전자를 도입하여 내병성 상추의 육성을 하기 위한 목적으로 형질전환을 수행하였다. 상추의 자엽조직을 NPTII-35S Promoter와 Bcl-2 유전자가 삽입된 Agrobacterium GV 3101과 공동배양 한 후 0.1 mg/L NAA, 0.5 mg/L BAP, 100 mg/L Kanamycin, 300 mg/L Lilacillin이 첨가된 MS 배지에서 식물체가 유기되었다. Kanamycin 내성을 가진 식물체들을 PCR, Southern blot 분석을 통해 Bcl-2 유전자가 안정적으로 식물체 genome 안에 삽입되었음을 확인하였다. 100개의 형질전환식물체가 확인되었으며 T1식물체를 채종하였다. T1 종자를 파종하여 Sclerotinia sclerotiorum. 균주를 접종하여 내병성 검정을 실시하였고 그 중 2개의 line에서 내병성을 확인하였다. 이러한 결과를 통하여 인간의 apoptosis에 관련하는 유전자가 식물체 내에서 안정된 발현을 통하여 내병성을 증가시켰음을 밝혔다.

• KSBB Journal
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• 제10권1호
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• pp.38-45
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• 1995

Aspergillus oryzae에서 A. nidulans의 glyceral d dehyde-3-phosphate dehydrogenase (gpdA)와 trpC, prmoter의 발현 능력 을 E. coli lacZ gene fusion을 이용하여 비교.분석하였다. A. oryzae 내에서 발현된 E. coli $\beta$galactosidase의 specific activIty를 조사하여 본 결과, gpdA promoter를 가지는 transformant들 에서는 2,000unit/ug of protem 정도의 activity를 보이는 반면, trpC, promater를 가지고 있는 transformant들에서는 10.5~52.3unit/ug of protein 정도의 activity를 보였다. 이 결과로부터 A. oryzae 내에서 A. nidulans의 gpdA promoter가 trpC, promoter에 비해 70 배 정도 더 강한 발현 능력을 보이고 있음을 알 수 있다. Western blot 분석에서도 gpdA promoter를 가지고 있는 transf ormant에서 더 많은 E. coli $\beta$-galactosidase가 발현된 것 을 보여 주고 있다. 또한 southern blot 분석에서는 이러한 강한 발현이 transform된 plasmid의 copy number와 상관 없음을 보여주고 있다.

• 미생물학회지
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• 제30권4호
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• pp.286-290
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• 1992

광주근교 지역의 근권 토양으로부터 cetrimide agar medium을 이용하여 형광성 pseudomonads를 분리하였고, CAS medium에서 siderophore의 생성능력이 우수한 pseudomonads만을 분리하여 생리화학적인 실험을 수행하였다. Kanamycin-sensitive pseudomonads를 Tn5를 이용한 mutagenesis를 실시하여 Kanamycin에 내성을 갖는 transconjugants를 선별하였고, siderophore 생합성을 하지 못하는 돌연변이주를 선별하기 위하여 CAS medium에서 yellow hallow를 형성하지 못하거나 King's B medium에서 형광성을 나타내지 못하는 colony를 선별하였다. 선별된 mutants들의 genomic DNA에 Tn5가 삽입되었는지를 확인하기 위하여 Southern blot hybridization을 실시한 결과 intact Tn5에 homology를 나타내는 하나의 single band를 확인하였다.

• 대한수의학회지
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• 제34권2호
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• pp.387-394
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• 1994

To make the genomic DNA probe of Theileria sergenti, the merozoites were purified from bovine erythrocytes. The infected erythrocytes were lysed by Aeromonas hydrophila(Ah-1) hemolysin, and the parasites were isolated by ultracentrifugation on a Percoll discontinuous density gradient. For construction of a T sergenti genomic DNA library, T sergenti DNA was digested with Pstl and the fragments were ligated into the PstI site of pUC19 before transformation of Escherichia coli JM83. Out of thousands of transformants obtained by transformation of E coli JM83 with the genomic library, three plasmids were chosen. The sizes of the inserted DNAs were 2.9kb(2.4kb and 0.5kb) in pKTS1, 4.3kb in pKTS2 and 1.5kb in pKTS3, respectively. The DNA fragments used as probe KTS1(2.4kb), KTS2(4.3kb) and KTS3(1.5kb) were labeled digoxigenin-11-dUTP for the Southern hybridization. In Southern hybridization, all of the probes(KTS1, KTS2 and KTS3) reacted specifically to T sergenti DNA, but not to bovine leucocyte DNA. In order to find out the sensitivities of the digoxigenin-11-dUTP-labeled KTS1 and KTS3 as the probes, purified merozoite DNA and bovine DNA (control) were checked by dot blot hybridization with the probes. Both of the probes, KTS1 and KTS3, detected as minimum amount of 975pg of the T sergenti DNA, but not bovine DNA even to 500ng.

• Ocean Science Journal
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• 제40권1호
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• pp.55-59
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• 2005

We cloned the complete cDNA of the ${\beta}-bubulin$ from the soft coral, Scleronephthya gracillimum $(K\ddot{u}kenthal)$ (Alcyonacea, Octocorallia, Anthozoa, Cnidaria), via the random sequencing of a cDNA library and the 5'-rapid amplification of cDNA end (RACE) technique. The full-length cDNA of the S. gracillimum ${\beta}-tubulin$ comprised 1541 bp, not including the poly $A^+$ stretch, also contained a complete open reading frame, which codes for a total of 445 amino acids. The amino acid residues 16402 appeared to be in a state of conservation in a variety of animals. Northern blot analysis clearly demonstrated that the sequence we have obtained is, indeed, the full-length cDNA of the ${\beta}-bubulin$ gene in S. gracillimum.