• Molecules and Cells
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• 제37권7호
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• pp.540-546
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• 2014

Several types of genetic and epigenetic regulation have been implicated in the development of drug resistance, one significant challenge for cancer therapy. Although changes in the expression of non-coding RNA are also responsible for drug resistance, the specific identities and roles of them remain to be elucidated. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are a type of ncRNA (> 200 nt) that influence the regulation of gene expression in various ways. In this study, we aimed to identify differentially expressed lncRNAs in 5-fluorouracil-resistant colon cancer cells. Using two pairs of 5-FU-resistant cells derived from the human colon cancer cell lines SNU-C4 and SNU-C5, we analyzed the expression of 90 lncRNAs by qPCR-based profiling and found that 19 and 23 lncRNAs were differentially expressed in SNU-C4R and SNU-C5R cells, respectively. We confirmed that snaR and BACE1AS were down-regulated in resistant cells. To further investigate the effects of snaR on cell growth, cell viability and cell cycle were analyzed after transfection of siRNAs targeting snaR. Down-regulation of snaR decreased cell death after 5-FU treatment, which indicates that snaR loss decreases in vitro sensitivity to 5-FU. Our results provide an important insight into the involvement of lncRNAs in 5-FU resistance in colon cancer cells.

• 한국융합학회논문지
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• 제6권1호
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• pp.77-83
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• 2015

최근 들어 사회연결망분석을 이용한 연구가 정치학, 언론학, 행정학 등의 사회과학 영역은 물론이고 나아가 자연과학 영역에 이르기까지 여러 분야에서 다양하게 이루어지고 있음에도 불구하고, 분석 도구의 소개에 대한 연구는 많지 않은 실정이다. 즉 사회연결망분석을 수행하기 위해서는 목적에 맞는 자료의 수집과 함께 분석 도구를 이용한 통계값 도출 및 시각화된 결과가 있어야 가능하지만, 아직까지 이를 체계적으로 설명한 연구는 부족한 실정이다. 이에 본 연구에서는 향후 사회연결망분석을 이용하여 연구를 수행하려는 연구자들에게 도움을 주고자, 무료 분석도구인 R프로그램을 이용한 분석과정을 자료입력부터 해석에 이르기까지를 실증자료를 이용하여 소개하고자 한다. 본 연구에서 활용되는 실증자료는 '한국학술지인용색인 DB'에서 제공하는 자료 중, 식품관련 국내학술지의 피인용자료이다. 연구방법론으로서의 사회연결망분석은 통계분석의 보완인 동시에 기존 연구방법을 대체하는 새로운 패러다임인 바, 본 고찰연구는 사회연결망분석의 활성화에 기여할 것이다.

• Wind and Structures
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• 제36권3호
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• pp.215-220
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• 2023

We study the progressive full-scale wind tunnel tests on a high solidity vertical axis wind turbine (VAWT) for various tip speeds and pitch angles to understand the VAWT shaft system's dynamics using 0-1 Test for chaos. We identify that while varying rotor speed (tip speed) of the turbine, the system's dynamics change from periodic to chaotic through quasiperiodic and strange non-chaotic (SNA) states. The present study is the first experimental evidence for the existence of these states in the VAWT shaft system to the best of our knowledge. Using the asymptotic growth value Kc in 0-1 test, when the turbine operates at the low tip speeds and high pitch angles for low incoming wind speeds, the system behaves periodic (Kc ≈ 0). However, when the incoming wind speed increases further the system's dynamics shift from periodic to chaotic vibrations through quasi-periodic and SNA. This phenomenon is due to the dynamic stalling of blades which induces chaotic vibration in the VAWT shaft system. Further, the singular continuous spectrum method validates the presence of SNA and differentiates the SNA from chaotic vibrations.

• 한국기술혁신학회:학술대회논문집
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• 한국기술혁신학회 2017년도 추계학술대회 논문집
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• pp.1375-1399
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• 2017

이 연구의 목적은 해양바이오 분야에 지원된 정부 R&D의 지원동향 분석을 기초로 향후 이 분야 정부연구개발 사업에 필요한 함의를 도출하는 데 있다. 이 연구에서는 NTIS DB를 통해 식별한 3,030건의 세부과제를 대상으로 기술통계와 과제명을 기초로 한 주제어 간 연결 관계를 SNA(Social Network Analysis) 방법을 이용해 실증분석 하였다. 이 연구에서 수행한 실증분석 결과를 간략하게 요약하면 다음과 같다. 첫째, 기술통계 분석 결과 최근으로 올수록 해양바이오 분야에 지원된 정부지원 연구개발 사업은 사업수와 연구비 지원규모 면에서 지속적인 성장을 보이고 있다. 둘째, 분야 특성상 이 분야에 대한 R&D 지원은 해수부가 주도적이지만, 대체로 범부처적 성격을 갖는다. 셋째, SNA를 통한 실증분석 결과 대부분의 사업이 해양생명자원이 가진 특이기작으로부터 유용신소재를 확보하기 위한 목적을 갖고 있는 것으로 분석되었다.

• Molecules and Cells
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• 제43권3호
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• pp.228-235
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• 2020

The Drosophila transmembrane semaphorin Sema-1a mediates forward and reverse signaling that plays an essential role in motor and central nervous system (CNS) axon pathfinding during embryonic neural development. Previous immunohistochemical analysis revealed that Sema-1a is expressed on most commissural and longitudinal axons in the CNS and five motor nerve branches in the peripheral nervous system (PNS). However, Sema-1a-mediated axon guidance function contributes significantly to both intersegmental nerve b (ISNb) and segmental nerve a (SNa), and slightly to ISNd and SNc, but not to ISN motor axon pathfinding. Here, we uncover three cis-regulatory elements (CREs), R34A03, R32H10, and R33F06, that robustly drove reporter expression in a large subset of neurons in the CNS. In the transgenic lines R34A03 and R32H10 reporter expression was consistently observed on both ISNb and SNa nerve branches, whereas in the line R33F06 reporter expression was irregularly detected on ISNb or SNa nerve branches in small subsets of abdominal hemisegments. Through complementation test with a Sema-1a loss-of-function allele, we found that neuronal expression of Sema-1a driven by each of R34A03 and R32H10 restores robustly the CNS and PNS motor axon guidance defects observed in Sema-1a homozygous mutants. However, when wild-type Sema-1a is expressed by R33F06 in Sema-1a mutants, the Sema-1a PNS axon guidance phenotypes are partially rescued while the Sema-1a CNS axon guidance defects are completely rescued. These results suggest that in a redundant manner, the CREs, R34A03, R32H10, and R33F06 govern the Sema-1a expression required for the axon guidance function of Sema-1a during embryonic neural development.

• 지적과 국토정보
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• 제49권1호
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• pp.113-121
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• 2019

본 연구에서는 국내 외 4차 산업혁명 관련 기술 분야의 연구 동향을 분석하기 위해서 웹 기반의 텍스트 마이닝 및 소셜 네트워크 분석 기법을 이용하였다. 이를 위해 2014년 1월 1일부터 2018년 12월 31일까지 국내 외 4차 산업혁명 관련 기술에 대한 연구 논문 및 보고서의 제목 텍스트와 날짜를 대상으로 하여 텍스트 마이닝을 수행하였다. 이후 개념적인 차원에서의 키워드 간 연관성을 분석하기 위해서 형태소 분석을 통한 대표 키워드를 도출하였다. 이후 사회 연결망 분석을 활용하여 핵심 키워드 및 연관 키워드 등을 도출하였다. 그 결과, 우리나라에서는 4차 산업혁명 기술 관련 연구 개발 및 법 제도적 완화 등에 대한 초점을 두고 있다고 유추할 수 있다. 반면, 국외는 단위 서비스 형태로의 접근을 통해 도시에 대한 실질적 적용 기술에 초점을 두고 있음을 파악할 수 있었다.

• 한국기술혁신학회:학술대회논문집
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• 한국기술혁신학회 2017년도 춘계학술대회 논문집
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• pp.335-356
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• 2017

본 연구에서는 4차 산업혁명에서 가장 중요하게 대두될 수 있는 융합R&D정책에 대해 소셜 네트워크 분석을 통해 새로운 대안을 제시하려고 한다. 연구장비, 연구성과의 자료들을 활용하여 연구장비 네트워크 분석을 실시하여 융합R&D의 특성 및 구조분석을 실시하며, 연구장비 공동활용 및 다학제 협력연구를 통해 창출될 수 있는 새로운 융합R&D정책에 대한 접근을 시도하려고 한다. 나아가, 연구개발과 사업화 사이에서 더욱 중요한 역할을 할 수 있는 분석과학기술에 대한 정책적 플랫폼 구축관점 대한 시사점을 찾아내려고 한다. 이를 위해 계량적 접근과 비계량적 접근을 동시에 활용하여 연구주제에 대한 타당성을 확보할 것이며, 앞으로 미래산업 및 유망기술에 대한 전략적 선별에 있어 일부 근거를 제시해줄 수 있을 것이다. 이러한 연구결과를 통해 우리나라 기초과학 및 기초과학인프라에 대한 발전적 정책방안과 융합연구 및 융합연구의 사업화에 대한 정책적 관점을 제시하도록 한다. 분석자료는 한국기초과학지원연구원(KBSI) 현황자료를 중심으로 살펴보며, 분석방법은 소셜네트워크분석(SNA:Socail Network Analysis)을 활용한다.

• Journal of Information Technology Applications and Management
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• 제21권4호
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• pp.65-96
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• 2014

To have global competitiveness in newly growing industry, good quality R&D's in convergence technology arerequired. Korean government also started to emphasize the importance of convergence technology as a new engine of growth for the future development. Since 2008, worldwide energy crisis and concerns on low carbon green growth made people focus on the convergence between information technology (IT) and energy technology (ET). However, the R&D performance comparison among the convergence technologies is not well explored so far. Therefore, this study uses Korea's patent citation database to measure the R&D performance of convergence technologies. We adopt technology development cycle, technology spillover analysis, and technology diffusion analysis to see the knowledge flow from R&D industry to others. We find that IT_ET convergence technology generally shows higher R&D performance than other convergence technologies. Contrary to public belief, convergence R&D by big companies has relatively low performance especially measures in technology spillover and technology diffusion. This implies that they might concentrate on delicate Fuel Cell Energy/Environment Technology (FEIT) or Nano Environment/Energy Information Technology (NEIT) rather than general energy information technologies. We also find that Korea's chemical industry may play a crucial role for the growth of other convergence technologies.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권6호
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• pp.3955-3961
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• 2013

Background: Defects of manganese superoxide dismutase (MnSOD) have long been implicated in generation of oxidative stress and risk susceptibility to various cancers. Two functional polymorphisms within the MnSOD gene, including the Val-9Ala of the mitochondrial targeting sequence (MTS) and the Ile58Thr of the exon-3, have been proposed to reduce its enzyme activity and antioxidant potential. Materials and Methods: A high-throughput multiplex SNaPshot$^{(R)}$ system was developed herein for simultaneous analyses of Val-9Ala and Ile58Thr in a single reaction. Genomic DNA extracted from each whole blood sample of 248 patients including 107 with cervical cancer and 141 with breast cancer and from 136 healthy women as controls was analyzed by the multiplex SNaPshot$^{(R)}$ system. Results: The Val/Val, Val/Ala genotypes and the Val allele of the MTS were predominant in patients with cervical or breast cancer as well as healthy women in Thailand. The Ile/Ile genotype and the Ile allele of the exon-3 were found in all of them whereas none of the Ile/Thr, the Thr/Thr genotypes and the Thr allele was detected. Genotypic association of both Val-9Ala and Ile58Thr polymorphisms with cervical cancer and breast cancer of these patients comparing to healthy women was not statistically significant (p<0.05). Conclusions: The Val/Val, Val/Ala genotypes and the Val allele of the MTS were found predominantly but the Ile/Ile genotype and the Ile allele of the exon-3 were detected in patients with cervical cancer, breast cancer and healthy women in Thailand. These two functional polymorphisms (Val-9Ala and Ile58Thr) in MnSOD gene did not associate with susceptibility risk of these cancer patients in Thailand.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제25권6호
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• pp.1431-1438
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• 2014

2013년 1월 1일부터 2013년 12월 31일까지의 부산지역지인 국제신문과 부산일보의 기사들 중 제목에 '부산'과 '교통'을 동시에 포함한 2889건의 기사 내용의 관계 또는 관련 있는 데이터에 내재되어 있는 의미 있는 패턴을 찾아내고자한다. 데이터마이닝 (datamining)의 일부인 텍스트마이닝(textmining)의 기법을 이용하여 사회네트워크분석 (SNA; social network analysis)을 실시하였다. 비정형 데이터의 정형화를 위해 빅데이터의 저장, 처리 및 분석을 위해 자바 기반의 오픈소스 프레임워크인 하둡 생태계 (Hadoop ecosystem)의 HDFS와 맵리듀스 (MapReduce)를 Linux (Ubuntu-12.04LTS) 환경에서 이용하였고, 기존의 R패키지에서 제공되는 사회 네트워크 분석보다 효율적인 시각화를 위해 각 노드 및 선에 비율에 따른 가중치를 주어 색상과 굵기로 해석할 수 있도록 새로운 알고리즘을 구현하였다.