• 한국자동차공학회논문집
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• 제15권1호
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• pp.8-15
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• 2007

Freeway corridors consist of urban freeways and parallel arterials that drivers can use alternatively. Ramp metering in freeways and signal control in arterials are contemporary traffic control methods that have been developed and applied in order to improve traffic conditions of freeway corridors. However, most of the existing studies have focused on either optimal ramp metering in freeways, or progression signal strategies between arterial intersections. There have been no traffic control systems in Korea that integrates the freeway ramp metering and arterial signal control. The effective control strategies for freeway operations may cause negative effects on arterial traffic. On the other hand, traffic congestion and bottleneck phenomenon of arterials due to the increasing peak-hour travel demand and ineffective signal operation may generate an accessibility problem to freeway ramps. Thus, the main function of the freeway which is the through-traffic process has not been successful. The purpose of this study is to develop an integrated control model that connects freeway ramp metering systems and signal control systems in arterial intersections. And Optimization of integrated control model which consists of ramp metering and signal control is another purpose. The design of experiment, neural network, and simulated annealing are used for optimization.

• Interdisciplinary Bio Central
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• 제3권1호
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• pp.5.1-5.5
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• 2011

Introduction: Many signal transduction pathways mediate cell's behavior by regulating expression level of involved genes. Abnormal behavior indicates loss of regulatory potential of pathways, and this can be attributed to loss of expression regulation of downstream genes. Therefore, function of pathways should be assessed by activity of a pathway itself and relative activity between a pathway and downstream genes, simultaneously. Results and Discussion: In this study, we suggested a new method to assess pathway's function by introducing concept of 'responsiveness'. The responsiveness was defined as a relative activity between a pathway itself and its downstream genes. The expression level of a downstream gene as a function of an upstream pathway activation characterizes disease status. In this aspect, by using the responsiveness we predicted potential progress in cancer development. We applied our method to predict primary and metastatic status of melanoma cancer. The result shows that the responsiveness-based approach achieves better performance than using gene or pathway information alone. The mean of ROC scores in the responsiveness-based approach was 0.90 for GSE7553 data set, increased more than 40% compared to a gene-based method. Moreover, identifying the abnormal regulatory patterns between pathway and its downstream genes provided more biologically interpretable information compared to gene or pathway based approaches.

• Molecules and Cells
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• 제26권6호
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• pp.590-594
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• 2008

brc-2, an ortholog of BRCA2 in Caenorhabditis elegans, is essential in the maintenance of genetic integrity. In C. elegans, cellular location correlates with meiotic progression, and transgene-induced cosuppression is observed in the germ line but not in somatic cells. We used these unique features to dissect the role of brc-2 in the germ line from that in somatic cells. In situ hybridization of wild type animals revealed that brc-2 gene expression was higher in oocytes than in other germline cells, and was barely detectable in mitotic cells. In contrast, germ cells containing multicopies of the brc-2 transgene showed no significant in situ hybridization signal at any oogenesis stage, confirming that brc-2 expression was functionally cosuppressed in the transgenic germ line. RAD-51 foci formation in response to DNA damage was abrogated in brc-2-cosuppressed germ cells, whereas wild-type germ cells showed strong RAD-51 foci formation. These germ cells exhibited massive chromosome fragmentation and decompaction instead of six bivalent chromosomes in diakinesis. Accordingly, lethality was observed after the early stage of germline development. These results suggest that brc-2 plays essential roles in chromosome integrity in early prophase, and therefore is crucial in meiotic progression and embryonic survival.

• Molecular & Cellular Toxicology
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• 제1권1호
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• pp.62-71
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• 2005

For toxicity model in the kidney, renal cell carcinoma (RCC) is one of the most important model to assess the structural and functional alterations. Most RCCs are sporadic, and environmental agents are suspected to play a role in the etiology of the disease. In this study, we discovered novel evidence for previously unknown gene expression patterns related to progression according to cancer stage in RCC. Four clear cell RCC tissue samples along with five corresponding patient-matched normal kidney tissue samples were obtained from patients undergoing partial or radical nephrectomy. To examine the difference of gene expression profile in clear cell RCC, radioactive cDNA microarrays were used to evaluate changes in the expression of 1,152 genes in a total. Using $^{33}P-labeled$ probes, this method provided highly sensitive gene expression profiles including drug metabolism, and cellular signaling. 29 genes were identified with expression levels that differed by more than 2.0 value of z-ratio, compared with that in control. Whereas expression of 38 genes were decreased by less than-2.0 value of z-ratio. In conclusion, this study has identified 67 gene expression alterations in clear-cell type of RCC. Most notably, genes involved in cell growth were up-regulated in stage I more than stage III whereas genes involved in signal transduction were down-regulated in which both stage I and stage III. The identified alteraions of gene expression will likely give in sight in to clear cell RCC and tumor progression.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권1호
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• pp.245-252
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• 2014

Human METCAM/MUC18, a cell adhesion molecule (CAM) in the immunoglobulin-like gene super family, plays a dual role in the progression of several epithelium cancers; however, its role in the nasopharyngeal carcinoma (NPC) remains unclear. To initiate the study we determined human METCAM/MUC18 expression in tissue samples of normal nasopharynx (NP), NPCs, and metastatic lesions, and in two established NPC cell lines. Immunoblotting analysis was used for the determination in lysates of frozen tissues, and immunohistochemistry (IHC) for expression in formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections of 7 normal nasopharynx specimens, 94 NPC tissue specimens, and 3 metastatic lesions. Human METCAM/MUC18 was expressed in 100% of the normal NP, not expressed in 73% of NPC specimens (or expressed at very low levels in only about 27% of NPC specimens), and expressed again in all of the metastatic lesions. The level of human METCAM/MUC18 expression in NPC tissues was about one fifth of that in the normal NP and metastatic lesions. The low level of human METCAM/MUC18 expression in NPC specimens was confirmed by a weak signal of RT-PCR amplification of the mRNA. Low expression levels of human METCAM/MUC18 in NPC tissues were also reflected in the seven established NPC cell lines. These findings provided the first evidence that diminished expression of human METCAM/MUC18 is an indicator for the emergence of NPC, but increased expression then occurs with metastatic progression, suggesting that huMETCAM/MUC18, perhaps similar to TGF-${\beta}$, may be a tumor suppressor, but a metastasis promoter for NPC.

• Journal of Korean Neurosurgical Society
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• 제40권5호
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• pp.351-356
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• 2006

Objective : Spondylodiscitis has been diagnosed by clinical, radiological and laboratory methods. MR imaging is well known as an excellent diagnostic tool for spondylodiscitis. However, the changes in MR images throughout the treatment process has not been studied. Thus we have analyzed the serial changes of MR images throughout the stages of infection. Methods : Ten patients were selected for retrospective reviewed who had been treated at our institute for infectious spondylodiscitis between 2000 and 2005. These patients had been followed-up at least six months and had taken more than a couple of series of MR scans. We classified the MR images into four groups according to the stages of treatment for the infection and compared them to the clinical and laboratory findings. Results : MR image signals changed minimally or appeared to be normal in the early stages. The progression of spondylodiscitis was characterized by a low T1 WI signal and a high T2 WI signal in disc and vertebral body. The signal changes of the MR images were then propagated and the end plate was destructed. During the treatment, the destructed endplate became stabilized and the signal intensity of both T1 and T2 WI were fixed to low-or iso-intensity. Conclusion : We can determine the serial signal changes based on MR images according to the treatment of spondylodiscitis. We can therefore determine the status of the infection and the stage of treatment, as well as the diagnosis of spondylodiscitis using serial MR images.

• 한국ITS학회 논문지
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• 제11권1호
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• pp.1-12
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• 2012

국내에 교통량의 변동을 고려하기 위하여 영상검지기를 이용한 반감응 신호제어시스템의 설치가 증가하고 있지만 그러한 반감응 신호제어시스템의 도입효과 및 성능을 평가하기 위한 절차 및 방법론은 아직까지 수립되어 있지 않다. 이에 본 연구에서는 효과분석 및 성능평가를 위한 방법론을 수립하였다. 개발된 방법론에서는 반감응 신호제어시스템의 특성을 고려하여 교통환경 개선 파악에 유용한 효과척도와 조사항목이 우선 설정되었고, 현장조사와 평가를 통해 시스템의 성능 및 도입에 따른 교통환경의 개선효과를 파악할 수 있는 방법을 제시하고 있다. 또한 본 연구에서는 개발된 방법론을 파주시 반감응 신호제어시스템에 대해서 사례 분석을 실시하였다. 단일교차로와 간선축으로 구분된 사례분석에서 교통량, 통행속도 항목과 신호효율측면의 현시이용효율, 연동효율 등 선정된 효과척도 분석결과 시스템 도입에 따라 일정수준의 개선효과가 있는 것으로 나타났다.

• 대한교통학회지
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• 제24권7호
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• pp.101-114
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• 2006

버스는 대중교통의 대표적인 수단으로 지하철보다 운영이 저렴하고 접근성이 뛰어나다는 장점을 가지고 있음에도 불구하고 일반차량과 도로를 공유하여 사용하기 때문에 도로혼잡의 직접적인 영향을 받고 있다. 이러한 버스의 정시성, 신속성, 쾌적성 등 버스서비스의 개선을 위해 버스우선신호의 도입이 요구되고 있다. 버스우선신호의 필요성 증대와 관련하여 서울시에서 운영되고 있는 실시간 신호제어시스템(COSMOS)은 버스우전신호에 대한 제어전략이 구축되어 있지 않은 실정이다. 이에 본 연구에서는 교통상황에 대응하여 신호시간을 결정하는 실시간신호제어시스템에서 대중교통, 특히 버스의 효율성을 높이는 버스우선신호 알고리즘을 정립하여 그것의 효과를 평가하였다. 본 연구에서 제안한 알고리즘은 실시간 교통대응제어를 기반으로 버스우선신호를 제공하기 때문에 기존 버스우선신호에 비해 부도로의 교통상황을 고려할 수 있다는 장점이 있다. 도심의 신호운영에서 중요시되는 연동을 유지하면서 우선신호를 제공하기 위해 수정주기 개념을 도입하였다 모의실험 결과 실시간 신호제어시스템하의 버스우선신호를 실행한 경우 그렇지 않은 경우와 비교하여 총지체는 증가하나 이는 기존 버스우선신호보다는 비교적 총지체를 감소시킨 것으로 나타났다. 버스통행시간의 감소로 버스서비스의 개선이 예상된다. 또한 버스의 재차인원을 고려할 경우, 차량이 아닌 사람을 기준으로 지체를 계산하기 때문의 본 알고리즘의 효율성을 인정받을 수 있다.

• 대한교통학회지
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• 제27권5호
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• pp.17-28
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• 2009

도시의 급변하는 교통수요에 대응하기 위해서 지속적으로 교통시설을 공급하는 데에는 한계가 있으므로 맹목적인 시설공급보다는 현재 교통시설에서의 운영관리측면이 강조되고있다. 특히 신호교차로들로 이루어진 단속류에서는 연동을 고려한 각 교차로별 최적신호시간 부여가 중요하다. 그러나 방향별로 부여된 신호시간이 단속류의 통과용량에 주요 변수인 것을 감안할 때 첨두시와 같이 교통수요가 급증하는 상황에서 보호좌회전 신호를 포함하는 4현시 신호운영을 지속적으로 유지하는 것은 방향별 통과용량에서의 한계가 있으며, 이에 대응하여 기존 과포화 신호제어 방법으로 내부미터링 기법에 대한 연구도 그동안 진행되어왔으나 실시간 신호제어시스템 상의 대기행렬 검지기 설치 부재로 인해 적용되지 못하고 있는 실정이다. 본 연구에서는 도시 간선도로의 지정체를 완화하기 위한 새로운 방법으로 현재 삼성역 교차로에서 운영 중에 있는 제한적 좌회전 신호운영 방안을 간선가로축을 대상으로 적용하였다. 이것은 시간대에 따라 주방향에 대한 좌회전 흐름을 직진 후 U턴으로 유도하여 현시수를 감소시키고 직진 신호시간을 최대화하여 통과용량을 증가시키는 신호제어 방법을 적용하는 것이다. 단, 본 신호제어에 대한 적용은 대상구간의 기하구조와 교통상황 조건 등에 따라 결정되어져야 하며, 이를 위해 기존의 교통 신호등 설치기준과 같이 각 교통상황 조건별로 명확한 적용기준이 필요하다.

• 대한교통학회지
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• 제33권1호
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• pp.70-80
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• 2015

본 연구는 최근 국내 도입이 추진되고 있는 궤도교통수단인 트램이 일반교통류와 도로를 공유했을 때 발생할 수 있는 문제를 예상하고, 트램운영의 효율성과 안정성을 확보할 수 있는 신호운영 전략과 통합 신호운영이 가능한 신호제어기 시작품을 개발하는데 연구의 목적이 있다. 통합 신호운영을 위해 고정식 트램 우선신호와 능동식 트램 우선신호를 포함한 3단계의 유기적인 통합 신호제어 전략을 수립하였고, 각 단계별 전략수행을 위한 신호운영 알고리즘을 개발하였다. 개발된 신호제어 알고리즘을 S/W로 구현하고, 표준 신호제어기에 기반한 H/W로 제작하였고, 이를 평가하기 위한 통합 신호제어 시뮬레이터(Hardware in the Loop Simulation system: HILS)를 개발하였다. 미시적 시뮬레이션 프로그램을 통해 통합 신호제어 전략의 효과와 개발된 통합 신호제어기의 성능을 평가한 결과, 본 연구를 통해 개발된 신호제어 알고리즘으로 산출한 교차로 신호시간이 트램차량의 신호교차로 정지수와 통행시간을 감소시켰음을 확인하였고, 트램 우선신호에 따른 일반차량의 지체증가가 거의 나타나지 않음을 확인하였다. 또한 통합 신호제어 시뮬레이터를 통해 개발된 통합 신호제어기의 H/W와 S/W의 기능 수행 여부을 확인하였다.