Journal of information and communication convergence engineering
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제16권3호
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pp.166-172
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2018
A pseudo-random sequence generated by using a primitive polynomial, trace function, and Legendre symbol has been researched in our previous work. Our previous sequence has some interesting features such as period, autocorrelation, and linear complexity. A pseudo-random sequence widely used in cryptography. However, from the aspect of the practical use in cryptographic systems sequence needs to generate swiftly. Our previous sequence generated by utilizing a primitive polynomial, however, finding a primitive polynomial requires high calculating cost when the degree or the characteristic is large. It’s a shortcoming of our previous work. The main contribution of this work is to find some relation between the generated sequence and irreducible polynomials. The purpose of this relationship is to generate the same sequence without utilizing a primitive polynomial. From the experimental observation, it is found that there are (p - 1)/2 kinds of polynomial, which generates the same sequence. In addition, some of these polynomials are non-primitive polynomial. In this paper, these relationships between the sequence and the polynomials are shown by some examples. Furthermore, these relationships are proven theoretically also.
According to the advancement of experimental techniques in molecular biology, genomic and protein sequence databases are increasing in size exponentially, and mean sequence lengths are also increasing. Because the sizes of these databases become larger, it is difficult to search similar sequences in biological databases with significant homologies to a query sequence. In this paper, we present the N-gram indexing method to retrieve similar sequences fast, precisely and comparably. This method regards a protein sequence as a text written in language of 20 amino acid codes, adapts N-gram tokens of fixed-length as its indexing scheme for sequence strings. After such tokens are indexed for all the sequences in the database, sequences can be searched with information retrieval algorithms. Using this new method, we have developed a protein sequence search system named as ProSeS (PROtein Sequence Search). ProSeS is a protein sequence analysis system which provides overall analysis results such as similar sequences with significant homologies, predicted subcellular locations of the query sequence, and major keywords extracted from annotations of similar sequences. We show experimentally that the N-gram indexing approach saves the retrieval time significantly, and that it is as accurate as current popular search tool BLAST.
As current postal automation is limited to dispatch and arrival sorting, delivery sequence sorting is performed manually by each postman. It not only acts as a bottleneck process in the overall mailing process but is expensive operation. To cope with this problem effectively, delivery sequence sorting automation is required. The important components of delivery sequence sorting automation system are sequence sorter and Hangul OCR which function is to extract the address of delivery point. DSI database will be interfaced to both Hangul OCR and sequence sorter for finding the accurate delivery sequence number and stacker number. The objectives of this research are to develop DSI(Delivery Sequence Information) database prototype and client application for managing information effectively. For database requirements collection and analysis, we draw all possible sorting plans, and apply the AHP(Analytic Hierarchy Process) method to determine the optimal one. And then, we design DSI database schema based on the optimal one and implement it using Oracle RDBMS. In addition, as address information in DIS database consist of hierarchical structure which has its correspondence sequence number, so it is important to reorganize sequence information accurately when address information is inserted, deleted or updated. To increase delivery accuracy, we reflect this point in writing application.
분자 생물학(computational molecular biology) 분야에서 DNA 염기 서열 배치 알고리즘은 다양한 방법으로 개선되어 왔다. 본 논문에서는 기존의 DNA 염기의 품질 정보(quality information)를 이용한 DNA 염기 서열 배치 방법을 개선하기 위하여 퍼지 논리 시스템(fuzzy logic system)과 DNA 염기 서열 단편의 특징을 적용한 품질 정보와 퍼지 추론 기법을 이용한 DNA 염기 서열 배치 알고리즘을 제안한다. 기존의 알고리즘은 Needleman-Wunsch가 제안한 전역 배치 알고리즘에 각 DNA 염기의 품질 정보를 적용하여 DNA 염기 서열 배치 점수를 계산하였다. 그러나 전체 DNA 염기의 품질 정보를 이용하여 계산하기 때문에 DNA 염기 말단 부분의 품질이 낮은 경우에는 DNA 염기 서열 배치 점수를 계산하는 과정에서 오차가 발생한다. 본 논문에서는 기존의 품질 정보를 이용한 알고리즘을 개선하여 DNA 염기 서열의 말단 부위의 품질이 낮은 경우에도 정확히 서열을 배치할 수 있도록 한다. 또한 DNA 염기 서열 단편의 길이와 낮은 품질의 DNA 염기 빈도를 퍼지 논리 시스템에 적용하여 DNA 염기 서열 배치 점수를 계산하는데 적용되는 매핑 점수 인자(parameter)를 동적으로 조정한다. 제안된 알고리즘의 성능 평가를 위해 NCBI(National Center for Biotechnology Information)의 실체 유전체 데이터를 받아 성능을 분석한 결과, 제안된 알고리즘이 기존의 품질 정보만을 이용한 알고리즘 보다 DNA 염기 서열 배치에 있어서 효율적임을 확인하였다.
프로토콜 적합성 시험은 시험 대상인 구현물을 하나의 black box로서 고려하여 input에 대한 output 과 결과 상태를 확인하는 일련의 과정으로 구성된다. 특히 결과 상태를 확인하는 방법에 따라 Unique Input/Output(UIO) Sequence, Distinguishing Sequence(DS) 및 Characterization Set(CS) 등으로 구분할 수 있다. 또한 UIO sequence가 존재하지 않는 상태에 대한 시험을 위해서라고 Partial UIO Set(CS) 등으로 구분 할 수 이따. 또한 PUIO sequence가 존재하지 않는 상태에 대한 시험을 위해서도 Partial UIO sequence 방법이 제안되었다. 본 논문에서는 이러한 PUIO sequence를 제시하고 이를 이용한 개선된 PUIO sequence 제안하였으며, 그 적용 결과로서 PUIO sequence의 수가 56%정도 줄어드는 것을 확인할 수 있었다.
A variety of different metrics has been introduced to measure the similarity of two given sequences. These widely used metrics are ranging from spell correctors and categorizers to new sequence mining applications. Different metrics consider different aspects of sequences, but the essence of any sequence is extracted from the ordering of its elements. In this paper, we propose a novel sequence similarity measure that is based on all ordered pairs of one sequence and where a Hasse diagram is built in the other sequence. In contrast with existing approaches, the idea behind the proposed sequence similarity metric is to extract all ordering features to capture sequence properties. We designed a clustering problem to evaluate our sequence similarity metric. Experimental results showed the superiority of our proposed sequence similarity metric in maximizing the purity of clustering compared to metrics such as d2, Smith-Waterman, Levenshtein, and Needleman-Wunsch. The limitation of those methods originates from some neglected sequence features, which are considered in our proposed sequence similarity metric.
본 논문에서는 랜덤시퀀스와 Hadamard 행렬을 이용하여 다중 정보를 은폐시킬 수 있는 새로운 디지털 제안하였다. 기존의 디지털 정보은폐에 사용된 기법은 하나의 랜덤시퀀스를 정보신호에 직접 곱하여 정보신호에 에너지 레벨을 매우 낮춤으로서 불법 이용자로 하여금 은폐된 정보의 검출이나 교란을 어렵게 하였다. 그러나 여러 개의 정보를 동일한 디지털 영상에 은폐시킬 경우에는 직교성이 보장되는 은폐코드를 사용해야 하기 때문에 어느 정도 상관성을 갖는 랜덤시퀀스만으로는 정보은폐가 어렵다. 따라서, 본 논문에서는 랜덤시퀀스의 장점과 더불어 직교성을 갖을 수 있도록 같은 행렬을 곱할 때만 정확한 신호로 추출되는 Hadamard 행렬을 랜덤시퀀스와 함께 사용하여 다수의 은폐정보에 대해서도 정확하게 은폐된 신호를 추출할 수 있는 새로운 디지털 정보은폐 방법을 제안하였다.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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제17권2호
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pp.569-579
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2006
Recently, the amount of genome sequence is increasing rapidly due to advanced computational techniques and experimental tools in the biological area. Sequence comparisons are very useful operations to predict the functions of the genes or proteins. However, it takes too much time to compare long sequence data and there are many research results for fast sequence comparisons. In this paper, we propose a hybrid grid system to improve the performance of the sequence comparisons based on the LanLinux system. Compared with conventional approaches, hybrid grid is easy to construct, maintain, and manage because there is no need to install SWs for every node. As a real experiment, we constructed an orthologous database for 89 prokaryotes just in a week under hybrid grid; note that it requires 33 weeks on a single computer.
Woerner는 비동기 트레리스 부호화 DS/COMA (asynchronous treilis-coded DS/CDMA systems, A-TC-CDMA) 시스템에 낮은 상관도의 다중 시퀀스 시그날링인 배직교 시퀀스 (biorthogonal sequence)를 이용함으로써 단일 시퀀스 시그날링인 M-ary PSK에 비해 보다 개선된 시스템 성능을 얻을 수 있음을 보여주었다. 본 논문에서는 최근 기 제안된 다중 시퀀스 시그날링 방식인 OPSM (orthogonal plane sequence modulation)과 배직교 시퀀스를 이용한 비동기 트레리스 부호화 CDMA 시스템 성능을 상호 비교 분석한다. 가입자 수신신호의 상호간섭 랜덤변수의 모멘트를 유도하고 그 결과 배직교 시퀀스 시그날링 방식에 비해 적은 수의 심볼당 시퀀스를 갖는 OPSM(orthogonal plane sequence modulation)이 시퀀스간 낮은 상호상관도 특성을 가짐을 보여준다. 또한 컴퓨터 시뮬레이션을 통하여 다중 시퀀스 시그날링 비동기 트레리스 시스템의 전력 효율 및 스펙트럼 효율을 비교 검증한다.
Due to the excessive zero-sequence voltage in dual three-level inverter fed open-end winding induction motor systems, zero-sequence circumfluence which is harmful to switching devices and insulation is then formed when operating in a single DC voltage source supplying mode. Traditionally, it is the mean value instead of instantaneous value of the zero-sequence voltage that is eliminated, through adjusting the durations of the operating vectors. A new strategy is proposed for zero-sequence voltage elimination, which utilizes unified voltage modulation and a decoupled SVPWM strategy to achieve two same-sized equivalent vectors for an angle of $120^{\circ}$, generated by two inverters independently. Both simulation and experimental results have verified its efficiency in the instantaneous value elimination of zero-sequence voltage.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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