• 제목/요약/키워드: rice dwarf virus

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Molecular Diagnosis of Rice Black-Streaked Dwarf Virus in Japan and Korea

  • Masamichi Isogai;Ichiro Uyeda;Park, Jang-Kyung
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제17권3호
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    • pp.164-168
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    • 2001
  • Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) and Maize rough dwarf virus (MRDV) are closely related viruses. Since the two viruses produce identical symptoms on maize, barley, and wheat, diagnosis of infected plants is difficult. Previously, we reported that partial cDNA clones of RBSDV S5 and S6 from the Japanese isolate (RBSDV-H) have lower sequence homology to MRDV than do cDNA clones from other genomic segments. In order to test whether cDNA clones of RBSDV-H S5 and S6 can be used for molecular diagnosis, RBSDV field isolates from Korea and from Hokkaido, Japan were tested in dot blot hybridizations probed with RBSDV-H S5 and S6 cDNA colnes. Hybridization with these probes was more intense against the RBSDV genome than against the MRDV genome. Therefore, RBSDV-H S5 and S6 cDNA clones can be used to differentiate between the two viruses. Furthermore, RBSDV-H S5 and S6 clones reacted more strongly against the viruses from stunted maize plants from Korean fields than to MRDV, indicating that RBSDV may be the causal disease agent in maize plants in Korea.

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벼오갈병의 발생 및 병원바이러스의 월동에 대하여 (Disease Occurrence and Overwintering of Rice Dwarf Virus)

  • 이기운
    • 한국식물병리학회지
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    • 제2권1호
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    • pp.17-21
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    • 1986
  • 현재 벼오갈병의 발생한계지역인 울진에서 바이러스 보독 끝동매미충의 약충이 포장상태에서 월동할 수 없었다. 매개충의 발생소장과 벼오갈병 발병과의 관계를 보면, 매채충은 년 5회, 발병은 년 3회의 최성기를 나타내었고, 월동세대의 성충, 2세대약충 및 3세대의 약충이 주로 바이러스 전염의 요인이 되었다. 상습발병지의 밀양 30호 재배포장에서 재생병에 $22.4\~26.8\%$의 발병주율을 나타냈으며, 월동에 들어갈 약충이 $11\~30$일간 재생이병주를 흡즙한 결과 이듬해의 바이러스 보독월동충율이 $13.0\~18.2\%$나 되었다. 벼오갈병에 감염된 추파 보리는 월동 생존할 수 없어, 감염식물에서의 월동이 불가능하였다.

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The Complete Genome Sequence of Southern rice black-streaked dwarf virus Isolated from Vietnam

  • Dinh, Thi-Sau;Zhou, Cuiji;Cao, Xiuling;Han, Chenggui;Yu, Jialin;Li, Dawei;Zhang, Yongliang
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제28권4호
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    • pp.428-432
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    • 2012
  • We determined the complete genome sequence of a Vietnamese isolate of Southern rice black-streaked dwarf virus (SRBSDV). Whole genome comparisons and phylogenetic analysis showed that the genome of the Vietnamese isolate shared high nucleotide sequence identities of over 97.5% with those of the reported Chinese isolates, confirming a common origin of them. Moreover, the greatest divergence between different SRBSDV isolates was found in the segments S1, S3, S4 and S6, which differs from the sequence alignment results between SRBSDV and Rice black streaked dwarf virus (RBSDV), implying that SRBSDV evolved in a unique way independent of RBSDV. This is the first report of a complete nucleotide sequence of SRBSDV from Vietnam and our data provides new clues for further understanding of molecular variation and epidemiology of SRBSDV in Southeast Asia.

dsRNA Analysis and Sequence of S12 to Rice dwarf virus Korean Isolate

  • Lee, Bong-Choon;Kwak, Do-Yeon;Hong, Yeon-Kyu;Cho, Hyun-Je;Park, Sung-Tae;Kim, Soon-Chul
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제20권2호
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    • pp.155-157
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    • 2004
  • We isolated Rice dwarf virus (RDV) from infected plants in rice fields (Korea, Japan, China, the Philippines and Nepal) and analyzed their genomic dsRNAs by polyacrylamide gel eletrophoresis. The genomic dsRNAs of the isolates showed distinct electrophoretic mobility profiles. The S12 coding to nonstructural protein of Korean isolate (RDV-Kr) was further analyzed by sequencing. The S12 of RDV-Kr was 1,066bp long and coded for a protein composed of 312 amino acids including three open reading frames of P12, P120Pa and P120Pb. The sequence identities were 96% and 98.6% with Japanese isolates (H, AN), 94.7% with Nepalese isolate (NEL), 94% with Chinese isolate (CK) and the Philippines isolate (P).

Occurrence and Detection of Rice black-streaked dwarf virus in Korea

  • Lee, Bong-Choon;Hong, Yeon-Kyu;Hong, Sung-Jun;Park, Sung-Tae;Lee, Key-Woon
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제21권2호
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    • pp.172-173
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    • 2005
  • Until now, occurrence of Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) is observed in Gyeongsang provinces, southeastern part of Korea. However, recently, the occurrence of RBSDV is increasing and spreading in Jeonra provinces including Gochang-gun, southwestern part of Korea. RBSDV infected plants showed typical symptoms including stunted, deformed leaves with white waxy or black-streaked swelling along the veins. We extracted viral genomic dsRNA from infected leaves and analyzed dsRNA pattern by polyacrylamide gel electrophoresis. Ten genomic segments with similar sized dsRNAs were observed. We also detected RBSDV by reverse transcription (RT)-PCR using specific primers for S10 from genomic dsRNA and observed amplified DNA fragment specific for RBSDV S10.

한국에서 벼 흑조위축병의 발생에 대하여 (Studies on the Occurrence of Rice Black-Streaked Dwarf Virus in Korea)

  • 이재열;이순형;정봉조
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.121-125
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    • 1977
  • 지금까지 우리나라에 발생되지 않았던 새로운 수도 바이러스병인 벼 흑조위축병에 대하여 실시한 확인 및 동정 실험결과는 다음과 같았다. 1) 애멸구(Laodelphax Striatellus FALLEN)가 벼 흑조위축병을 매개하였다. 2) 바이러스의 입자는 구형이었으며 직경은 약60nm이었다. 3) 이 병은 령, 호남지방 및 충청북도에서 발생하였다. 4) 이앙시기가 빠를수록, 바맥일수록 이병주율이 높았다.

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벼 오갈병 바이러스의 순화와 항혈청 제조에 관한 연구 (Studies on Purification and Serology of Rice Dwarf Virus)

  • 이순형;이기운;정봉조
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.65-67
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    • 1977
  • 우리나라 중부이남 지역에서 벼 오갈병에 의한 피가 현저히 늘어나고 있는 실정이다. 본시험에서는 매개충을 사용, 순수분리하고 이를 접종하여 증식한 후 Toyoda 등의 순화방법을 개선하여 순화하였다. 그 결과 순화된 바이러스 함량은 ml당 3.12mg 이었다. 순화된 바이러스를 Adjuvant와 함께 토끼에 10-14일 간격으로 5회 주사하여 항혈청을 제조한 결과 1/4,096의 높은 역가를 나타내는 항혈청이 제조되었다.

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벼오갈병 바이러스 P12 단백질의 벼 감염세포 내 소재양식 (In Situ Localization of Rice dwarf phytoreovirus P12 Protein in Infected Rice Plant)

  • 이봉춘;홍연규;홍성준;박성태
    • 식물병연구
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    • 제12권1호
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    • pp.25-27
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    • 2006
  • 벼오갈병바이러스(Rice dwarf virus, RDV)는 Phytoreovius 속에 속하며 게놈은 double stranded RNA의 12분절로 이루어져 있는데 전기영동상에서 크기가 큰 것부터 S1에서 S12로 명명한다. 본 실험에서는 RDV 입자 및 P12 단백질의 세포질 내에서의 소재양식을 확인하였다. 바이러스 입자 및 P12 단백질 특이적 항혈청에 protein A-gold 입자를 immunolabelling하여 전자현미경에서 gold입자의 존재양상을 관찰하였다. 바이러스 입자 특이적 항혈청을 사용한 경우에는 gold 입자가 세포질내의 바이러스 입자에 특이적으로 반응한 것이 관찰되었다. P12단백질 특이적 항혈청의 경우 gold 입자가 세포질내의 세포소기관에 특이적으로 존재하지 않고 세포질전체에 산재하여 존재하였다. 이 결과로서 RDV S12가 코드하는 단백질 P12가 세포질내에 존재함을 확인하였다.

벼검은줄오갈병 바이러스가 매개충 및 기주식물에 미치는 영향 (The Effects of Rice Black-Streaked Dwarf Virus on Vector (Laodelphax striatellus U.) and Host Plants)

  • 이기운;김상규
    • 한국식물병리학회지
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    • 제1권3호
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    • pp.190-194
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    • 1985
  • 벼검은줄오갈병 매개충인 애멸구의 기주식물 선호성은 실내유균접종과 포장상태에서 공히 옥수수가 벼보다 낮으나 발병율은 아주 높았다. 바이러스가 매개충의 생태에 미치는 영향은 보독충이 무독충보다 성충의 생존일수, 부화약충수 및 성충율에서 심한 장애를 나타냈다. 벼에서는 감염초기부터 후기까지 건물중이 이병주가 건전주보다 낮았다. 그러나 옥수수에서는 감염초기에 이병주가 건전주보다 건물중이 높았다. 한천내확산법 및 미량심강법에 의한 감염바이러스의 정량결과, 항혈청과의 반응정도는 옥수수잎, 벼줄기, 벼잎, 옥수수줄기에서 부분순화한 항원바이러스의 순으로 나타났다. 이병기주식물의 phloem gall 형성에서 저온처리의 효과가 인정되었다.

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국내 기장 및 수수의 바이러스병 발생 조사 (A Survey of Viral Diseases of Proso Millet (Panicum miliaceum L.) and Sorghum (Sorghum bicolor L.) in South Korea)

  • 민현근;박충열;이홍규;염윤아;오종희;김봉섭;임승모;윤영남;이수헌
    • 식물병연구
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    • 제23권3호
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    • pp.262-267
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    • 2017
  • 2015년부터 2016년까지 국내 5개 지역에서 기장 101점, 수수 200점의 시료를 채집하였다. 채집한 시료에 대해 paired-end RNA sequencing, RT-PCR 진단을 수행하였다. 그 결과, 경상도에서 채집한 수수에서 Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV)가 검출되었으며, RBSDV, Rice stripe virus (RSV), Barley virus G (BVG), Cereal yellow dwarf virus (CYDV) 4종의 바이러스가 기장에서 검출되었다. 기장에서 검출된 4종의 바이러스 중 RSV와 RBSDV는 경상도에서 채집한 시료에서 높은 감염률을 보였다. 반면, BVG는 5개 지역에서 모두 감염이 확인되었으며, 이미 전국적으로 분포되어 있는 바이러스인 것으로 보인다. 본 연구에서는 국내 기장과 수수에서 RBSDV를 처음으로 동정하였으며, 수수에서 검출된 CYDV는 기존에 보고된 CYDV 분리주와 상동성이 상대적으로 낮은 것으로 보아 Polerovirus 속의 신종 바이러스로 예상된다.