This study is conducted to evaluate the effects of root restriction on growth of maple(Acer palmatum Thumb.). Tow types of container such as clay pot(CP), root control bag(RCB) were used to restrict maple's root and each type of container was divided into 5 sizes. The containers with plants were buried just below the soil level and maples planted directly in the soil (nonrestricted root treatment) were included as comparison. Data were collected on dry weight of leaf, trunk, thick root, rootlet and soil water potential. We have analyzed, simple linear regression, Pearson's Correlation analysis, Duncan's multiple rang test, and Covariance Analysis using SAS statistical software. The results of analysis based on these data are as follows; 1. Total dry weight of maple in CP was significantly larger than in RCB. 2. Difference in growth reduction by the kinds of containers was induced by different hydraulic diffusion ratios between container and soil. Difference in growth reduction by the size of container was induced by the difference density of rootlet and soil moisture contents in the container. 4. Commercial products of root control of root control bag appeared not proper for countries in which fluctuation of rainfall is severe. Because maples in RCB were restricted by excess soil water in the rainy season, or by lack of soil water in the dray season.
To elucidate the molecular genetical properties of the canine parvoviruses isolated from the diseased puppies in the regions of Kyunggi and Chungnam provinces, the replicative form (RF) DNA of four field isolates were compared with those of two attenuated vaccine strains and a reference strains of CPV by restriction endonuclease analysis (REA). REA by Hinf I showed that three CPV isolates except CPV-V15 had an identical banding pattern with two vaccine strains, one standard strain and feline panleukopenia virus (FPLV). In CPV-V15 strain the fourth fragment of DNA with 800 bp was deleted. REA by Bgl II and Pst I indicated that CPV-V15 and FPLV had a bigger second fragment than those of the other strains of CPV. Meanwhile REA by Bam HI revealed that all the field isolates and vaccine strains used in this experiment showed similar banding patterns.
This study employed two PCR-based 16S rDNA approaches, amplified rDNA restriction analysis (ARDRA) and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), to characterize the bacterial community structure in groundwater. Samples were collected from groundwater for the use by private residences, as well as for industrial and agricultural purposes, in Ansan City. Each PCR product was obtained by PCR with eubacteria 16S rDNA and variable V3 region specific primer sets. After amplification, the 16S rDNA PCR products were digested with 4-base site specific restriction endonucleases, and the restriction pattern analyzed. The genetic diversity and similarity of the groundwater bacterial community was analyzed by eubacteria universal primer sets for the amplification of variable V3 regions of the bacterial 16S rDNA. The result of the bacterial community analysis, by ARDRA and DGGE, revealed the same pattern. The highest diversity was found in groundwater from site G1, which was used in residences. In the DGGE profile, a high intensity band was sequenced, and revealed to be Pseudomonas sp. strain P51.
Mitochondrial DNA(mt DNA) of Mammalian is the circular one which the 16.5K base pairs and show the maternal inheritance. Evolutional speed of nucleotide sequence is very fast. So that polymorphic analysis of mt DNA provide the useful informations to investigate the genetic relations of interspecies. Authors trials were focussed to compare with the polymorphic differences of mitochondrial DNA between Jindo and Japanese mongrel dogs. DNA was extracted from bloods of 21 head of Jindo dogs and 20 head of Japanese dogs and isolated using 10 kinds of restriction endonucleases(Apa I, BamH I, Bgl II, EcoR I, EcoR V, Hinc II. Hind III, Pst I, Sty I, Xba I) and then separated by the agarose gel electrophoresis. After sourthern blotting hybridization was completed using the mtDNA of Japanese mongrel dogs as a probe. Autoradiography was used to compare the polymorphism of mtDNA both dogs. The results obtained were as follows; 1. mt DNA of Jindo dog showed polymorphism resulting cleavage with four kinds of restriction endonuclease, Apa I, EcoR V, Hinc II, Sty I. While in the Japanese mongrel dogs observed the polymorphism in the five kinds of restriction endonuclease supplemented with EcoR I. 2. Compared with both dogs the frequency differences of DNA polymorphism were recognized in the specific restriction endonuclease Apa I. Consequently in the restriction endonuclease Apa I both dogs classified with three types as A, B, C however in the Jindo dogs frequency of C type was 71.5 percent but in Japanese mongrel dogs observed 45 percent in the A type. 3. DNA polymorphism obtained from the use of five kinds of restriction endonuclease were classified with seven types. In Jindo dogs frequency was highest in the type 6 as 71.4 percent but in the Japanese mongrel dogs showed 35 percent in the type 5. 4. Genetic distances calculated by NEI method showed 0.0089 in Jindo dogs and was 0.0094 in the Japanese mongrel dogs.
Krawczyk, Beata;Leibner-Ciszak, Justyna;Stojowska, Karolina;Kur, Jozef
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제21권12호
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pp.1336-1344
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2011
This study details and examines a novel ligation-mediated polymerase chain reaction (LM-PCR) method. Named the LM-PCR/Shifter, it relies on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4-base, 5' overhangs, this being the Shifter, and the ligation of appropriate oligonucleotide adapters. A sequence of 4-base, 5' overhangs of the adapter and a 4-base sequence of the 3' end of the primer(s) determine a subset of the genomic restriction fragments, which are amplified by PCR. The method permits the differentiation of bacterial species strains on the basis of the different DNA band patterns obtained after electrophoresis in polyacrylamide gels stained with ethidium bromide and visualized in UV light. The usefulness of the LM-PCR/Shifter method for genotyping is analyzed by a comparison with the restriction endonuclease analysis of chromosomal DNA by the pulsed-field gel electrophoresis (REA-PFGE) and PCR melting profile (PCR MP) methods for isolates of clinical origin. The clustering of the LM-PCR/Shifter fingerprinting data matched those of the REA-PFGE and PCR MP methods. We found that the LM-PCR/Shifter is rapid, and offers good discriminatory power and excellent reproducibility, making it a method that may be effectively applied in epidemiological studies.
The purposes of this study were investigated physical compensation for gait on induced knee stiffness in normal subjects. Ten subjects were participated in the experiment(age: $26.0{\pm}6.3$ yrs, height: $175.5{\pm}5.3$ cm, weight: $69.1{\pm}6.1$ kg). The study method adopted 3D analysis with five cameras and ground reaction force with two force-plate. Induced knee stiffness level were classified as gait pattern on ROM of knee(free level, $30^{\circ}$ restriction level, fix level). The results were as follows; In angular displacement of hip joint, left hip joint was the more extended in mid-stance on induced right knee stiffness. In angular displacement of knee joint, there was no physical compensation on induced right knee stiffness, but free knee level gait was more flexed in swing phase of right knee joint. In angular displacement of ankle joint, right ankle joint was the more dorsiflexed on induced right knee stiffness, and $30^{\circ}$ restriction level and fix level gait were less plantarflexed in TO2. In trunk tilt, free and $30^{\circ}$ restriction level gait was more backward tilt on induced right knee stiffness. In ROM of each joint, right knee joint was more larger and trunk tilt was more lower on induced right knee stiffness. In GRF, Fx was more bigger lateral force in free and $30^{\circ}$ restriction level gait, and was more bigger medial force in fix level gait. Fy was more bigger propulsion force in free level gait, and was was more bigger braking force in $30^{\circ}$ restriction level gait. Left braking force in $30^{\circ}$ restriction level gait was more bigger. Fz was no significant.
Since May 1st in 2008, the products of ginkgo biloba extract have had to be used with the patient's out-of-pocket payment due to reimbursement restriction guidelines. This study aims to analyze the policy effects of reimbursement restriction on pharmaceutical expenditures using interrupted time series(ITS) analysis. We retrieved monthly NHI claims data for the period between May, 2005 and December 2009. The ingredients identified as a substitute for ginkgo biloba have similar indications based on the similar pharmacological activities. The effects of changes in reimbursement scope were evaluated both for all relevant pharmaceuticals within the same therapeutic class and for 2 separate groups : ginkgo biloba's and its substitutes. According to the study results, restrictions on reimbursement scope resulted in savings of the drug expenditures in the targeted therapeutic class. Direct restriction on ginkgo biloba was associated with a decrease in expenditure level by 60.1% and changes in trend from an average increase rate of 1.4% to an average decrease rate of 1.5% for the therapeutic class, with a dramatic decrease in expenditure level(-191.5%) for ginkgo biloba itself, but with an increased expenditure level(+50.1%) and changes in trend from an average increase rate of 2.0% to an average decrease rate of 1.0% for the substitute group. Further policy to restrict nicergoline was associated with additional decrease in expenditure level for the therapeutic class. Additionally, we could identify the balloon effect - a new policy squeezing one part results in bulging out elsewhere. After the restriction of ginkgo biloba, the utilization of and expenditures on its substitutes increased significantly. In conclusion, we demonstrated that consecutively introduced policies effectively reduced overall expenditures on the therapeutic class of interest. Some ingredients played as a substitute while others did not. Further studies need to be conducted to identify which factors determine a substitute.
차나무의 분자학적 유연관계 및 유전적 다양성을 알아보기 위하여 한국에서 자생하는 차나무 집단 21개 지역 차나무에 대하여 DFR 유전자 부위를 이용하여 PCR-RFLP분석을 하였다. DFR 4+5 primer 쌍을 이용하여 증폭결과 DFR유전자의 크기는 약 1.4kb에서 PCR산물을 획득하였다. PCR산물에 제한효소 Hpa II 및 Mse I를 이용하여 RFLP분석 결과 차나무 집단간 또는 집단내 차나무간의 유전적 다양성을 보였다. Hpa II 제한효소를 이용한 RFLP 밴드패턴은 3가지 형태로 구분되었으며, 같은 차나무 집단내에서도 유전적 다양성이 나타났다. Mse I 제한효소를 이용한 밴드패턴은 6가지의 형태로 다양성을 보였으며, 웅포집단 차나무의 경우 집단 내 다양성이 2가지 형태로 나타나 같은 집단내에서의 유전적 변이는 적은 것으로 보인다. 본 연구에서 사용한 2가지의 제한효소의 결과 차나무의 집단간 또는 같은 집단내의 차나무간에서 유전적 다양성을 확인할 수 있었다.
미생물 구조 및 집단 구성원의 변화를 배양에 의존하지 않고, 빠르게 평가할 수 있는 방법의 하나인 terminal-restriction fragment length polymorphism (I-RFLP) 분석을 김치 유산균 연구에 적용하여, $15^{\circ}C$ 및 $4^{\circ}C$ 발효 김치에 관여하는 유산균의 다양성과 역동성을 검토하였다. 두 발효온도에서 공통적으로 Leuconostoc mesenteroides, Lc, inhae, Lc. kimchii, Weissella koreensis, W. cibaria, Lactobacillus sakei, Lb. curvatus, Lb. plantarum, Lb. paraplantarum, Lb. pentosus, 및 Lb. brevis의 존재가 예상되었고, Lc. citreum과 Enterococcus faecalis는 각각 $15^{\circ}C$와 $4^{\circ}C$에서 검출되었다. W. koreensis는 중기발효에 우점을 점하였고, Lactobacillus 속은 발효 후기의 우점종으로 나타났다. Lb. sakei, Lb. curvatus는 발효온도에 관계 없이 우점종을 형성하였지만, Lb. plantarum, Lb. paraplantarum, Lb, pentosus와 Lb. brevis의 생육은 저온에서 잘 일어나지 않았다. 몇 종의 Leuconostoc 속 유산균은 발효 후기까지 생장이 유지되었다.
The purpose of this study was to determine the factors related to eating breakfast for middle and high school students in Seoul using the Theory of Planned Behavior. Out of 2,280 questionnaires distributed to 22 schools, 2,060 were returned (90.4% response rate) and 1,899 were analyzed (83.3% analysis rate). Gender, self-perceived household income level and mother's working status were examined as demographic factors. "Attitude", "Subjective norm", "Perceived difficulty in access to breakfast", "Perceived time restriction" and "Self restriction to breakfast" were extracted as psychosocial factors as the results of factor analysis and reliability test using 17 items. In case of middle school students, boys were more likely to skip breakfast than girls. The students perceiving their household income level "low or middle low" were more likely to skip breakfast than those who perceived their household income level "high or middle high". The students whose mother had a job tended to skip breakfast than those whose mother had no job. In case of high school students, the students perceiving their household income level "low or middle low" tended to skip breakfast than those perceiving their household income level "high or middle high". The results of analysis of variance, all the psychosocial factors examined in this study-"Attitude", "Subjective norm", "Perceived difficulty in access to breakfast", "Perceived time restriction" and "Self restriction to breakfast"- were related to the frequencies of eating breakfast during weekdays in both the middle and high school students.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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