The human respiratory tract hosts both pathogenic and commensal bacteria. The development of well-conserved 16S rRNA sequencing and culture-independent techniques has enabled many achievements in the study of the human microbiome. Microbial composition of the respiratory tract in early childhood has been shown to correlate to respiratory health in later stages of life. This review highlights current understandings of respiratory microbiota development in healthy children, examples of microbial interactions, impacts on the host immune system, and the relationship between respiratory tract microbiome and respiratory health.
Jeong, Jea Heon;Moon, Kyoung Hee;Lee, Chang Woo;Choi, Du Young;Oh, Yeun Geun;Yoon, Hyang Suk;Cho, Ji Hyun;Kim, Jong Duck
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.49
no.4
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pp.394-400
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2006
Purpose : This study was design and performed for evaluations of resent clinical pattern of bronchiolitis caused by RSV infection with children under 2 year of age for 5 years, who were admitted to pediatric ward. Methods : The inclusion criteria of the patients were children under 24 month-of-age, clinical manifestations of lower respiratory tract infection, and RSV antigen that was detected by a direct immunofluorescence test from the nasal secretions. The additional laboratory and simple chest X-ray findings were reviewed from the medical records of children who were admitted Wonkwang university hospital from Jan. 1999 to Dec. 2003. Results : In the 5 year study duration, 127 patients were enrolled and outbreak of RSV bronchiolitis took place in 2001. The 80 cases(63 percent) of RSV infection were concentrated in later autumn and winter. Number of the cases show coughing were 120(94.5 percent), but rale was audible in 78 cases(61.4 percent). Dyspnea, wheezing, and intercostal retraction were noticed in 27(21.3 percent), 21(16.5 percent), and 4(3 percent) cases respectively. The most common chest X-ray finding was hyperinflation of the lung that was noticed in 110 cases(86.6 percent). Care with mechanical ventilator for more than 2 days required in 5 cases. Conclusion : Lower respiratory tract infection by RSV was common in late autumn and winter season but year-round infection was noticed. The severity of RSV respiratory tract infectiontakes in some degree a grave course. So we suggest that population-based surveillance of acute respiratory infection due to RSV is necessary for assessment of prevalence and epidemiology of this disease.
Objectives: The aim of this study was to investigate the preventive effects of Sambok-go for upper respiratory tract infection. Methods: Sambok-go was performed to outpatients which had visited Daejeon university oriental medicine hospital. The number of participants who received Sambok-go at least once were 85, 21 patients did not receive Sambok-go three times were excluded first. Participants who received treatment three times were 64 patients. After the 2011 winter, 2012.05 we follow-up by telephone, except eight, 56 patients were analyzed. Sambok-go is composed of 8 kinds of medicinal herbs. Each Sambok-go weighs about 1.1g and attatchment surface diameter is about 1.5 cm. Sambok-go was attached to both side of 폐유(肺兪)(BL13), 심유(心兪)(BL15), 폐유(膈兪)(BL17), patients under the age of 15 were attached for an hour, patients over 15 years age were attatched for 3 hours. Results: Among the finally analyzed 56 participants, we compared the number of flu outbreak during winter before and after treatment. Before treatment measured $6.14{\pm}6.57$, after treatment measured $1.57{\pm}1.14$. In conclusion, the number of flu outbreak was significantly decreased(p<0.001). To investigate the effect of worsening factors on the pre-existing upper respiratory diseases, we checked whether the patients had pre-existing upper respiratory diseases. The patients who already had old upper respiratory diseases were 34. The increase in the frequency of deterioration in 5 patients, 4 patients no change, decreased in 24 cases, one patient was unresponsive. After evaluating the satisfaction of The patients who were treated with the Sambok-Go, the 29 cases were very satisfied, the 23 were satisfied, None of the paitents showed dissatisfaction or bad dissatisfaction. Conclusion: Sambok-go seems to be effective in the prevention of URI. Further studies are recommended to confirm this effect.
Nontuberculous mycobacteria (NTM) are a major cause of opportunistic infections in immunocompromised patients, making the reliable and rapid identification of NTM to the species level very important for the treatment of such patients. Therefore, this study evaluated the usefulness of the novel target genes tuf and tmRNA for the identification of NTM to the species level, using a PCRrestriction fragment length polymorphism analysis (PRA). A total of 44 reference strains and 17 clinical isolates of the genus Mycobacterium were used. The 741 bp or 744 bp tuf genes were amplified, restricted with two restriction enzymes (HaeIII/MboI), and sequenced. The tuf gene-PRA patterns were compared with those for the tmRNA (AvaII), hsp65 (HaeIII/HphI), rpoB (MspI/HaeIII), and 16S rRNA (HaeIII) genes. For the reference strains, the tuf gene-PRA yielded 43 HaeIII patterns, of which 35 (81.4%) showed unique patterns on the species level, whereas the tmRNA, hsp65, rpoB, and 16S rRNA-PRAs only showed 10 (23.3%), 32 (74.4%), 19 (44.2%), and 3 (7%) unique patterns after single digestion, respectively. The tuf gene-PRA produced a clear distinction between closely related NTM species, such as M. abscessus (557-84-58) and M. chelonae (477-84-80-58), and M. kansasii (141-136-80-63-58-54-51) and M. gastri (141-136-117-80-58-51). No difference was observed between the tuf-PRA patterns for the reference strains and clinical isolates. Thus, a diagnostic algorithm using a tuf gene-targeting PRA is a promising tool with more advantages than the previously used hsp65, rpoB, and 16S rRNA genes for the identification of NTM to the species level.
Han, Young Ik;Choi, Ji Yeon;Lee, Hyewon;Lee, Teak-Jin
Pediatric Infection and Vaccine
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v.21
no.2
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pp.114-120
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2014
Purpose: The objective of this study was to assess and investigate the epidemiology of pertussis in infants under 6 months of age. Methods: A prospective study was conducted between October 1, 2011 and April 30, 2013 in CHA Bundang Medical Center, Seongnam, South Korea. Polymerase chain reaction (PCR) or culture was used to detect Bordetella pertussis in nasopharyngeal aspirates from case patients who were hospitalized for acute lower respiratory tract infection (LRTI). In addition, multiplex real-time PCR assays were also performed to detect 6 etiologic viruses, including adenovirus, human metapeumo-virus, influenza virus, parainfluenza virus, respiratory syncytial virus and rhinovirus. Results: Of the 79 enrolled case patients, whose median age was 2 months of age, the most common diagnoses uncovered in this study were acute bronchiolitis (60%) and pneumonia (28%). B. pertussis infection was found in 13 cases (16%), in which 7 (53%) was coinfected with respiratory syncytial virus and 1 (7%) with influenza A virus. Of the 13 patients with B. pertussis infection, 6 (46%) were not vaccinated with the diphtheria, tetanus toxoid, and acellular pertussis vaccine, while 6 (46%) received 1 dose, and 1 (8%) received 2 doses. Conclusion: B. pertussis infection was present in 16% of under 6 month-old infants, who were hospitalized for acute LRTI. Therefore, a nationwide epidemiological surveillance of pertussis, including institutions that cater to infants under 6 months of age is necessary and needed.
Ahn, Jung Min;Choi, Seong Yeol;Kim, Dong Soo;Kim, Ki Hwan
Pediatric Infection and Vaccine
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v.20
no.1
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pp.28-35
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2013
Purpose : The aim of this study was to determine the frequency, epidemiology and the clinical manifestation of human metapneumovirus (hMPV) infection in Korean children. Methods : From February 2010 to January 2012, we collected nasopharyngeal aspiration from 1,554 children who were hospitalized for acute lower respiratory tract infections at the Department of Pediatrics, Severance Children's Hospital. hMPV was detected by performing reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). The medical records of the patients with positive results were retrospectively reviewed. Results : We detected hMPV in 99 of the 1,554 hospitalized children. The mean age of the hMPV infected children was 25 months, and 87% of the illnesses occurred between April and June. The most common diagnoses were pneumonia (73%) and bronchiolitis (16%). The clinical manifestations included cough, fever, respiratory distress, hoarseness, tachypnea, and wheezing. Coinfection with other respiratory viruses was found in 43 children (43%). Conclusion : hMPV is one of the major virus causing acute respiratory tract infection in the age between 13 months and 48 months old with peaks during April to June. Reports of hMPV in Korea has been increasing but additional studies are required to define the epidemiology and the extent of disease caused by hMPV to determine future development of this illness in Korean children.
Hong, Ki Bae;Shin, Youn Shim;Roh, Eui-Jung;Chung, Eun Hee
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.51
no.7
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pp.729-735
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2008
Purpose : Chlamydia trachomatis is one of the most common sexually transmitted diseases and is also a cause of pneumonia in infants. Respiratory infections by respiratory viruses are also common for infants. The objectives of this study were to identify the clinical manifestations and to determine the prevalence of C. trachomatis respiratory infections and coinfections by respiratory viruses in infants younger than 6 months of age. Methods : For this study, we enrolled 6 months or younger infants who were admitted to the Dankook University Hospital between January 2002 and July 2007, with respiratory symptoms. Nasopharyngeal aspirates or throat swabs were collected within s d of hospitalization and C. trachomatis was detected using polymerase chain reaction (PCR). Patients who tested positive underwent multiplex PCR for respiratory viruses. Results : A total of 690 patients underwent chlamydial PCR testing and 36 (5.2%) had positive results. Of the 36, 28 (78%) were male; 30 were vaginally delivered. From the 36 patients positive for C. trachomatis, 26 underwent multiplex respiratory viral PCR; 12 were coinfected with viruses. Respiratory syncytial virus (RSV) was the most frequent pathogen that was detected in 6 patients. Increased C-reactive protein and fever were significant in patients coinfected with respiratory viruses. Conclusion : C. trachomatis can infected in infants delivered by cesarean section as well as in 6 months old or younger infants. Infant with C. trachomatis respiratory infections can also be coinfected with respiratory infection also coinfected with respiratory viruses. Further studies are needed to better understand the prevalence rates of the this infection and its coinfection rate with respiratory viruses.
Purpose : To identify clinical characteristics of severe respiratory syncytial virus (RSV) in neonatal period and early infancy and provide information in clinical practice. Methods : Twelve neonates and young infants (<6 months) who were infected by respiratory syncytial virus and required mechanical ventilation between March 2005 and July 2007 were enrolled. Diagnosis of RSV infection was made based on the positive results by rapid antigen immunoassay or polymerase chain reaction. Results : There were four premature infants, of whom three were near-term. Birth weight of subject patients was $2.8{\pm}0.6kg$, gestational age was $37{\pm}2weeks$ and the age at the time of admission was $35{\pm}15days$. Nine of them showed apnea and in five patients, apnea itself was an indication for mechanical ventilation. In seven of the apneic patients, apnea was the first manifestation of RSV infection. In three of these seven apneic patients, apnea preceded definite respiratory distress signs or typical stethoscopic findings by 1-3 days. Mean duration of mechanical ventilation was $3{\pm}2days$, and mean duration of stay in intensive care unit was $6{\pm}2days$. Conclusion : RSV is a major cause of severe respiratory tract infection in term or near-term infant younger than 2 months. For apnea could be the first manifestation of the RSV infection, high level of suspicion is required in practice of neonates or young infants who show any upper respiratory infection symptoms during RSV season.
Cho, Kyung-Soon;Park, Sun-Mee;Kim, Seang-Joon;Jung, Myung-Ju;Lee, Joo-Yeon;Kang, Chun
Korean Journal of Microbiology
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v.43
no.3
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pp.173-178
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2007
The occurrence of acute respiratory infections caused by the influenza virus are particularly high during the winter season in Busan, Korea. In 2004 and 2005, a study of the rate of occurrences of the influenza virus was conducted. The results reveal that in 2004, of the 1,869 people with an acute respiratory infection that 154 (8.2%) people were infected by the influenza virus. In 2005, of the 1,579 people infected with an acute respiratory infection that 19 people (1.2%) were infected with the influenza virus. The study shows a decrease in the numbers of an influenza virus infection from 2004 to 2005. Data was collected by inspecting throat swabs and nasal discharge from those with an acute respiratory infection. Further inspection of the throat swab and nasal discharge from the infected individuals during 2004 and 2005 study show the occurrence of the different types of influenza virus in the population: 6 cases (3.5%) of influenza type A/H1N1, 129 cases (74.5%) of A/H3N2, and 38 cases (22.0%) of type B. The study conducted in 2004 and 2005 reveal that children between the ages of two and five were more likely to be infected than any other age group. In the study, about 62.2% of the infected individuals were between two and five years old. The detection rates between males and females are similar. However, it is notable that females are slightly more likely to develop an acute respiratory infection caused by the influence virus compared to their male counterparts.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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