• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제32권3호
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• pp.333-340
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• 2022

Leuconostoc has been used as a principal starter in natural kimchi fermentation, but limited research has been conducted on its phages. In this study, prophage distribution and characterization in kimchi-derived Leuconostoc strains were investigated, and phage induction was performed. Except for one strain, 16 Leuconostoc strains had at least one prophage region with questionable and incomplete regions, which comprised 0.5-6.0% of the bacterial genome. Based on major capsid protein analysis, ten intact prophages and an induced incomplete prophage of Leu. lactis CBA3626 belonged to the Siphoviridae family and were similar to Lc-Nu-like, sha1-like, phiMH1-like, and TPA_asm groups. Bacterial immunology genes, such as superinfection exclusion proteins and methylase, were found on several prophages. One prophage of Leu. lactis CBA3626 was induced using mitomycin C and was confirmed as belonging to the Siphoviridae family. Homology of the induced prophage with 21 reported prophages was not high (< 4%), and 47% identity was confirmed only with TPA_asm from Siphoviridae sp. isolate ct3pk4. Therefore, it is suggested that Leuconostoc from kimchi had diverse prophages with less than 6% genome proportion and some immunological genes. Interestingly, the induced prophage was very different from the reported prophages of other Leuconostoc species.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제18권3호
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• pp.215-220
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• 1990

L.casei YIT 9018균주에 N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine을 처리하여 thermoinducible mutants를 분리하였고, 이 균주를 $42^{\circ}C$에서 30분 동안 열처리하여 prophage가 cured된 균주 L.casei HYM 1213과 L.casei HYM 4024를 분리하였다. Prophage cured strain L.case HYM 1213과 L.casei HYM 4024는 temperate phage $\phi$Fsw에 대해 지시균으로서 능력을 가지고 있었으며, 어떤 온도에서도 temperate phage $\phi$FSW가 검출되지 않았다. 이들의 생리적 특성을 모균주인 L.caseiYIT 9018과 비교한 결과 L.casei HYM 1213 균주는 균의 증식, pH변화, 산생성능력, 당 발효능력에서 모균주와 유사한 것으로 나타났으나, L.casei HYM 4024균주는 pH변화와 산생성능력이 모균주에 비해 미약한 것으로 나타났다. Plasmid DNA는 두 균주 모두 모균주와 동일한 size를 보여주여, prophage가 cured되었어도 plasmid DNA에는 손실을 가져오지 않았음을 알 수 있었다.

• KSBB Journal
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• 제10권5호
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• pp.575-581
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• 1995

Plasmid pTTY2에 의한 competent cell(P90c/$\phi$ 434)의 형질전환에 의하여 lipase를 생성하는 재조합 대장균(P90c/따434/pTTY2)을 합성하였다. Li pase 활성 조사를 위한 LAT plate, Rhodamine B plate를 이용한 실험에서 P90c/$\phi$434의 경우 halo 형성이 없었고, P90c/$\phi$434/pTTY2의 경우 용해시 켜 얻은 상등액과 용해되지 않은 미생물을 물리적으 로 깨 서 얻은 상등액 모두 halo를 형성하였다. P90c/$\phi$434/pTTY2에 대한 IPTG 유도시점, 유도 시간이 $\phi$434에 의한 미생물 용해에 미치는 영향을 살펴 봄으로써 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 재조합 대장균의 효과적인 용해는 ODGOO 0.5 ~ 2 2.5인 초기 exponential growth phase에서 IPTG 로 유도한 후, mitomycin C 첨가나 uv조사에 의 해 이루어진다. 2. 재조합 대장균의 용해는 IPTG 유도시간이 1 시간일 때 가장 효과적이었으며, 이후 유도시간이 증가할수록 감소하여 유도시간이 4시간일 때는 세포 용해가 이루어지지 않는다. 3. 실험한 범위에서 uv조사보다 mitomycin C 첨가가 세포 용해에 더 효과적이다. 본 연구결과가 대규모의 생물공학 생산물의 정제 에 응용되기 위해서는 고농도 세포에서의 세포용해 에 대한 연구가 펼요한 것으로 판단된다.

• 방사선산업학회지
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• 제7권2_3호
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• pp.109-113
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• 2013

In a previous study, a relatively high dose of gamma radiation (1 kGy) did not fully induce typical SOS genes such as sulA, recA, recN, and din in Salmonella Typhimurium (S. Typhimurium) (Lim et al. 2008, Gene expression profiles following high-dose exposure to gamma radiation in Salmonella enterica serovar Typhimuium. J. Radiat. Ind. 3:111-119). In this study, we examined changes in the transcriptional repertoire of S. Typhimurium after a dose of 10 Gy using DNA microarrays. It was found that more than half (~65%) of the 26 up-regulated genes belong to the SOS regulon: ten genes are typical SOS genes, and seven genes are Salmonella prophage genes, which are known to be activated by LexA cleavage. Among 29 down-regulated genes, the function of five genes with the most decreased expression is associated with carbohydrate transport and energy production. This suggests that upon exposure to gamma radiation cells may cease growing by reducing the metabolic activity, and repair DNA damage using a DNA repair system such as the SOS response system. The difference in expression of the SOS genes between a high (1 kGy) and low (10 Gy) dose of radiation shows the possibility that cells may opt for one of multiple regulatory circuits in response to the specific gamma radiation dose.