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Comparative genomic hybridization 기법을 이용한 인체 구강암의 유전자 변화에 대한 연구 (GENETIC ALTERATIONS OF HUMAN ORAL CANCERS USING COMPARATIVE GENOMIC HYBRIDIZATION)

  • 이명렬;심광섭;이영수;우순섭;공구
    • Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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    • 제26권3호
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    • pp.245-253
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    • 2000
  • The development and progression of oral cancer is associated with an accumulation of multiple genetic alterations through the multistep processes. Comparative genomic hybridization(CGH), newly developed cytogenetic and molecular biologic technique, has been widely accepted as a useful method to allow the detection of genetic imbalance in solid tumors and the screening for chromosome sites frequently affected by gains or losses in DNA copy number. The authors examined 19 primary oral squamous cell carcinomas using CGH to identify altered chromosome regions that might contain novel oncogenes and tumor suppressor genes. Interrelationship between these genetic aberrations detected and major oncogenes and tumor suppressor genes previously recognized in carcinogenesis of oral cancers was studied. 1. Changes in DNA copy number were detected in 14 of 19 oral cancers (78.9%, mean: 5.58, range: $3{\sim}13$). High level amplification was present in 4 cases at 9p23, $12p21.1{\sim}q13.1$, 3q and $8q24{\sim}24.3$. Fourteen cases(78.9%, mean: 3.00, range: $1{\sim}8$) showed gains of DNA copy number and 12 cases(70.5%, mean: 2.58, range: $1{\sim}9$) revealed losses of DNA copy number. 2. The most common gains were detected on 3q(52.6%), 5p(21.0%), 8q(21.0%), 9p(21.0%), and 11q(21.0%). The losses of DNA copy number were frequently occurred at 9p(36.8%), 17q(36.8%), 13q(26.3%), 4p(21.0%) and 9p(21.0%). 3. The minimal common regions of gains were repeatedly observed at $3q24{\sim}26.7$, $3q27{\sim}29$, $1q22{\sim}31$, $5p12{\sim}13.3$, $8q23{\sim}24$, and 11q13.1-13.3. The minimal common regions of losses were detected at $9q11{\sim}21.3$, 17p31, $13q22{\sim}34$, and 14p16. 4. In comparison of CGH results with tumor stages, the lower stage group showed more frequent gain at 3q, 5q, 9p, and 14q, whereas gains at 1q($1q22{\sim}31$) and 11q($11q13.1{\sim}13.3$) were mainly detected in higher stage group. The loss at $13q22{\sim}34$ was exclusively detected in higher stage. The results indicate that the most frequent genetic alterations in the development of oral cancers were gains at $3q24{\sim}26.3$, $1q22{\sim}31$, and $5p12{\sim}13.3$ and losses at $9q11{\sim}21.3$, 17p31, and 13q. It is suggested that genetic alterations manifested as gains at $3q24{\sim}26.3$, $3q27{\sim}29$, $5p12{\sim}13.3$ and 5p are associated with the early progression of oral cancer. Gains at $1q22{\sim}31$ and $11q13.1{\sim}13.3$ and loss at 13q22-34 could be involved in the late progression of oral cancers.

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이동적응망에서 데이터 일관성 보장을 위한 주사본 기반 데이터 중복 기법 (Primary Copy based Data Replication Scheme for Ensuring Data Consistency in Mobile Ad-hoc Networks)

  • 문애경
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2005년도 가을 학술발표논문집 Vol.32 No.2 (1)
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    • pp.334-336
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    • 2005
  • 이동적응망(MANET: Mobile Ad-hoc Network)은 네트워크 하부 구조를 필요로 하지 않은 무선 단말들로 구성된 네트워크이다. 이러한 특성은 네트워크 단절 가능성을 높게 하기 때문에 이동단말들의 데이터 액세스률이 낮아지게 된다는 문제점을 갖는다. 이를 해결하기 위하여 이동 노드들은 데이터의 중복사본을 갖는다. 이동 노드가 갖는 중복사본은 데이터 일관성을 유지하기 위하여 별도의 중복관리 기법이 필요하다. 하지만 MANET을 구성하는 이동 노드들은 일반적으로 제한된 전력을 가지고 있고 단절될 가능성이 높기 때문에 중복 사본의 일관성 보장은 어려운 문제로 지적되고 있다. 기존에 제안된 MANET에서의 데이터 중복관리 기법은 데이터 액세스 빈도수를 계산하여 액세스률을 높이는 방법에 주안점을 두고 있고 갱신 데이터의 일관성 보장은 그 어려움 때문에 주로 판독 연산만 고려하였다. 갱신 트랜잭션을 지원하는 경우 대부분 높은 통신비용을 이유로 데이터 일관성을 보장하지 않는다. 또한 이동 노드가 다수의 서버를 통해서 갱신 연산을 실행하기 때문에 통신 오버헤드로 인하여 전력소모가 크다. 본 논문에서는 주사본 노드를 통하여 갱신을 가능하게 함으로써 데이터 일관성을 유지할 수 있는 데이터 중복 기법을 제안한다. 제안된 기법은 이동 노드들의 에너지 특성을 고려하여 더 않은 에너지를 가진 노드에게 갱신 전파 및 일관성 유지를 의뢰함으로써 상대적으로 낮은 에너지를 갖는 이동 노드의 에너지 효율을 고려하였다.

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Spray type과 Soot type 입자발생기별 나노입자 개수농도분포 측정특성 비교 (Comparison on Nano-particle Number Measurement Characteristics for Different Particle Generators between Spray type and Soot Type)

  • 김민식;권지원;정명철;이진욱
    • 한국분무공학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.185-191
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    • 2012
  • Particulate matters (PM) that is generated by most diesel engine is regulated by the mass concentration measured by the conventional method it had been. Recently, Europe PMP (Particle Measurement Program) decided to start the regulation of vehicle's nano-sized particle number (PN) from the year of 2011 because of nano-particle's higher degree of harm to the human body. So firstly, the standard level of PN emission is introduced in the Euro 5/6 emissions regulation with a limit of $6{\times}10^{11}$ per km for light duty vehicle. Also KPMP(Korea Particle Measurement Program) was organized to copy quickly international technical trend. In this paper, it was investigated the nano-sized PN measurement characteristics for different particle generators between spray type and soot type. And the difference ratio between particle generators, the characteristic of PN concentration, counting efficiency and linearity was analyzed. Then, we make conclusions as followed. When particle diameter is increased, counting efficiency of two generators is decreased. Also Secondary calibration method is more higher 3% than Primary calibration method. Finally, SOF which is included in soot particles is not totally removed so it have great influence on test result of counting efficiency and linearity.

Aspergillus nidulans의 무성포자를 이용한 PCR 조건의 최적화 (Optimization of PCR Condition with Conidiospore for Primary Screening of Aspergillus nidulans Transformants)

  • 박희문;박범찬;박윤희;양소영
    • 미생물학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.103-106
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    • 2002
  • 사상균류의 세포자체로부터 직접 PCR을 하는 방법은 세포벽 파괴의 어려움 때문에 모든 곰팡이에 적용될 수 없다. 극초단파 조사는 사상균류의 DNA를 추출함에 있어서 그 유용함이 이미 검중된 바 있는데, 본 논문에서는 극초단파 조사를 이용하여 Aspergillus nidulans의 포자로부터 손쉽게 주형 DNA를 얻어 PCR증폭하는 방법을 소개하고자 한다. 본 실험에서는 극초단파 조사시간과 PCR에 필요한 주형 DNA의 양 등을 최적화하였으며, 이렇게 수행된 PCR결과는 single copy유전자를 대상으로도 약 3 kb크기의 산물가지 증폭 가능하여, 형질전환체를 선별하기에 충분한 크기의 산물들도 효과적으로 얻어짐을 보여주었다. 따라서 이 방법은A. nidulans의 형질전환체를 보다 손쉽게, 시간을 절약하여 선별할 수 있는 효과적인 방법이라 생각된다.

교육용 기록정보콘텐츠 개발 절차에 관한 연구 (A Study on developing procedures of an archival contents for education)

  • 이은영
    • 기록학연구
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    • 제29호
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    • pp.129-173
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    • 2011
  • 교육과정에 기반한 교육용 기록정보콘텐츠는 역사적 사고력 함양에 가장 효과적인 교수 학습 도구라 할 수 있다. 본 논문은 교육용 기록정보콘텐츠의 개발 방법론을 제안함으로써 국립 기관인 국가기록원이 본격적인 교육용 기록정보콘텐츠 서비스를 제공함에 있어 이론적 지침이 되고자 하였다. 본 논문에서 제안한 교육용 기록정보콘텐츠의 개발 절차는 e-러닝 콘텐츠의 개발 단계인 '기획-분석-설계-개발-평가'의 단계를 거친다. 구체적으로는 교육용 기록정보콘텐츠로서의 특성을 띤 교육과정 분석과 컬렉션 분석, 교수 학습 목표를 효과적으로 달성할 수 있는 구조화된 형태로 설계하기 위한 세부 단계를 거친다. 교육과정 분석에선 일차 사료를 활용한 학습이 가능한 주제 항목을 설정하고 이를 검색을 위한 키워드로 도출하는 절차와 일차 사료별 교수 학습 활동에 적용할 수 있는 교수 학습 방법을 분석하였다. 컬렉션 분석에선 키워드별로 기록 검색을 실시한 뒤 일차 사료의 선별 기준에 따라 최종적인 기록을 선정하는 과정을 제안하였다. 분석의 결과를 토대로 설계 단계에서는 콘텐츠의 제목 및 내용 구조를 결정하고, 학습 흐름도를 기반으로 스토리보드를 작성하여야 한다. 개발 시엔 일차 사료의 질감을 원본에 최대한 가깝게 제작하는 것이 핵심이며, 평가 단계에선 콘텐츠의 교수 학습 내용이 학습 목표를 효과적으로 성취할 수 있도록 개발되었는지를 평가하고 실제 콘텐츠 서비스 운영 후 이용자 만족도 조사에 의한 평가 결과를 새로운 콘텐츠 개발이나 콘텐츠 업데이트에 반영하도록 하였다.

변형된 면적기반영역선별 기법에 의한 문자영상분할 (Handwritten Image Segmentation by the Modified Area-based Region Selection Technique)

  • 황재호
    • 대한전자공학회논문지SP
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    • 제43권5호
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    • pp.30-36
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    • 2006
  • 변형된 면적기반영역선별 기법으로 문자영상 속에 내재되어 있던 영역 분할을 회복하는 새로운 기법을 제안한다. 정보영역과 바탕영역으로 양분되어 있는 이진 원영상에 비해 오염 및 훼손으로 관측영상은 얼룩점과 잡음이 전체 영상에 섞여 다수의 크고 작은 영역들이 혼재된 그레이스케일 형태가 된다. 이러한 영상을 종래의 문턱치 처리나 확률적 기법으로 영역 분할하려면 이진영상으로 전환시킴에 의한 영역 형태 변형 문제가 발생한다. 이 문제를 최소화하기 위해 마름모꼴 블록을 채택한 반복조건부양식(iterated conditional mode, ICM) 기법으로 이진 영상을 구현하여 일차적으로 영역들의 집합으로 분류하였다. 그 다음 현재고려중인 화소에서 화소의 영역형성 판별과 영역의 면적을 산출하였다. 이를 전체 화소에 걸쳐 순차적으로 확산하여 해당영역들의 정보영역으로의 귀속 여부를 선택적으로 판정 분할함으로 정보영역 본래 형태를 복원하였다. 이 때 지정 영역들의 산출 면적들은 하나의 집합으로 배속 정렬되며 확률처리로 얻은 판별 파라미터 값에 의해 선별된다. 그레이스케일 탁본영상을 대상으로 종래의 문턱치 영역분할 기법과 ICM 기법도 함께 실험하였다. 그 결과 종래의 기법에 비해 우수한 영역분할 효과를 얻을 수 있었다.

트랜잭션 캐쉬 일관성을 유지하기 위한 지연 로킹 기법의 성능 평가 (Performance Evaluation of Deferrd Locking for Maintaining Transactional Cache Consistency)

  • 권혁민
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제7권8호
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    • pp.2310-2326
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    • 2000
  • 데이터전송(data-shipping)모델에 근간을 둔 클라이언트-서버(client-server)DBMS는 트랜잭션간 캐슁(inter-transaction caching)을 허용함에 의해 클라이언트의 자원을 효율적으로 이용할 수 있다. 그거나 트랜잭션간 캐슁을 허용하면 각 클라이언트는 데이터베이스의 일부분을 동적으로 캐슁할 수 있기 때문에 트랜잭션 캐쉬 일관성 유지(transactional cache consistency maintenance : TCCM)기법의 필요성을 야기한다. 지연 로킹(deferred locking: DL)기법은 주사본 로킹 기법에 근간을 둔 새로운 검사기반의 TCCM 기법이다. DL에서는 클라이언트에 캐슁된 데이터의 유효성 검사를 위한 메시지 부담을 줄이기 위하여 다수의 로크 요청과 데이터전송 요청을 단일 메시지로 구성하였다. 모의실험을 통하여, DL 기법과 검사기반기법중 가장 대표적인 적응적 낙관적 동시성 제어 기법과 캐슁 두단계 로킹 기법과의 성능을 비교하였다. DL 기법은 다른 검사기반 기법과 비교하여 적당한 수준의 트랜잭션 철회율을 보이며 성능도 우수하다.

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탄소나노튜브를 활용한 에너지 저장 소자에 관한 연구 (The research regarding the energy storage device which applies the carbon nanotube)

  • 김도환;강순덕
    • 정보학연구
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    • 제10권2호
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    • pp.37-45
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    • 2007
  • The multiple-ability which the structure and the physical properties which the carbon or scull tube are unique show the applicability is superior in the plane indication element which is an indispensability of information communications apparatus, the stubbornness memory element, 2nd change of air and the rough copy dosage [khay] plaque seater, the hydrogen store material and the chemical sensor back and it has the possibility which will pass over the limit which the element of existing has. from the present paper it compared in the steel and only 10 the boat it did and it analyzed against an energy storage space voluntary application and developmental apply the carbon or scull tube trend in order about under researching the effective energy storage element it could be appeared, the technique of the strong carbon nano tube. 1. The hazard which embodies the energy storage element which uses the carbon or scull tube it follows in the function which stands and CNT of the structure which is various is necessary. 2. CNT fabrications of each one must precede possible not only must be each Cabinet conference circumstances quality gain and loss. 3. The structural control of syntheses, length controls, diameter controls and the metal - CNT junction control backs of quality CNT must precede. Applies the hereafter carbon or the scull tube in the various element with the primary preceding base technique for the structural plan technique of the carbon or scull tube to be certainly established, it does, secondarily the various element functional control technique which uses the carbon or scull tube is researched and will do.

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Genomic Alteration of Bisphenol A Treatment in the Testis of Mice

  • Kim, Seung-Jun;Park, Hye-Won;Youn, Jong-Pil;Ha, Jung-Mi;An, Yu-Ri;Lee, Chang-Hyeon;Oh, Moon-Ju;Oh, Jung-Hwa;Yoon, Seok-Joo;Hwang, Seung-Yong
    • Molecular & Cellular Toxicology
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    • 제5권3호
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    • pp.216-221
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    • 2009
  • Bisphenol A (BPA) is commonly used in the production of pharmaceutical, industrial, and housing epoxy, as well as polycarbonate plastics. Owing to its extensive use, BPA can contaminate the environment either directly or through derivatives of these products. BPA has been classified as an endocrine disruptor chemicals (EDCs), and the primary toxicity of these EDCs in males involves the induction of reproductive system abnormality. First, in order to evaluate the direct effects on the Y chromosome associated with reproduction, we evaluated Y chromosome abnormalities using a Y chromosome microdeletion detection kit. However, we detected no Yq abnormality as the result of BPA exposure. Secondly, we performed high-density oligonucleotide array-based comparative genome hybridization (CGH) to assess genomic alteration as a component of our toxicity assessment. The results of our data analysis revealed some changes in copy number. Seven observed features were gains or losses in chromosomal DNA (P-value<1.0e-5, average log2 ratio>0.2). Interestingly, 21 probes of chr7:7312289-10272836 (qA1-qA2 in cytoband) were a commonly observed amplification (P-value 3.69e-10). Another region, chr14:4551029-10397399, was also commonly amplified (P-value 2.93e-12, average of log2 ratios in segment>0.3786). These regions include many genes associated with pheromone response, transcription, and signal transduction using ArrayToKegg software. These results help us to understand the molecular mechanisms underlying the reproductive effects induced by BPA.

Zinc finger RING-H2 protein관련 Ac/Ds전이인자 삽입 변이체 Oszinc626 유전자의 특성 분석 (Characterization of Oszinc626, knock-out in zinc finger RING-H2 protein gene, in Ac/Ds mutant lines of rice(Oryza sativar L.))

  • 박슬아;정유진;안병옥;윤도원;지현소;박용환;은무영;서석철;이순열;이명철
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제35권3호
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    • pp.177-183
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    • 2008
  • 본 연구는 동진벼 유래의 Ac/Ds 삽입변이집단의 GUS 분석을 통하여 뿌리 및 미숙종자에서 강하게 GUS가 발현한 개체를 선발하여 FST(flanking sequence tag) 분석 한 결과 Ds 전이 인자가 3번 염색체 zinc finger RING-H2 관련 Oszinc626 유전자의 첫 번째 exon 부위에 single copy로 삽입되어 있었으며, 선발변이체는 뿌리 및 종자 발달이 정상인 동진벼에 비해 매우 낮은 것으로 나타났다. Oszinc626 유전자는 RING-H2 type(C3-H2-C3)으로 $Cys-X_2-Cys-X_{28}-Cys-X-His-X_2-His-X_2-Cys-X_{14}-Cys-X_2-Cys$ 배열이 C-terminus 가장 말단에 위치하며, 49 kDa의 분자량을 가지고 있다. 또한 Southern blot 분석에서 Oszinc626 유전자는 벼 게놈상에 single copy로 존재하였다. RT-PCR을 통한 돌연변이 유전자의 발현분석 결과 250 mM의 염과, $4^{\circ}C$ 저온등과 같은abiotic stress에 의해 발현이 증가함을 보였고, 호르몬처리에 있어서 ABA와 IAA의 식물호르몬을 처리했을 경우 24시간까지 계속해서 발현양이 증가하는 것을 보이는 반면, 2,4-D 처리의 경우 30분 후에 발현이 일시적으로 증가되었으나 이후 발현이 급속히 감소한 것을 보였다. 벼의 조직 별 발현 검정에서 미성숙한 종자, 뿌리 분열조직 및 신초 등 주로 생장점 부위에서 강하게 발현되는 것을 보임에 따라 Oszinc626 유전자의 경우 식물의 생장에 관여하는 주동 유전자의 하나로 판단된다.