• 제목/요약/키워드: pedigree information

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Genealogical Relationship between Pedigree and Microsatellite Information and Analysis of Genetic Structure of a Highly Inbred Japanese Black Cattle Strain

  • Sasazaki, S.;Honda, T.;Fukushima, M.;Oyama, K.;Mannen, H.;Mukai, F.;Tsuji, S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권10호
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    • pp.1355-1359
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    • 2004
  • Japanese Black cattle of Hyogo prefecture (Tajima strain) are famous for its ability to produce high-quality meat and have been maintained as a closed system for more than 80 years. In order to assess the usefulness of microsatellite markers in closed cattle populations, and evaluate the genetic structure of the Tajima strain, we analyzed representative dams of the Tajima strain comprised of the substrains Nakadoi and Kinosaki. Genetic variability analyses indicated low genetic diversity in the Tajima strain. In addition, a recent genetic bottleneck, which could be accounted for by the high level of inbreeding, was detected in both substrains. In phylogenetic analyses, relationship coefficients and genetic distances between individuals were calculated using pedigree and microsatellite information. Two phylogenetic trees were constructed from microsatellite and pedigree information using the UPGMA method. Both trees illustrated that most individuals were distinguished clearly on the basis of the two substrains, although in the microsatellite tree some individuals appeared in clusters of different substrains. Comparing the two phylogenetic trees revealed good consistency between the microsatellite analysis tree and the pedigree information. The correlation coefficient between genetic distances derived from microsatellite and pedigree information was 0.686 with a high significance level (p<0.001). These results indicated that microsatellite information may provide data substantially equivalent to pedigree information even in unusually inbred herds of cattle, and suggested that microsatellite markers may be useful in revealing genetic structure without accurate or complete pedigree nformation. Japanese Black cattle of Hyogo prefecture (Tajima strain) are famous for its ability to produce high-quality meat and have been maintained as a closed system for more than 80 years. In order to assess the usefulness of microsatellite markers in closed cattle populations, and evaluate the genetic structure of the Tajima strain, we analyzed representative dams of the Tajima strain comprised of the substrains Nakadoi and Kinosaki. Genetic variability analyses indicated low genetic diversity in the Tajima strain. In addition, a recent genetic bottleneck, which could be accounted for by the high level of inbreeding, was detected in both substrains. In phylogenetic analyses, relationship coefficients and genetic distances between individuals were calculated using pedigree and microsatellite information. Two phylogenetic trees were constructed from microsatellite and pedigree information using the UPGMA method. Both trees illustrated that most individuals were distinguished clearly on the basis of the two substrains, although in the microsatellite tree some individuals appeared in clusters of different substrains. Comparing the two phylogenetic trees revealed good consistency between the microsatellite analysis tree and the pedigree information. The correlation coefficient between genetic distances derived from microsatellite and pedigree information was 0.686 with a high significance level (p<0.001). These results indicated that microsatellite information may provide data substantially equivalent to pedigree information even in unusually inbred herds of cattle, and suggested that microsatellite markers may be useful in revealing genetic structure without accurate or complete pedigree information.

순물류와 역물류 관리에 적합한 RFID 기반의 G-Pedigree 시스템과 G-code 체계 개발 (G-Pedigree and G-code System of RFID-based Development for Forward & Reverse Logistics Management)

  • 황보현;윤종호;최명렬
    • 정보통신설비학회논문지
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    • 제9권3호
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    • pp.112-118
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    • 2010
  • This paper propose G-code and G-Pedigree system that are development based on the e-Pedigree and EPC, and RFID solutions for logistics management is proposed. The proposed G-Pedigree system to include the forward logistics and reverse logistics all logistics and management systems are appropriate for the event, with security features, security and accessibility of critical data was strengthened. The proposed G-code systems and the EPC code of the existing RFID readers, tags can be applied to, the more you can manage the logistics-related information.

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제약산업에서의 위조의약품 방지를 위한 전자계보(e-Pedigree) 도입에 관한 연구 (A Study on Introduction of e-Pedigree for eradicating Counterfeit Drugs in Pharmaceutical Industry)

  • 남궁광;최용정
    • 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
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    • 한국컴퓨터정보학회 2012년도 제45차 동계학술발표논문집 20권1호
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    • pp.51-54
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    • 2012
  • 전 세계적으로 유통되고 있는 가짜의약품으로 인하여 제약사들은 판매수익과 기업브랜드 이미지에 큰 피해를 입고 있으며 가짜 의약품을 복용한 소비자들은 생명에 위협을 받고 있는 실정이다. 이러한 가짜의약품의 유통을 근절시키기 위하여 세계 각국에서는 의약품의 생산에서부터 소비자에게 판매될 때까지, 즉 의약품 유통과정을 추적하여 가시성있는 이력관리를 할 수 있도록 RFID 및 barcode 등 IT기반의 e-Pedigree(electronic pedigree)를 법제화시키고 있지만 구체적이고 실질적인 구축방법이 제시되지 못하고 있다. 따라서 본 연구는 국내 제약산업의 유통합리화와 소비자 안전성을 제고시키기 위하여 RFID 기반의e-Pedigree 적용방안을 제시하는데 그 목적이 있고 더 나아가 세계 각 국가의 e-Pedigree 구축을 위한 참조모델 개발에 일조하고자 한다.

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콜드체인에서 입증성 향상을 위한 Pedigree 시스템 설계 (Pedigree System Design for Improving Authenticity in Cold-chain)

  • 엄지인;김기홍;홍봉희
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2009년도 춘계학술발표대회
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    • pp.766-769
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    • 2009
  • 콜드체인은 생산지로부터 소비지까지 저온상태로 상품을 신선하게 유지하여 안전하게 소비자에게 공급하는 것을 목적으로 한다. 그러나 유통 중 저온 유지가 안될 경우가 발생하고 이에 따라 변질된 상품을 소비자가 구매할 수 있다. 그러므로 소비자는 냉장 유통과정에 대해 입증할 수 있는 정보를 제공받기를 원한다. 따라서 본 논문에서 제안하는 Pedigree 시스템은 콜드체인 상품을 주고 받을 때 거래에 관한 정보인 Pedigree 데이터를 교환하는 시스템으로, 매 분배 단계에서 냉장 온도 및 물품의 상태를 체크하여 이상이 없을 경우에만 확인자의 서명정보를 추가하여 다음 분배지로 유통시키고 이상이 있을 경우 유통을 중지하여 변질된 상품이 유통되는 것을 막는다. 본 시스템의 아키텍처는 기존의 EPCIS(EPC Information Services)를 확장하여 사용하도록 설계하였고, Pedigree 처리를 위한 API 를 제공하는 Pedigree Library 를 제안하여 EPCIS 환경에 대하여 확장이 용이하다.

ECDSA를 사용한 Pedigree 디지털 서명의 설계 및 구현 (Design and Implementation of Digital Signature on Pedigree Using ECDSA)

  • 코시아완 요하네스;권준호;홍봉희
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2012년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.39 No.1(C)
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    • pp.286-288
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    • 2012
  • Facing the counterfeiting acts towards various products, many manufacturers implement ePedigree system to secure their supply chain. Using ePedigree, a distribution history including a valid product identifier from the manufacturer until the final retailer is recorded. And this ePedigree is signed by each involved supply chain party using digital signature. With this digital signature, any unauthorized alteration to the ePedigree document would generate a failed verification process. If there is a counterfeit product using a fake ePedigree document, it wouldn't be able to pass the verification process either. Hence, there wouldn't be any counterfeit product that could enter the legal supply chain and bought by the consumer. We are proposing to use ECDSA instead of RSA since it has faster performance and shorter key size. At a certain same security level, ECDSA only needs 163 bits, while RSA needs 1024 bits.

Selection of Young Dairy Bulls for Future Use in Artificial Insemination

  • Dutt, Triveni;Gaur, G.K.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제11권2호
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    • pp.117-120
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    • 1998
  • Relationships of breeding values of sires for first lactation milk yield with pedigree information or indices were examined to identify the optimal criteria of selecting young dairy bulls for future use in artificial insemination (AI). Records of performance data on 1087 crossbred daughters (Holstein - Friesian, Jersey and Brown Swiss with Hariana) of 147 sires, generated at Livestock Production Research (Cattle and Buffaloes) Farm, IVRI, Izatnagar, U.P., during 1972 - 1995 were used to obtain the estimates of sire's breeding values (EBV) using the Best Linear Unbiased Prediction Procedures. The correlations between young bull's EBV and the dam's first lactation milk yield was non-significantly different from zero. However, the young bull's EBV was negatively and significantly related (r = - 0.275 ; P < 0.05) to the dam's best lactation milk yield, suggesting that the selection of young dairy bulls from high yielding elite dams is not a suitable criteria for genetic improvement. The correlations of sire's and paternal grandsire's EBV's with young bull's EBV were high and positive (0.532, 0.844; P < 0.01). The maternal grandsire's EBV was positively but non-significantly related to grandson's EBV. The pedigree index incorporating dam's milk records and sire's EBV's showed a negative and non-significant correlation with young bull's EBV. However, the correlation of a pedigree index $(I_3)$ combining information on sire's and paternal grand-sire's EBV's with young bull's EBV's was considerably high and positive (0.797; P < 0.01). The regression coefficients of young bull's EBV on pedigree index $I_3$, was higher than those on other pedigree information. These results revealed that there was no advantage in basing selection on dam's performance or maternal grand-sire's EBV and that sire's and paternal grandsire's EBV's were reliable pedigree information for selection of young dairy bulls for future use in AI.

글로벌 SCM 강화를 위한 e-pedigree에 대한 고찰 (A Review on e-pedigree for Strengthening Global Supply Chain Management)

  • 서동민;한대희;최용정;정해준;김현수
    • 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
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    • 한국컴퓨터정보학회 2010년도 제42차 하계학술발표논문집 18권2호
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    • pp.361-364
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    • 2010
  • 글로벌 시장환경체제에서 유통구조가 복잡해짐에 따라 제조사에서 유통업체 및 소비자까지 아우르는 전체 공급망에서 제품에 대한 이력추적관리는 투명한 유통구조를 형성시킬 뿐만 아니라 더 나아가 소비자들의 안전에 지대한 영향을 미친다. 세계보건기구(WHO)에 따르면 선진국에서 부정 전문의약품의 유통비중은 전체 의약품의 1% 정도이며 이를 미국에 적용할 경우(2006년 기준), 미국에서 유통된 34억 개 전문의약품 중 3,400만 개의 전문의약품이 가짜일 가능성이 있는 것으로 보고되고 있다. 이로 인해 미국 캘리포니아주에서는 유통망의 투명성과 소비자의 안전을 보고하기 위하여 2D 바코드나 RFID(Radio Frequency IDentification)를 통해 의약품 제조에서 약국까지의 유통과정 계보를 추적할 수 있도록 제약기업에 2015년부터 제품에 시리얼번호를 부착한 이력장치(serialized e-pedigree)를 시행할 예정이다. 따라서 본 연구에서는 국내 외적으로 물류/유통과정에서 제품의 위 변조를 예방하기 위한 e-pedigree에 현황 및 동태를 파악하고 국내 e-pedigree에 대한 방향성을 고찰하는데 그 목적이 있다.

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제약 공급망에서 의약품 유통 이력추적에 관한 연구 (A Study on Drug Traceability in Pharmaceutical Supply Chain)

  • 최용정;정상윤
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제20권2호
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    • pp.197-208
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    • 2015
  • 세계적으로 유통되고 있는 가짜의약품으로 인하여 제약사들은 판매수익과 기업브랜드 이미지에 큰 피해를 입고 있는 실정이고, 불법적으로 유통된 의약품이 복용 또는 투약된 환자(소비자)들은 생명에 위협을 받을 가능성이 점점 더 높아지고 있다. 이러한 가짜의약품의 유통을 근절시키기 위하여 세계 각국에서는 의약품의 생산에서부터 소비자에게 판매될 때까지 즉 의약품 유통과정을 추적하여 가시성있는 이력관리를 할 수 있도록 RFID 및 barcode 등 IT기반의 e-Pedigree(electronic pedigree)의 법제화 및 일련번호 관리제도를 도입하고 있다. 따라서, 본 연구에서는 국내 외 의약품 관리체계를 고찰하고 RFID 기반의 e-Pedigree 적용방안을 제시함으로써 국내 제약산업의 유통합리화와 이를 통한 소비자 안전성을 제고시키는데 그 목적이 있다.

협동조합을 위한 전자 페디그리 사설인증 방법 (Private Certification Method of ePedigree for Cooperatives)

  • 김상식;채명수;정성관
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국정보통신학회 2016년도 추계학술대회
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    • pp.463-466
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    • 2016
  • 제품과 유통과정의 정보들을 유통 파트너 상호간에 공유하는 것은 제품 유통 과정의 기본적인 활동이며 유통의 성공을 보장하는 핵심 요구사항이다. 제품의 생산자부터 리테일에 이르기까지의 모든 이벤트를 저장하는 페디그리는 유통 체인의 모든 주체에게 추적 가능한 정보를 저장하고 공유하는 유연한 메커니즘을 제공하고 Public Key Infrastructure(PKI) 기반의 디지털 서명을 이용하여 공유하는 정보의 신뢰성을 제공한다. PKI를 통해 인증 가능한 서명을 하기 위해서 유통 체인의 주체들은 Certificate Authority(CA)로부터 PKI 인증서를 구매해야만 한다. 다수의 영세 조합원들로 구성된 농축산 협동조합의 경우 구성원들 모두가 PKI 인증서를 구매하는 것은 현실적으로 어렵고 이 것은 페디그리가 유통과정에 적용되는 데 있어서 큰 장애요소이다. 본 논문은 협동조합을 위한 페디그리 사설 인증 방법을 제안한다. 협동조합은 제안하는 전자 페디그리를 최소의 비용으로 조합 전체에 적용가능하며, 제안한 방법은 기존 전자 페디그리와 동일하게 정보의 신뢰성을 보장할 수 있다.

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제주마 집단의 혈연 정보량과 정보 오류가 유전 모수 추정치에 미치는 영향 (Influence of Amount of Pedigree Information and Parental Misidentification of Progeny on Estimates of Genetic Parameters in Jeju Race Horses)

  • 김남영;이성수;양영훈
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.289-296
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    • 2014
  • 제주마 경주 능력 개량을 위한 기초 자료 확보를 위하여 혈통 정보량과 오류량이 유전 모수 추정에 미치는 영향을 분석하였다. 혈통 자료는 램덤으로 혈통 정보의 삭제(0~25%) 또는 오류 유발(0~25%)과 각 수준별 20회 반복으로 모의자료를 형성하였다. 분석에 이용된 형질은 제주마 1,000m 경주의 주파 시간을 이용하였고, 상가적 유전 분산의 추정은 DF-REMLAI 알고리즘을 이용하였다. 개체의 양부모에 대한 정보 유실량과 오류량의 증가는 선형적인 회귀관계로 상가적 유전 분산 성분(유실 b = -0.079, 오류 b= -0.114)과 유전력 추정치(유실, b= -0.006; 오류, b = 0.008)의 감소를 초래했다(p<0.01). 특히 개체의 양부모에 대한 정보유실보다는 정보 오류가 상가적 유전분산량과 유전력 추정치를 보다 크게 왜곡하는 것으로 나타났다. 부 또는 모에 대한 정보의 유실과 오류의 증가도 대부분 오차 분산 성분과 영구 환경 분산 성분의 증가를 유발시키고, 상가적 유전 분산성분의 감소를 가져왔다. 원자료에서 얻은 모수를 기준으로 했을 때 양부모에 대한 정보의 유실량과 오류량이 1% 증가함에 따라 유전력은 각각 0.92% 및 1.39%씩 낮아지는 관계를 보였다 (p<0.01). 제주마의 1,000m 주파 속도에 대한 유전력은 0.60으로 추정되었지만, 초기 집단에 존재하는 혈통 정보의 누락 및 오류를 고려한다면 실제보다도 10% 정도는 낮게 추정되고 있다고 사료되었다. 이와 같은 결과는 상가적 유전 분산량의 감소는 물론, 선발에 따른 제주마의 경주 능력에 대한 유전적 개량량에도 영향을 줄 것으로 판단된다.