Pseudomonas syringae pv. tabaci는 숙주인 담배에 감염하여 들불병(wild fire)을 일으키는 식물 병원성 세균이다. 이 세균의 pathogenicity island (PAI)는 Type III secretion system 및 병원성 유전자들을 암호화하고 있으며, 병원성 조절에 있어 핵심적인 역할을 한다. 최근 식물 병원성 세균인 Ralstonia solanacearum에서 식물 세포 접촉을 매개로 하여 hrp gene cluster를 양성조절하는 PrhA (plant regulator of hrp) receptor가 발견되었다. 본 연구에서는 P. syringae에서 식물세포에 의해 hrp 유전자가 유도되는지 확인하기 위해, prhA 유사체를 동정하고 PrhA 결실돌연변이주(BL11)를 구축하였다. BL11은 숙주 감염 실험에서 병원성이 현저히 감소하였고, 식물 세포현탁액에서 hrpA 유전자의 발현수준이 hrp 유도배지에서 보다 3배 더 높게 나타났다. 이러한 결과들을 근거로 PrhA가 식물세포접촉에 의한 조절에 중요한 역할을 한다는 것을 확인하였으며, hrpA-gfp reporter fusion을 사용하여 이를 다시 검증하였다.
2000년도 2회에 걸쳐 제주도 일원 넙치 양식장을 대상으로 감염어에서 분리된 연쇄구균에 대한 특성시험 결과를 요약하면 다음과 같다. 감염어로부터 분리된 연쇄구균은 형태적으로 연쇄상의 gram 양성의 구균이었고, catalase와 oxidase에 음성이었으며, 용혈성 시험에서는 $\beta$-용혈성을 나타내었다. 감염어에서 각 장기별 생균수에서는 환부, 신장, 혈액 그리고 뇌순으로 연쇄구균이 검출되었다. 약제 감수성에서는 ampicillin, ciprofloxicin 둥에 감수성이 있었지만 erythromycin 등에는 감수성이 없었다. 복강에 주사하여 병원성 시험을 한 결과 10일 이내에 전량 폐사하는 강한 병원성을 보였다. 감염균의 용혈성에 대한 특성은 $50^{\circ}C$ 30분의 배양에서 용혈활성이 마르게 증가되어 최대값에 도달되었고 또한 $pH 5.5\~6.5$에서 높은 활성값을 보였다.
Zoysiagrass는 대표적인 난지형 잔디로 Curvularia leaf spot, Large patch, Rhizoctonia blight, Spring dead spot, 그리고 Dollar spot 등의 다양한 병에 직면해 있으며 최근에는 많은 병원균들의 복합 감염에 의한 잔디병 양상을 보이고 있다. 최근에 패취형태의 병반을 가진 zoysiagrass 엽조직으로 부터 Rhizoctonia 속과 유사한 곰팡이를 분리하였다. 리보소옴 DNA의 염기서열을 분석하여 Waitea circinata 균주들과 98% 이상의 상동성을 보였고, Koch's 법칙에 따라 zoysiagrass에서 병원성을 확인하여 이 병의 주 원인균은 Waitea circinata로 판명되었다. 따라서 본 병은 zoysiagrass에서 Waitea circinata에 의해 최초로 국내에서 발생한 병으로 사료되며, 기본 병명과 동일하게 Waitea ring patch로 사용하기를 제안하고자 한다.
Lee, Hojun;Kim, Seul I;Park, Sojung;Nam, Eunwoo;Yoon, Hyunjin
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제28권11호
/
pp.1896-1907
/
2018
Salmonellosis is commonly associated with meat and poultry products, but an increasing number of Salmonella outbreaks have been attributed to contaminated vegetables and fruits. Enteric pathogens including Salmonella enterica spp. can colonize diverse produce and persist for a long time. Considering that fresh vegetables and fruits are usually consumed raw without heat treatments, Salmonella contamination may subsequently lead to serious human infections. In order to understand the underlying mechanism of Salmonella adaptation to produce, we investigated the transcriptomics of Salmonella in contact with green vegetables, namely cabbage and napa cabbage. Interestingly, Salmonella pathogenicity island (SPI)-1 genes, which are required for Salmonella invasion into host cells, were up-regulated upon contact with vegetables, suggesting that SPI-1 may be implicated in Salmonella colonization of plant tissues as well as animal tissues. Furthermore, Salmonella transcriptomic profiling revealed several genetic loci that showed significant changes in their expression in response to vegetables and were associated with bacterial adaptation to unfavorable niches, including STM14_0818 and STM14_0817 (speF/potE), STM14_0880 (nadA), STM14_1894 to STM14_1892 (fdnGHI), STM14_2006 (ogt), STM14_2269, and STM14_2513 to STM14_2523 (cbi operon). Here, we show that nadA was required for bacterial growth under nutrient-restricted conditions, while the other genes were required for bacterial invasion into host cells. The transcriptomes of Salmonella in contact with cabbage and napa cabbage provided insights into the comprehensive bacterial transcriptional response to produce and also suggested diverse virulence determinants relevant to Salmonella survival and adaptation.
Kim, Jong-Chul;Yoon, Jang-Won;Kim, Jong-Bae;Oh, Kyung-Hwan;Park, Mi-Sun;Lee, Bok-Kwon;Cho, Seung-Hak
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제20권2호
/
pp.415-424
/
2010
The purpose of this study was to investigate the relationship between the global regulatory mechanism known as quorum sensing and expression of virulence factors in Escherichia coli O157:87. A nonpolar luxS deletion was introduced into the chromosome of strain CI03J, a human clinical isolate from South Korea, to create the ${\Delta}luxS$ mutant strain ML03J. Phenotypic characterization of wild-type and mutant strains demonstrated that ML03J had no obvious growth or metabolic defects on 0.2% glucose LB medium, produced a functionally defective flagellum, and could not utilize sorbose; the biological significance of sorbose utilization is unknown. Omics-based analysis revealed the involvement of LuxS in the transcriptional activation of several flagella/chemotaxisrelated genes (flhD; fliA, C, D, S, Z; and cheA, Y, Z), repression of glutamate-dependent acid resistance genes (gadAB), and expression of virulence factors including Shiga toxin, hemolysin, and SepD within the LEE pathogenicity island.
Helicobacter pylori (H. pylori) infects more than half of the people in the world as a major microbe to cause most of gastric diseases. Recently, cytotoxin associated-antigen A (CagA) is believed as one of the most important virulence factors of H. pylori. Molecular toxicological pathway of CagA is necessary to investigate for understanding the pathological and toxicological aspects of H. pylori, since this virulence protein harasses intercellular processes of host cells to get profit for the survival of H. pylori. CagA is coded from cag pathogenicity island (cag PAI) and translocated into host cells by Type 4 secretion system (TFSS). Tyrosine phosphorylation of CagA targets Src homology 2-containing phosphotyrosine phosphatase (SHP-2) to form a CagA-SHP-2 complex. This complex depends on the similarity of sequence between EPIYA motif and Src homology 2 domain (SH2 domain) of CagA. The generation of growth factors is an essential role of CagA in protecting and healing gastric mucosa for the survival of H. pylori. On the other hand, the activation of IL-8 by CagA induces neutrophils generating inflammation and free radicals. Indeed, free radicals are well known carcinogen to induce DNA damage. In addition, the transduction of mitogen-activation signal by CagA is one of the interesting features to understand how to cause cancer. The relationship between cancer and inflammation with CagA was mainly discussed in this review.
Park, Sojung;Nam, Eun woo;Kim, Yeeun;Lee, Seohyeon;Kim, Seul I;Yoon, Hyunjin
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제30권11호
/
pp.1729-1738
/
2020
Salmonellosis is a form of gastroenteritis caused by Salmonella infection. The main transmission route of salmonellosis has been identified as poorly cooked meat and poultry products contaminated with Salmonella. However, in recent years, the number of outbreaks attributed to contaminated raw produce has increased dramatically. To understand how Salmonella adapts to produce, transcriptomic analysis was conducted on Salmonella enterica serovar Virchow exposed to fresh-cut radish greens. Considering the different Salmonella lifestyles in contact with fresh produce, such as motile and sessile lifestyles, total RNA was extracted from planktonic and epiphytic cells separately. Transcriptomic analysis of S. Virchow cells revealed different transcription profiles between lifestyles. During bacterial adaptation to fresh-cut radish greens, planktonic cells were likely to shift toward anaerobic metabolism, exploiting nitrate as an electron acceptor of anaerobic respiration, and utilizing cobalamin as a cofactor for coupled metabolic pathways. Meanwhile, Salmonella cells adhering to plant surfaces showed coordinated upregulation in genes associated with translation and ribosomal biogenesis, indicating dramatic cellular reprogramming in response to environmental changes. In accordance with the extensive translational response, epiphytic cells showed an increase in the transcription of genes that are important for bacterial motility, nucleotide transporter/metabolism, cell envelope biogenesis, and defense mechanisms. Intriguingly, Salmonella pathogenicity island (SPI)-1 and SPI-2 displayed up- and downregulation, respectively, regardless of lifestyles in contact with the radish greens, suggesting altered Salmonella virulence during adaptation to plant environments. This study provides molecular insights into Salmonella adaptation to plants as an alternative environmental reservoir.
Choi, Hye Ri;Lim, Hyun;Lee, Ju Hee;Park, Haeil;Kim, Hyun Pyo
Biomolecules & Therapeutics
/
제29권4호
/
pp.410-418
/
2021
Helicobacter pylori causes chronic gastritis through cag pathogenicity island (cagPAI), vacuolating cytotoxin A (VacA), lipopolysaccharides (LPS), and flagellin as pathogen-related molecular patterns (PAMPs), which, in combination with the pattern recognition receptors (PRRs) of host cells promotes the expression and secretion of inflammation-causing cytokines and activates innate immune responses such as inflammasomes. To identify useful compounds against H. pylori-associated gastric disorders, the effect of chalcone derivatives to activate the nucleotide-binding oligomerization domain (NOD)-like receptor family, pyrin domain-containing 3 (NLRP3) inflammasome was examined in an H. pylori-infected human monocytic THP-1 cell line in this study. Among the five synthetic structurally-related chalcone derivatives examined, 2'-hydroxy-4',6'-dimethoxychalcone (8) and 2'-hydroxy-3,4,5-trimethoxychalcone (12) strongly blocked the NLRP3 inflammasome in H. pylori-infected THP-1 cells. At 10 μM, these compounds inhibited the production of active IL-1β, IL-18, and caspase-1, and apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase recruitment domain (ASC) oligomerization, but did not affect the expression levels of NLRP3, ASC, and pro-caspase-1. The interruption of NLRP3 inflammasome activation by these compounds was found to be mediated via the inhibition of the interleukin-1 receptor-associated kinase 4 (IRAK4)/IκBα/NF-κB signaling pathway. These compounds also inhibited caspase-4 production associated with non-canonical NLRP3 inflammasome activation. These results show for the first time that certain chalcones could interrupt the activation of the NLRP3 inflammasome in H. pylori-infected THP-1 cells. Therefore, these chalcones may be helpful in alleviating H. pylori-related inflammatory disorders including chronic gastritis.
Mi-Hyun Lee;Sung-Jun Hong;Dong Suk Park;Hyeonheui Ham;Hyun Gi Kong
The Plant Pathology Journal
/
제39권4호
/
pp.409-416
/
2023
Bacterial leaf blight of carrots caused by Xanthomonas hortorum pv. carotae (Xhc) is an important worldwide seed-borne disease. In 2012 and 2013, symptoms similar to bacterial leaf blight were found in carrot farms in Jeju Island, Korea. The phenotypic characteristics of the Korean isolation strains were similar to the type strain of Xhc. Pathogenicity showed symptoms on the 14th day after inoculation on carrot plants. Identification by genetic method was multi-position sequencing of the isolated strain JJ2001 was performed using four genes (danK, gyrB, fyuA, and rpoD). The isolated strain was confirmed to be most similar to Xhc M081. Furthermore, in order to analyze the genetic characteristics of the isolated strain, whole genome analysis was performed through the next-generation sequencing method. The draft genome size of JJ2001 is 5,443,372 bp, which contains 63.57% of G + C and has 4,547 open reading frames. Specifically, the classification of pathovar can be confirmed to be similar to that of the host lineage. Plant pathogenic factors and determinants of the majority of the secretion system are conserved in strain JJ2001. This genetic information enables detailed comparative analysis in the pathovar stage of pathogenic bacteria. Furthermore, these findings provide basic data for the distribution and diagnosis of Xanthomonas hortorum pv. carotae, a major plant pathogen that infects carrots in Korea.
제주도 감귤원에서 문제가 되고 있는 검은점무늬병의 발병원인을 구명하기 위하여 병원균의 분리동정과 병원성을 조사하였다. 감귤의 마른가지로부터 분리된 병원균은 불완전세대인 Phomopsis citri(완전세대 Diaporthe citri)로 확인되었다. 각 지역 감귤원에서 수집분리한 18개 균주의 분생포자각의 크기는 11.2~614.4${\mu}m$ 범위로 평균 크기는 328.8${\mu}m$였으며 균주별로 크기가 다소 상이하였다. 병포자는 ${\alpha}$포자와 ${\beta}$포자 2종류가 관찰되었으며 ${\alpha}$포자는 무색 단포로 타원형이었고, ${\beta}$포자는 무색 단포로 사상형이며 활처럼 약간 구부러졌고 대개의 경우 한쪽 끝이 휘어 있었다. 크기는 ${\alpha}$포자가 평균 6.7 ${\times}$ 2.3${\mu}m$ 였고, ${\beta}$포자는 22.1 ${\times}$ 1.0${\mu}m$ 였다. 균주별 병원성 검정결과 모든 균주에서 검은점무늬병의 발병이 확인되었으며 균주에 따라 병원성의 차이가 있었다.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.