• Journal of Ginseng Research
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• 제44권6호
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• pp.775-783
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• 2020

Background: The reports about valuable oligosaccharides in ginseng are quite limited. There is an urgent need to develop a practical procedure to detect and analyze ginseng oligosaccharides. Methods: The oligosaccharide extracts from ginseng were permethylated by solid-phase methylation method and then were analyzed by ultra-high-performance liquid chromatography-Q-Orbitrap/MS. The sequence, linkage, and configuration information of oligosaccharides were determined by using accurate m/z value and tandem mass information. Several standard references were used to further confirm the identification. The oligosaccharide composition in white ginseng and red ginseng was compared using a multivariate statistical analysis method. Results: The nonreducing oligosaccharide erlose among 12 oligosaccharides identified was reported for the first time in ginseng. In the comparison of the oligosaccharide extracts from white ginseng and red ginseng, a clear separation was observed in the partial least squares-discriminate analysis score plot, indicating the sugar differences in these two kinds of ginseng samples. The glycans with variable importance in the projection value large than 1.0 were considered to contribute most to the classification. The contents of oligosaccharides in red ginseng were lower than those in white ginseng, and the contents of maltose, maltotriose, maltotetraose, maltopentaose, maltohexaose, maltoheptaose, maltooctaose, maltononaose, sucrose, and erlose decreased significantly (p < 0.05) in red ginseng. Conclusion: A solid-phase methylation method combined with liquid chromatography-tandem mass spectrometry was successfully applied to analyze the oligosaccharides in ginseng extracts, which provides the possibility for holistic evaluation of ginseng oligosaccharides. The comparison of oligosaccharide composition of white ginseng and red ginseng could help understand the differences in pharmacological activities between these two kinds of ginseng samples from the perspective of glycans.

• 한국임상수의학회지
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• 제25권4호
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• pp.241-244
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• 2008

본 연구는 특이적인 임상증상이 없는 360두의 개를 대상으로 multiplex nested PCR 기법을 이용하여 Brucella spp. 및 Leptospira interrogans를 검출하였다. Brucella spp.는 총4두 (1.1%, 암컷 2두, 수컷 2두)가 검출되었고, Leptospira interrogans는 59두 (16.4%, 암컷31두, 수컷28두)에서 검출되었다. 결론적으로 Brucella spp.의 검출률은 낮은 반면 Leptospira interrogans는 높았다. 또한 multiplex nested PCR기법은 무증상의 개 혈액에서 Brucella spp. 및 Leptospira interrogans를 조기에 검출하는데 빠르고 편리한 기법으로 판단된다.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제35권1호
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• pp.51-57
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• 2017

The tiny dragonfly, Nannophya pygmaea (Odonata: Libellulidae), is an endangered insect in South Korea. Previously, a partial mitochondrial DNA sequence that corresponded to a DNA barcoding region has been used to infer genetic diversity and gene flow. In this study, we additionally sequenced the barcoding region from N. pygmaea that had been collected from three previously sampled populations (40 individuals) and these sequences were combined with the preexisting data. We also selected and sequenced an additional mitochondrial gene (ND5) to find further variable gene regions in the mitochondrial genome. DNA barcoding sequences of 108 individuals from five South Korean localities showed that genetic diversity was highest in Gangjin, Jeollanam-do Province. Muuido, which was previously occupied by a single haplotype, was also found to have an identical haplotype, which confirmed the low genetic diversity on this islet. Gene flow among populations is highly limited, and no clear distance- or region-based geographic partitioning was observed. Phylogenetic relationships among haplotypes showed that there were no discernable haplotypes in South Korea. ND5 provided slightly more haplotypes compared to the barcoding region in 40 individuals (14 vs. 10 haplotypes in the COI gene). It also had a slightly higher within-locality diversity estimate, which suggested that ND5 had potential as mitochondrial DNA-based marker for population genetic analysis.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제28권3호
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• pp.215-219
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• 2012

To examine genetic divergences of two endemic Sorex caecutiens subspecies from Korea (S. c. hallamontanus in Korean Jeju Island and S. c. annexus in the mainland Korean Peninsula), we obtained partial cytochrome oxidase I (COI) sequences (429 bp) and complete cytochrome b sequences (1,140 bp) from the two Korean subspecies, and we compared these sequences to the corresponding sequences of S. caecutiens, obtained from GenBank. We found that Jeju S. c. hallamontanus is one of three clades within S. caecutiens, with an average Jukes-Cantor distance of 1.57% in the COI sequences and the distance of 2.07% and 11 fixed site differences in the cytochrome b sequences, indicating that Jeju S. c. hallamontanus is one endemic subspecies with concordant genetic distinctness, although further analyses with nuclear DNA sequences are necessary to confirm these findings. However, S. c. annexus from the mainland Korean Peninsula was not divergent from S. c. macropygmaeus from northeastern China and adjacent Russia, indicating that S. c. annexus from the mainland Korean Peninsula is another endemic subspecies with only morphological differences, although it is necessary to reexamine the subspecies status of S. c. annexus.

• 한국응용곤충학회지
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• 제37권1호
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• pp.23-30
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• 1998

DNA의 제한요소단편 다형현상(RFLP)이 유전변이 연구에 널리 이용되고 있다. 본 연구는 파밤나방(Spodoptera exigua(H bner)) 미토콘드리아 DNA(mtDNA)의 RFLP방법을 개발하기 위해 게놈 크기 측정 및 PCR primer들을 선발하였다. 파밤나방의 mtDNA 전체크기는 약 16kb였다. 대부분 곤충 mtDNA에 적합하게 구성된 (Simon et al., 1994)29개 promer들중 21개가 파밤나방의 mtDNA증폭에 적합했다. 이들 primer들을 이용하여 여러 유전자 영역(CO-I, CO-II, Cyt-B, ND-1, 12S rRNA, 16S rRNA 및 일부 tRNA)의 일분 또는 전체를 포함하는 유전자 절편을 증폭시켰다. 일반적으로 다형을 보이는 primer조합을 중심으로 4염기 제한부위를 인식하는 8종의 제한 효소를 통해 분석된 PCR-RFLP는 서로 다은 지역(안동, 경산, 순천) 집단들간에 제한부위에 있어서 차이가 없었으나 일부 영역에서는 길이 차이를 보여 유용한 유전지표로서의 가능성을 제시했다.

• 한국지반환경공학회 논문집
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• 제15권10호
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• pp.53-62
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• 2014

국내의 경우 하수관으로 많이 사용되어 온 관종은 콘크리트 흄관으로 대표되는 강성관이 주를 이루고 있으나, 시간 경과에 따른 관 부식 및 수밀성 부족 등의 이유로 사용이 급격히 감소하고 있다. 반면에 연성관은 부식에 강할 뿐만 아니라 자재의 무게가 경량이어서 시공성이 우수한 장점이 있어 사용이 증가하고 있는 실정이다. 그러나 연성관에 대한 시장의 신뢰성 부족과 미흡한 다짐관리로 인한 국부적인 파손사례가 발생하고 있어 이에 대한 원인분석 및 관리방안이 필요한 실정이다. 이에 본 연구에서는 시공순서, 관의 강성, 관 하부 콘크리트 기초의 강도, 관 하부 모래기초의 다짐도, 관 주변 모래의 다짐도 및 관 상단 되메움재의 다짐도 등을 변화시켜 가며 각각의 조건에 따른 관의 변형특성을 수치해석을 통하여 평가하였다. 평가결과 각 인자에 대한 영향을 확인할 수 있었으며 특히 연성관의 경우 관 주변 모래의 품질관리가 중요한 것으로 나타났다.

• 한국통신학회논문지
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• 제34권8A호
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• pp.583-591
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• 2009

높은 PAPR을 갖는 직교 주파수 분할 다중 접속 신호는 비선형 왜곡을 발생시키거나, 송신기의 전력 증폭기의 효율을 나쁘게 한다. 그래서 비선형 왜곡을 줄이기 위한 상호 변조 왜곡 저감 기법이 제안되었다. IMD 저감 기법은 비선형 왜곡에 대하여 PAPR 저감 기법보다 비트 오차율 작게 한다. 하지만 IMD 저감 기법의 결정 기준은 주파수 영역에서 이루어지기 때문에 송신기에 FFT가 추가되어 시스템 복잡도가 증가하고, IMD 연산의 복잡한 계산 과정과, 이에 따른 처리시간이 증가하는 문제가 있다. 그러므로 본 논문에서는 이러한 기존의 IMD 저감 기법의 복잡도와 계산량 저감하기 위한 새로운 방식의 IMD 저감 방식을 제안한다. 또한 본 논문에서는 제안된 방식을 PTS 방식의 OFDM 통신 시스템에 적용하여 기존의 기법과 복잡도와 계산량을 비교한다. 제안된 기법은 PAPR처럼 시간영역에서 IMD의 전력량을 계산하므로 송신기에서 시스템의 복잡도와 계산량을 크게 줄일 수 있다. 또한 새로운 기법은 기존 방식과 BER 성능 면에서 차이를 보이지 않는다.

• 대한전자공학회논문지TC
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• 제42권1호`
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• pp.1-8
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• 2005

본 논문에서는 채널간간섭 자기소거를 위한 부대역 부호화기법에 따른 직교 주파수분할다중화의 첨두전력 대 평균전력비가 분석된다. 인접부대역에 대척신호를 할당하는 기존 상관부호화의 경우 전송신호열에서 형상성분이 발생됨을 이론적ㆍ실험적으로 검증한다. 이로 인하여 심볼의 중간부분과 가장자리부분에서의 신호전력은 서로 다른 가중치의 영향을 받게 되며, 이는 증가된 첨두전력 대 평균전력비를 초래한다. 이와 같은 문제점을 극복하기 위하여 본 논문에서는 새로운 간단한 부대역 부호화기법이 제시된다. 여기서는 신호쌍의 위상차가 매 신호마다 변화되도록 할당함으로써 신호의 부분적인 반복성으로 인한 형상성분을 제거한다. 그 결과, 새로운 부대역 부호화기법이 적용된 시스템은 기존의 시스템보다 2～3 dB 적은 첨두전력 대 평균전력비를 가지면서도 일반적인 직교 주파수분할다중화에 비하여 현저히 큰 반송파대 간섭비를 유지한다.

• ALGAE
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• 제23권2호
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• pp.119-133
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• 2008

We cultured a tubular marine green alga, originally identified as Capsosiphon groenlandicus (J. Agardh) K.L. Vinogradova, from Amaknak Island, Alaska. The alga had an alternation of heteromorphic generations in which tubular monoecious fronds produced quadriflagellate zoospores and/or biflagellate isogametes. The gametes fused to produce cysts or Codiolum-like zygotes with long, tortuous stalks. Cysts and codiola produced 8-16 aplanospores, which germinated in situ to yield upright fronds. Fronds arising from both aplanospores and zoospores displayed a distinctive development in which non-septate colorless rhizoids from the base of the initially uniseriate, Ulothrix-like filament were transformed into septate uniseriate Ulothrix-like photosynthetic filaments. These transformed filaments then developed new basal non-septate rhizoids. This pattern of rhizoids becoming filaments, which then produced new rhizoids, was repeated to yield a tuft of up to 50 fronds. Periclinal and longitudinal divisions occurred in each filament, starting basally, until the mature tubular thallus was achieved. Pyrenoid ultrastructure revealed several short inward extensions of chloroplast lamellae, each of which was surrounded by pyrenoglobuli. Analysis of ribosomal SSU and ITS sequences placed this alga in the family Ulotrichaceae, order Ulotrichales, together with but as a distinct species from North Atlantic Capsosiphon groenlandicus. Analysis of a partial ITS sequence from authentic Capsosiphon fulvescens, the current name of the type of the genus Capsosiphon, indicated that neither our material nor C. groenlandicus belongs in that genus, and we propose a new genus, Pseudothrix, to accommodate both species. We propose P. borealis for the North Pacific entity formerly called C. groenlandicus and make the new combination P. groenlandica for the Atlantic species.

• BMB Reports
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• 제40권3호
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• pp.373-381
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• 2007

Seed storage proteins (SSPs) are important for seed germination and early seedling growth. We studied the accumulation and degradation profiles of four major Arabidopsis 12S SSPs using a 2-DE scheme combined with mass spectrometric methods. On the 2-DE map of 23 dpa (days post anthesis) siliques, 48 protein spots were identified as putative full-length or partial $\alpha$, $\delta$ subunits. Only 9 of them were found in 12 dpa siliques with none in younger than 8 dpa siliques, indicating that the accumulation of 12S SSPs started after the completion of cell elongation processes both in siliques and in developing seeds. The length and strength of transcription activity for each gene determined the final contents of respective SSP. At the beginning of imbibition, 68 SSP spots were identified while only 2 spots were found at the end of the 4 d germination period, with $\alpha$, subunits degraded more rapidly than the $\alpha$ subunits. The CRC $\delta$ subunit was found to degrade from its C-terminus with conserved sequence motifs. Our data provide an important basis for understanding the nutritional value of developing plant seeds and may serve as a useful platform for other species.