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분석조건별 담수어류의 환경 DNA 메타바코딩 효율 비교: 필터, 추출 키트, 프라이머 조합 및 PCR 방법 (Efficiency Comparison of Environmental DNA Metabarcoding of Freshwater Fishes according to Filters, Extraction Kits, Primer Sets and PCR Methods)

  • 김근식;김근용;윤주덕
    • 생태와환경
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    • 제54권3호
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    • pp.199-208
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    • 2021
  • 메타바코딩을 이용한 환경 DNA 분석은 검출 감도가 높아 어류의 생물다양성 평가 및 멸종위기종의 검출에 유용한 기술이다. 이번 연구는 메타바코딩을 이용해 우리나라 담수어류를 대상으로 높은 검출 효율을 보일 수 있는 적합한 분석방법을 확인하기 위해 4가지 분석조건별, 즉 필터(cellulose nitrate filter, glass fiber filter), 추출 키트(DNeasy® Blood & Tissue Kit, DNeasy® PowerWater Kit), 프라이머 조합(12S rDNA, 16S rDNA) 그리고 PCR 방법(conventional PCR, touchdown PCR)로 나타나는 Operational Taxonomic Units(OTUs) 수와 종 조성을 비교하였다. Glass fiber filter와 DNeasy® Tissue & Blood Kit를 이용해 추출한 시료는 12S rDNA와 16S rDNA 프라이머 조합에서 담수어류 OTUs가 가장 많이 검출되었다. 모든 분석조건 중 프라이머 조합에서만 조기어강(Class Actinopterygii) 평균 OTUs 수에서 통계적으로 유의한 차이를 보였고(Non-parametric Wilcoxon Signed Ranks Test, p=0.005), 담수어류 평균 OTUs 수는 유의하지 않았다. 종 조성 비교 결과 역시 프라이머 조합에서 유의한 차이를 보였고(PERMANOVA, Pseudo-F=6.9489, p=0.006), 나머지 분석조건에서는 유의한 차이를 보이지 않았다. NMDS 분석 결과 종 조성은 유사도 65% 기준에서 프라이머 조합에 따라 묶였고, 16S rDNA 프라이머 세트는 주로 멸종위기종인 모래주사(Microphysogobio koreensis), 꼬치동자개(Pseudogobio brevicorpus)가 기여하였고, 12S rDNA 프라이머 세트는 주로 일반종인 피라미(Zacco platypus), 꺽지(Coreoperca herzi) 등이 기여한 것으로 나타났다. 본 연구는 국내 하천에서 채취한 시료에 대한 메타바코딩을 이용한 종 다양성 분석의 기초정보를 제공한다.

모친의 교육수준이 아동의 치아우식증 발생에 미치는 영향: 2006 국민구강건강실태조사자료 분석결과 (Effect of Mother's Education Level on Prevalence of Dental Caries among Preschool Children: Analysis of Korea National Oral Health Survey 2006)

  • 정연;김수진;김경남;강수진;도순자
    • 보건교육건강증진학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.117-128
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    • 2009
  • Objectives: The purpose of this study was to assess the effect of mothers education attainment on prevalence of dental caries among their preschool children. Methods: Data were obtained from the third 2006 Korea National Oral Health Survey. A total of 515 preschool children aged 2 to 7 years and their mothers were selected in this study. We used mother's education level as her socioeconomic position and controlled children's tooth brushing frequency, tooth brushing before bed, the frequency of eating snack, and the preventive dental visit. Whether children experienced dental caries or not and the number of decayed or filled or missing tooth surface they had were used as outcome variables. Results: The proportion of children affected with dental caries was 46.21%. The mother's education level affected children's caries significantly (p<0.05) and children whose mother attended less than high school had more possibility of having caries than children whose mother graduated from college or more (p<0.05). This effect was still significant and got larger(p<0.05), even after controlling children's dental health behavior. Conclusion: This study showed that mother's education level affected the prevalence of caries among their preschool children. In addition, this result indicated a need for more definite policy for children's dental health in lower socioeconomic class with general dental education.

Epidemiology and Survival of Hepatocellular Carcinoma in North-east Peninsular Malaysia

  • Norsa'adah, Bachok;Nurhazalini-Zayani, Che Ghazali Che
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권11호
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    • pp.6955-6959
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    • 2013
  • The incidence of hepatocellular carcinoma (HCC) is relatively high in Southeast Asia. Globally, HCC has a high fatality rate and short survival. The objectives of this retrospective cohort study were to review the epidemiology and survival of HCC patients at a tertiary centre in north-east of Peninsular Malaysia. Subjects were adult HCC patients diagnosed by histopathology or radio-imaging. Secondary liver carcinoma was excluded. Kaplan Meier and multiple Cox proportional hazard survival analyses were used. Only 210 HCC cases from years 1987-2008, were included in the final analysis. The number of cases was increasing annually. The mean age was 55.0 (SD 13.9) years with male:female ratio of 3.7:1. Approximately 57.6% had positive hepatitis B virus, 2.4% hepatitis C virus, 20% liver cirrhosis and 8.1% chronic liver disease. Only 2.9% had family history and 9.0% had frequently consumed alcohol. Most patients presented with abdominal pain or discomfort and had hepatomegaly, 47.9% had an elevated ${\alpha}$-fetoprotein level of 800 IU/ml or more, 51.9% had multiple tumors and 44.8% involved multiple liver lobes. Approximately 63.3% were in stage 3 and 23.4% in stage 4, and 82.9% did not receive any treatment. The overall median survival time was 1.9 months (95% confidence interval (CI): 1.5, 2.3). The 1-month, 6-month, 1-year and 2-year survival rates were 71.8%, 23.3%, 13.0% and 7.3% respectively. Significant prognostic factors were Malay ethnicity [Adjusted hazard ratio (AHR) 1.6; 95%CI: 1.0, 2.5; p=0.030], no chemotherapy [AHR 1.7; 95%CI: 1.1, 2.5; p=0.017] and Child-Pugh class C [AHR 2.6; 95%CI: 1.4, 4.9; p=0.002]. HCC in our study affected a wide age range, mostly male, in advanced stage of disease, with no treatment and very low survival rates. Primary prevention should be advocated in view of late presentation and difficulty of treatment. Vaccination of hepatitis virus and avoidance of liver toxins are to be encouraged.

CMOS 저잡음 기가비트급 광전단 증폭기 설계 (CMOS Gigahertz Low Power Optical Preamplier Design)

  • 황용희;강진구
    • 전기전자학회논문지
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    • 제7권1호
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    • pp.72-79
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    • 2003
  • 일반적으로 p-i-n Photodiode 수신기의 광신호처리 전단증폭기의 설계에서 공통소스 입력단을 사용하는 트랜스임피던스(Transimpedance)구조로 설계한다. 본 논문에서는 공통게이트 입력단을 사용하는 전류모드 광전단증폭기를 설계하였다. 이러한 광전단증폭기로 사용되는 전류모드 공통게이트 트랜스임피던스 증폭기의 특징은 높은 이득과 높은 대역폭을 동시에 얻을 수 있다는 것이다. 본 논문에서는 광전단 증폭기 설계에서 잡음 최적화를 이용하여 설계과정을 자동화 시킴으로써 보다 단순하게 트랜스임피던스 증폭기를 설계하는 기법을 제시하였다. 그리고 커패시턴스 피킹(Capacitive Peaking) 기술을 사용하여 대역폭을 더욱 증가시킬 수 있다. 제안하는 기법을 사용하여 설계된 전류모드 광전단 증폭기에 캐패시턴스 피킹을 적용하여 0.35um CMOS 공정을 사용할 경우 대역폭이 1.57GHz이고, 트랜스임피던스 이득이 2.34k, 입력 잡음전류가 470nA이고 입력 잡음 전류의 주파수밀도(spectral density)가 6.13pA/ 인 저 잡음의 고속 전류모드 트랜스임피던스 광전단증폭기를 설계 하였다. 시뮬레이션 결과 제안된 광전단증폭기의 전력소비는 3.3V 공급전압에서16.84mW이었다.

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다중 클래스 SVM을 이용한 계층적 인터넷 애플리케이션 트래픽의 분류 (Hierarchical Internet Application Traffic Classification using a Multi-class SVM)

  • 유재학;이한성;임영희;김명섭;박대희
    • 한국지능시스템학회논문지
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    • 제20권1호
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    • pp.7-14
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    • 2010
  • 본 논문에서는 인터넷 애플리케이션 트래픽 분류방법으로 대표되는 포트 번호 및 페이로드 정보를 이용하는 방법론의 한계점을 극복하는 대안으로서, SVM을 기반으로 한 계층적 인터넷 애플리케이션 트래픽 분류 시스템을 제안한다. 제안된 시스템은 이진 분류기인 SVM과 단일클래스 SVM의 대표적 모델인 SVDD를 계층적으로 결합한 새로운 트래픽 분류 모델로서, 학내에서 수집된 양방향 트래픽 플로우 데이터에 대한 최적의 속성 부분집합을 선택한 후, P2P 트래픽과 non-P2P 트래픽을 빠르게 분류하는 첫 번째 계층, P2P 트래픽들을 파일공유, 메신저, TV로 분류하는 두 번째 계층, 그리고 전체 16가지 애플리케이션 트래픽별로 세분화 분류하는 세 번째 계층으로 구성된다. 제안된 시스템은 인터넷 애플리케이션 트래픽을 coarse 혹은 fine하게 분류함으로써 효율적인 시스템의 자원 관리, 안정적인 네트워크 환경의 지원, 원활한 대역폭의 사용, 그리고 적절한 QoS를 보장할 수 있다. 또한, 새로운 애플리케이션 트래픽이 추가되더라도 전체 시스템을 재학습시킬 필요 없이 새로운 애플리케이션 트래픽만을 추가 학습함으로써 시스템의 점증적 갱신 및 확장성도 가능하다. 실험을 통하여 제안된 시스템의 성능을 검증한다.

금강 수계 서식지 유형분류 및 수서곤충 섭식기능군 분포특성 (Habitat Classification and Distribution Characteristic of Aquatic Insect Functional Feeding Groups in the Geum River, Korea)

  • 박영준;김기동;조영호;한용구;김영진;남상호
    • 한국환경생태학회지
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    • 제25권5호
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    • pp.691-709
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    • 2011
  • 본 연구는 금강 수계의 환경요인을 이용한 서식지 유형분류와 그에 따른 수서곤충 섭식기능군의 분포특성을 규명하기 위한 것으로 2007년부터 2008년까지 금강 수계에서 총 38개 지점에 대하여 봄과 가을에 걸쳐 년 2회씩 총 4회 조사를 실시하였다. 38개 조사지점별로 15개의 환경요인들을 현장 측정한 후 서식지 유사도 분석을 실시한 결과, 거리 척도값 4를 전후하여 상류구간(HD)은 C1과 C3그룹, 중류구간(MS)은 C2와 C4 그리고 C5그룹, 하류구간(LR)은 C6과 C7그룹으로 서식지 유형이 분류되었다. 서식지 유형분류에 있어 영향을 끼치는 주요한 환경요인은, 물리적 환경요인의 경우 하폭과 고도, 화학적 환경요인의 경우 수온과 전기전도도 그리고 DO, 하상재료의 경우 모래와 실트 그리고 잔자갈의 함량으로 분석되었다. 조사시기 동안 출현한 수서곤충은 총 9목 46과 142종으로 조사되었고, 서식지 유형별 종수 및 개체수 현존량 증감과 높은 상관성을 보인 주요 환경요인은 유속과 모래의 함량으로 나타났다. 또한 섭식기능군과 환경요인 사이의 상관성 분석결과, (1) 걸러먹는 무리(FC)는 유속, 수폭, 실트 (2) 주어먹는 무리(GC)는 유속 (3) 잡아먹는 무리(P)는 고도, 유속, 큰돌, 전기전도도, 모래 (4) 뚫어먹는 무리(PP)는 수폭, 실트 (5) 긁어먹는 무리(SC)는 유속, 전기전도도 (6) 썰어먹는 무리(SH)는 고도, 큰돌, DO, pH, 전기전도도, 수온과 각각 상관성을 보이는 것으로 나타났다. 본 연구의 결과, 단계적 다중회귀분석(SMRA)에 의해 도출된 금강 수계의 환경요인 중 고도, 하폭, 유속, 전기전도도, 수온 그리고 모래 등 6개의 요인은 생물군집의 서식과 상관성($r{\geqq}0.600$, P<0.01)이 있는 것으로 나타나 금강 수계 섭식기능군 분포에 영향을 미치는 주요한 요인으로 제시되었다.

Ormocer 계열 수복재의 물성에 관한 연구 (SELECTED MECHANICAL PROPERTIES OF ORMOCER RESTORATIVE MATERIALS)

  • 이동수;정태성;김신
    • 대한소아치과학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.362-370
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    • 2002
  • 최근 20년간 다양한 종류의 심미 수복재가 개발되었고, 특히 지난 5년 동안에는 그 수에 있어서 극적인 증가추세를 보였다. 최근 들어, ormocer라는 새로운 종류의 광중합형 수복재료가 소개되었는데, 화학 분야에서는 이미 오래 전부터 알려져 있던 성분으로, 광학렌즈 등의 표면경화제로 이용되어 오다가 최근 치과용 수복재에 도입되었다. 'Ormocer' 란 'Organically Modified Ceramics'의 약자로 'Ormosils' (Organically Modified Silicates)로도 알려져 있다. 그러나, 이 새로운 수복재에 대한 연구는 아직 미흡한 실정이다. 본 연구에서는 서로 다른 계통의 광중합형 수복재들(Z-100, Surefil, Tetric Ceram, Dyract AP)과 ormocer(Admira)를 압축강도와 굴곡강도 측면에서 비교 평가하고, 구강내 환경과 유사한 조건에서 수분흡수가 그 물성에 미치는 영향을 평가할 목적으로 시도되어 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 1일 후에 측정한 Admira의 압축강도는 Surefil보다는 낮았으나, 다른 재료들과는 유의한 차이를 나타내지 않았다(p>0.05). 2. 1일 후에 측정한 Admira의 굴곡강도는 다른 4종의 재료에 비해서 낮았다(p<0.05). 2일부터는 3종의 복합레진에 비해서 낮았다(p<0.05). 3. 실험기간(30일) 중 hybrid composite resin군(Z-100, Tetric Ceram)과 packable resin(Surefil)군 간에는 압축강도와 굴곡강도에서 유의한 차이가 없었다(p>0.05). 4. 실험에 사용된 5종의 수복재 모두 압축강도와 굴곡강도가 2일까지 증가하다가 7일부터 감소하였다(p<0.05). 5. 각 재료의 시간에 따른 압축강도와 굴곡강도의 변화양상은 통계적으로 유사하였다(p>0.05).

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Treatment Response Evaluation by Computed Tomography Pulmonary Vasculature Analysis in Patients With Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension

  • Yu-Sen Huang;Zheng-Wei Chen;Wen-Jeng Lee;Cho-Kai Wu;Ping-Hung Kuo;Hsao-Hsun Hsu;Shu-Yu Tang;Cheng-Hsuan Tsai;Mao-Yuan Su;Chi-Lun Ko;Juey-Jen Hwang;Yen-Hung Lin;Yeun-Chung Chang
    • Korean Journal of Radiology
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    • 제24권4호
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    • pp.349-361
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    • 2023
  • Objective: To quantitatively assess the pulmonary vasculature using non-contrast computed tomography (CT) in patients with chronic thromboembolic pulmonary hypertension (CTEPH) pre- and post-treatment and correlate CT-based parameters with right heart catheterization (RHC) hemodynamic and clinical parameters. Materials and Methods: A total of 30 patients with CTEPH (mean age, 57.9 years; 53% female) who received multimodal treatment, including riociguat for ≥ 16 weeks with or without balloon pulmonary angioplasty and underwent both non-contrast CT for pulmonary vasculature analysis and RHC pre- and post-treatment were included. The radiographic analysis included subpleural perfusion parameters, including blood volume in small vessels with a cross-sectional area ≤ 5 mm2 (BV5) and total blood vessel volume (TBV) in the lungs. The RHC parameters included mean pulmonary artery pressure (mPAP), pulmonary vascular resistance (PVR), and cardiac index (CI). Clinical parameters included the World Health Organization (WHO) functional class and 6-minute walking distance (6MWD). Results: The number, area, and density of the subpleural small vessels increased after treatment by 35.7% (P < 0.001), 13.3% (P = 0.028), and 39.3% (P < 0.001), respectively. The blood volume shifted from larger to smaller vessels, as indicated by an 11.3% increase in the BV5/TBV ratio (P = 0.042). The BV5/TBV ratio was negatively correlated with PVR (r = -0.26; P = 0.035) and positively correlated with CI (r = 0.33; P = 0.009). The percent change across treatment in the BV5/TBV ratio correlated with the percent change in mPAP (r = -0.56; P = 0.001), PVR (r = -0.64; P < 0.001), and CI (r = 0.28; P = 0.049). Furthermore, the BV5/TBV ratio was inversely associated with the WHO functional classes I-IV (P = 0.004) and positively associated with 6MWD (P = 0.013). Conclusion: Non-contrast CT measures could quantitatively assess changes in the pulmonary vasculature in response to treatment and were correlated with hemodynamic and clinical parameters.

삼첨판막 대치술의 장기간 임상성적 (Long-Term Clinical Results of Tricuspid Valve Replacement)

  • 임상현;홍유선;유경종;강면식;김치영;조범구;장병철
    • Journal of Chest Surgery
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    • 제37권4호
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    • pp.328-334
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    • 2004
  • 삼첨판막대치술의 장기 결과에 대한 연구결과는 보고된 바가 많지 않다. 이에 저자들은 삼첨판막대치술의 위험인자를 분석해 보고, 삼첨판막대치술의 장기 결과를 알고자 연구를 시행하였다. 대상 및 방법: 대상 환자들은 1978년 10월부터 1996년 12월까지 삼첨판막대치술을 시행 받은 환자 70명을 대상으로 후향적인 연구를 진행하였는데, 7명의 환자들은 2차례의 삼첨판막대치술을 시행 받아 총 77예의 삼첨판막대치슬을 시행하였다. 환자들의 평균 나이는 38.8$\pm$15.9세였으며, 26예에서는 조직판막을, 51예에서는 기계판막을 이식하였다. 결과: 수술 사망률은 15.6%였고, 만기 사망률은 12.3%였다. 5년, 10년 그리고 13년에서의 생존율은 조직판막과 기계판막이 각각 81.3% vs. 100%, 66.1% vs. 100%, 60.6% vs. 100%였다(p=0.0175).판막과 관련된 재수술이 없을 확률은 5년, 10년 그리고 13년에서 조직판막과 기계판막이 각각 100% vs. 93.9, 100% vs. 93.9% 그리고 58.3% vs. 93.9%였다(p=0,3274). 판막과 관련된 재수술을 시행할 확률은 조직판막이 2.27%/환자-년이었고, 기계판막이 1.10%/환자-년이었다. 수술 사망과 관련된 위험인자 분석상, 수술 전 복수, 간비대, NYHA class가 나쁠수록, 그리고 삼첨판막대치술을 여러 번 받는 경우가 유의한 위험인자로 분석되었고, 조직판막의 사용과 심장수술을 여러 번 받는 경우가 만기 사망과 관련된 유의한 위험인자로 분석되었다. 걸론: 기계판막을 이용하여 삼첨판막대치술을 시행한 환자들의 장기간 생존율이 조직판막을 이용한 환자들보다 우수하였다. 따라서 수술 후에 적절한 추적관찰이 가능하다면, 기계판막을 이용하여 삼첨판막대치술을 시행하는 것이 필요하리라 생각한다.

식도발성의 숙련 정도에 따른 모음의 음향학적 특징과 자음 산출에 대한 연구 (Analysis of Acoustic Characteristics of Vowel and Consonants Production Study on Speech Proficiency in Esophageal Speech)

  • 최성희;최홍식;김한수;임성은;이성은;표화영
    • 음성과학
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    • 제10권3호
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    • pp.7-27
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    • 2003
  • Esophageal Speech uses the esophageal air during phonation. Fluent esophageal speakers frequently intake air in oral communication, but unskilled esophageal speakers are difficult with swallowing lots of air. The purpose of this study was to investigate the difference of acoustic characteristics of vowel and consonants production according to the speech proficiency level in esophageal speech. 13 normal male speakers and 13 male esophageal speakers (5 unskilled esophageal speakers, 8 skilled esophageal speakers) with age ranging from 50 to 70 years old. The stimuli were sustained /a/ vowel and 36 meaningless two syllable words. Used vowel is /a/ and consonants were 18 : /k, n, t, m, p, s, c, $C^{h},\;k^{h},\;t^{h},\;p^{h}$, h, I, k', t', p', s', c'/. Fundermental frequency (Fx), Jitter, shimmer, HNR, MPT were measured with by electroglottography using Lx speech studio (Laryngograph Ltd, London, UK). 36 meaningless words produced by esophageal speakers were presented to 3 speech-language pathologists who phonetically transcribed their responses. Fx, Jitter, HNR parameters is significant different between skilled esophageal speakers and unskilled esophageal speakers (P<.05). Considering manner of articulation, ANOVA showed that differences in two esophageal speech groups on speech proficiency were significant; Glide had the highest number of confusion with the other phoneme class, affricates are the most intelligible in the unskilled esophageal speech group, whereas in the skilled esophageal speech group fricatives resulted highest number of confusions, nasals are the most intelligible. In the place of articulation, glottal /h/ is the highest confusion consonant in both groups. Bilabials are the most intelligible in the skilled esophageal speech, velars are the most intelligible in the unskilled esophageal speech. In the structure of syllable, 'CV+V' is more confusion in the skilled esophageal group, unskilled esophageal speech group has similar confusion in both structures. In unskilled esophageal speech, significantly different Fx, Jitter, HNR acoustic parameters of vowel and the highest confusions of Liquid, Nasals consonants could be attributed to unstable, improper contact of neoglottis as vibratory source and insufficiency in the phonatory air supply, and higher motoric demand of remaining articulation due to morphological characteristics of vocal tract after laryngectomy.

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