• 제목/요약/키워드: oligopeptides

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PAMAM Dendrimer Conjugated with N-terminal Oligopeptides of Mouse Fibroblast Growth Factor 3 as a Novel Gene Carrier

  • Jung, Jinwoo;Lee, Jeil;Kim, Tae-Hun;Yang, Bong Suk;Lee, Eunji;Kim, Youn-Joong;Park, Jong-Sang;Choi, Joon Sig
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제35권4호
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    • pp.1036-1042
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    • 2014
  • In this study, we introduced the RRLR oligopeptide sequences on the surface of polyamidoamine (PAMAM) dendrimer and characterized the physical properties and gene carrier activity of the novel polymer using HEK 293, NIH3T3, and HeLa cells. The RRLR peptide sequences were derived from a mouse fibroblast growth factor 3 (FGF3) protein containing a bipartite NLS motif. The entire sequence of FGF3 is RLRRDAGGRGGVYEHLGGAPRRRK and it has two functional sequences RLRR and RRRK at N-terminus and C-terminus, respectively. In particular, PAMAM G4-RRLR conferred enhanced transfection efficiency and lower cytotoxicity compared with those of PEI 25 kDa, PAMAM G4-R, and PAMAM G4 in various cell lines. These results suggest that the introduction of N-terminal oligopeptides of FGF3 on the surface of PAMAM holds promise as an effective non-viral gene delivery carrier for gene therapy.

사슬이합체의 헬릭스-코일 구조에 미치는 온도와 변성시약의 영향 (The Effects of Temperature and Denaturant on the Helix-Coil Transition of Chain-Dimer)

  • 김영구;박형석
    • 대한화학회지
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    • 제40권6호
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    • pp.394-400
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    • 1996
  • 결합성 사슬이합체를 형성할 수 있는 올리고펩티드-$(HPPHPPP)_n$-(H: 소수성 아미노산, P: 친수성 아미노산)는 온도, 수소이온 농도, 이온세기, 변성시약 등에 의해 구조적인 변화가 가능하다. 본 연구에서는 변성시약과 온도에 의한 올리고펩티드의 전이 현상을 이론적으로 고찰하였다. 사슬이합체로는 올리고펩티드20R, 변성시약으로는 구아니듐-염산을 사용하였다(20R에는 사슬 내의 정전기적 반발력이 10개가 존재하고, 사슬사이의 정전기적 반발력이 10개가 존재한다). 변성 시약에 의한 올리고펩티드의 나선에서 코일로의 전이는 급격한 것으로 보아, 변성이 일어나는 전이상태에서 올리고펩티드들은 완전한 나선구조와 무질서한 코일구조로만 되어있다. 반면에 온도에 의한 전이는 변성시약에 의한 전이보다 완만하게 일어난다. 낮은 온도에서 긴 나선 구조를 가지는 올리고펩티드가 짧은 나선 구조를 가지는 것보다 다량으로 존재한다. 온도가 증가할수록 부분적으로 변성된 분자들의 몰분율이 증가하여, 전이가 일어나는 온도에서 부분적으로 변성된 올리고펩티드가 널리 분포되어 있다.

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Correlation Between The Helix-Forming Propensity Of Peptides Eptides Obtained By NS MD Simulation and The Chou-Fasman Parameters

  • Murayama, Shinichi;Mori, Toru;Nishigaki, Koichi
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
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    • pp.300-304
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    • 2005
  • Molecular dynamics of nanosecond timescale could provide a significant result for the structure analysis of oligopeptides. The most surprising was the fact that Chou-Fasman parameters which have no direct relationship with nanosecond molecular dynamics could implicate the result to a certain extent. A novel parameter termed X %-stickiness, which is another measure of compactness of a molecule, was first introduced effectively.

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Antihypertensive Angiotensin I-Converting Enzyme Inhibitory Activity and Antioxidant Activity of Vitis hybrid-Vitis coignetiae Red Wine Made with Saccharomyces cerevisiae

  • Jang, Jeong-Hoon;Lee, Jong-Soo
    • Mycobiology
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    • 제39권2호
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    • pp.137-139
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    • 2011
  • A Vitis hybrid-Vitis coignetiae red wine was vinified by fermentation of a mixture of a Vitis hybrid.Vitis coignetiae must with Saccharomyces cerevisiae KCTC 7904 at $25^{\circ}C$ for 10 days. The Vitis hybrid-Vitis coignetiae red wine showed high antihypertensive angiotensin I-converting enzyme (ACE) inhibitory activity (67.8%) and antioxidant activity (76.7%). The antihypertensive ACE inhibitor in the Vitis hybrid-Vitis coignetiae red wine was partially purified by solid phase extraction chromatography, and its ACE inhibitory activity yielded an $IC_{50}$ of 1.8 mg/mL. Six kinds of oligopeptides, including five new kinds, were contained in the partially purified ACE inhibitor fraction from the red wine after 10 days of fermentation. Antioxidant activity decreased significantly from 76.7% to 40.5% when the post-fermentation period was prolonged to 30 days.

Terpene Constituents from Aster spathulifolius

  • Lee, Sung-Ok;Choi, Sang-Zin;Yang, Min-Cheol;Nam, Jung-Hwan;Lee, Kyu-Ha;Lee, Jong-Hwa;Jang, Ki-Uk;Lee, Kang-Ro
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2-2
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    • pp.192.3-193
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    • 2003
  • Aster species has been used in traditional chinese medicine for treatment of a bruies and asthma. On reviewing the literatures of this species, monoterpene glycosides, diterpenoids, triterpene glycosides, cyclic pentapeptides, oligopeptides and flavonoids 1) were isolated and some pharmacological activites were investigated 2). In continuation of our search for bioative components from Korean medicinal plants, we have examined Aster spathulifolius, collected from Jeju island on August 2001. (omitted)

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양식 및 자연산 넙치의 함질소엑스성분 비교 (Comparison of Extractive Nitrogenous Constituents in Cultured and Wild Olive Flounder (Paralichthys olivaceus) Muscle)

  • 박춘규
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.174-179
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    • 2000
  • 우리 나라에서 활발히 양식되고 있는 양직산과 자연산 넙치의 맛성분 조성을 비교하기 위하여 맛과 관계가 깊은 함질소 엑스성분을 분석하여 비교한 결과는 다음과 같다. 일반성분 중 수분은 양식산이 자연산보다 다소 낮은 반면 단백질과 지질은 다소 높았다. 엑스분 질소는 자연산이 다소 높았다. 유리아미노산은 양식산에서 31종, 자연산에서 36종이 검출되어 자연산이 더 다양한 아미노산 조성을 보였으며, 그 총량은 양식산 자연산 모두 전반적으로 낮은 수준이었다. 넙치의 taurine 함량은 양식산과 자연산에서 각각 115 mg과 91 mg으로 유리아미노산 중 가장 높았으며, 우리아미노산 총량의 각각 57.0%와 37.0%를 차지하였다. 양식산에서 함량이 많은 유리아미노산으로서는 taurine, alanine, asparagine, glutamine, glutamic acid, lysine 등이었고, 자연산에서는 taurine, lysine, alanine, carnosine, hydroxyproline 등이었다. 넙치는 oligopeptide류 함량이 869 mg과 1,063 mg으로서 유리아미노산 총량의 4.3배에 달하였다. ATP관련 화합물의 총량은 각각 $9.56\;\mumol과\;6,58\;\mumol$로서 양식산이 다소 높았으며 IMP가 각각 68.2%와 78.6%로서 대부분을 차지하였다. TMAO는 각각 273 mg과 316 mg으로서 자연산이 높고, creatine은 각각 522 mg와 487 mg으로서 양식산이 높았다. Betaine류, TMA, creatinine은 모두 미량이었다. 엑스분 중의 질소분포는 creatine과 creatinine 질소가 가장 높고, 다음은 oligopeptide류 질소, TMAO와 TMA질소, ATP관련 물질 질소, 유리아미노산 질소의 순이었고 질소의 회수율은 95% 이상이었다.취상태를 평가받고 과부족이 되기 쉬운 영양소의 급원 식품과 음식에 대한 영양정보도 제공받을 수 있도록 할 뿐 아니라 식이요법을 필요로 하는 질환의 영양상담을 위한 기본 프로그램으로 활용될 수 있도록 하는데 그 의의가 있다.사만을 선택하여 성별과 결혼여부에 따라 환경친화적 음식소비 행동의 차이를 알아보기 위한 결과 역시 차이를 보이지 않았다. 환경친화적 음식소비행동은 연령, 월평균소득 및 엥겔계수와 의미 있는 상관관계를 보이지 않았다. 조리사와 주부는 음식을 소비하는 전 과정에서 가장 많이 관여하고 있는 집단이다. 그런데 조리사와주부 모두 전반적으로 환경친화적 음식소비행동의 수준이 높지 않음으로 합리적인 식생활문화를 생활화 할 수 있도록 교육과 홍보가 필요하다고 본다. 주부의 경우 유치원이나 어린이집, 초중고둥학교에서 하는 부모교육과 반상회의 홍보자료에 반상회의 홍보자료에 반드시환경친화적 음식소비행동에 관한 교육이 포함되어야 한다. 조리사의 경우 정기교육과정에 환경친화적 음식소비행동에 관한 홍보를 함께 함으로써 외식이나 단체급식에서 발행하는 음식물 쓰레기의 양을 줄 일 수 있을 것이다.m its genes controlling host specificity to its population sturctures and dynamics, have begun to provide new insights into the potential mechanisms underlying race variation. In this review we aim to provide an overview on (a) the molecular basis of host specificity of M. grisea, (b) the population structure and dynamics of rice pathogens, and (c) the nature and mechanisms

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생 멸치의 함질소 엑스성분조성 및 지역과 계절에 따른 변동 (Comparison of Seasonal and Regional Variation in Extractive Nitrogenous. Constituents of the Raw Anchovy (Engraulis japonica))

  • 박춘규
    • 한국수산과학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.25-31
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    • 2000
  • 우리 나라 남해안에서 어획되고 있는 생 멸치의 함질소 엑스성분 조성을 밝히기 위하여 1991년 6월부터 1992년 6월까지 경남 남해군 이동면 근해와 양산군 기장면 대변리 근해어장에서 어획된 생 멸치를 계절별로 각각 4회 수집하여 맛과 밀접한 관계가 있는 함질소 엑스성분 조성을 분석하여 비교하였다. 생 멸치의 엑스분 질소 함량 범위는 $444{\~}773\;mg/100\;g$으로서 높은 때는 낮은 때의 1.7배 이상의 차이가 있었다. 유리아미노산 총량은 $1,049{\~}2,079\;mg/100\;g$이었고, 함량에 있어서 histidine, taurine, alanine, leucine, glutamic acid가 많았다. Oligopeptide류 유래의 아미노산은 $517{\~}l,650\;mg/100\;g$에 달하였고, 유리아미노산 총량의 평균$67.6{\%}$를 차지하였다. ATP 관련 화합물 총량은 평균 $5.02 {\mu}mol/g$이었으며, 그 중 IMP가 대부분을 차지하였다. Betaine류는 glycinebetaine, ${\beta}-alaninebetaine,\;{\gamma}-butyrobetaine$, 및 homarine 이 검출되었으나, 미량에 불과하였다. TMAO와 TMA는 평균 $164mg 과 16mg/100g$ 검출되었고, creatine과 creatinine은 평균 229 mg과 7 mg/100g 검출되었다. 엑스분 중의 질소분포는 지역이나 계절별로 유사한 조성을 나타내었으며, 질소의 회수율은 평균 $93.7{\%}$이었다. 멸치의 함질소 엑스성분에 대한 지역차를 보면 남해산은 기장산 보다 엑스분 질소, 유리아미노산, oligopeptide류, betaine류 및 creatine함량이 높았으나, ATP 관련화합물과 TMAO는 낮았다. 봄멸치는 가을멸치보다 엑스분 질소, 유리아미노산, oligopeptide류, ATP관련물질 및 betaine류가 높았으며, TMAO와 creatinine 함량은 낮았다.

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토하(土蝦) 및 젓새우의 함질소(含窒素) 엑스성분(成分)에 관(關)한 연구(硏究) (Extractive Nitrogenous Constituents of Toha (Caridina denticulata denticulata, Freshwater Shrimp) and Jeotsaeu (Acetes japonicus , Seawater Shrimp))

  • 박춘규;박정임
    • 한국식품과학회지
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    • 제28권6호
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    • pp.1111-1118
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    • 1996
  • 본 연구는 토하(Caridina denticulata denticulata)의 식품학적인 우수성을 밝히기 위하여 식품성분 중 맛과 밀접한 관계를 가지고 있는 함질소 엑스성분을 상세히 분석한 후 그 성분조정을 파악하는 한편, 이와 비교하기 위하여 바다에서 어획되는 젓새우(Acetes japonicus)에 대해서도 동일한 이화학 성분들을 분석하여 그 성분 차이를 검토함으로써 토하에 대한 맛의 특성을 구명하고자 하였다. 토하는 1994년 12월부터 1995년 11월 사이에 전남 나주군에서 양식된 것을, 그리고 젓새우는 1994년 12월과 1995년 11월 전남 신안군에서 어획된 것을 시료로하여 엑스분질소, 유리아미노산, oligopeptide류, 핵산관련물질, betaine류, 4급 암모늄염기, 구아니시노화합물 등을 분석하였다. 토하는 젓새우보다 엑스분질소, 유리아미노산, oligopeptide류, 핵산관련물질의 함량이 높은 편이었고, 젓새우는 토하보다 homarine, trimethylamine oxide, trimethylamine이 높은 편이었으며, creatine과 creatinine은 토하와 젓새우에서 미량으로서 큰 차이가 없었다. 토하의 중요한 유리아미노산으로는 arginine, lysine, glutamine, glutamic acid, pheylalanine, leucine, alanine, asparagine, glycine 등이었고, 젓새우의 중요한 유리아미노산은 arginine, glutamic acid, proline, glutamine, lysine, leucine, glycine, alanine, taurine 등이었다. 그리고 methionine, glutamine, valine 등은 토하와 젓새우에서 그 함량이 같은 수준이었다. 토하에서 가장 함량이 많은 핵산관련물질은 AMP였으며, 젓새우에서는 inosine이었다. 이상의 결과로부터 토하는 맛을 나타내는데 중요한 역할을 하는 대부분의 함질소 엑스성분들의 함량이 젓새우보다 높았기 때문에 식품학적으로 더 우수한 가공원료라고 판단되었다.

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국내산 마른 김(Porphyra)의 생리활성 및 아미노산 조성 비교 (Physiological Activities and Amino Acid Compositions of Korean Dried Laver Porphyra Products)

  • 이학증;최종일;최성재
    • 한국수산과학회지
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    • 제45권5호
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    • pp.409-413
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    • 2012
  • The physiological activities and amino acid compositions of dried lavers of Porphyra from the Jangheung, Seochen and Haenam coasts were determined. The ethanol extract of the Haenam dried laver exhibited the greatest 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH) radical scavenging activity (56.1%), ferric-reducing antioxidant potential (FRAP) value(86.5 mM) and total polyphenol content (3.51 ppm) of these dried laver products. In addition, there was a strong positive correlation between the antioxidative activity and total polyphenol content of the laver products, suggesting that polyphenol compounds contribute to the antioxidant capacity in the ethanol extract of dried laver. However, there was no difference among the extracts in terms of cell proliferation activity. Fourteen combined amino acids were identified in oligopeptides from the dried laver products. Of the three extracts, that of the Haenam dried laver contained the highest levels of both free and total amino acids including alanine, glutamic acid, taurine, phosphoserine, and aspartic acid.

구조활성상관(QSAR)에 의한 피마엽 추출물의 HIV-1 효소억제활성인자 예측 (Inhibitory Effects of Ricinus communis on HIV-1 Essential Enzymes in vitro and Prediction of Inhibitory Factor Using QSAR in silico)

  • 한창호;유영법
    • 대한한방내과학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.888-894
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    • 2006
  • Objectives : For the purpose of developing new anti-HIV agents from natural sources, the extracts of Ricinus communis were tested for their inhibitory effects on essential enzymes reverse transcriptase (RT), protease and alpha-glucosidase. Inhibition activity of major compounds of Ricinus communis were predicted from quantitative structure activity relationships (QSAR) in silico. Methods and Results : In the anti-HIV-1 RT using enzyme-linked oligonucleotide sorbent assay (ELOSA) method, water and methanol extracts (100ug/ml) of Ricinus communis showed strong activity of 94.2% and 82.7%, respectively. In the HIV-1 protease and alpha-glucosidase inhibition assay, neither water nor methanol extracts of Ricinus communis inhibited the activity of the enzyme to cleave any substrates as oligopeptides and oligosaccharides. Conclusions : We found that for these samples it is possible that the inhibition of the RT in vitro is due to the secondary metabolites of Ricinus communis such as ricinine and quercetin. It would beof great interest to identify the compounds which are responsible for this inhibition, since all therapeutically useful agents up to date are RT inhibitors.

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