This paper treats a genetic algorithm for ship scheduling problem in set packing formulation. We newly devised a partition based representation of solution and compose initial population using a domain knowledge of problem which results in saving calculation cost. We established replacement strategy which makes each individual not to degenerate during evolutionary process and applied adaptive mutate operator to improve feasibility of individual. If offspring is feasible then an improve operator is applied to increase objective value without loss of feasibility. A computational experiment was carried out with real data and showed a useful result for a large size real world problem.
Here, we report a computer program written in Python, which phases SNP genotypes and infers inherited deletions based on the pattern of Mendelian inheritance within a trio pedigree. When tiered trio genotypes that encompass three generations are available, it narrows a recombination event down to a region between two consecutive heterozygous markers. In addition, the phase information that is inferred from the upper trio that is formed by one of the parents and grandparents can be propagated to phase the genotypes of the lower trio that is formed by the parents and an offspring.
한국독성학회 2002년도 Current Trends in Toxicological Sciences
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pp.133-133
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2002
Recently, there is an increasing nationwide concern in Korea that exposure to electric and magnetic fields (MF) in the home environment may not be safe in humans. We previously demonstrated that exposure of MF during the entire period of pregnancy did not induce any adverse effects on both pregnant dams and embryo-fetal development in rats.(omitted)
This paper considers development of noninformative priors for the familial data when the families have equal number of offspring. Several noninformative priors including the widely used Jeffreys' prior as well as the different reference priors are derived. Also, a simultaneously-marginally-probability-matching prior is considered and probability matching priors are derived when the parameter of interest is inter- or intra-class correlation coefficient. The simulation study implemented by Gibbs sampler shows that two-group reference prior is slightly edge over the others in terms of coverage probability.
Objectives: The present study was conducted in order to investigate the reproductive toxicity in rats exposed to 1,4-dichlorobutane. Methods: The test chemical was administered orally at 0, 8.3, 50 and 300 mg/kg/day. Males were administered daily for 10 weeks prior to the mating period. Females were administered from between two weeks before mating to the 21stday of lactation. Results: In both sexes, a decrease in body weight and an increase in the weights of the liver and kidneys were observed. In males, discoloration of the liver, hepatocyte hypertrophy and mineralization in the kidneys were observed. In females, animal deaths, dystocia and pup deaths due to maternal dysfunction were observed. In F1 animals of both sexes, a decrease in body weight was observed at 300 mg/kg/day. An increase in the weights of the liver in both sexes, mineralization in the kidneys of males, animal deaths, hepatocyte hypertrophy and pup deaths due to maternal dysfunction were observed at 50 mg/kg/day. Mineralization in the kidneys of males was observed at 8.3 mg/kg/day. Therefore, the no-observed-adverse-effect levels (NOAELs) of 1,4- dichlorobutane were considered to be under 8.3 mg/kg/day for males, 8.3 mg/kg/day for females, more than 300 mg/kg/day for fertility in both sexes, 8.3 mg/kg/day for maternal functions and 50 mg/kg/day for F1 offspring. The absolute toxic dose was believed to be 8.3 mg/kg/day for males, 50 mg/kg/day for females, 50 mg/kg/day for maternal functions and 300 mg/kg/day for F1 offspring. However NOAEL for fertility could not be determined since there were no treatment-related changes. Conclusions: Under the present experimental conditions, 1,4-dichlorobutane is a Category 1B Reproductive Toxicant (presumed human reproductive or developmental toxicant).
The mouse myxovirus resistance protein 1 (Mx1) is known to be sufficient to confer resistance to influenza viruses, and the gene encoding Mx1 is, therefore, an interesting candidate gene for disease resistance in farm animals. The porcine Mx1 gene has already been identified and characterized based on its homology with mouse Mx1; the full-length coding region of the pig Mx1 gene spans 2,545 bp (M65087) and is organized into 17 exons compared with the human ortholog mRNA. In this study, the exons 9, 10 and 11 and introns 6 and 9 of the porcine Mx1 gene were cloned and sequenced. Two SNPs were identified in exons 9, 10 and 11 but none of the SNPs led to an amino acid exchange, and the other eleven variants were detected in introns 6 and 9, respectively. Differences in allele frequency between Meishan and other pig breeds were observed within intron 6, of which an $A{\rightarrow}G$ substitution at position 371 was detected as an SnaBI PCR-RFLP. The association analysis using the Large White${\times}$Meishan $F_2$ offspring suggested that the Mx1 genotype was associated with variation in several immunity traits that are of interest in pig breeding. However, further investigations in more populations are needed to confirm the above result.
저자들은 안구돌출, 각막혼탁, 혀 유착증, 짧은 목, 뇌실 확장, 심방중격결손증, 동맥관개존증 및 양측 다섯번째 중위지골이 짧은 증상을 갖은 선천성 이상 환아에서 세포 유전학 검사를 통해 2번과 7번의 비균형 전위로 인한 7번 염색체의 부분 삼체성, 2번과 20번의 비균형 전위가 모친에 의해 유전되어 나타났음을 경험하였기에 보고하는 바이다.
The purpose of this paper was to concisely review the practical changes in MeHg concentrations in fetus and offspring throughout gestation and suckling from our recent animal and human studies. In the animal study, adult female rats were given a diet containing 5ug/g Hg (as MeHg) for 8 weeks. Then they were mated and subsequently given the same diet throughout gestation and suckling. On embryonic days 18, 20, 22 and at parturition, the concentrations of Hg in the brains of fetus were approximately 1.5-2.0 times higher than those in the mothers. However, during the suckling period Hg concentrations in the brain rapidly declined to about 1/10 of that during late pregnancy. Hg concentrations in blood also decreased rapidly after birth. In human study, Hg concentrations in red blood cells (RBC-Hg) in 16 pairs of maternal and umbilical cord blood samples were compared at birth and 3 months of age after parturition. RBC-Hg in the umbilical cords was about 1.6 times higher than those in the mothers at parturition. However, all the infants showed declines in Hg concentrations throughout the breast-feeding period. RBC-Hg at 3 months of age was about half that at birth. Both the animal and human studies indicated that MeHg exposure to the fetus might be especially high but it dramatically decreases during the suckling period. Therefore, close attention should be paid to the gestation rather than the breast-feeding period to avoid the risk of MeHg to human infants.
Since it was first reported in 1997, somatic cell cloning has been demonstrated in several other mammalian species. On the mouse, it can be cloned from embryonic stem (ES) cells, fetus-derived cells, and adult-derived cells, both male and female. While cloning efficiencies range from 0 to 20%, rates of just 1-2% are typical (i.e. one or two live offspring per one hundred initial embryos). Recently, abnormalities in mice cloned from somatic cells have been reported, such as abnormal gene expression in embryo (Boiani et al., 2001, Bortvin et al., 2003), abnormal placenta (Wakayama and Yanagimachi 1999), obesity (Tamashiro et ai, 2000, 2002) or early death (Ogonuki et al., 2002). Such abnormalities notwithstanding, success in generating cloned offspring has opened new avenues of investigation and provides a valuable tool that basic research scientists have employed to study complex processes such as genomic reprogramming, imprinting and embryonic development. On the other hand, mouse ES cell lines can also be generated from adult somatic cells via nuclear transfer. These 'ntES cells' are capable of differentiation into an extensive variety of cell types in vitro, as well assperm and oocytes in vivo. Interestingly, the establish rate of ntES cell line from cloned blastocyst is much higher than the success rate of cloned mouse. It is also possible to make cloned mice from ntES cell nuclei as donor, but this serial nuclear transfer method could not improved the cloning efficiency. Might be ntES cell has both character between ES cell and somatic cell. A number of potential agricultural and clinical applications are also are being explored, including the reproductive cloning of farm animals and therapeutic cloning for human cell, tissue, and organ replacement. This talk seeks to describe both the relationship between nucleus donor cell type and cloning success rate, and methods for establishing ntES cell lines. (중략)
Background: Physical and chemical properties of feedstuffs can be changed by feed processing. Moreover, through various mechanisms, feed processing can affect growth performance and feed efficiency of swine, nutrition value of the feed. Weaning-to service-intervals (WSI), subsequent farrowing rates, and total-born litter sizes were determined by feed intake and metabolic state during lactation. Methods: A total of 20 sows (Landrace ${\times}$ Yorkshire) with an average body weight (BW) of 266.1 kg 4 d before farrowing were used to determine the effect of feed processing on the performance of lactating sows and their offspring. The following two dietary treatments were used: 1) Crumble diet (C); and 2) Mash diet (M). Ten replications were used for each treatment. Back fat thickness of sows was measured 6 cm off the midline at the 10th rib using a real-time ultrasound instrument at 4 d before farrowing, 1 d after farrowing, and during weaning. Sow BW were also checked at 4 d before farrowing, 1 d after farrowing, and during weaning. Fecal score of sows were assessed on d 14. Fecal score of piglets were observed on d 7, 15, and 24. Data were analyzed using t-test procedure of SAS (2014) with sow as experimental unit. Results: No significant (p > 0.05) difference was observed in the reproduction performance of sows between the two treatments. In addition, there was no significant (p > 0.05) difference in the growth performance of piglets between the two treatments. Fecal score of sows or piglets showed no significant (p > 0.05) difference either. Conclusions: In conclusion, different feed processing (mash or crumble) did not make any significant difference on the performance of lactation sow or their piglets.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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