• 제목/요약/키워드: nucleoside

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Saccharomyces cerevisiae에서 얻은 Purine Nucleoside Phosphorylase의 반응기작과 효소에 대한 Sulfhydryl Reagent의 영향 (Reaction Mechanism of Purine Nucleoside Phosphorylase and Effects of Reactive Agents for SH Group on the Enzyme in Saccharomyces cerevisiae)

  • 최혜선
    • 미생물학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.222-231
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    • 1994
  • Saccharomyces cerevisiae에서 얻은 purine nucleoside phosphorylase (PNP)의 반응 기작을 밝히기 위해 반응속도론적 분석이 수행되어졌다. 반응기작에 PNP${\cdot}$phosphate와 PNP${\cdot}$ribose 1-phosphate의 binary complex가 형성되는 것으로 추정되어진다. Initial velocity와 product inhibition study의 결과는 반응이 ordered bi, bi reaction으로 일어난다는 것과 일치하고 있다. 두 개의 기질중 무기인산이 효소에 먼저 붙고, 그 다음에 nucleoside, 그리고 base가 효소를 떠나는 첫 번째 생성물이고 마지막으로 ribose 1-phosphate가 생성되고 효소는 원래의 상태로 돌아간다. 반응속도론적 분석에 이해 제안된 작용기작은 sulfhydryl reagents인 p-chloromercuribenzoate(PCMB) and 5,5'-dithiobisnitrobenzoate (DTNB)에 의한 효소의 불활성화에 대한 기질으 보호작용의 결과와 일치하고 있다. PNP는 ribose 1-phosphate와 phosphate에 의해 보호되지만 nucleoside나 base에 의해서는 아무런 효과과 없다는 사실은 반응 순서가 효소에 무기인산이 먼저 붙는 ordered bi, bi 기작이라는 것을 지지하고 있다. PCMB 나 DTNB에 의해 불활성화된 PNP는 dithiothreitol(DTT)에 의해서는 활성이 완전히 회복되고 2-mercaptoethanol에 의해서는 77%의 활성이 회복된다는 사실은 효소의 불활성화가 가역적이라는 것을 시사하고 있다. PCMB에 의해 불활성화된 효소는 inosine이 변화하는 기질일때 정상효소보다 높은 $K_m$과 낮은 $V_m$ 값을 보여주고 이런 현상은 DTT 처리시 원래의 상태로 돌아온다. DTNB에 의해 불활성화된 효소는 PCMB 처리시와 비슷하게 정상효소보다 높은 $V_m$ 값을 보이지만 $V_m$ 값은 큰 변화가 없다. S. cerevisiae PNP에서 발견되는 높은 무기인산의 농도에서의 하위단위체간의 음성적 협동성이 PCMB나 DTNB를 처리한 PNP에서는 보이지 않았다.

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혈청 농도가 다제내성 억제제 BIBW22의 nucleoside 수송에 미치는 영향 (Effect of Serum Concentration on Inhibition of Nucleoside Transport by Multidrug Resistance Inhibitor BIBW22)

  • 이동권
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제3권2호
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    • pp.116-121
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    • 1995
  • Some multidrug resistance inhibitors have been known to be influenced by the serum concentration. In this study, effect of serum concentration on inhibition of nucleoside transport by BIBW22, a new multidrug resistance inhibitor derived from dipyridamole (DPM), was studied. When 5% or 100% (v/v) of fetal bovine serum (FBS) was contained in the culture, DPM dose for which nucleoside transport was inhibited by 50% (lD$_{50}$) was 0.42 $\mu$M or 1.17 $\mu$M, respectively. BIBW22 also showed the same trend as DPM did in response to increase of FBS concentration. However, ID$_{50}$ value for DPM in the absence or presence of human plasma was 0.007 $\mu$M or 1.02 $\mu$M respectively showing 145 times increase of ID$_{50}$ value. ID$_{50}$ value for BIBW22 in the presence of human plasma was 0.028 $\mu$M showing only 5 times increase in ID$_{50}$ value. This result suggests that potency of BIBW22 was much less affected by the plasma concentration and BIBW22 could be a good candidate for a clinical use in multidrug resistance treatment.treatment.

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Serratia marcescens Purine Nucleoside Phosphorylase의 생합성에 대한 글리옥실산의 대사적 역할 (Metabolic Role of Glyoxylate on the Biosynthesis of Serratia marcescens Purine Nucleoside Phosphorylase)

  • 방선권
    • 한국식품영양학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.43-49
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    • 1999
  • The effects of purine catabolites in growth media on the Serratia marcescens purine nucleoside phos-phorylase activity were examined. The enzyme activity was decreased above 60% by guanosine(5 to 15mM). The enzyme activity was not affected at low concentration of inosine (0.1∼1mM). The en-zyme activity was decreased approximately by 40∼50% in the presence of high concentrations of aden-osine hypoxanthine and xanthine (5∼15mM) but was not affected at low concentration of adenosine hypoxanthine and xanthine (0.1∼0.5mM). However the enzyme activity was increase by 20% with low concentrations of uric acid(0.5mN). but was decreased by 80% with high concentrations of same purine catabolite (15mM). Also the enxzyme activity was increased by 20% with low concentrations of glyoxylate (0.5mM) final degradative product of uric acid but was decreased by 30∼50% with high con-centrations of glyoxylate (3∼15mM). The enzyme activity was decreased approximately by 20% by the simultaneous addition of inosine hypoxanthine and uricacid at 5mM each whereas it was increased by 22 and 33% by the combination of inosine and uric acid three purine catabolites at 0.5mM respectively These data suggest that S. marcescens purine nucleoside phosphorylase is positively regulated by a glyox-ylate concentration and then may play a regulatory role in a purine catabolism.

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Synthesis of Novel Carbovir Analogue

  • Kim, Ai-hong;Hong, Joon-Hee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제27권7호
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    • pp.976-980
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    • 2006
  • The synthesis of 4'-phenyl and 1'-methyl doubly branched carbocyclic nucleoside was accomplished from 2-hydroxy acetophenone. The 4'-phenyl group was installed via a [3,3]-sigmatropic rearrangement reaction, and the carbonyl addition of methylmagnesium bromide was used to introduce the 1'-methyl group. Cyclization of divinyl 9 was performed using $2^{nd}$ generation Grubbs catalyst. The coupling of cyclopentenol 12$\alpha$ with 6-chloropurine by Mitsunobu reaction and desilylation was used to synthesize the target nucleoside 15.

Synthesis and Antiviral Evaluation of 1'-Branched-5'-Norcarbocyclic Adenosine Phosphonic Acid Analogues

  • Oh, Chang-Hyun;Yoo, Kyung-Ho;Hong, Joon-Hee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권9호
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    • pp.2473-2478
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    • 2010
  • Novel 1'-methyl-5'-norcarbocyclic adenosine phosphonic acid analogues were synthesized using an acyclic stereoselective route from commercially available 3,3-diethoxy-propan-1-ol 4. The synthesized nucleoside phosphonate 19 and phosphonic acid 21 were subjected to antiviral screening against various viruses.

HIV-1 RT (reverse transcriptase) 저해제에 대한 내성 발현 기전

  • 임광진
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 1995년도 제3회 추계심포지움
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    • pp.67-69
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    • 1995
  • reverse transcription은 AIDS를 일으킨다고 알려진 바이러스인 HIV-1의 번식에는 필수적이나 인체 세포에는 필수적이 아니기에 이 단계를 표적으로 하는 AIDS 치료제가 우선적으로 개발되었다. 그 단계에 필요한 효소가 바이러스에 의해 만들어진 RT이며 이 효소의 작용을 저해하는 nucleoside 유도체들인 AZT, DDC, DDI 들이 현재 AIDS 환자의 치료에 사용되고 있다. 이들 nucleoside 유도체들은 세포안으로 들어가 triphosphate 형태로 변화된 후 dNTP와 상경적으로 경쟁하며 합성 중인 바이러스의 DNA에 들어가 DNA의 합성을 정지시켜 바이러스의 증식을 억제한다. 그러나, 이들 nucleoside 유도체들은 치료용량에서 심한 독성을 나타낼 뿐만 아니라 장기 투여시 내성을 나타내는 바이러스가 생겨나 AIDS의 치료를 불가능하게 하고 있다.

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Carboacyciic nucleoside계 항 바이러스제 개발에 관한 연구

  • 김희두
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 1993년도 제2회 신약개발 연구발표회 초록집
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    • pp.41-41
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    • 1993
  • 현재 유일하게 AIDS 치료제로 허가된 AZT를 비롯하여 항 virus 효과를 나타내는 약물의 대부분은 구조적으로 Nucleoside계에 속하는 화합물로서 수많은 약리학적 연구 및 합성 화학적 연구가 이루어져 왔다. 특히 합성 화학적 측면에서 이들 화합물의 합성은 크게 두 가지로 나누어지는데 그것은 Sugar 부위의 변형을 통한 방법과 염기 부위의 변형을 통한 방법에 의해 새로운 항 바이러스제를 개발하는 것이다. 최근의 연구 동향에 있어서 주목할 만한 변화의 하나는 Sugar 부위의 구조적 변형을 시도하는데 있어서 종래의 5원환 형태에서 환이개열된 형태의 Acyclic Nucleoside에 대한 연구가 이루어져 좋은 효과를 거두고 있다는 사실이다. Acyclovir, Ganciclovir 등의 개발이 그것이다. 본 연구에서는 이와 같은 Acyclic Nucleoside계의 새로운 항 virus제를 합성하여 그 생리 활성을 검색하고자 한다.

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Synthesis of Novel Mercaptophenyl Carbocyclic C-Nucleoside Analogue Using Sequential [3,3]-Sigmatropic Rearrangement and Ring-closing Metathesis

  • Li, Hua;Hong, Joon-Hee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제29권4호
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    • pp.847-850
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    • 2008
  • Novel mercaptophenyl carbocyclic C-nucleoside analogue was synthesized via a cyclopentenol intermediate 10, which was prepared using a sequential [3,3]-sigmatropic rearrangement and ring-closing metathesis (RCM). Friedel-Crafts alkylation was then used to couple the thiophenol.

Understanding the RNA-Specificity of HCV RdRp: Implications for Anti-HCV Drug Discovery

  • Kim, Jin-young;Chong, You-hoon
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제27권1호
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    • pp.59-64
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    • 2006
  • Unlike other viral polymerases, HCV RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) has not been successfully inhibited by nucleoside analogues presumably due to its strong substrate specificity for RNA. Thus, in order to understand the RNA-specificity of HCV RdRp, the structural characteristics of the active site was investigated. The hereto unknown 2-OH binding pocket at the active site of RdRp provides invaluable implication for the development of novel anti-HCV nucleoside analogues.