• ALGAE
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• 제21권2호
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• pp.261-266
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• 2006

The innate soluble polysaccharides and phenolic compounds of marine macroalgae are serious contaminants which interfere with experimental procedures such as restriction enzyme digestion, polymerase chain reaction (PCR) and other enzymatic reactions using extracted DNA samples. The viscous polysaccharides are co-precipitated with DNA samples by isopropanol or ethanol precipitation in conventional experiment. To overcome the problem, a method for the isolation of high molecular weight DNA from Porphyra tenera is developed with the application of diatomaceous earth column. The isolated DNAs by this method were about 50-100 kb in size and could be digested well with restriction enzymes. The nuclease activity seemed to be minimal, and high reproducibility in the arbitrary primed PCR for RAPD analyses was a distinctive feature. These results suggest that this method is very efficient in isolating nucleic acid from macroalgae including Porphyra.

• 한국식품과학회지
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• 제18권3호
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• pp.210-214
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• 1986

수소세균을 단세포단백질자원으로 이용하기 위한 기초연구로서 수소를 에너지원으로 이산화탄소를 탄소원으로 하는 autotrophic condition에서 수소세균 Alcaligenes eutrophus ATCC 17697의 배양조건 및 균체성분을 조사하였다. 균체성장을 위한 최적 pH와 온도는 각각 7.0과 $30^{\circ}C$ 이었으며 0.059atm부터 0.27atm까지의 산소분압범위에서 균체성장에 대한 산소분압의 영향을 본 결과 산소분압 0.11atm$(H_2:O_2:CO_2=7\;:\;1\;:\;1)$에서 최대비증식속도 ${\mu}max\;=0.31hr^{-1}$를 보였다. 건조균체의 조단백, 핵산, 회분함량은 각각 69.2%, 17.6%, 3.62%이었다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제51권4호
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• pp.414-419
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• 2019

JC polyomavirus (JCPyV)는 viral group I, Polyomaviridae로 분류되는 사람 병원성 바이러스 이다. JCPyV는 최근 하수 등 수질오염 지표로 제안됨에 따라 수질환경에서 모니터링 필요성이 제기되고 있다. 임상 및 환경 시료 중 JCPyV 검출을 위해서 PCR 시스템이 사용되어 왔다. 그러나 신속하고 높은 검출 민감도를 가진 방법의 필요성에 따라 이번 연구에서는 등온증폭 프라이머 조합을 개발하였다. 이번에 개발한 방법은 기존 PCR 시스템에 비해 더욱 신속 및 약 10배 더 높은 검출 민감도를 보여주었다. 또한 본 연구에서 개발한 검출 방법의 재 검정을 위해서 HaeIII 제한효소를 이용한 방법을 함께 고안하였다. 따라서 이번 연구는 임상, 환경 등의 시료에서 JCPyV를 모니터링 하기 위한 방법으로 활용이 기대된다.

• 한국어병학회지
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• 제25권3호
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• pp.165-172
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• 2012

Vibrio alginolyticus (V. alginolyticus) 는 우리나라 전 연안에서 높은 빈도로 발견되며 인간 및 어패류에 감염을 유발시키는 박테리아의 일종이다. 본 연구는 서해안 양식장의 해수와 어패류에서 V. alginolyticus와 이에 대한 특이적인 용균성 파아지를 분리하였으며 분리된 파아지의 형태학적 특성을 전자현미경으로 확인 하였다. 또한 파아지의 핵산의 종류 및 구조 단백질의 특성 대한 연구가 수행되었다. 분리된 파아지는 형태학적으로 60 nm의 육각형 두부와 20 nm의 짧은 미부를 가진 podoviridae과로 분류되었다. 핵산을 분리한 결과 23 Kb 크기의 DNA로 판명 되었으며 구조 단백질은 37.8 kDa과 198 kDa 사이에 7종류의 단백질 분획이 존재함을 확인 하였다.

• 환경생물
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• 제35권4호
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• pp.461-467
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• 2017

Shrimps infected with WSSV(White Spot Syndrome Virus) generally exhibit white spots in their inner space of carapaces as an acute clinical sign. In an effort to identify the correlation between this acute clinical sign and the condition, the index factors (RNA/DNA concentration and ratio, trypsin activity) were analyzed. A total 580 farmed Fenneropenaeus chinensis and 130 Lithopenaeus vannamei were collected from western and southern fifteen outdoor ponds in Korea. The status of the white spot pathology was divided into four stages (stage 0, stage I, stage II, and stage III), in accordance with the clinical signs as to the size and area of white spots. A significant decrease in RNA concentration and RNA/DNA ratio for multi-infected fleshy prawn (WSSV and vibrio sp.) occurred during the stage III (the whole carapace is covered with a white spot). In particular, RNA/DNA ratio was significantly lower as $1.47{\pm}0.04$ than other groups. A similar trend was also found in the single infection (WSSV), but the decrease was less than the multi-infection. In the species comparison, both species were vulnerable to the multi-infection, but L. vannamei was more sensitive than F. chinensis(ANOVA, p<0.05): A significant decrease in RNA concentration and RNA/DNA ratio was first found in stage II for the former species, while it was found in stage III for the latter species. Trypsin activity was also showed a similar tendency with nucleic acid variation. Multi-infected shrimp showed drastically decrease of trypsin activity. According to the results, clinical signs of the white spot under carapace have an only physiological effect on shrimp if they covered entirely with white spots.

• 한국식품영양과학회지
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• 제12권4호
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• pp.305-309
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• 1983

수종(數種)의 핵산구성성분(核酸構成成分), 아미노산(酸), 요소유도체(尿素誘導體)와 같은 생리활성물질(生理活性物質) 및 함질소화합물(含窒素化合物)의 DNA에 대한 작용(作用)과 그 작용(作用)에 무기(無機)ion의 영향을 검토(檢討)하였다. PTU, Cys-SH는 금속(金屬) ion없이도 DNA 절단능력(切斷能力)을 가지고 있었고, Tyr, Phe, Trp는 $CuSO_4$존재(存在) 하(下)에서 약한 DNA damage 유기작용(誘起作用)이 있었으며 5mM 이상의 Cys-SH와 $500{\mu}M$ $CuSO_4$의 혼합액(混合液)은 강(强)한 DNA 절단작용(切斷作用)을 나타냈다. $Sn^{2+}$를 제외한 $500{\mu}M$의 무기염(無機鹽)은 DNA에 대한 절단능력이 없었으나, $Cu^{2+}$, $Ni^{2+}$, $Mn^{2+}$, $Zn^{2+}$, $Sn^{2+}$ 등은 수종(數種)의 아미노산(酸)의 DNA breaking action에 영향을 미치고 있음을 확인(確認)되었다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제64권4호
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• pp.357-362
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• 2021

본 연구에서는 홍삼의 항충치 효과를 조사하기 위하여 홍삼박 n-hexane 추출물의 충치 원인균 Streptococcus mutans에 대한 항균 효과, 균체 부착과 생물막 생성 저해 효과를 측정하였다. 홍삼박 n-hexane 추출물의 농도에 비례하여 S. mutans의 생육이 저해되었으며, 125 ㎍/mL 이상의 농도에서는 거의 관찰되지 않았다(MIC=125 ㎍/mL). 홍삼박 n-hexane 추출물이 세포막에 작용하여 세포의 핵산 성분이 유출시키는 것으로 나타났다. 그리고, 홍삼박 n-hexane 추출물은 125 ㎍/mL 이상의 농도에서 S. mutans의 부착과 생물막 형성을 90% 이상 저해하였다. GTase 활성은 50 ㎍/mL 농도에서 완전히 저해되었다. 결론적으로 홍삼박 n-hexane 추출물은 S. mutans의 생육과 생물막 형성을 공통적으로 저해하는 것으로 나타났다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권9호
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• pp.1470-1477
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• 2019

${\beta}_2$-adrenergic receptor (${\beta}_2-AR$) was expressed efficiently using Bac-to-Bac Baculovirus Expression System in Sf9 cells as a bio-recognition element for multianalyte screening of ${\beta}$-agonist residues in pork. Sf9 cells were selected as the expression system, and codon optimization of wild-type nucleic acid sequence and time-dependent screening of expression conditions were then carried out for enhancing expression level and biological activity. Under optimum conditions of multiplicity of infection (MOI) = 5 and 48 h post transfection, the protein yield was up to 1.23 mg/ml. After purification by chromatographic techniques, the purified recombinant protein was applied to develop a direct competitive enzyme-linked receptor assay (ELRA) and the efficiency and reliability of the assay was determined. The IC50 values of clenbuterol, salbutamol, and ractopamine were 28.36, 50.70, and $59.57{\mu}g/l$, and clenbuterol showed 47.61% and 55.94% cross-reactivities with ractopamine and salbutamol, respectively. The limit of detection (LOD) was $3.2{\mu}g/l$ and the relevant recoveries in pork samples were in the range of 73.0-91.2%, 69.4-84.6%, and 63.7-80.2%, respectively. The results showed that it had better performance compared with other present nonradioactive receptorbased assays, indicating that the genetically modified ${\beta}_2-AR$ would have great application potential in detection of ${\beta}$-agonist residues.

• 대한화장품학회지
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• 제45권1호
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• pp.19-25
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• 2019

최종당화산물은 환원당과 단백질, 지질 또는 핵산 사이의 당화반응에 의해서 생성되는 물질로 이물질은 피부 노화 과정에 밀접하게 연관되어 있다고 보고되어 있다. 본 연구에서는 항산화 활성, 최종당화산물 생성 저해, 콜라겐과 최종당화산물의 교차결합 저해 및 억제, 엘라스타제 활성 저해 효능 시험을 통해서 비자나무 유박 추출물의 항노화 효과를 평가하였다. 시험 결과, 비자나무 유박 추출물은 폴리페놀과 플라보노이드를 함유하고 있으며, DPPH와 ABTS 자유라디칼을 50% 소거할 수 있는 농도는 각각 $16.4{\mu}g$ (Dried materials, DM)/mL과 $16.7{\mu}g\;DM/mL$ 로 관찰되었다. 또한, 비자나무 유박 추출물은 농도 의존적으로 최종당화산물 생성과 엘라스타제 활성을 저해하였고, 콜라겐과 최종당화산물의 교차결합을 저해 및 억제하였다. 따라서 본 연구 결과를 바탕으로 비자나무 유박 추출물은 항노화 효능이 있는 화장품 소재로서 활용가치가 있음을 확인하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권1호
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• pp.127-140
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• 2019

Since 1990, many nucleic acid expression platforms consisting of DNA or RNA have been developed. However, although RNA expression platforms have been relatively neglected, several such platforms capped at the 5' end of RNA by an anti-reverse cap analog have now been developed. At the same time, the capping reaction is a bottleneck in the production of such platforms, with high cost and low efficiency. Here, we investigated several viral and eukaryotic internal ribosome entry sites (IRESs) to develop an optimal RNA expression platform, because IRES-dependent translation does not require a capping step. RNA expression platforms constructed with IRESs from the 5' untranslated regions of the encephalomyocarditis virus (EMCV) and the intergenic region of the cricket paralysis virus (CrPV) showed sufficient expression efficiency compared with cap-dependent RNA expression platforms. However, eukaryotic IRESs exhibited a lower viral IRES expression efficiency. Interestingly, the addition of a poly(A) sequence to the 5' end of the coxsackievirus B3 (CVB3) IRES (pMA-CVB3) increased the expression level compared with the CVB3 IRES without poly(A) (pCVB3). Therefore, we developed two multiexpression platforms (termed pMA-CVB3-EMCV and pCrPV-EMCV) by combining the IRESs of CVB3, CrPV, and EMCV in a single-RNA backbone. The pMA-CVB3-EMCV-derived RNA platform showed the highest expression level. Moreover, it clearly exhibited expression in mouse muscles in vivo. These RNA expression platforms prepared using viral IRESs will be useful in developing potential RNA-based prophylactic or therapeutic vaccines, because they have better expression efficiency and do not need a capping step.