• 미생물학회지
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• 제19권2호
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• pp.63-77
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• 1981

The growth rate of yeast population (Saccharomyces uvarum) cultivated in the Knopp's modified medium (plus various carbon sources) appeared the highest value when the Knopp's minimal medium was treated to 1.5% with disaccharide such as maltose and sucrose. Also the treatment of lactose and raffinose resulted in polulation growth as to the population size in case of maltose and sucrose. However, the gorwth of yeast was not occurred at all when a polysaccharide, such as inulin, was added as carbon source. The growth from of yeast population in Knopp's modified medium are characterized by the fact that log phase continued 100hrs after inoculation and that stationary state phase appeared in general 250hrs after inoculation. Applying the various carbon sources to respiration substrate for yeast cell, the respiration rate of yeast showed the highest value in treatment of maltose and followed in order of raffinose, lactose, glucose, and sucrose. Determined the amount of poly-phosphate and turn over pathway of poly-phosphate according to culture phase of yeast, it is revealed that the yeast synthesized 3 types of poly phosphate (poly-P A,B, and C) and postulated that turn over pathway of poly-phosphate as follows ; Inorganic phosphate is converted into each kind of polyphosphates, and then one part of poly-P-C is converted into poly-P-B, the rest poly-p-C and poly-P-B are converted into poly-P-A. The synthesized poly-phosphate is considered to have a role as energy pool utilizing to synthesis of cellular organic materials. Of the 13 carbon sources used in this experiment, the useful carbon sources for biosynthesis of poly-phosphate and cellular organic materials are confirmed as disaccharide (maltose and sucrose) as well as glucose. Protein synthesis in yeast cell showed the two peaks on 6th and 8th day after inoculation ; nucleic acid on 2nd day (48hrs), carbohydrates on 2nd day (48hrs), and phospholipid on 2nd and 8th day after inoculation, respectively.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제21권7호
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• pp.734-738
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• 2011

Streptococcus pneumoniae is a major cause of invasive infection in young infants and older adults. There are currently 90 capsular serotypes identified and 23 serotypes (1, 2, 3, 4, 5, 6B, 7F, 8, 9N, 9V, 10A, 11A, 12F, 14, 15B, 17F, 18C, 19F, 19A, 20, 22F, 23F, and 33F) are responsible for about 90% of invasive disease. Among the more than 90 different S. pneumoniae serotypes, serotype 19A is globally very prevalent. A simplified purification procedure including adjustment of cell lysate pH to 4.5, fractionation with 50. 80% ethanol, and dialysis rendered capsular polysaccharide (CPS) in a yield of $31.32{\pm}3.11$ mg from 1 l culture (75% recovery after lyses). The product contained only 69.6 ${\mu}g$ of protein (99.78% purity) and 0.8mg (sum of the precipitants from 50~60%, 60~70%, and 70~80%) of nucleic acid (97.45% purity). The purified CPS was conjugated with bovine serum albumin; the product size ranged from 100 to 180 kDa.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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• 제31권12호
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• pp.1602-1610
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• 2004

다양한 유전체 프로젝트로 말미암아 엄청난 서열 데이타들이 쏟아지고, 이에 따라 핵산 및 단백질 수준의 서열 데이타 분석이 매우 중요하게 인식되고 있다. 특히 최근에는 단백질이 단순하게 개별적인 기능을 가진 독립적인 요소가 아닌 전체 단백질 상호작용 네트워크 상에서 다른 객체들과 유기적인 관계를 갖으며 나름대로의 중요한 역할을 수행하고 있다는 점에 초점을 맞추어 연구가 진행되고 있다. 특히 단백질 상호작용 관계 분석을 위해서는 실제로 상호작용이 일어나는 도메인 모듈 정보가 아주 중요하게 작용하는데, 본 논문에서는 이러한 점을 고려하여 우리가 개발한 단백질 기능 및 상호작용 분석을 위한 PIVS(Protein-protein interaction Inference and Visualization System)에 대해 소개하고 있다 PIVS는 기존의 단백질 상호작용 데이타베이스들을 합쳐서 통합 데이타베이스를 생성하고, 다양한 전처리 과정으로 통합 데이타베이스 서열의 기능 및 주석 정보를 추출하여 로컬 데이타베이스화 하였다. 그리고 특히 단백질 상호작용 관계 분석을 위해 중요하게 작용하는 도메인 모듈 정보들을 추출하여 로컬 데이터베이스를 구축하였고, 기존의 단백질 상호작용 관계 데이타를 이용하석 도메인 사이의 상호작용 관계 정보도 수집하여 분석하였다. PIVS는 단백질의 종합적인 분석 정보, 즉, 기능 및 주석, 도메인, 상호작용 관계 정보 등을 손쉽고 편리하게 얻고자 하는 사용자에게 매우 유용하게 사용될 수 있을 것이다.

• 식물병연구
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• 제9권1호
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• pp.1-9
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• 2003

The occurrence of potato(Sotanum tuberosum) viral diseases caused by Potato virus X(PVX), Potato virus Y (PVY), Potato leafroll virus(PLRV), Potato vims S(PVS), Potato virus M(PVM), Potato virus A(PVA), Potato virus T(PVT), Alfalfa mosic virus(AIMV), Tobacco mosic virus(TMV), Potato mop top virus(PMTV) Tobacco rattle virus(TRV) and Potato spindle tuber viroid(PSTVd), potato witches' broom phytoplasma, have been identified so far in Korea. Major viral diseases such as PVX, PVY and PLRV had been studied more deeply, however, the others are just identified and only partially characterized since the first study on the relation between PVX nucleic acid and virus protein by Kim in 1961. The most studies on potato viral diseases are mainly focused on the problems of seed potato production. The National Alpine Agricultural Experiment Station(NAAES), since it began its activities in 1961, has given special attention to this problem by doing studies to identify, characterize and control potato virus diseases. This effort resulted in the development of new potato virus detection methods as a basis for elaborating new method of control, such as the production of seed potato free of virus and the selection of new virus-resistant transgenic potatoes. The further studies of potato viral diseases required would be fallowings: the continuous monitoring for the occurrence of identified or not identified potato viruses in Korea, the isolation of resistant viral genes, the development of control method for the non-persistently transmitted viruses like PVY, special vectors such as nematode and fungus transmitted viruses, TRV and PMTV and the development of control methods against potato viral diseases by viral cross protection, therapy, transgenic plant, and the use of the agents or molecules, such as virus inhibitors and antiviral proteins, etc., blocking viral replication.

• 한국균학회지
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• 제29권2호
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• pp.104-109
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• 2001

Polyphosphate의 Candida albicans와 Trichophyton mentagrophytes에 대한 항진균 작용에 대하여 연구하였다. 평균 사슬길이가 15, 45, 75인 polyphosphate는 진균에 대하여 성장억제 효과를 나타낸 반면, pyrophosphate는 성장억제 효과가 없었다. 사슬길이가 증가함에 따라서 진균 성장억제 효과가 증가하는 것으로 관찰되었으며 $800\;{\mu}g/ml$ 농도에서는 균주의 성장을 완전히 억제시켰다. $Mg^{2+}$나 $Ca^{2+}$의 첨가는 polyphosphate의 성장억제 효과를 감소시켰다. Polyphosphate를 처리한 C. albicans에서는 핵산물질의 유리가 관찰되었으며, 세포 swelling이나 표면돌출과 같은 세포형태 변화도 관찰되었다. 세포막 불투과성 물질인 propidium iodide는 Polyphosphate를 처리한 C. albicans의 핵을 염색하는 것이 관찰되었다. Polyphosphate의 항진균 작용은 polyphosphate가 진균 세포벽이나 세포막의 필수 양이온에 대한 chelation 효과에 의한 것으로 사려된다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제37권4호
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• pp.567-573
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• 2010

To ascertain the effect of over-expressed maize calreticulin in tomato plant on tobamovirus movement in addition to validating potentiality of the gene (ZmCRT) as a means for the virus-resistance resource, four ZmCRT-expressing homozygous lines were generated from the T0 plants as using an Agrobacterium-mediated transformation, nucleic acid analyses, and a conventional breeding method. Of them, a line was subjected to the bioassay for tolerances to tobacco mosaic virus-U1 (TMV-U1) and tomato mosaic virus (ToMV) followed by RT-PCR and a chlorophyll fluorescence quenching analyses. Both transgenic plants transcribing ZmCRT and wild-type plants showed no symptom by 20 days after viruses inoculation, however the photosystem II quantum yield parameter measured from the upper leaves of ToMV-inoculated plants revealed that ZmCRT transgenic plants have higher photosynthetic ability than wild-type ones at that time, which indirectly implies that over-expressed ZmCRT product acts as a barrier to the cell-to-cell and/or systemic movement of ToMV. Moreover, ZmCRT transgenic plants showed remarkably longer shoot length than wild-type ones in 40 days after TMV-U1 or ToMV inoculation each, which might be resulted from higher photosynthetic ability during the phase not yet showing any external symptoms. Collectively, over-expressed ZmCRT protein in tomato plants is able to interrupt the systemic movement of infected TMV-U1 and ToMV even though not perfect.

• ALGAE
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• 제21권2호
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• pp.261-266
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• 2006

The innate soluble polysaccharides and phenolic compounds of marine macroalgae are serious contaminants which interfere with experimental procedures such as restriction enzyme digestion, polymerase chain reaction (PCR) and other enzymatic reactions using extracted DNA samples. The viscous polysaccharides are co-precipitated with DNA samples by isopropanol or ethanol precipitation in conventional experiment. To overcome the problem, a method for the isolation of high molecular weight DNA from Porphyra tenera is developed with the application of diatomaceous earth column. The isolated DNAs by this method were about 50-100 kb in size and could be digested well with restriction enzymes. The nuclease activity seemed to be minimal, and high reproducibility in the arbitrary primed PCR for RAPD analyses was a distinctive feature. These results suggest that this method is very efficient in isolating nucleic acid from macroalgae including Porphyra.

• 한국식품과학회지
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• 제18권3호
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• pp.210-214
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• 1986

수소세균을 단세포단백질자원으로 이용하기 위한 기초연구로서 수소를 에너지원으로 이산화탄소를 탄소원으로 하는 autotrophic condition에서 수소세균 Alcaligenes eutrophus ATCC 17697의 배양조건 및 균체성분을 조사하였다. 균체성장을 위한 최적 pH와 온도는 각각 7.0과 $30^{\circ}C$ 이었으며 0.059atm부터 0.27atm까지의 산소분압범위에서 균체성장에 대한 산소분압의 영향을 본 결과 산소분압 0.11atm$(H_2:O_2:CO_2=7\;:\;1\;:\;1)$에서 최대비증식속도 ${\mu}max\;=0.31hr^{-1}$를 보였다. 건조균체의 조단백, 핵산, 회분함량은 각각 69.2%, 17.6%, 3.62%이었다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제51권4호
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• pp.414-419
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• 2019

JC polyomavirus (JCPyV)는 viral group I, Polyomaviridae로 분류되는 사람 병원성 바이러스 이다. JCPyV는 최근 하수 등 수질오염 지표로 제안됨에 따라 수질환경에서 모니터링 필요성이 제기되고 있다. 임상 및 환경 시료 중 JCPyV 검출을 위해서 PCR 시스템이 사용되어 왔다. 그러나 신속하고 높은 검출 민감도를 가진 방법의 필요성에 따라 이번 연구에서는 등온증폭 프라이머 조합을 개발하였다. 이번에 개발한 방법은 기존 PCR 시스템에 비해 더욱 신속 및 약 10배 더 높은 검출 민감도를 보여주었다. 또한 본 연구에서 개발한 검출 방법의 재 검정을 위해서 HaeIII 제한효소를 이용한 방법을 함께 고안하였다. 따라서 이번 연구는 임상, 환경 등의 시료에서 JCPyV를 모니터링 하기 위한 방법으로 활용이 기대된다.

• 한국어병학회지
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• 제25권3호
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• pp.165-172
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• 2012

Vibrio alginolyticus (V. alginolyticus) 는 우리나라 전 연안에서 높은 빈도로 발견되며 인간 및 어패류에 감염을 유발시키는 박테리아의 일종이다. 본 연구는 서해안 양식장의 해수와 어패류에서 V. alginolyticus와 이에 대한 특이적인 용균성 파아지를 분리하였으며 분리된 파아지의 형태학적 특성을 전자현미경으로 확인 하였다. 또한 파아지의 핵산의 종류 및 구조 단백질의 특성 대한 연구가 수행되었다. 분리된 파아지는 형태학적으로 60 nm의 육각형 두부와 20 nm의 짧은 미부를 가진 podoviridae과로 분류되었다. 핵산을 분리한 결과 23 Kb 크기의 DNA로 판명 되었으며 구조 단백질은 37.8 kDa과 198 kDa 사이에 7종류의 단백질 분획이 존재함을 확인 하였다.