• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제42권3호
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• pp.93-119
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• 2004

Acanthamoeba and Naegleria are widely distributed in fresh water, soil and dust throughout the world, and cause meningoencephalitis or keratoconjunctivitis in humans and other mammals. Korean isolates, namely, Naegleria sp. YM-1 and Acanthamoeba sp. YM-2, YM-3, YM-4, YM-5, YM-6 and YM-7, were collected from sewage, water puddles, a storage reservoir, the gills of a fresh water fish, and by corneal washing. These isolates were categorized into three groups based on the mortalities of infected mice namely, highly virulent (YM-4), moderately virulent (YM-2, YM-5 and YM-7) and nonpathogenic (YM-3). In addition, a new species of Acanthamoeba was isolated from a freshwater fish in Korea and tentatively named Korean isolate YM-4. The morphologic characters of its cysts were similar to those of A. culbertsoni and A. royreba, which were previously designated as Acanthamoeba group III. Based on experimentally infected mouse mortality, Acanthamoeba YM-4 was highly virulent. The isoenzymes profile of Acanthamoeba YM-4 was similar to that of A. royreba. Moreover, an anti-Acanthamoeba YM-4 monoclonal anti-body reacted only with Acanthamoeba YM-4, and not with A. culbertsoni. Random amplified polymorphic DNA marker analysis and RFLP analysis of mitochondrial DNA and of a 188 small subunit ribosomal RNA, placed Acanthamoeba YM-4 in a separate cluster based on phylogenic distances. Thus Acanthamoeba YM-4 was identified as a new species, and assigned Acanthamoeba sohi. Up to the year 2002 in Korea, two clinical cases were found to be infected with Acanthamoeba spp. These patients died of meningoencephalitis. In addition, one case of Acanthamoeba pneumonia with an immunodeficient status was reported and Acanthamoeba was detected in several cases of chronic relapsing corneal ulcer, chronic conjunctivitis, and keratitis.

• 대한미생물학회지
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• 제22권2호
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• pp.147-153
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• 1987

Colonization factor antigen I(CFA I) has been shown to be one of several virulence factors that promote attachment of enterotoxigenic E. coli(ETEC) to small intestinal epithelial cells of humans. The ability of ETEC to produce mannose-resistant hemagglutination(MRHA) of human blood group A has been used to detect CFA I. To determine gastrointestinal carriage in Korean children of E. coli with MRHA and CFA I, 116 strains of E. coli from diarrheal children admitted to Hanyang University Hospital were examined for MRHA of human erythrocytes and the presence of CFA I. Of 45 ETEC strains, 18(40%) gave a positive MRHA($MRHA^+$) and eight(18%) were positive for CFA I(CFA $I^+$). ETEC with CFA I were all heat-stable enterotoxin(ST) producers and two of these strains were of serogroups $O_{25}$. Of 17 classic enteropathogenic E. coli(EPEC), 7(41%) were $MRHA^+$ but all were negative for CFA I(CFA $I^-$). Of 30 enteroadherent E. coli(EAEC) strains, 11(37%) were $MRHA^+$ and one was CFA $I^+$. Of 24 nonpathogenic E. coli, 4(17%) were $MRHA^+$ but all were CFA $I^-$. It was shown that MRHA was common in all strains of E. coli, CFA I was limited only to ST producing ETEC and EAEC; although MRHA is a useful screening procedure, serologic tests seem to be necessary to comfirm CFA I production. CFA I was associated with a lower proportion of ETEC isolates in Korea than has been reported for other locations.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.90.1-90
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• 2003

Colonization of Pseudomonas chlororaphis O6, a nonpathogenic rhizobacterium, on the roots induced systemic resistance in cucumber plants against tai-get leaf spot, a foliar disease caused by Corynespora cassiicola. A cDNA library was constructed using mRNA extracted from the cucumber leaves 12 h after inoculation with C. cassiicola, which roots had been previously treated with O6. To identify the genes involved in the O6-mediated induced systemic resistance (ISR), we employed a subtractive hybridization method using mRNAs extracted from C cassiicola-inoculated cucumber leaves with and without previous O6 treatment on the plant roots. Differential screening of the cDNA library led to the isolation of 5 distinct genesencoding a GTP-binding protein, a putative senescence-associated protein, a galactinol synthase, a hypersensitive-induced reaction protein, and a putative aquaporin. Expressions of these genes are not induced by O6 colonization alone. Before challenge inoculation, no increase in the gene transcriptions could be detected in previously O6-treated and untreated plants but, upon subsequent inoculation with the pathogenic fungus, transcription levels in O6-treated plants rose significantly faster and stronger than in untreated plants. Therefore, the O6-mediated ISR may be associated with an enhanced capacity for the rapid and effective activation of cellular defense responses which becomes apparent only after challenge inoculation on the distal, untreated plant parts, as suggested by Conrath et al. (2002). This work was supported by a grant R11-2001-092-02006-0 from the Korea Science and Engineering Foundation through the Agricultural Plant Stress Research Center at Chonnam National University.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제62권1호
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• pp.117-130
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• 2024

Ticks host different pathogens as endosymbiont and nonpathogenic microorganisms and play an important role in reproductive fitness and nutrient provision. However, the bacterial microbiomes of white-tailed deer ticks have received minimal attention. This study aimed to examine the bacterial microbiome of ticks collected from Odocoileus virginianus on the Mexico-United States border to assess differences in microbiome diversity in ticks of different species, sexes, and localities. Five different tick species were collected: Rhipicephalus microplus, Dermacentor nitens, Otobius megnini, Amblyomma cajennense, and A. maculatum. The tick microbiomes were analyzed using next-generation sequencing. Among all tick species, the most predominant phylum was Proteobacteria, followed by Actinobacteria and Firmicutes. The ticks from Tamaulipas and Nuevo León presented the highest bacterial species diversity. Acinetobacter johnsonii and A. lwoffii were the common bacterial species in the microbiome of all ticks, Coxiella were present in R. microplus, and Dermacentor nitens also exhibited a Francisella-like endosymbiont. The microbiome of most females in D. nitens was less diverse than that of males, whereas R. microplus occurs in females, suggesting that microbiome diversity is influenced by sex. In the bacterial communities of A. maculatum and O. megnini, Candidatus Midichloria massiliensis, and Candidatus Endoecteinascidia fumentensis were the most predominant endosymbionts. These results constitute the initial report on these bacteria, and this is also the first study to characterize the microbiome of O. megnini.

• 한국응용곤충학회지
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• 제36권4호
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• pp.331-340
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• 1997

곤충 유전자를 이용한 항세균성 펩타이드 생산 및 응용에 관한 기초 연구로서 비병원성 세균(Escherichia coli K12)으로 면역 반응을 유도한 누에로부터 발현량이 증가하는 유전자 중 Hyalophora cecropia의 attacin과 cDNA 상동성을 나타내는 BmInc6 클론을 분리하고 그 특성을 조사하였다. BmInc6 cDNA의 전체염기서열을 분석한 결과 그 크기는 852 bp이고, 35번째 염기에서 변역이 개시되어 679 bp 위치에서 종결되는 open reading frame을 가지며 812번째 위치에 잠정 전사 종결 신호의 존재가 확인되었다(GenBank, AF005384). BmInc6에 의해 coding되는 아미노산은 214개이며, hydropathy 분석 결과 친수성을 나타내는 단백질이었다. 그리고 BmInc6 유전자에 의해 연역되는 펩타이드를 nuecin으로 명명하였다. Nuecin 유전자를 baculovirus 발현 백터계를 이용하여 곤충세포주에서 발현시킨 결과 전사체의 크기는 약 950 bp였고, 세포내 벌현 펩타이드의 분자량은 약 23 kDa이었다. 세포내에서 발현된 nuecin 전구체로 추정되는 23 kDa 펩타이드는 세포외로 분비되는 과정에서 약 3 kDa의 signal 펩타이드가 제거됨으로서 약 20 kDa의 성숙 nuecin으로 된다는 사실을 단백질 전기영동상으로 확인하였다. Nuecin 단백질의 항세균 활성을 수종의 그람 음성 및 양성 세균에 대해 검정한 결과, 특히 E. coli와 Bacillus subtilis에 높은 활성을 나타내었으며, attacin이 한정된 그람 음성 세균에만 항세균 활성을 나타내는데 비해 nuecin은 그람 음성은 물론 그람 양성에도 항세균 활성을 나타내어, 보다 넓은 항세균 스펙트럼을 가지는 것을 알 수 있었다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제40권1호
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• pp.29-34
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• 1993

연구배경 : Ikeda에 의해 임상에 도입된 굴곡성 기관지경은 각종 폐 질환의 진단과 치료에 광범위하게 이용되고 있으며 시술 증례도 증가하고 있으나 외국에서는 결핵균, 비결핵항산균 및 여러 세균들에 의한 기관지경의 교차오염예가 다수 보고되고 있으므로 기관지경의 세척과 소독방법에 대해 주의를 기울여야 한다. 방법 : 1991년 11월부터 1992년 5월 까지 기관지내시경을 시행한 예중에서 기관지세척액에서 비결핵항산균이 배양된 예들을 분석하고 본원에서 화학살균제로 사용하고 있는 2% alkaline glutaraldehyde의 살균작용을 평가하기 위하여 실험실내에서 2% alkaline glutaraldehyde와 비결핵항산균 및 세균을 접촉시킨후 균의 사멸 여부를 알아 보았다. 결과 : 2% glutaraldehyde 소독제 용액에 비결핵항산균은 2% glutaraldehyde 1:1 용액으로 30분간 접촉한 후 균이 자라지 않았으며 그 밖의 세균들은 접촉 바로 후에 자라지 않았다. 위발생 인지후 철저한 기계적 세척과 함께 세척기내에서 30분이상 2% glutaraldehyde에 담가둔 이후로는 위양성이 발생하지 않았다. 결론 : 기관지경 사용후 기계적 세척을 철저히 하는 것이 중요하며 2% glutaraldehyde 용액으로 소독시 비결핵항산균의 소멸을 기대하려면 적어도 30분 이상 접촉이 필요할 것으로 생각된다. 또한 감염조절 방법을 엄격하게 적용한다 하더라도 오염을 완전히 배제할 수 없으므로, 일반적으로 비병원균으로 알려진 균들이 비통상적으로 갑자가 높은율로 검출되면 위발생을 생각하여야 한다.

• 한국축산식품학회지
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• 제26권2호
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• pp.263-268
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• 2006

최근 들어 병원성 미생물의 저감화를 위하여 기존의 항생제 계열의 항균물질이 아닌 새로운 개념의 신소재 개발이 활발하게 진행 중에 있다. 특히, 이러한 신개념의 병원성 저감화 소재 중 인간의 장내에 존해하는 probiotics 균주의 특성을 이용하여 병원성 미생물을 예방하는 것은 보다 효과적인 방법 중의 하나가 될 수 있을 것으로 판단된다. 본 실험에서는 HT-29 cell을 대상으로 L. acidophilus 균체와 세포 파쇄물을 대상으로 STEC ATCC 43894의 장 상피세포 부착 억제능력을 측정하였다. 10 mg/mL의 세포 파쇄물이 존재하였을 때 $10^9cfu/mL$의 균체가 존재했을 때와 유사한 수준으로 STEC ATCC 43894의 부착 저해 효과가 관찰되었다. 하지만, L. acidophilus A4의 상등액에서는 그 저해 효과가 세포 파쇄물의 $5{\sim}10%$ 정도 수준으로 관찰되어 그 효과는 매우 적은 것으로 판단되었다. 또한, L. acidophilus A4의 세포 파쇄물이 STEC의 부착에 미치는 영향을 관찰하기 위하여 10mg/mL의 세포 파쇄물이 첨가된 배지에서 STEC의 단백질발현 양상을 확인하였다. 각 gel의 image에서 평균적으로 800개의 spot을 관찰할 수 있었으며 이중 2배 이상의 발현차이를 보이는 13개의 spot을 선발하였다. 7개의 spot은 세포파쇄물이 첨가되었을 때 발현이 증가하였으며 3개의 spot은 발현이 감소하였다. 흥미롭게도 3개의 단백질 spot은 세포파쇄물이 존재할 때만 발현되는 것을 확인하였다. 명확하지는 않지만 이러한 L. acidophilus A4의 세포 파쇄물에 존재하는 물질은 (1)STEC의 부착과 관련된 특정 단백질의 발현을 저해하거나 (2)STEC과 장상 피세포에서의 수용체 경합을 통해 부착을 억제하는 것으로 생각된다. 앞으로 이와 관련된 보다 세부적인 작용 메카니즘 연구 및 생화학적연구가 필요할 것으로 판단된다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제40권4호
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• pp.315-324
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• 2016

Background: Biocontrol agents are regarded as promising and environmental friendly approaches as agrochemicals for phytodiseases that cause serious environmental and health problems. Trichoderma species have been widely used in suppression of soil-borne pathogens. In this study, an endophytic fungus, Trichoderma gamsii YIM PH30019, from healthy Panax notoginseng root was investigated for its biocontrol potential. Methods: In vitro detached healthy roots, and pot and field experiments were used to investigate the pathogenicity and biocontrol efficacy of T. gamsii YIM PH30019 to the host plant. The antagonistic mechanisms against test phytopathogens were analyzed using dual culture, scanning electron microscopy, and volatile organic compounds (VOCs). Tolerance to chemical fertilizers was also tested in a series of concentrations. Results: The results indicated that T. gamsii YIM PH30019 was nonpathogenic to the host, presented appreciable biocontrol efficacy, and could tolerate chemical fertilizer concentrations of up to 20%. T. gamsii YIM PH30019 displayed antagonistic activities against the pathogenic fungi of P. notoginseng via production of VOCs. On the basis of gas chromatography-mass spectrometry, VOCs were identified as dimethyl disulfide, dibenzofuran, methanethiol, ketones, etc., which are effective ingredients for antagonistic activity. T. gamsii YIM PH30019 was able to improve the seedlings' emergence and protect P. notoginseng plants from soil-borne disease in the continuous cropping field tests. Conclusion: The results suggest that the endophytic fungus T. gamsii YIM PH30019 may have a good potential as a biological control agent against notoginseng phytodiseases and can provide a clue to further illuminate the interactions between Trichoderma and phytopathogens.

• 대한미생물학회지
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• 제21권4호
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• pp.503-513
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• 1986

치주질환의 처치에 있어서 tetracycline의 전신적 투여는 치은연하 세균의 제거 및 감소에 매우 효과가 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 전신적 투여시의 문제점 보완과 국소적 투여시 기할 수 있는 병소부위의 보다 높은 농도의 유지를 위하여 국소도포용 tetracycline gel을 제조하여 예비실험을 시행하였으며, 본 실험에서는 치주낭 깊이 $4{\sim}6mm$의 중등도 치주염 환자 13명에서 double-blind, split-mouth design으로 상악 또는 하악중 한악은 scaling 및 root planing을 시행하였고, 나머지 악은 그대로 두었으며, 좌측 또는 우측중 한측에는 예비실험결과 가장 효과가 있는 것으로 나타난 국소도포용 3% tetracycline gel을 치주낭내 깊숙히 주2회 2주간 투여하여, (1) tetracycline-scaled (2) tetracycline-unscaled (3) placebo-scaled (4) placebo-unscaled의 4군에서 0일, 14일, 49일에 임상적, 미생물학적 검사를 시행하여 각기 그 효과를 비교하였다. 또한 치주질환과 관련이 깊은, 그람 음성혐기성 세균, 특히 black-pigmented Bacteroides의 분포 변화를 관찰하기 위하여, 시험부위에서 치은연하 치태세균을 채취하여 pre-reduced Ringer액에 혐기성조건으로 보관 운반하여 $37^{\circ}C$혐기성 세균 배양기 내에서 혈액배지에 담아 7일간 배양하여 분리한 후, 생화학 검사를 통하여 Bacteroides균주를 검정하였으며, 이로써 tetracycline투여와 관련된 치주질환의 disease activity를 분석 검토하였다. 이상의 임상적, 미생물학적 검사결과 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 예비실험 결과 국소도포시 가장 효과가 있었던 3% tetracycline gel은 본 실험사용시 치주질환치료 및 치은연하 세균분포변화에 매우 효과가 있으며, 임상적으로 scaling, root planing과 병행시에 가장 효과가 있는 것으로 나타났다. 2. Bacterial morphotype의 관찰결과 tetracycline투여군에서 coccal form의 증가와 spirochetes의 현저한 감소를 보였으며, non-motile rods와 motile rods의 비율에는 다소증감이 있었으나 의미있는 변화는 없었다. 3. Streptococcus균주간의 분포 비율은 tetracycline-scaled군에서 S. sanguis I은 14일에 현저히 증가하였고, 49일에는 다소 감소하였으며, S. mitis는 증가하는 경향을 보였다. 4. Tetracycline-scaled군에서는 black-pigmented Bacteroides의 비율이 현저히 감소하였으며, tetracycline 투여만으로도 black-pigmented Bacteroides 비율은 감소되었다. 그러나 scaling만으로는 black-pigmented Bacteroides 비율에는 변화를 주지못했다. 5. Black-pigmented Bacteroides 균주간의 분포를 보면 실험 및 대조군 모두에서 B. loeschii가 가장 많이 나타났으며, 시간의 경과에 따라 거의 변화가 얼었다. 또한 tetracycline 투여군에서는 B. intermedius와 B. gingivalis가 감소하였고, B. melaninogenicus는 증가하였다.

• 생명과학회지
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• 제31권5호
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• pp.453-463
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• 2021

청력 장애(hearing loss)는 임상적 및 유전적으로 상당히 이질적인 질병들의 그룹으로, 일반적으로 증후군 유형(syndromic type)과 비증후군 유형(non-syndromic type)으로 구분된다. 상염색체 열성의 청력 장애 환자가 다른 나라들에 비해 파키스탄에서는 상대적으로 흔하게 관찰되는데, 그 원인으로는 빈번한 근친 결혼의 문화가 일부 관여할 것으로 여겨진다. 본 연구는 상염색체 열성의 청력 장애 환자가 있는 두 파키스탄의 근친 가계를 대상으로 전장 엑솜 서열분석(whole exome sequencing)을 실시하여 유전적 원인을 규명하기 위해 수행되었다. 환자의 유전체 분석 결과, 우리는 언어 습득전 발병(prelingual onset)의 청력 장애 가족으로부터 MYO7A 유전자에서 병원성으로 판단되는 동형접합성 돌연변이인 p.Leu326Gln을 분리하였으며, 조기 발병의 청력 장애와 동시에 근위축(muscular atrophy)을 나타내는 환자 가족에서는 병원성이 확실하지 않는 두 변이(variants of uncertain significance)를 GPR98 유전자(p.Val3094Ile)와 PLA2G6 유전자 (p.Asp56Gly)에서 각각 분리하였다. MYO7A 및 PLA2G6 유전자의 missense 돌연변이는 고도로 보존된 단백질 부위에 위치했으며, 인실리코 분석(in silico analysis)에서도 병원성을 예측하였다. 그러나, GPR98 유전자의 돌연변이는 보존성이 다소 낮은 부위에 위치하였으며, 대부분의 인실리코 분석도 비병원성으로 예측했다. 동형접합성 매핑(homozygosity mapping)을 실시하였을 때, 각 가계에서 분리된 동형접합성 돌연변이의 두 대립유전자가 모두 단일 기원에서 유래한 것으로 예측되었는데, 이것은 근친 결혼에 기인한 것으로 판단된다. 본 연구는 파키스탄의 상염색체 열성 청력 장애 환자들의 정확한 분자진단 및 치료에 도움을 줄 수 있을 것으로 기대된다.