• 제목/요약/키워드: nodD

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Bradyrhizobium sp. SNU001의 nodD와 nodA의 염기서열 (Nucleotide Sequences of nodD and nodA from Bradyrhizobium sp. SNU001)

  • 나영순;심웅섭;안정선
    • 미생물학회지
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    • 제31권3호
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    • pp.189-196
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    • 1993
  • 대두(Glycine max) 뿌리혹의 질소고정 공생균주 Bradyhizobium sp. SNU001 의 nod D 와 nodA 의 염기서열을 결정하였다. 총 314개의 아미노산을 암호화하는 nod D 의 open reading frame (ORF) 은 942bp 로 B. japonicum USDA110 의 nodD1 과 99.4% 의 유사성을 보여주었으며, 총 210개의 아미노산을 암호화하고 콩과식물의 Bradyrhizobium 에서는 처음으로 염기서열이 결정된 nodA 의 ORF 는 630bp 로 B. sp. (Parasponia) 의 nodA 와 81.5% 의 유사성을 보여주었다. nodYAB 오페론과 nodD 상류에서는 9bp의 반복서열을 각각 4번, 2번 가지는 보존적인 nodbox 가 발견되었으며 nodD 의 상류에서는 A, T-rich 서열도 존재하였다.

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Bradyrhizobium sp.(Cassia) CN9135의 nodD1 유전자의 크로닝과 염기서열 분석 (Cloning and Sequence Analysis of the nodD1 Gene from Bradyrhizobium sp.(Cassia) CN9135)

  • 최순용;고상균
    • 미생물학회지
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    • 제36권4호
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    • pp.267-272
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    • 2000
  • 차풀(Cassia nomame)의 뿌리혹 공생세균인 Bradyrhizobium sp.(Cassia) CN9135의 nodD1 유전자를 중합효소 연쇄반응을 통해 크로닝하여 그 염기서열을 조사하였다. 염기서열로부터 유추된 NodD1 단백질은 Bradyrhizobium elkanii와 가장 높은 95%의 상동성을 나타내었다. 뿐만 아니라 nodD2 사이의 intergenic space 부위의 염기서열도 B. japonicum을 포함하는 다른 bradyrhizobia와는 상동성이 거의 없었으나 B. elkanii와는 88%의 높은 상동성을 나타내었다. 우리의 실험 결과는 Bradyrhizobium sp.(Cassia)가 B. elkanii와 매우 근연한 관계임을 보여 주고 있다.

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The Role of Intracellular Receptor NODs for Cytokine Production by Macrophages Infected with Mycobacterium Leprae

  • Kang, Tae-Jin;Chae, Gue-Tae
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제11권6호
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    • pp.424-427
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    • 2011
  • The nucleotide-oligomerization domain (NOD) proteins are members of the NOD-like receptor (NLR) family, which are intracellular and cytoplasmic receptors. We analyzed the role of NODs for cytokine production by macrophages infected with intracellular pathogen M. leprae, the causative agent of leprosy. Production of pro-inflammatory cytokines such as IL-$1{\beta}$ and TNF-${\alpha}$ was inhibited in the presence of cytochalasin D, an agent blocking phagocytosis, suggesting that intracellular signaling was, partially, required for macrophage activation to M. leprae infection. Next, we investigated the role of NOD1 and NOD2 proteins on NF-${\kappa}B$ activation and cytokine expression. Treatment with M. leprae significantly increased NF-${\kappa}B$ activation and expression of TNF-${\alpha}$ and IL-$1{\beta}$ in NOD1- and NOD2-transfected cells. Interestingly, their activation and expression were inhibited by cytochalasin D, suggesting that stimulation of NOD proteins may be associated with the enhancement of cytokine production in host to M. leprae.

Subcloning of Nodulin 26 Wild Type(S262) and Phosphorylation Site Mutant(S262D) into the Yeast Expression Vector pYES2

  • Cha, Youn-Soo
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제2권1호
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    • pp.61-65
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    • 1997
  • Wild type nodulin 26(nod 26) cDNA(S262) and phodphorylation aite mutant(S262D) were constructed by a yeast expression system using pYES2 plasmids(pTES2-D262 and pTES2-S262D) were sc-reened by restriction mapping with BamHI of KpnI. S262 nod 26 contained a sreine residue at position 262 and S262D nod 26 contained the substitution mutation of serine to aspartic acid residue at position 262 were verified by automated floursent DNA sequencing.

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NoD서비스용 멀티미디어 데이터의 효율적인 저장 및 검색을 위한 하부저장 관리자의 설계 및 구현 (Design and Implementation of a Low-level Storage Manager for Efficient Storage and Retrieval of Multimedia Data in NOD Services)

  • 진기성;정재욱;장재우
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제7권4호
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    • pp.1033-1043
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    • 2000
  • 최근 NoD(News-on-Demand)에 대한 사용자의 요구가 증가함에 따라, 이러한 요구를 충족시키기 위한 많은 연구가 진행중에 있다. 그러니 뉴스 비디오 데디터는 짧은 생명주기, 앵커를 중시미으로 한 주기적 변화로인해 기존의 비디오 저장방식을 그대로 용하기가 어렵다. 이릉 위해, 본 논문에서는 NoD서비스용 멀티미디어 데이터의 효율적인 저장 및 검색을 위한 하부저장 관리자를 설계 및 구현하다. 하부 저장 관리자는 멀티미디어 객체 지체의 비디오 스트림 데이터와 색인 정보를 효율적으로 저장하고 관리하며, 텍스트 기반 검색을 위해 역화일 기법과 고차훤 특징 벡터의 색인을 위해 X-트리 구조를 제공한다. 아울러 하부 저장 관리자는 계층적인 뉴스 비디오 객체로부터 추출된 부가적인 정보들은 효율적으로 저장할 수 있는 저장 API(Application Program Interpace)와 커서를 통한 사용자의 편리한 검색을 지원하는 검색API를 제공한다. 마지막으로 하부 저장 관리자는 SHORE(Scalable Heterogeneous Object REpository) 저장 시스템을 이용하여 UNLX 운영체제 하엣 표준 C++언어를 사용하여 구현하였다. 구현하였다.

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Short-Term High Expression of Interferon-Alpha Modulates Progression of Type 1 Diabetes in NOD Mice

  • Park, Mi-Kyoung;Seo, Su-Yeong;Hong, Sook-Hee;Kim, Hye-Jin;Park, Eun-Jin;Kim, Duk-Kyu;Lee, Hye-Jeong
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제10권1호
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    • pp.39-44
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    • 2006
  • Type I diabetes (T1D) is an organ-specific autoimmune disease caused by the T cell-mediated destruction of the insulin-producing ${\beta}$ cells in the pancreatic islets. The onset of T1D is the consequence of a progressive destruction of islet ${\beta}$ cells mediated by an imbalance between effector $CD4^+$ T helper (Th)1 and regulatory $CD4^+$ Th2 cell function. Since interferon-alpha (IFN-${\alpha}$) has been known to modulate immune function and autoimmunity, we investigated whether administration of adenoviralmediated IFN-${\alpha}$ gene would inhibit the diabetic process in NOD mice. The development of diabetes was significantly inhibited by a single injection of adenoviral-mediated IFN-${\alpha}$ gene before 8 weeks of age. Next, we examined the hypothesis that Th2-type cytokines are associated with host protection against autoimmune diabetes, whereas Th1-type cytokines are associated with pathogenesis of T1D. The expression of IFN-${\alpha}$ induced increase of serum IL-4 and IL-6 (Th2 cytokines) levels and decrease of serum IL-12 and IFN-${\gamma}$ (Th1 cytokines) levels. Therefore, overexpression of IFN-${\alpha}$ by adenoviralmediated delivery provides modulation of pathogenic progression and protection of NOD mice from T1D.

동영상 컨텐츠의 메타데이타에 기반한 효율적인 브라우징 기법 (Efficient Browsing Method based on Metadata of Video Contents)

  • 천수덕;신정훈;이상준
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제16권5호
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    • pp.513-518
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    • 2010
  • 정보기술은 통신 및 멀티미디어 기술의 발전에 힘입어 빠르게 발전하고 있으며, 이에 따른 디지털 콘텐츠에 대한 수요가 증가하였다. 디지털 콘텐츠 중 비디오 콘텐츠는 VOD, NOD, 디지털 도서관, IPTV, UCC 등 다양한 응용 분야에서 점점 확산되고 있다. 비디오 데이터는 순차적인 특성이 있으며, 시간과 공간정보가 결합한 3차원 데이터로서 계산 비용이 많이 드는 작업이기 때문에 검색이나 브라우징이 어렵다. 본 논문에서는 비디오 데이터를 구조화하는 동영상 내용 편집 도구(ATVC: Authoring Tool for Video Contents)를 제안한다. 동영상 내용 편집 도구는 비주얼 리듬을 이용하여 비디오 데이터에서 대표 프레임을 추출한 다음 XML을 이용한 태그 및 키워드 정보를 대표 프레임에 삽입하는 도구(Tool)이다. 비주얼 리듬은 3차원의 시공간적인 정보를 2차원으로 매핑한 정보로 IDCT과정 없이 픽셀 정보를 얻을 수 있어 처리속도가 빠르며 컷, 와이프, 디졸브 등의 편집 효과를 효과적으로 구분할 수 있다. 그리고 XML 데이터에는 태그 및 키워드 정보와 함께 대표 프레임의 정보까지 저장되므로 효율적인 브라우징을 제공할 수 있다.

Ginsenoside Rg3 protects against iE-DAP-induced endothelial-to-mesenchymal transition by regulating the miR-139-5p-NF-κB axis

  • Lee, Aram;Yun, Eunsik;Chang, Woochul;Kim, Jongmin
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제44권2호
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    • pp.300-307
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    • 2020
  • Background: Emerging evidence suggests that endothelial-to-mesenchymal transition (EndMT) in endothelial dysfunction due to persistent inflammation is a key component and emerging concept in the pathogenesis of vascular diseases. Ginsenoside Rg3 (Rg3), an active compound from red ginseng, has been known to be important for vascular homeostasis. However, the effect of Rg3 on inflammation-induced EndMT has never been reported. Here, we hypothesize that Rg3 might reverse the inflammation-induced EndMT and serve as a novel therapeutic strategy for vascular diseases. Methods: EndMT was examined under an inflammatory condition mediated by the NOD1 agonist, γ-d-glutamyl-meso-diaminopimelic acid (iE-DAP), treatment in human umbilical vein endothelial cells. The expression of EndMT markers was determined by Western blot analysis, real-time polymerase chain reaction, and immunocytochemistry. The underlying mechanisms of Rg3-mediated EndMT regulation were investigated by modulating the microRNA expression. Results: The NOD1 agonist, iE-DAP, led to a fibroblast-like morphology change with a decrease in the expression of endothelial markers and an increase in the expression of the mesenchymal marker, namely EndMT. On the other hand, Rg3 markedly attenuated the iE-DAP-induced EndMT and preserved the endothelial phenotype. Mechanically, miR-139 was downregulated in cells with iE-DAP-induced EndMT and partly reversed in response to Rg3 via the regulation of NF-κB signaling, suggesting that the Rg3-miR-139-5p-NF-κB axis is a key mediator in iE-DAP-induced EndMT. Conclusion: These results suggest, for the first time, that Rg3 can be used to inhibit inflammation-induced EndMT and may be a novel therapeutic option against EndMT-associated vascular diseases.

계층적 속성문법을 위한 효율적인 점진적 속성평가 (Effective incremental attribute evaluation for a hierarchical attribute grammar)

  • 장재춘;김태훈
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제2권3호
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    • pp.71-79
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    • 2001
  • 점진적 속성 평가 알고리즘에서는 새로운 입력 트리가 기존 입력 트리와 정확히 비교되어서 새로운 트리를 구성할 때 기존 속성 트리의 어떤 서브 트리를 사용해야 하는가를 결정한다. 이 논문에서는 계층적 속성 문법의 점진적 평가를 효율적으로 하기 위해 점진적 속성 평가 알고리즘을 이용하였으며 Carle과 Pollock의 알고리즘을 분석하여 점진적 속성 평가 알고리즘으로 재구성하고, 속성 트리 dcopy의 구성요소를 새로운 속성 트리 d'copy에 적용하여 최적화된 속성 트리 d'copy의 점진적 속성 평가 알고리즘을 구성하였다. 또한 점진적 속성 평가 알고리즘을 이용하여 실제적인 입력 프로그램에서 재사용된 노드의 표현과 정의된 변수 형(type)이 어떻게 점진적인 속성 평가를 수행하는가를 나타내었다.

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