The aim of the sutdy is to collect a variety of wild yeasts from different regions in Korea and in different seasons and to account for the natural patterns of regional and seasonal variation that they display. From the specimens collected in this study, more useful strains are expected to be discovered, which can be cultivated and utilized fro industrial development. The study attempts to determine the degree to which utilizable yeasts can be applied in brewing, confectionary, baking, the manufacture of medicine, and as feed yeast. Such findings would contribute not only to the development of academic research, but would also be important in obtaining raw material that can be applied in our daily lives and in industrial development in response to the demands of the times.
To understand the importance of Y-base adjacent to the anticodon stabilizing codon-anticodon interaction, a study has been undertaken for the model compound involving the interaction between Y-base and anticodon as well as the participation of water molecule by calculating the conformational free energy using an empirical potential function. We restrict our analysis to sites directly associated with Y-base by varying only the backbone torsion angles of Y-base. The hydration and $Mg^{+2}$ binding effects on the conformational stability of Y-base are calculated and discussed. The free Y-base is proved to be less stable than the hydrated one. The free energy change due to the hydration of Y-base amounts to -119.5 kcal/mole, in which the conformational energy change is -142.4 kcal/mole and the configurational entropy change is -76.9 e. u. It is found that the water molecules bound to Y-base and $Mg^{+2}$ contribute to the conformation of Y-base dominantly.
Kumar, G. Satheesh;Chandra, M. Subhosh;Mallaiah, K.V.;Sreenivasulu, P.;Choi, Yong-Lark
Journal of Life Science
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v.22
no.4
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pp.472-477
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2012
A thermophilic $Alicyclobacillus$$acidocaldarius$, which produces thermostable ${\alpha}$-amylase, was isolated from the hot water effluent of a boiled rice mill near Tirupati, Andhra Pradesh, India. The effect of different culture conditions on the growth and production of extracellular ${\alpha}$-amylase by thermophilic $A.$$acidocaldarius$ was investigated in laboratory scale. The results showed that the optimum conditions for the production of ${\alpha}$-amylase are a temperature of $60^{\circ}C$, pH of 6.0, and medium starch concentration of 1.0%, and yeast extract and tryptone of 0.2%. Surfactants, like Tween-20 and SDS, up to 0.02%, were found to increase the bacterial growth and enzymes. Further increase in their concentration resulted in significantly decreased enzyme production.
Kim, Sung-Won;Jo, Min-Young;Yokota, Yasuhiro;Chung, Yun-Jo;Park, Chung-Ung;Kim, Kyung-Suk
Bulletin of the Korean Chemical Society
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v.25
no.2
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pp.237-242
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2004
Recombinant human ferritin homopolymers (rHF and rLF) were successfully produced in the Saccharomyces cerevisiae Y2805, which was transformed with human ferritin H or L-chain genes, respectively. In order to characterize the molecular properties of the recombinant ferritins in relation to mineralization, the proteins were isolated and apoferritins were prepared. The apoferritins were reconstituted with 2000 Fe atoms per protein molecule under various experimental conditions (the concentration of the protein, the buffer concentration of the MOPS buffer, the total volume of the reaction and the reconstitution method). The structure and composition of the iron cores formed in the ferritins were examined using transmission electron microscopy. The recombinant ferritins behaved in a similar manner to other mammalian ferritins in accumulating iron in the core. Proteins of rHF and rLF showed varying reconstitution yields of 37-72% depending on the reaction conditions. In general, the rHF showed higher reconstitution yield than the rLF at the protein concentrations and the reaction volumes we examined. Iron cores with a similar mean particle size were obtained in the rHF, rLF and horse spleen ferritin reconstituted at a protein concentration of 1.0 mg/mL. Electron diffraction of all the three ferritins showed 2-3 diffuse lines, with d-spacings corresponding to those of the mineral ferrihydrite with a limited crystallinity.
Tricholoma matsutake is an ectomycorrhizal fungus, related with the host of Pinus densiflora. Most of studies on T. matsutake have focused on mycelial growth, genes and genomics, phylogenetics, symbiosis, and immune activity of this strain. T. matsutake is known for its unique fragrance in Eastern Asia. The most major component of its scent is (R)-(-)-1-octen-3-ol and is biosynthesized from the substrate linoleic acid by the sequential reaction of lipoxygenase and peroxide lyase. Here, we report for the first time the biosynthesis of (R)-(-)-1-octen-3-ol of T. matsutake using the yeast Saccharomyces cerevisiae as a host. In this study, cDNA genes correlated with these reactions were cloned from T. matsutake, and expression studies of theses genes were carried out in the yeast Saccharomyces cerevisiae. The product of these genes expression study was carried out with Western blotting. The biosynthesis of (R)-(-)-1-octen-3-ol of T. matsutake in recombinant Saccharomyces cerevisiae was subsequently identified with GC-MS chromatography analysis. The biosynthesis of (R)-(-)-1-octen-3-ol with S. cerevisiae represents a significant step forward.
Selenium is considered to be one of the most controversial trace elements. On the one hand, it is toxic at high doses and there is a great body of information related to environmental issues of Se contamination. On the other hand, Se deficiency is a global problem related to an increased susceptibility to various diseases of animals and humans and decreased productive and reproductive performance of farm animals. Optimisation of Se nutrition of poultry and farm animals will result in increased efficiency of egg, meat and milk production and even more important, will improve quality. From the data presented in the review it is clear that the main lesson which we have to learn from nature is how to use organic selenium in animal and human diets. Selenium-enriched yeast (Sel-Plex) is the result of such a lesson and it is just a matter of time before animal nutrition moves completely from using ineffective sodium selenite to organic selenium. Other lessons from nature will follow. Recent advances in genomics and proteomics, in association with descriptions of new selenoproteins, will be a driving force in reconsidering old approaches related to Se nutrition. Probably 90% of all Se research has been conducted with sodium selenite and we now understand that the natural form of selenium is different. The main advances in Se status assessment and Se requirements were established based on the activity of glutathione peroxidase (GSH-Px), an enzyme which for many years was considered to be the main selenoprotein. Recently it was discovered that it is only one of at least 25 various selenoproteins. Se research and practical applications are developing quickly and they are very exciting and promising.
An intracellular accumulation of cadmium by the intact cell of an extremely cadmium tolerant yeast, Hansenula anomala B-7, was investigated in the presence of Triton X-100. The uptake of cadmium by the intact cell was efficiently enhanced up to approximately 40% or more by 0.1% of Triton X-100 and Aerosol OT, respectively. The Michaelis constant, Km, done by Lineweaver-Burk plot of accumulation velocity of cadmium vs. cadmium concentration was calculated to be 0.247mM. The optimal conditions of pH and the temperature for the effective cadmium uptake were from neutrality to alkali and 4$0^{\circ}C$, respectively. The accumulation of cadmium was increased approximately 3 times under the shaking incubation, with no correlation to shaking rate. By zinc the cadmium accumulation was decreased.
LEE, JI-HYUN;JEONG-HWA KIM;MI-RYUNG KIM;SUNG-MI LIM;SOO-WAN NAM;JIN-WOO LEE;SUNG-KOO KIM
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.12
no.1
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pp.1-7
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2002
The effects of DO and pH on the mass production of pullulan with high molecular weight and the morphology of A. pullulans ATCC 42023 were evaluated. A. pullulans showed a maximum production of pullulan (11.98 g/l) when the initial pH of the culture broth was 6.5 in a shake-flask culture. In a batch culture, the mixture of a yeast-like and mycelial cell forms was found at a pH of 4.5, and the maximum production of pullulan (13.31 g/l) was obtained. However, a high proportion of high molecular weight pullulan (M.W.>2,000,000) was produced at a pH of 6.5, with a yeast-like morphology. The maximum pullulan production yield ($51\%$) was obtained at a pH noncontrol (initial pH 6.5) and DO control (above $50\%$) condition. Pullulan degrading enzyme was activated when the pH of the broth was lower than 5.0 and the portion of low molecular weight pullulan was increased. The formation of a black pigment was observed at an initial stationary phase, at 40 h of fermentation. Therefore, the fermentation should be carried out in a pH noncontrol (initial pH of 6.5) and DO control (above $50\%$) condition, and should be harvested before reaching the stationary phase (around 40 h) for the production of high molecular weight pullulan.
Dryfilm method by using 3M Petrifilm$^{TM}$ has been examined to replace conventional agar method for isolation of microorganisms from foods. The objectives of the present study were to evaluate suitability of dryfilm method as a microbial isolation method and to determine the effect of antimicrobial agent on dryfilm for isolation of microorganisms from foods. Five different foods, milk, ground beef, fishery surimi, Takju and wheat flour were used to isolate the natural microflora in foods and the inoculated Escheri chia coli. Standard method agar (SMA, Difco) and Petrifilm$^{TM}$ aerobic count (PAC, 3M) were used to isolate total microorganisms from foods. Violet red bile agar (VRBA), brilliant green lactose bile (BGLB) broth and Petrifilm$^{TM}$ coliform count (PCC, 3M) were used to isolate coliforms from foods. E. coli broth (EC broth) and Petrifilm$^{TM}$ E. coli count (PEC, 3M) were used to isolate E. coli from foods. Acidified potato dextrose agar (APDA) and Petrifilm$^{TM}$ yeast & mold count (PYMC, 3M) were used to isolate yeasts and molds from foods. Total aerobic plate counts isolated from five different foods by SMA and PAC (3M) were riot significantly different each other at P<0.05 level and were highly correlated each other ($\geq$0.96). Mugwort extract as an antimicrobial agent did not affect microbial enumeratiion of Dryfilm. Significantly higher number of coliform colonies were formed on VRBA than PCC (3M) from ground beef, but they were not significantly different in coliform colonies from milk samples. PCC (3M) and BGLB were not significantly different for enumeration of coliforms in milk and beef samples. Significantly higher number of E. coli were isolated by EC broth than PEC from ground beef, but these were not significontly different for enumeration of E. coli from milk. Yeast and mold counts isolated from Takju and wheat flour by APDA and PYMC (3M) were not significantly different at P<0.05 level. These data indicate that dryfilm method by using 3M Petrifilm$^{TM}$ can be successively used as an alternative to conventional agar method for enumeration of microorganisms in various foods.
So, Kum-Kang;Ko, Yo-Han;Chun, Jeesun;Kim, Jung-Mi;Kim, Dae-Hyuk
한국균학회소식:학술대회논문집
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2018.05a
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pp.11-11
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2018
Cryphonectria parasitica, chestnut blight fungus, has a characteristic of decreasing pathogenicity when infected with Cryphonectria hypovirus 1. C. parasitica is known to be one of the most representative model systems used to observe the interaction between viruses, plants and fungi. The mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway, which is well conserved in various organisms ranging from yeast to humans, functions in relaying phosphorylation-dependent signals within MAPK cascades to diverse cellular functions involved in the regulation of pheromone, cell wall integrity, and osmotolerance in filamentous fungi. Several genes in the MAPK pathway were revealed to be regulated by hypovirus, or to be involved in pathogenicity in C. parasitica. Among these pathways, the CWI pathway has aroused interest because CpBck1, an ortholog of yeast Bck1 (a CWI MAPKKK), was previously reported to be involved in cell wall integrity and sectorization. Interestingly, sporadic sectorization was observed in the CpBck1 mutant and sectored phenotypes were stably inherited in the progeny that were successively transferred from sectored mycelia. In this study, we analyzed the biological function of CpSlt2, downstream gene of CpBck1, to confirm whether the sectorization phenomenon occurred in the specific single gene or cell wall integrity (CWI) pathway. As results, the CpSlt2-null mutant exhibited marked changes in colonial growth, near absence of conidiation and aerial hyphae, abnormal pigmentation, CWI-related phenotypic defects, and dramatically impaired virulence. As cultivation of the mutant strains progressed, the majority of the colonies showed sporadic sectorization and mycelia from the sectored area stably maintained the sectored phenotype. These results suggest that the unique sectorization is CWI pathway-specific, though the components in the same CWI pathway have common and specific functions.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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