We investigated the virulence genes, O-serotypes, antimicrobial resistance of pathogenic E. coli isolated from carcasses (n=455) and environmental (n=372) samples of 11 cattle and 12 pig slaughterhouses from December 2020 to December 2021. E. coli were isolated from nine carcasses (2.0%), three slaughter facilities (1.4%), two utensils (2.7%) and three abattoir workers (3.5%) from four cattle and four pig slaughterhouses. Among all isolates, 13 STEC (76.5%) were identified, followed by four EPEC (23.5%). As a result of the antibiotic susceptibility test, all isolates were resistant to at least one antimicrobial, of which 70.6% isolates showed multidrug resistance patterns. The serotypes were diverse in pigs compared to cattle, with serotypes O18, O66, O109 in cattle and O9, O76, O85, O100, O153, and O159 in pigs. In a single cattle slaughterhouse, eight STEC O66 were isolated from various types of sample (4 slaughter animal surfaces, 3 gloves, and 1 knife) with two antimicrobial resistance patterns (CHL-FIS-STR and CHL-FIS). Those two types of strain were suspected cross-contamination from utensils to slaughter animal surfaces. These results showed that pathogenic E. coli were detected in carcasses and various environmental samples in cattle and pig slaughterhouses. Nationwide monitoring and hygiene management are required to prevent cross-contamination of STEC isolate slaughterhouses.
Background: The emergence of drug-resistant tuberculosis (TB), is a major menace to cast off TB worldwide. Line probe assay (LPA; GenoType MTBDRplus ver. 2) and Xpert MTB/RIF assays are two rapid molecular TB detection/diagnostic tests. To compare the performance of LPA and Xpert MTB/RIF assay for early diagnosis of rifampicin-resistant (RR) TB in acid-fast bacillus (AFB) smear-positive and negative sputum samples. Methods: A total 576 presumptive AFB patients were selected and subjected to AFB microscopy, Xpert MTB/RIF assay and recent version of LPA (GenoType MTBDRplus assay version 2) tests directly on sputum samples. Results were compared with phenotypic culture and drug susceptibility testing (DST). DNA sequencing was performed with rpoB gene for samples with discordant rifampicin susceptibility results. Results: Among culture-positive samples, Xpert MTB/RIF assay detected Mycobacterium tuberculosis (Mtb) in 97.3% (364/374) of AFB smear-positive samples and 76.5% (13/17) among smear-negative samples, and the corresponding values for LPA test (valid results with Mtb control band) were 97.9% (366/374) and 58.8% (10/17), respectively. For detection of RR among Mtb positive molecular results, the sensitivity of Xpert MTB/RIF assay and LPA (after resolving discordant phenotypic DST results with DNA sequencing) were found to be 96% and 99%, respectively. Whereas, specificity of both test for detecting RR were found to be 99%. Conclusion: We conclude that although Xpert MTB/RIF assay is comparatively superior to LPA in detecting Mtb among AFB smear-negative pulmonary TB. However, both tests are equally efficient in early diagnosis of AFB smear-positive presumptive RR-TB patients.
Back, Seung Hyun;Eom, Hong Sik;Lee, Haeng Ho;Lee, Gi Yong;Park, Kun Taek;Yang, Soo-Jin
Journal of Veterinary Science
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제21권1호
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pp.2.1-2.14
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2020
The emergence of livestock-associated (LA)-methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in livestock animal has become a significant zoonotic concern. In the present study, we investigated nationwide prevalence of LA-MRSA across pork production chain including pig farms, slaughterhouses, and retail markets. A total of 40 MRSA strains were isolated during the investigation and the overall prevalence of MRSA was 3.4% (n = 37), 0.6% (n = 2), and 0.4% (n = 1) in pig farms, slaughterhouses, and retail markets, respectively. Multilocus sequence typing analyses revealed that the 2 most significant clonal lineages in pork production chain in Korea were ST398 (n = 25) and ST541 (n = 6). All of the 40 MRSA isolates were further characterized to investigate key genotypic and phenotypic correlates associated with the emergence and spread of clonal complex 398 (CC398; ST398, and ST541) LA-MRSA. Although the prevalence of swine-associated MRSA was still relatively low and mostly restricted to pig farms, multidrug-resistant CC398 LA-MRSA isolates with new spa types (t18102 and t18103) were identified as a major clonal lineage. The CC398 LA-MRSA strains tended to exhibit increased levels of multiple drug resistance (MDR) phenotype compared with non-CC398 MRSA strains. Of note, in comparison with non-CC398 MRSA isolates, CC398 LA-MRSA isolates exhibited significantly enhanced tetracycline (TET) and zinc resistance. These findings suggested that co-selection pressure associated with MDR phenotype, especially TET resistance, and zinc resistance may have played a significant role in the emergence and persistence of CC398 LA-MRSA in pig farms in Korea.
Streptococcus is one of the major pathogen groups inducing bovine mastitis. The aim of this study was to investigate the antimicrobial resistance patterns of Streptococcus species isolated from bovine mastitis milk samples in Korea from 2016 to 2021. In total, 181 (10.3%) Streptococcal isolates were collected from 1,761 quarter milk samples at 122 farms; S. uberis 39.2% (n=71), S. dysgalactiae 29.3% (n=53), S. equinus 9.9% (n=18), S. suis 6.1% (n=11), S. parauberis 4.4% (n=8), S. lutetiensis 3.9% (n=7), others 7.2% (n=13). However, S. agalactiae was not isolated. The isolates showed the highest resistance rate to tetracycline (55.2%) followed by erythromycin (45.3%) and pirlimycin (36.5%). In contrast, all isolates were susceptible to ceftiofur, cephalothin, penicillin/novobiocin, and only single S. equinus isolate was resistant to both ampicillin and penicillin. Of 181 isolates, 64 (35.4%) were multidrug resistance (MDR). The resistance to pirlimycin of S. uberis (73.2%) was much higher than that of other species (0~36.4%). All S. suis isolates were resistance to tetracycline. S. dysgalactiae showed lower resistance to erythromycin, pirlimycin and tetracycline than S. uberis and S. suis. The rate of MDR was relatively higher among S. uberis (73.2%) than among S. suis (36.4%), S. dysgalactiae (15.1%), others (0%). In conclusion, antimicrobial resistance in Streptococcus spp. should be regularly examined for appropriate therapies because the resistance patterns were various among the individual species.
The aim of this study was to investigate the prevalence of antimicrobial resistance and virulence factors in staphylococci isolated from canine otitis externa. A total 295 causative microorganisms were isolated. The most common isolated species were Staphylococcus (S) pseudintermedius (94 isolates) followed by Pseudomonas aeruginosa (60 isolates), S. schleiferi (25 isolates), Escherichia coli (23 isolates) and Proteus mirabilis (20 isolates). Staphylococci isolates were showed high resistance to penicillin (78.6%), erythromycin (55.9%), tetracycline (52.4%), clindamycin (51.7%) and ciprofloxacin (42.8%). Of the 145 staphylococci isolates, 49 (33.8%) methicillin-resistant staphylococci (MRS) were observed, distributed among S. pseudintermedius (n=34), S. schleiferi (n=6), S. epidermis (n=4), S. hominis (n=2), S. aureus, S. caprae and S. saprophyticus (n=1, respectively). Forty-three (87.8%) of 49 MRS and 10 (10.4%) of 96 methicillin-susceptibility staphylococci harbored mecA gene. About 80% of MRS were multidrug-resistant with resistance to at least one antibiotic in three or more antibiotic classes. Resistance genes blaZ (93/114, 81.5%), ermB (35/81, 43.2%), ermC (3/81, 3.7%), aacA-aphD (50/54, 92.5%), tetM (69/76, 90.7%) and tetK (6/76, 7.8%) were detected among resistant isolates. Virulence factors genes lukF and lukS were found in 100%(145/145) and 43.4%(63/145), respectively. Genes encoding ermA, eta, etb and tsst were not detected. To the best of our knowledge, this is the first study which investigated for the presence of genes encoding antimicrobial resistance and staphylococcal toxins in staphylococci isolated from canine otitis externa. A continuous monitoring and surveillance program to prevent antimicrobial resistance in companion animals is demanded.
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is an important healthcare problem worldwide. Often, glucocorticoid (GC) resistance develops during COPD treatment. As a classic hypoglycemic drug, metformin (MET) can be used as a treatment strategy for COPD due to its anti-inflammatory and antioxidant effects, but its specific mechanism of action is not known. We aimed to clarify the role of MET on COPD and cigarette smoke extract (CSE)-induced GC resistance. Through establishment of a COPD model in rats, we found that MET could improve lung function, reduce pathological injury, as well as reduce the level of inflammation and oxidative stress in COPD, and upregulate expression of nuclear factor E2-related factor 2 (Nrf2), heme oxygenase-1 (HO-1), multidrug resistance protein 1 (MRP1), and histone deacetylase 2 (HDAC2). By establishing a model of GC resistance in human bronchial epithelial cells stimulated by CSE, we found that MET reduced secretion of interleukin-8, and could upregulate expression of Nrf2, HO-1, MRP1, and HDAC2. MET could also increase the inhibition of MRP1 efflux by MK571 significantly, and increase expression of HDAC2 mRNA and protein. In conclusion, MET may upregulate MRP1 expression by activating the Nrf2/HO-1 signaling pathway, and then regulate expression of HDAC2 protein to reduce GC resistance.
Aly E. Abo-Amer;Sanaa M. F. Gad El-Rab;Eman M. Halawani;Ameen M. Niaz;Mohammed S. Bamaga
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제32권12호
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pp.1537-1546
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2022
Staphylococcus aureus is a cause of high mortality in humans and therefore it is necessary to prevent its transmission and reduce infections. Our goals in this research were to investigate the frequency of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) in Taif, Saudi Arabia, and assess the relationship between the phenotypic antimicrobial sensitivity patterns and the genes responsible for resistance. In addition, we examined the antimicrobial efficiency and application of silver nanoparticles (AgNPs) against MRSA isolates. Seventy-two nasal swabs were taken from patients; MRSA was cultivated on Mannitol Salt Agar supplemented with methicillin, and 16S rRNA sequencing was conducted in addition to morphological and biochemical identification. Specific resistance genes such as ermAC, aacA-aphD, tetKM, vatABC and mecA were PCR-amplified and resistance plasmids were also investigated. The MRSA incidence was ~49 % among the 72 S. aureus isolates and all MRSA strains were resistant to oxacillin, penicillin, and cefoxitin. However, vancomycin, linezolid, teicoplanin, mupirocin, and rifampicin were effective against 100% of MRSA strains. About 61% of MRSA strains exhibited multidrug resistance and were resistant to 3-12 antimicrobial medications (MDR). Methicillin resistance gene mecA was presented in all MDR-MRSA strains. Most MDR-MRSA contained a plasmid of > 10 kb. To overcome bacterial resistance, AgNPs were applied and displayed high antimicrobial activity and synergistic effect with penicillin. Our findings may help establish programs to control bacterial spread in communities as AgNPs appeared to exert a synergistic effect with penicillin to control bacterial resistance.
Objectives: The aim of this study was to evaluate the effect of fruit juices on Multi-Drug Resistant (MDR) bacterial pathogens involved in Urinary Tract Infections (UTIs) and Sexually Transmitted Infections (STIs) among tribal women in the district Anuppur, Madhya Pradesh, India. Methods: Fresh juices of lemon (Citrus limon), amla/Indian gooseberry (Phyllanthus emblica), pineapple (Ananas comosus), mosambi/sweet lime (Citrus limetta), orange (Citrus sinensis), kiwi (Actinidia deliciosa), and pomegranate (Punica granatum) fruits were evaluated for in vitro antibacterial activity against bacterial pathogens involved in UITs and STIs among tribal women. Physico-chemical analysis of fresh fruits was also carried out by measuring the pH, moisture, protein, fat, crude fibre, carbohydrate, and ascorbic acid content. Results: Lemon and amla juice showed better antibacterial activity against the pathogens as compared to other juices. MIC results fruit juices against UTIs and STIs pathogens vary depending on the specific pathogen and juice chemical constituents. The physico-chemical analysis showed that the moisture content was highest in mosambi (90%), followed by orange (87%). Ascorbic acid content was found highest in amla (540 mg/100 g), followed by kiwi (90.3 mg/100 g). Pomegranate showed highest concentration of carbohydrate (15.28 g/100 g), fat (1.28 g/100 g), and protein (1.65 g/100 g). Lemon juice had lowest pH of 2.20, followed by amla 2.67. Conclusion: The lemon juice showed highest antibacterial activity against MDR bacterial pathogens involved in UTIs and STIs among tribal women in district Anuppur, Madhya Pradesh, India. The low pH of lemon may be responsible for its high antibacterial activity as compared to other juices.
Ji Heon Park;Gi Yong Lee;Ji Hyun Lim;Geun-Bae Kim;Kun Taek Park;Soo-Jin Yang
한국축산식품학회지
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제43권5호
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pp.792-804
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2023
Non-aureus staphylococci (NAS), particularly antimicrobial-resistant NAS, have a substantial impact on human and animal health. In the current study, we investigated (1) the species profiles of NAS isolates collected from healthy broilers, farm environments, and farm workers in Korea, (2) the occurrence of antimicrobial-resistant NAS isolates, especially methicillin resistance, and (3) the genetic factors involved in the methicillin and fluoroquinolone resistance. In total, 216 NAS isolates of 16 different species were collected from healthy broilers (n=178), broiler farm environments (n=18), and farm workers (n=20) of 20 different broiler farms. The two most dominant broiler-associated NAS species were Staphylococcus agnetis (23.6%) and Staphylococcus xylosus (22.9%). Six NAS isolates were mecA-positive carrying staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) II (n=1), SCCmec IV (n=1), SCCmec V (n=2), or nontypeable SCCmec element (n=2). While two mecA-positive Staphylococcus epidermidis isolates from farm workers had SCCmec II and IV, a mecA-positive S. epidermidis isolate from broiler and a Staphylococcus haemolyticus isolate farm environment carried SCCmec V. The occurrence of multidrug resistance was observed in 48.1% (104/216 isolates) of NAS isolates with high resistance rates to β-lactams (>40%) and fusidic acid (59.7%). Fluoroquinolone resistance was confirmed in 59 NAS isolates (27.3%), and diverse mutations in the quinolone resistance determining regions of gyrA, gyrB, parC, and parE were identified. These findings suggest that NAS in broiler farms may have a potential role in the acquisition, amplification, and transmission of antimicrobial resistance.
Sin-Wook Park;Keon Kim;Chang-Yun Je;Chang-Hyeon Choi;Sang-Gyue Choi;Jong-Soo Lim;Ok-Mi Jeong;Guk-Hyun Suh;Chang-Min Lee
한국동물위생학회지
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제46권3호
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pp.211-218
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2023
This study was carried out to investigate the prevalence and antimicrobial resistance of Salmonella serotypes in duck farms of Jeollanam-do Province, South Korea. A total of 1112 samples (breeder ducks, 286; broiler ducks, 826) were collected from 196 duck farms (breeder duck farms, 25; broiler duck farms, 171) between January 2018 and November 2019. The total prevalence of Salmonella serotypes was 45.4% (89/196) in the duck farms, with no significant difference between prevalence in breeder and broiler duck farms (48% and 45%, respectively; P>0.05). The most prevalent serotype among the 127 Salmonella isolates was Salmonella Typhimurium (20.5%) followed by Salmonella Albany (17.3%), Salmonella Hadar (15.7%), and Salmonella Enteritidis (11.8%). Maximum resistance was observed against penicillin (78.74%), followed by tetracycline (68.50%), and kanamycin (65.35%). Of the 127 isolates, 117 (92.13%) were resistant to ≥3 antimicrobials and 2 to all 18 antimicrobials. Our results demonstrate the presence of Salmonella strains and their resistance to multiple antimicrobials, thus indicating a public health concern in South Korea. The emergence of Salmonella stains that are resistant to multiple drugs highlight the need for careful use of antimicrobials in duck farms.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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