• 대한수의학회지
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• 제34권2호
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• pp.243-247
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• 1994

As a result of the detection of mitochondrial DNA(mtDNA) polymorphism to Thoroughbred and Percheron using 14 restriction enzymes, mtDNA polymorphism of Cheju horse observed in the Bam HI and Sac I. Only in both restriction enzymes two types were classified as of A type, which is high expression frequency and B type, which is low expression frequency. In the other 12 restriction enzymes mtDNA polymorphism was not detected. On the basis of this information mtDNA polymorphism of Cheju horse was examined but was not observed the polymorphism and only A type was expressed both Bam HI and Sac I restriction enzymes. Through this study Cheju horse was demonstrated that lower genetic variation was expressed from the detection of mtDNA polymorphism.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제13권1호
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• pp.21-27
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• 1997

한국 고유종인 새코미꾸리(Cobitis rotundicaudata)의 집단간 유전적 차이에 따른 종 분화 여부를 밝히고자 4개집단을 대상으로mitochondrial DNA(mtDNA)의 RFLP분석을 실시 하였다. C. rotundicaudata mtDNA를 10개의 6-base cutting 제한요소로 처리한 다음 그 절 편 양상을 비교, 분석한 결과 4개 집단 공히 mtDNA의 전체 genome 크기는 약 16.5$\pm$ 0.5Kbp였으며 공통절편수(F)에서 한강 2개 집단(가평, 진부)과 동해안 마읍천 짐단간의 F값 은 0.911로 매우 가까웠으나 낙동강의 산청집단은 타 3개 집단과 F=0.375로 차이가 있었다. 또한 염기치환율(p)에 있어서도 한강 2개 집단 및 마읍천 집단간은 평균 p=0.005로 매우 유 사하였으나, 산청 집단은 타 집단들과 염기치환율에 있어 p=0.059로 종수준의 뚜렷한 차이 를 나타내어서 이들은 각각 별종으로 사료된다.

• 한국수산과학회지
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• 제30권5호
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• pp.804-808
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• 1997

한국산 참굴의 유전적 특성을 조사하기 위하여 한국의 지역별 참굴을 대상으로 mtDNA 제한효소 절편분석과 클로닝을 수행하였다. 지역별로 각각 20개체의 mtDNA에 대하여 8가지 제한효소를 사용하여 DNA 절편양상을 분석한 결과 서해안산 참굴에서는 개체간 차이가 없는 단일 양상이었으며 남해안산의 경우는 두 가지 양상을 보였으며 차이는 HindIII 절단양상에서만 나타났다. 그 중 소수 개체들에서 나타난 양상은 서해안산 개체들에서의 양상과 동일하여 남해안에 서해안산 참굴이 유입되어 혼재하는 것으로 추정되었다. 한국산 참굴의 mtDNA를 대장균 E. coli HB101에서 클로닝하여 유전적 분석을 용이하도록 하였다. 전체 mtDNA를 제한효소를 사용하여 세부분으로 나누어 pUC19 유전자운반체에 클로닝하였다. 클로닝된 재조합 DNA를 제한효소들로 절단하여 한국산 참굴 mtDNA의 제한효소지도를 작성하였다. 남해안산과 서해안산 참굴 mtDNA에서 HindIII 적단 양상이 다르게 나타남을 확인하였고 이는 남해안산이나 서해안산에서 염기치환의 돌연변이에 의한 것으로 사료되었다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제16권1호
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• pp.87-90
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• 2015

Alterations in mitochondrial DNA (mtDNA) have been studied in various cancers. However, the clinical value of mtDNA copy number (mtCN) alterations in gastric cancer (GC) is poorly understood. In the present study, we investigated whether alterations in mtCNs might be associated with clinicopathological parameters in GC cases. mtCN was measured in 109 patients with GC by quantitative real-time PCR. Then, correlations with clinicopathological characteristics were analyzed. mtCN was elevated in 64.2% of GC tissues compared with paired, adjacent, non-cancerous tissue. However, the observed alterations in mtCN were not associated with any clinicopathological characteristics, including age, gender, TN stage, Lauren classification, lymph node metastasis, and depth of invasion. Moreover, Kaplan-Meier survival curves revealed that mtCN was not significantly associated with the survival of GC patients. In this study, we demonstrated that mtCN was not a significant marker for predicting clinical characteristics or prognosis in GC.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제13권1호
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• pp.29-36
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• 1997

한국산 기름종개속 어류중 Cobitis taenia complex의 집단간 유전적 차이에 따른 종 분화 여부를 밝히고자 6개 집단을 대상으로 mitochondrial DNA(mtDNA)의 RFLP분석을 실 시하였다. C. taenia complex mtDNA를 10개의 6-base cutting 제한효소로 처리한 다음 그 절편 양상을 비교, 분석한 결과 6개 집단 공히 mtDNA 의 전체 genome 크기는 약 17.0$\pm$ 0.5Kbp였으며 공동절편수(F)에서 C. t. taenia 2개집단과 C. t. stria와 C. t. lutheri 4개 집단 간의 F값은 평균 0.263으로 차이가 있었으나, C. t. striata 와 C. t. lutheri 사이는 F=0.569로 가깝게 나타났다. 염기치환율 (p)에 있어 C. t. taenia는 C. t. striata 및 C. t. lutheri와 평균 p=0.082로 뚜렷한 종간차이를 보였으나, C. t. striata와 C. t. lutheri 집단들은 p=0.033으로 매우 가까운 유사성을 나타내었다. MtDNA 분석결과 C. taenia complex 중 C. t. taenia는 완전히 종분화가 이루어진 별종으로, C. t. striata와 C. t. lutherisms 아직 종수준의 분화가 이루어지지 않은 아종으로 분류함이 타당하다고 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제16권2호
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• pp.240-244
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• 2006

본 실험에서는 토마토의 종자를 기내 배양하여 얻어진 1g 이하의 무균 잎 조직을 이용하여 미토콘드리아를 분리 정제하여 MitoTracker를 이용하여 세포생물학적으로 확인하였고, 이들의 mt를 이용하여 미토콘드리아 DNA와 RNA를 추출과 검정을 하였다. 또한 고농도의 이온성을 이용하여 미토콘드리아와 mtDNA 및 mtRNA을 추출할 수 있었으며, 식물의 여러 종류에도 사용되어질 수 있을 것이다. mtDNA는 PCR 분석에 의하여 plastid DNA와 혼재되어 있지 않음을 확인하였다. mtRNA는 RT-PCR 분석을 통하여 plastid RNA와 흔재되어 있지 않음을 확인할 수 있었다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제12권2호
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• pp.109-117
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• 2015

Purpose: Mitochondrial diseases are clinically and genetically heterogeneous disorders, which make their exact diagnosis and classification difficult. The purpose of this study was to identify pathogenic mitochondrial DNA (mtDNA) mutations in 2 Korean families with myoclonic epilepsy with ragged-red fibers (MERRF) and Leigh syndrome, respectively. Materials and Methods: Whole mtDNAs were sequenced by the method of mtDNA-targeted next-generation sequencing (NGS). Results: Two causative mtDNA mutations were identified from the NGS data. An m.8344A>G mutation in the tRNA-Lys gene (MT-TK) was detected in a MERRF patient (family ID: MT132), and an m.9176T>C (p.Leu217Pro) mutation in the mitochondrial ATP6 gene (MT-ATP6) was detected in a Leigh syndrome patient (family ID: MT130). Both mutations, which have been reported several times before in affected individuals, were not found in the control samples. Conclusion: This study suggests that mtDNA-targeted NGS will be helpful for the molecular diagnosis of genetically heterogeneous mitochondrial diseases with complex phenotypes.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제9권3호
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• pp.101-106
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• 2006

The cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene region of mitochondrial DNA (mtDNA) was examined in four abalone species to estimate its utility as a genetic marker using restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. The utility was evaluated in terms of genetic divergence and relationships among Haliotis discus hannai, H. rufescens, H. rubra, and H. midae in both hemispheres of the world. There was clear genetic divergence in the mtDNA COI region between all pairs of the four species. Moreover, relationships among the abalone species were reflected in their geographical distributions and morphological characteristics. Therefore, RFLP analysis of the mtDNA COI region is a suitable genetic marker for the estimation of genetic divergence and relationships among abalone species. However, it is not effective for the evaluation of genetic differences within abalone species.

• 한국동물학회지
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• 제38권1호
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• pp.87-95
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• 1995

한국산 담수어류의 잉어목, 황어아과(Leuciscinae) 어류 2속 5종의 계통적 유연관계를 구명하기 위하여 mtDNA분석을 실시하였다 6 base를 인지하는 10개의 제한효소를 처리하여 얻어진 강tDNA의 크기는 16.5-17.5 Kb였으며 Bcl I, Bgl I, Bgl II, Hin dIII, Pvu II, Xba I 등은 종간 차이가 뚜렷하였다. 각종의 집단간 mtDNA분화정도는 매우 낮았으나(p=1% 미만) M. oxyephalus의 무주집단과 제주집단은 예리적으로 큰 차이를 보였다(p=5.3%) Moroco속의 종간 분화정도를 비교한 결과 M. oxycephafus와 M. lagowsk서 사이가 평균 f=7.2%로 근면관계가 제일 가까웠고 M. keumkang과 M. semotilus는 타종들과 근연관계가 제일 멀었다. Moroco속과 Phoxinus속간의 평균 유전적 분화정도는 f=13.7%로 현저한 차이를 보였다. Brown 등(1979)의 공식을 이용하여 이들 황어아과 2속 5종의 분화시기를 추정한 결과 이들은 후기 선신세(Pliocene)와 흥적세(Pleistocene) 사이에 분화된 것으로 추정되었으며 이 결과는 동위효소 연구에서 얻어진 결파(Yang and Min, 1989)와 잘 일치한다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권3호
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• pp.301-307
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• 2005

Genetic variants of Hanwoo mtDNA in the region of cytochrome oxidase subunit I, II and III complex were detected using restriction enzymes. PCR primers were designed based on the bovine mtDNA sequence, and 6 primer sets (Mt4, Mt5, Mt6, Mt7, Mt8 and Mt9) were used. A total of 20 restriction enzymes were used, and 6 restriction enzymes, which were Hinf I, Pvu II, Rsa I, Eco RI, Bgl II, and Msp I, showed genetic polymorphisms. Significant associations between genetic variants and weight traits were observed at WT15 (p<0.05) and WT18 (p<0.01) with Pvu II for Mt9, Bgl II for Mt6 and Rsa I for Mt8 segments in the region of cytochrome oxidase subunit complex. Significant associations were also observed at Mt9-Pvu II and Mt6-Bgl II segments for WT9 (p=0.01), WT12 (p=0.02), respectively. These results suggest that genetic variants of mtDNA in the region of cytochrome oxidase subunit complex may be candidate segments for improvement of animal growth as weight traits.