• 제목/요약/키워드: mtCOI gene

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Reports of Drawida (Oligochaeta: Moniligastridae) from far East Asia

  • Blakemore, Robert J.;Lee, Seunghan;Seo, Hong-Yul
    • Journal of Species Research
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    • 제3권2호
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    • pp.127-166
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    • 2014
  • Moniligastrids are an important yet often ignored earthworm group commonly found in cultivated soils, especially paddy, in the tropical East. Seven new taxa are: Drawida koreana austri, D. koreana nanjiro, D. koreana shindo, D. odaesan, D. jeombongsan, D. companio and D. csuzdii Blakemore spp. or sub-spp. nov. from Korea. Drawida csuzdii is the first new species from North Korea since Lumbricidae Eisenia koreana (Zicsi, 1972). Historical East Asian moniligastrids are reviewed chronologically and Drawida barwelli (Beddard, 1886), D. japonica (Michaelsen, 1892) and D. siemsseni Michaelsen, 1910 are compared on their museum types. These three taxa were thought similar and related to D. nepalensis Michaelsen, 1907 and its possible synonym D. burchardi Michaelsen, 1903 (priority!) and both of these to prior D. uniqua (Bourne, 1887). Indian Drawida calebi Gates, 1945 is compared to new material of D. japonica from Japan, and D. willsi Michaelsen, 1907 to the new sub-species of D. koreana Kobayashi, 1938 from Korea. Where available, mtDNA COI gene barcodes are provided to help objective determinations and a phylogram is provided with outgroup Ocnerodrilidae Eukerria saltensis (Beddard, 1895) itself found in rice paddy/irrigation. The challenge now is comparison of all early taxa in their various homelands in order to assess the genetic variability and taxonomic boundaries acceptable, especially for unpigmented D. barwelli and also for pink/grey D. japonica and blue/grey D. koreana. A checklist of moniligastrids is appended showing 22 species from China (including Hainan and Taiwan), 21 from Korea, nine from Japan and the Drawida ghilarovi Gates, 1969 species-complex from far eastern Russian (Siberia). Recent Drawida dandongensis Zhang & Sun, 2014 from Sino-Korean border is misdescribed and cannot be meaningfully compared to any other Drawidas.

한국 남해에서 채집된 사량넙치 Psettina tosana 자어의 분자 동정 및 형태 발달 (Molecular Identification and Morphological Development of Larvae of Psettina tosana Collected from Southern Sea of Korea)

  • 지재민;유효재;황강석;박정호;이정훈;김진구
    • 한국어류학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.244-251
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    • 2017
  • 본 연구는 2016년에 한국 남해에서 채집된 둥글넙치과 자어를 분자방법으로 동정하였으며, 자어의 크기별 외부 형태를 상세히 기술하였다. 채집된 자어 15개체 (3.53~19.49 mm 체장)의 mitochondrial DNA (mtDNA) cytochrome c oxidase subunit I gene (COI) 434 bp의 염기서열을 비교한 결과, 모두 사량넙치로 확인되었다. 사량넙치의 자어는 2개의 길게 연장된 등지느러미 기조를 가지며, 등지느러미와 뒷지느러미 기저에 흑색소포가 일렬로 나 있는 반면 체측에는 흑색소포가 없었다. 성장하면서 체장에 대한 두장 및 두고의 비율이 증가 추세에서 감소 추세로 바뀌는 변곡점이 체장 9.93 mm~10.73mm에서 확인되었다. 사량넙치 자어는 형태적으로 가장 유사한 동백가자미(Psettina iijimae)와 달리 등지느러미와 뒷지느러미의 기저 근처에 흑색소포군을 가지지 않는 점에서 잘 구분된다.

Mitochondrial DNA Sequence Variation of the Oriental Mole Cricket, Gryllotalpa orientalis (Orthoptera: Gryllotalpidae) in Korea

  • Kim, Ik-Soo;Cha, So-Young;Lee, Sun-Young;Kim, Seong-Ryul;Hwang, Jae-Sam;Li, Jianhong;Han, Yeon-Soo;Jin, Byung-Rae
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제14권2호
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    • pp.107-112
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    • 2007
  • The mole crickets, Gryllotalpa, are insect pest distributed in the world. In Korea, G. orientalis was reported to occur, but previous ecological studies suggested the presence of two ecological types. To test this hypothesis, we sequenced a portion of mitochondrial (mt) genome from 48 G. orientali individuals collected over five Korean localities: Busan, Suwon, Okchon, Wonju, and Gangneung. From the sequence analysis, only two haplotypes were obtained, but the sequence divergence between the two haplotypes was 11 %, suggesting the presence of two distinct genetic groups in Korea. Although the population of Busan, Okchon, Wonju, and Gangneung was identified as a single haplotype, but that of Suwon was occupied by both hapotypes. Considering sequence divergence of other insect species occurring in Korea, the divergence estimate found between the two haplotypes seems to be too large to be considered as identical species. This result may suggest that the two differentiated haplotypes found in this study may reflect the previously reported two ecological types found in Suwon, Korea. To further understand the genetic divergence of the two phylogenetic groups, analysis of more variable regions of G. orientalis genome is required.

우리나라 연안해역 난 및 자치어의 분포특성 (Distribution of Eggs and Larvae in Coastal Waters of Korea)

  • 백정익;지환성;유효재;황강석;김두남
    • 한국수산과학회지
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    • 제54권4호
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    • pp.467-479
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    • 2021
  • The distribution and abundance of fish eggs and larvae were investigated from February to December 2020 along the coastal waters of Korea. The eggs and larvae were identified using the mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I (mtDNA COI) and 16s rRNA gene. During the study period, eggs of overall 45 taxa belonging to 26 families were collected and larvae of overall 39 taxa belonging to 23 families were collected. In Yeongil Bay, eggs of Engraulis japonicus, which accounted for 83.9% of the total population, was the most dominant species, followed by Sardinops sagax (4.0%), Repomucenus valenciennei (3.8%) and E. japonicus larvae, which accounted for 34.9% of the total population. These were followed by Sebastiscus marmoratus (31.0%). In Gomso Bay, E. japonicus eggs accounted for 61.7% of the total population, followed by Sillago japonica (14.0%), Johnius grypotus (8.8%) and Pholis fangi larvae, which accounted for 53.5% of the total population, followed by Ammodytes personatus (34.1%). In Jinhae Bay, E. japonicus eggs accounted for 86.0% of the total population, followed by Leiognathus nuchalis (4.1%), Konosirus punctatus (3.7%) and E. japonicus larvae, which accounted for 48.7% of the total population, followed by Parablennius yatabei (21.6%).

한국고유종 북방종개(어류강, 미꾸리과)의 집단유전학적 구조 (Population Genetic Structure of the Korean Endemic Species, Iksookimia pacifica (Pisces: Cobitidae) Distributed in Northeast Korea)

  • 장숙진;고명훈;권예슬;원용진
    • 한국환경생태학회지
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    • 제31권5호
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    • pp.461-471
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    • 2017
  • 북방종개(Iksookimia pacifica)의 유전적 다양성과 구조적 특징을 밝히기 위해 동해 독립하천들에 서식하는 10개의 집단들을 대상으로 핵유전자와 미토콘드리아 유전자에 기반한 집단유전학적 분석을 실시하였다. 일부 예외적인 경우를 제외하고, 미토콘드리아와 핵유전자 모두 통계적으로 유의미한 집단 간 유전적 분화가 관찰되었다. 핵유전자들의 DNA 서열자료에서 추출한 유전자형 자료를 Bayesian 방법으로 분석한 결과 북방종개는 천진천과 양양남대천을 기준으로 북쪽과 남쪽의 두 개의 그룹으로 나뉘는 구조를 보였다. 현재 동해 하천들이 지리적으로 단절되어 온 독립 수계라는 것을 감안했을 때, 남북으로 구별되는 집단유전적 구조는 북방종개가 한반도에 정착했던 초기 조상 집단이 남북으로 갈라지는 지리적인 분리 사건과 관련되었을 것으로 해석되며, 이러한 초기 조상집단의 지리적 분리 이후, 두 조상그룹들은 남북의 지리적인 범위 내에서 하천 별 고립에 따른 추가적인 분화 과정을 거쳤을 것으로 추정된다. 주목할 점으론, 자산천 집단의 많은 개체들이 지리적 거리가 먼 양양남대천 및 강릉남대천 집단과 하나의 유전적 cluster를 형성하고 있는 것이다. 이와 함께 미토콘드리아 유전자의 경우 몇몇 이웃하는 집단들 사이에 현저히 낮은 유전적 분화도 그리고 일부 집단들에서 매우 낮은 유전적 다양성이 관찰되었다. 본 집단유전학적 결과는 향후 북방종개의 보존 및 관리를 위한 기초자료로 제시될 것이다.

연안 요각류의 성체와 휴면란의 계절별 개체수 변화를 통한 개체군 유지 전략 (The Strategy of Population Maintenance by Coastal Copepod Inferred from Seasonal Variations in Abundance of Adults and Resting Eggs)

  • 박채린;주세종;박원규;김현우;이수린;박정호
    • Ocean and Polar Research
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    • 제40권4호
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    • pp.213-222
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    • 2018
  • We investigated seasonal variations in the abundance of the adults and the resting eggs of copepods to understand the role of copepod resting eggs for maintaining their population inhabiting the coastal area of Dadaepo, Korea. Adults and resting eggs of copepods were collected bi-monthly with a conical net (45 cm mouth diameter, $330{\mu}m$ mesh size) and van Veen grab ($0.1m^2$ area), respectively, from October 2016 to September 2017. The species of resting eggs were identified using mtCOI gene. The mean abundance of copepods was highest in October ($3686{\pm}1190inds{\cdot}m^{-3}$) and lowest in January ($176{\pm}60inds{\cdot}m^{-3}$) with the dominance of Paracalanus parvus s.l.. Among copepod producing resting eggs, Acartia omorii and Centropages abdominalis were dominant. The mean abundance of resting eggs was the highest in July ($9148{\pm}6787eggs{\cdot}m^{-2}$) and the lowest in October ($530{\pm}348eggs{\cdot}m^{-2}$). Most of the collected resting eggs were identified as A. omorii's. The mean abundances of A. omorii adults and resting eggs were highest in July, and both abundances fluctuated in a similar pattern except in September. In September, A. omorii adults were observed in a state of low abundance, while their resting eggs occurred in a state of high abundance. These results suggest that A. omorii maintain their population by producing a large quantity of resting eggs, particularly diapause eggs, before the seawater temperature rises. These eggs would hatch and be newly recruited to their population when the environmental condition becomes favorable.

한강 수계 내 서식하는 깔따구류 유충의 속 수준에서의 분류 형질 (Taxonomic Characteristics of Chironomids Larvae from the Hangang River at the Genus Level.)

  • 박재원;고봉순;유현수;공동수;곽인실
    • 생태와환경
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    • 제56권2호
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    • pp.140-150
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    • 2023
  • 깔따구류 유충(Chironomidae larvae)은 저서성대형무척추동물로 수질 및 환경오염 생물 모니터링에 중요한 지표생물이다. 본 연구에서는 2022년 7월에서 9월 동안 한강의 다양한 수계에서 서식하는 깔따구류 유충을 채집하여 형태적 동정 및 유전자 계통 분석을 실시하였다. 20개 지점에서 총 3아과 18속 32종의 깔따구류 유충이 출현하였으며, 반지깔따구속에 속하는 1개 종이 6개 지점에서 우점하였다. 깔따구류 유충을 분류하는 데 이용하는 몸통, 두부, 하순기절, 촉각 등을 관찰하여 특징을 Pictorial key로 제시하였고, 유전자 계통분석 결과 3개 아과가 명확하게 구분되었으며, 속 수준에서도 구분이 되었다. 이러한 결과들은 깔따구류 유충 동정에 도움이 될 것이고, 수질 조사 및 관리에 기초적인 자료로 활용할 것으로 기대된다.