• 식물조직배양학회지
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• 제27권6호
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• pp.435-439
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• 2000

겨울 상추 품종인 청치마 상추의 자엽조직을 ${\gamma}$-TMT유전자가 도입된 A. tumefaciens LBA 4404와 공동배양한 후, 50 mg/L kanamycin, 500 mg/L carbenicillin, 0.1 mg/L NAA, 0.5mg/L BA가 첨가된 MS재분화 배지에 옮겨 약4주 배양하여 재분화된 신초를 얻었다. 재분화된 신초를 50 mg/L kanamycin, 250mg/L carbenicillin이 포함된 MS 기본 배지에 옮겨 발근된 소식물체를 얻었다. 선발된 형질전환 식물체의 genomic DNA에 대한 PCR분석과 Southern분석을 수행하여 애기장대 ${\gamma}$-TMT유전자 특이적 DNA단편이 상추의 genomic DNA내에 삽입되었음을 확인하였다. 선발된 상추 형질전환체 잎의 $\alpha$-tocopherol/${\gamma}$-tocopherol 함량 비율이 대조 식물체에 비하여 약 4배 증가하여 도입된 ${\gamma}$-TMT유전자가 안정적으로 발현함을 나타내었다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권4호
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• pp.1232-1236
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• 2013

The Cu cation binding sites of $[Cu(I){\cdot}d(CpG){\cdot}d(CpG)-2H]^{-1}$ complex have been investigated to explain the $[Cu{\cdot}DNA]$ biological activity caused by the Cu association to DNA. The structure of $[Cu(I){\cdot}d(CpG){\cdot}d(CpG)-2H]^{-1}$ complex was investigated by electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS). The fragmentation patterns of $[Cu(I){\cdot}d(CpG){\cdot}d(CpG)-2H]^{-1}$ complex were analyzed by MS/MS spectra. In the MS/MS spectra of $[Cu(I){\cdot}d(CpG){\cdot}d(CpG)-2H]^{-1}$ complex, three fragment ions were observed with the loss of d(CpG), {d(CpG) + Cyt}, and {d(CpG) + Cyt + dR}. The Cu cation binds to d(CpG) mainly by substituting the $H^+$ of phosphate group. Simultaneously, the Cu cation prefers to bind to a guanine base rather than a cytosine base. Five possible geometries were considered in the attempt to optimize the $[Cu(I){\cdot}d(CpG){\cdot}d(CpG)-2H]^{-1}$ complex structure. The ab initio calculations were performed at B3LYP/6-31G(d) level.

• 한국환경농학회지
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• 제23권4호
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• pp.197-202
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• 2004

토양과 지하수에서 pendimethalin의 지속성은 환경에 해로운 영향을 미친다. 경남 마산에서 분리한 pendimealalin분해 균주는 API CHB50 kit 시험, FAME분석, 그리고 16S rDNA 염기서열분석 결과로 Bacillus sp. MS202로 잠정적으로 동정하였다. TLC, GC, 그리고 GC-MS 분석에 의해 Bacillus sp. MS202가 pendimethalin의 $-NO_2$를 $-NH_2$로 환원시킨다는 것을 알 수 있었다. 이는 일반적으로 알려진 호기성 미생물에 의한 pendimethalin 분해가 탈알킬화가 우선한다는 보고와 상반되는 새로운 결과이다.

• 식물조직배양학회지
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• 제21권5호
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• pp.309-314
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• 1994

간편하면서도 효율적인 단자엽 식물의 형질전환 기법을 개발하기 위하여 배발생 세포를 직접 electroporation하여 DNA를 도입하는 실험을 벼와 잔디에서 실시하였다. 잔디는 수정 후 3주된 미숙배에서 캘러스를 유도하였으며, 2.4-D가 1 mg/L 함유된 액체 MS배지로 옮겨 진탕배양한 것을 electroporation 실험에 이용하였다. 벼는 20 mm 정도의 미숙화서 유래의 캘러스를 액체 N$_{6}$배지(1 mg/L 2.4-D 함유)에서 진탕배양하여 획득한 세포주를 사용하였다. 액체 진탕배양한 세포괴를 GUS expression vector인 pGA1074 (30 $\mu\textrm{g}$/ml)와 함께 MS 액체 배지에서 Electroporation하였다. 세포벽과 세포막을 통한 세포로의 DNA 전이는 GUS 유전자의 발현 여부 및 정도에 따라 결정하였다. 400 volt, 800 $\mu$F capacitance로 electroporation 처리된 벼와 잔디의 세포괴들은 200 ${\mu}\ell$ (packed cell volume)의 세포괴 당 25 unit (1 unit=파란색을 띤 독립된 세포군) 이상의 빈도로 GUS 활성을 나타내었다. 반면에 무처리 세포주 및 처리한 비배발생 세포주에서는 GUS 발현이 일어나지 않음을 반복적으로 확인차였다. 따라서 electroporation에 의한 벼와 잔디의 형질전환실험에서 원형질체 대신 intact한 배발생 세포가 이용될 수 있음을 의미한다

• 한국식물병리학회지
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• 제11권2호
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• pp.173-178
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• 1995

동물계에서 항바이러스와관련된 dsRNA 의존성 인산화 효소(PKR)의 유전자를 식물체에서 발현시킬 경우 PKR에 의한 단백질합성 및 식물바이러스의 증식조절 가능성에 대한 기초자료를 확보하기 위하여 사람에서 분리된 PKR cDNA를 Agrobacterium 방법에 의하여 연초식물체(Nicotiana tabacum cv. Xanthi-nc)로 형질전환시켰다. HindIII/PstI처리에 의해 얻어지는 약 1.8kb의 phPKR cDNA절편을 일련의 유전자 조작 방법을 통하여 식물발현벡터인 pBI121에 도입하여, p12168을 재조합하였다. 이를 A. tumefaciens LBA 4404에 형질전환시켜 연초식물체형질 전환에 이용하였다. 2mg/l BA와 0.5mg/l NAA가 포함되고 100$\mu\textrm{g}$/ml의 kanamycin이 첨가된 MS배지에서 shooting시킨 후 phytohormone이 첨가되지 않은 MS배지상에서 rooting을 시켜 형질전환 연초식물체를 얻었으며, 형질전환식물체는 정상식물체와 유사한 생육양상을 나타내었다. 형질전환식물체의 유전자도입은 hPKR cDNA의 전사부여는 RT-PCR 방법에 의하여 확인되었다.

• 원예과학기술지
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• 제33권5호
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• pp.737-750
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• 2015

국내에서 시판되고 있는 수박 102 품종에 대한 DNA 프로 파일 데이터베이스를 구축하기 위하여 genomic microsatellite(gMS)와 expressed sequence tag(EST) microsatellite(eMS) 마커의 다형성 정도의 비교와 유전적 연관성 분석을 통한 품종식별력 검정 등에 대한 일련의 연구를 수행하였다. 수박 gMS 마커를 이용하여 국내에서 시판되고 있는 수박 102 품종을 검정하였을 때 마커당 3.63개의 평균 대립유전자가 검출되었으며, 평균 PIC 값은 0.479로 나타났다. 이에 반해 eMS 마커는 평균 대립유전자의 수가 2.50개, PIC 값이 0.425로 나타나 gMS 마커보다 다형성 정도가 낮게 나타났다. gMS와 eMS 및 이들 두 종류의 마커를 병합하여 작성된 계통도는 microsatellite 마커의 다형성에 따라 수박 102개 품종을 6-8개의 그룹으로 구분하였고 대부분의 품종의 식별이 가능하였다. 3가지 마커 유형에 따라 작성된 계통도를 Mantel test에 의해 상관 정도를 분석하였을 때 높은 상관($r{\geq}0.80$)을 나타내었다. 따라서 본 연구에 활용된 microsatellite 마커는 수박 유전자원의 특성평가, 순도검정 및 품종의 지문화 작업의 수단으로 유용하게 활용될 수 있을 것이다.

• 미생물학회지
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• 제35권2호
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• pp.121-127
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• 1999

염기서열 해독작업에서 각 핵산 단편을 조립하는 contig 구성문제에 활용이 가능한 computer program을 개발하였다. 본 프로그램은 국내에서 광범위하게 사용되고 있는 MS-Windows 운영체제의 개인용 컴퓨터에서 작동이 가능하며, GenBank, FASTA, ASCII 등과 같은 다양한 형태의 염기서열 자료를 입력할 수 있다. 두 단편에서 최대 유사도를 나타내는 부분을 정렬하는 작업에는 염기서열의 국부적 상동성을 계산하고 dynamic programming 알고리즘을 적용하는 방법을 이용하였다. 또한 사용하기 편리한 그래픽 방식의 인터페이스를 제공하여 초보자라도 손쉽게 조작할 수 있다는 장점을 갖는다. 본 프로그램의 성능을 검증하기 위하여 세균과 곰팡이로부터 해독된 16S rRNA 와 18S rRNA 유전자의 단편 염기서열을 재구성하는 작업에 프로그램을 사용하였을 때에 효율적인 작업이 가능하였다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제30권11호
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• pp.2655-2660
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• 2009

A breed of cattle, i.e., Korean cattle (Hanwoo), was identified based on the DNA mobilities of their microsatellites (MSs) by capillary gel electrophoresis (CGE) with a laser-induced fluorescence (LIF) detector. The MS markers were used for the accurate identification of species-specific genes. The DNA mobilities of the MS markers of Hanwoo and Holstein were measured using a CGE system with a fused-silica capillary (inner diameter of 75 ${\mu}m$, outer diameter of 365 ${\mu}m$, and total length of 50 cm). The capillary was dynamically coated with 1.0% (w/v) polyvinylpyrrolidone ($M_r$ = 1,000,000) and then filled with a mixture of 1.3% (w/v) poly(ethylene oxide) ($M_r$ = 600,000) and 1.9% (w/v) poly(ethylene oxide) (Mr = 8,000,000) as a sieving gel matrix. The species-specific genes of Hanwoo and Holstein were clearly distinguished within 33 min. This CGE assay technique is expected to be a useful analytical method for the fast and accurate identification of breeds of cattle.

• 식물조직배양학회지
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• 제27권6호
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• pp.441-445
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• 2000

저인산 조건하에서 인산 흡수 효율이 높은 벼 품종을 개발하고자 담배의 인산수송자 유전자를 벼에 형질전환하였다. 동진벼로부터 유도된 callus를 담배의 인산수송자 유전자가 도입된 A. tumefaciens LBA 4404와 공동배 양한 후, 선발배지에서 증식된 callus를 250 mg/L carbenicillin, 2 mg/L kinetin, 0.1 mg/L NAA가 첨가된 MS배지에 옮겨 약 2주 후부터 소식물체를 얻었다. Carbenicillin 250 mg/L 첨가된 MS 기본배지에서 소식물체의 발근을 유도하여 재분화 식물체를 얻었다. 선발된 callus는 약 52%의 식물체 재력화율을 보였다. 선발된 재분화 식물체에 대한 PCR 분석을 수행하여 형질전환 벼 식물체에 담배의 인산수송자 유전자가 삽입되었음을 확인하였다. 형질전환체의 genonlic DNA로부터 PCR에 의해 증폭된 DNA에 대한 Southern blot분석 결과, 대조 식물체에서는 band가 검출되지 않았으나 형질전환 식물체에서는 인산수송자 유전자와 동일한 1.7kb의 band가 검출되어 외래유전자인 담배 인산수송자 유전자가 안전적으로 도입되었음이 확인되었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제17권10호
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• pp.1329-1333
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• 2004

To isolate the microsatellites from the chromosomal DNA of the Korean cattle (Hanwoo) and to use those for the genetic selection, four bacteriophage genomic libraries containing the chromosomal DNA of six Hanwoo steers showing the differences in meat quality and quantity were used. Screening of the genomic libraries using $^{32}P-radiolabeled 5'-({CA})_{12}-3$nucleotide as a probe, resulted in isolation of about 3,000 positive candidate bacteriophage clones that contain $(CA)_n$-type dinucleotide microsatellites. After confirming the presence of microsatellite in each positive candidate clone by Southern blot analysis, the DNA fragments that include microsatellite and flanking sequences possessing less than 2 kb in size, were subcloned into plasmid vector. Results from the analysis of microsatellite length polymorphism, using twenty-two PCR primers designed from flanking region of each microsatellite DNA, demonstrated that 208 and 210 alleles of HW-YU-MS#3 were closely related to the economic traits such as marbling score, daily gain, backfat thickness and M. longissimus dorsi area in Hanwoo. Interestingly, HW-YU-MS#3 microsatellite was localized in bovine chromosome 17 on which QTLs related to regulation of the body fat content and muscle ypertrophy locus are previously known to exist. Taken together, the results from the present study suggest the possible use of the two alleles as a DNA marker related to economic trait to select the Hanwoo in the future.