We have studied the central parts of M82, which is a well-known infrared luminous, starburst galaxy, by analyzing archival data from the Infrared Space Observatory (ISO). M82 was observed at 11 positions covering $\pm$45" from the center along the major axis. We analyzed 4 emission lines, [ArIII] 8.99 ${\mu}m$, $H_2$ 17.034 ${\mu}m$, [FeII] 25,98 ${\mu}m$, and [SiII] 34,815 ${\mu}m$ from $SWSO_2$ data. The integrated flux distributions of these lines are quite different. The $H_2$ line shows symmetric twin peaks at $\~$18" from the center, which is a general characteristic of molecular lines in starburst or barred galaxies. This line appears to be associated with the rotating molecular ring at around $\~$200 pc just outside the inner spiral arm. The relative depletion of the $H_2$ line at the center may be due to the active star formation activity which dissociates the $H_2$ molecules. The other lines have peaks at the center and the distributions are nearly symmetric. The line profiles are deconvolved assuming that both intrinsic and instrumental profiles are Gaussian. The velocity dispersion outside the core is found to be $\~50 km s^{-1}$. The central velocity dispersion is much higher than $50 km s^{-1}$, and different lines give different values. The large central velocity dispersion ($\sigma$) is mostly due to the rotation, but there is also evidence for a high $\sigma$ for [ArIII] line. We also generated position-velocity maps for these four lines. We found very diverse features from these maps.
Using first-principles density-functional calculations, we investigate the chain reaction mechanism of allyl alcohol (ALA) molecules on the H-terminated Si(001)-2${\times}$1 surface. Recently, it was reported [1] that allyl mercaptan (ALM) molecules show a self-directed line growth across the dimer rows through a chain reaction involving several reaction processes: (i) The created radical at the C atom is transferred to the S atom, (ii) the resulting S-centered radical easily abstracts an H atom from the neighboring dimer row, and (iii) the generated S-H group further reacts with the neighboring dimer row to produce the Si-S bond on the neighboring dimer row, accompanying the associative desorption of H2. This H2-desorption process creates a new DB on the neighboring dimer row, setting off the chain reaction across the dimer rows. In the present study, we find that although the structure of ALA with -OH functional is analogous to that of ALM with -SH functional, ALA and ALM lines show a difference in their growth direction. We predict that ALA undergoes the chain reaction to show a line growth along the dimer row, contrasting with the ALM line growth across the Si dimer rows. Our analysis shows that the different growth direction of ALA is due to the strong instability of oxygen radical intermediate, which prevents from growing across the dimer rows. Thus, we demonstrate that the stability of the radical intermediate plays a crucial role in determining the direction of molecular line growth.
Recently, several new methods for the detection of genetic damages in vitro and in vivo based on molecular biological techniques were introduced according to the rapid progress in toxicology combined with cellular and molecular biology. Among these methods, mouse lymphoma thymidine kanase (tk) gene forward mutation assay, single cell gel electrophoresis (comet assay) and transgenic animal and cell line model as a target gene of lac I (Big Blue) and lac Z (Muta Mouse) gene mutation are newly introduced based on molecular toxicological approaches. The mouse lymphoma tk$\^$+/-/ gene assay (MOLY) using L5178Y tk$\^$+/-/ mouse lymphoma cell line is one of the mammalian forward mutation assays, and has many advantages and more sensitive than hprt assay. The target gene of MOLY is a heterozygous tk$\^$+/-/ gene located in 11 chromosome, so it is able to detect the wide range of genetic changes like point mutation, deletion, rearrangement, and mitotic recombination within tk gene or deletion of entire chromosome 11. The comet assay is a rapid, simple, visual and sensitive technique for measuring and analysing DNA breakages in mammalian cells, Also, transgenic animal and cell line models, which have exogenous DNA incorporated into their genome, carry recoverable shuttle vector containing reporter genes to assess endogenous effects or alteration in specific genes related to disease process, are powerful tools to study the mechanism of mutation in vivo and in vitro, respectively. Also in vivo acridine orange supravital staining micronucleus assay by using mouse peripheral reticulocytes was introduced as an alternative of bone marrow micronucleus assay. In this respect, there was an International workshop on genotoxicity procedure (IWGTP) supported by OECD and EMS (Environmental Mutagen Society) at Washington D. C. in March 25-26, 1999. The objective of IWGTP is to harmonize the testing procedures internationally, and to extend to finalization of OECD guideline, and to the agreement of new guidelines under the International Conference of Harmonization (ICH) for these methods mentioned above. Therefore, we introduce and review the principle, detailed procedure, and application of MOLY, comet assay, transgenic mutagenesis assay and supravital staining micronucleus assay.
Bandala, Cindy;Miliar-Garcia, A.;Mejia-Barradas, C.M.;Anaya-Ruiz, M.;Luna-Arias, J.P.;Bazan-Mendez, C.I.;Gomez-Lopez, M.;Juarez-Mendez, S.;Lara-Padilla, E.
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제13권10호
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pp.5063-5067
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2012
New molecular markers of cancer had emerged with novel applications in cancer prevention and therapeutics, including for breast cancer of unknown causes, which has a high impact on the health of women worldwide. The purpose of this research was to detemine protein and mRNA expression of synaptic vesicle 2 (SV2) isoforms A, B and C in breast cancer cell lines. Cultured cell lines MDA-MB-231, SKBR3, T47D were lysed and their protein and mRNA expression analyzed by real-time PCR and western blot technique, respectively. SV2A, B proteins were identified in non-tumor (MCF-10A) and tumor cell lines (MDA-MB-231 and T47D) while SV2C only was found in the T47D cell line. Furthermore, the genomic expression was consistent with protein expression for a such cell line, but in MDA-MB-231 there was no SV2B genomic expression, and the SV2C mRNA and protein were not found in the non tumoral cell line. These findings suggest a possible cellular transdifferentiation to neural character in breast cancer, of possible relevance to cancer development, and point to possible use of SV2 as molecular marker and a vehicle for cancer treatment with botulinum toxin.
Glioblastoma is the most common primary malignant brain tumor in adults. Temozolomide (TMZ) is an FDA-approved drug used to treat this type of cancer. Cinnamaldehyde (CIN) is a derivative of cinnamon extract and makes up 99% of it. The aim of this study was to investigate the in vitro combined effect of CIN and TMZ on human glioblastoma multiforme T98G cell line viability. In this study, we used 3-(4,5 dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-tertazolium bromide (MTT) method to evaluate the extent of IC50, acridine orange, Giemsa and Hoechst staining to evaluate the manner of apoptosis and the Western blotting method to examine the expression change of apoptotic proteins. Our results show that TMZ has an inhibitory effect on CIN when both used in combination at concentrations of 300 and 100 µM (P<0.05) and has a cytotoxic effect when used alone at the same concentrations (P<0.05). The western blotting result showed that TMZ at concentrations of 2,000 and 1,000 µM significantly increased Bax expression and decreased Bcl2 expression (P<0.05), indicating that TMZ induced apoptosis through the mitochondrial pathway. However, CIN had no effect on Bax and Bcl2 expressions, thus causing apoptosis from another pathway. Also, the Bax:Bcl2 expression ratio at concentrations combined was lower than that for TMZ 1,000 µM and higher than that for CIN 150 and 100 µM (P<0.05), which confirms the inhibitory effect of TMZ on CIN. From the present study, we conclude that TMZ in combination with CIN has an inhibitory effect on increasing the cytotoxicity rate.
We report the results of H I 21-cm and molecular line studies of the shocked interstellar gas in the W51 complex. We present convincing evidences suggesting that the shocked gas has been produced by the interaction of the W51C supernova remant (SNR) with a large molecular cloud, Our results show that W51C is the second SNR with direct evidences for the shocked cloud material.
The synthesis of coumarin-based natural products and their derivatives is described. In vitro MDR reversal activities of the synthesized compounds were evaluated in P-glycoprotein over-expressing human sarcoma cell line MES-SA/DX5. Some of the coumarin derivatives were found to show potent MDR reversal activity. In particular, pyridyl derivative (15e) exhibited more potency than verapamil.
Targeting fibroblast growth factor receptors (FGFRs) has been slow compared to other targeted cancer therapies for receptor tyrosine kinases, such as epidermal growth factor receptors. The low efficacy and variable response have limited the growth of FGFR inhibitors in clinical use. Nevertheless, recent systematic and genomic approaches have identified the biological conditions for effectively targeting FGFRs and can accelerate the development of targeted drugs. Under clinical and preclinical trials, the inhibitors started fast growing furious races to target FGFRs. Finally, FGFRs will be more actionable and targetable with more precise and effective drugs at the end of the race, passing the finish line.
SMILES (simplified molecular-input line-entry system) information of small molecules parsed by one-hot array is passed to a convolutional neural network called black box. Outputs data representing a gene signature is then matched to the genetic signature of a disease to predict the appropriate small molecule. Efficacy of the predicted small molecules is examined by in vivo animal models. GSEA, gene set enrichment analysis.
The 3mm transitions to CO, $^{13}CO,\;CS,\;HCO^+$, and HCN have been observed toward the compact HII regions in W58 using the 14m Daeduk Radio Telescope (DRT). Some of the observed lines show high-velocity wings resulted from outflowing materials of the compact HII regions. We derive the beam averaged column densities of the observed species and compare their relative abundances. The $HCO^+$ abundance appears to be smaller by about an order of magnitude than those of 'typical' quiet molecular clouds. CS may be a good reference molecule in comparing relative abundances in different physical conditions.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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