• 제목/요약/키워드: molecular distribution

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한국 희귀 특산식물 꼬리말발도리 집단의 유전적 다양성 및 구조 (Genetic Diversity and Structure of the Korean Rare and Endemic Species, Deutzia pdaniculata Nakai, as Revealed by ISSR Markers)

  • 손성원;최경수;박규태;김은혜;박선주
    • 한국자원식물학회지
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    • 제26권5호
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    • pp.619-627
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    • 2013
  • 꼬리말발도리(Deutzia paniculata Nakai)는 전 세계적으로 우리나라 경상남북도 일부지역에만 자생하는 매우 제한된 분포범위를 가지는 특산식물이다. 이러한 꼬리말발도리 집단의 유전적 다양성 및 구조를 조사하기 위해 5집단 155개체에 대한 ISSR(Inter Simple Sequence Repeat) 분석이 수행되었다. 총 6개의 ISSR 프라이머를 이용하여 31개의 증폭산물을 관찰하였으며, 집단 수준에서의 유전적 다양성의 평균은 SI(Shannon's information index)=0.429, h (Nei's genetic diversity)=0.271로, 매우 높은 수준으로 나타났다. 집단별로는 큰 차이는 없었지만 비교적 높은 개화율을 보이는 밀양, 양산 집단이 다른 집단에 비해 다소 높은 유전 다양성을 유지하고 있는 것으로 나타났다. AMOVA 분석 결과 전체 유전변이의 약 16%가 집단 간 차이에 기인하는 것으로 설명되었으며, 나머지 84%는 집단 내 개체간에 존재하는 것으로 나타났다. 이처럼 제한된 분포범위를 가지는 꼬리말발도리 집단에서 나타나는 높은 유전다양성과 집단간 낮은 유전적 분화율은 완전 타가수정하는 교배양식과 집단내 비교적 풍부한 개체수의 영향인 것으로 판단된다. 따라서 현재의 유전다양성을 유지할 수 있는 적절한 현지 내 보전대책 수립이 요구된다.

강낭콩 전분의 분자구조적 특성 (Structural Characteristics of Kidney Bean Starch)

  • 김관;강길진;김성곤
    • 한국식품과학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.521-527
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    • 1996
  • 세 품종의 강낭콩 전분에 대하여 분자구조적 측면에서 그 특성을 조사하였다. 전분의 아밀로오스 함량과 ${\beta}$-아밀라아제 분해한도는 Pink종이 다른 종에 비하여 다소 높았다. 그리고 아밀로펙틴의 사슬분포는 ${\overline{DP}$60 이상의 초장사슬, ${\overline{DP}}45{\sim}60$인 B 사슬, 그리고 ${\overline{DP}}10{\sim}20$인 A 사슬로 분포하였으며, 그 분포도는 품종별로 차이를 보였는데, Pink종은 B사슬, Red종은 초장사슬, 그리고 White종은 A 사슬이 다른 종에 비하여 더 많이 분포하였다. 전분의 딴 가수분해(2.2N HCI는 3 단계로 일어났으며, 각 품종간에는 가수분해 속도와 요오드 반응에서 다소 차이를 보였다. 전분은 산처리에 따라 아밀로오스와 무정형인 아밀로펙틴의 ${\alpha}$-1.6 결합이 점차 분해되어, 결국은 결정성을 가진 ${\overline{DP}}$ 20 정도의 사슬로 남았다. 이러한 결과로부터 강낭콩은 품종에 따라 전분의 분자구조가 다름을 알 수 있었다.

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In Vivo Effects of CETP Inhibitory Peptides in Hypercholesterolemic Rabbit and Cholesteryl Ester Transfer Protein-Transgenic Mice

  • Cho, Kyung-Hyun;Shin, Yong-Won;Choi, Myung-Sook;Bok, Song-Hae;Jang, Sang-Hee;Park, Yong-Bok
    • BMB Reports
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    • 제35권2호
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    • pp.172-177
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    • 2002
  • We previously reported that cholesteryl ester transfer protein (CETP) inhibitory peptides (designated $P_{28}$ and $P_{10})$ have anti-atherogenic effects in hypercholesterolemic rabbits (Biochim. Biophys. Acta (1998) 1391, 133-144). To further investigate those effects, we studied rabbit plasma that was collected after 30 h of a $P_{28}$ or $P_{10}$ injection. We found that there is a strong correlation between the in vivo CETP inhibition effects and alterations of lipoprotein particle size distribution in rabbit plasma, as determined on an agarose gel electrophoresis and gel filtration column chromatography. In vivo effects of the peptide were observed again in C57BL/6 mice that expressed simian CETP. The $P_{28}$ or $P_{10}$ peptide ($7\;{\mu}g/g$ of body weight) that was dissolved in saline was injected subcutaneously into the mice. The $P_{28}$ injection caused the partial inhibition of plasma CETP activity up to 50%, decreasing the total plasma cholesterol concentration by 30%, and increasing the ratio of HD/total-cholesterol concentration by 150% in the CETP-transgenic (tg) mice. The CETP inhibition by the $P_{28}$ or $P_{10}$ made alterations that modulated the size re-distribution of the lipoproteins in the blood stream. Particle size of the very low (VLDL) and low density lipoproteins (LDL) from the peptide-injected group was highly decreased compared to the saline-injected group (determined on the gel filtration column chromatography). In contrast, The HDL particle size of the $P_{28}$-injected group increased compared to the control group (saline-injected). The expression level of the CETP mRNA of the $P_{28}$-injected CETP-tg mouse appeared lower than the saline-injected CETP-tg mouse. These results suggest that the injection of the CETP inhibitory peptide could affect the CETP expression level in the liver by influencing lipoprotein metabolism.

리소솜 Acid Phosphatase에 대한 단일 항체를 이용한 도롱뇽 다리 재생 연구 (Lysosomal Acid Phosphatase in Regenerating Salamander Limbs Studied with Monoclonal Antibodies)

  • 주봉건;박상렬;최의열;김원선
    • 한국동물학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.426-436
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    • 1996
  • 앞서 본 연구실에서는 도롱뇽(Hynobius leechii) 다리 재생 과정중 기존의 조직들이 와해되고 조직 및 그 구성 세포의 분화 양성이 소멸되는 탈분화 과정중 시소솜 acid phosphatase의 활성도가 급격히 증가함을 보고한바 있다. 본 연구에서는 다리 재생 과정에서 이 효소의 시간적, 공간적 분포 및 발현 양상을 알아보기 위해 단일 항체를 만들었다. 리소솜 acid phosphatase에 대한 22단일 항체균중 5항체군이 탈분화 조직과 강한 면역반응을 보였으며 이들의 시간적, 공간적 반응 양상은 조직의 탈분화 상태와 일치하였다. 이 결과는 탈분화 과정시 증가하는 리소솜 acid phosphatase의 활성도가 이 효소의 시간적, 공간적 분포 및 발현 양상과 밀접히 연관되어 있음을 반영하며 탈분화 과정중 이 효소의 역할이 매우 중요함을 시사하고 있다. Immunoblotting 결과 이들 단일 항체군은 리소솜 acid phosphatase의 monomer인 53kDa밴드를 인식하였다. 한편 도롱뇽의 리소솜 acid phosphatase에 대한 단일 항체와 타종의 LAP에 대한 cross-reactivity를 immunoblot으로 조사한 결과 양서류인 axolotl(Ambystoma mexicanum)과 Xenopus laevis에서는 유사한 분자량 band에서 반응이 나타났으나 그외 생쥐, 초파리, C.elegans에서는 cross-reactivity가 없는 것으로 조사되었다. 이러한 결과들은 본 연구에서 만들어진 단일 항체가 한국산 도롱뇽의 리소솜 acid phosphatase를 특이적으로 인식하며 나아가 양서류내에서는 이 효소의 상동서이 높음을 시사하고 있다.

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단식(斷食), 재급식(再給食)과 인슈린주사(注射)에 따른 쥐의 간세포핵단백질(肝細胞核蛋白質)에 대한 전기영동상의 분포양상 비교 (Comparison of SDS Gel Electrophoretic Patterns of Rat Liver Nuclear Proteins in Response to Starvation, Refeeding and Insulin Injection)

  • 이효사;데이비드 엠 깁슨
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제22권3호
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    • pp.173-180
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    • 1979
  • 쥐를 48시간 굶긴 뒤에 위에 탄수화물 농도가 높은 먹이를 주거나 streptozotocin을 이용하여 당뇨병을 가지게 만든 쥐에 인슈린 주사를 주었을 때 쥐 간계포의 핵단백질중 가장 주요한 0.14M NaCl에 녹는 핵단백질, histones 그리고 페놀에 녹는 핵단백질의 분포 변화를 조사하고자 SDS gel 전기영동법을 이용하였다. 각 핵단백질 분획을 전기영동법으로 분리시킨 단백질의 상대량을 비교하였을 때 0.14M NaCl 추출물은 현저한 변화를 나타내었으나 histones과 페놀로 추출된 핵단백질 분획들은 분리된 단백질 상대량에 큰 변화가 없었다. 48시간 굶긴 쥐와 정상적으로 먹이를 준 쥐의 0.14M MaCl 추출 핵단백질 분획을 비교하였을때 분자량이 50,000 과 180,000 daltons 사이에 있는 적어도 5개의 핵단백질의 농도가 다른 핵단백질에 비교하여 크게 감소되었다. 반면 분자량이 36,000 daltons 단백질의 농도는 48시간 굶긴 쥐에게 다시 탄수화물 농도가 높은 먹이를 주었을 때 24시간 동안에 정상적으로 먹이를 준 쥐에서 관찰한 핵단백질 분포 양상과 비슷한 결과를 얻었다. 당뇨병을 가진 쥐에게 인슈린 주사를 준 쥐와 인슈린주사를 주지 않은 당뇨병 쥐의 0.14M NaCl추출 핵단백질 분획을 비교 조사한 결과는 굶은 쥐에게 탄수화물 농도가 높은 먹이를 준 다음에 얻은 뒤의 결과와 정상적으로 유사하였다. 여기서 얻은 실험결과들은 0.14M NaCl 추출 핵단백질 중에 있는 어떤 핵단백질의 분포 변화가 이미 알려진 인슈린 신호에 따라 조정되고 cytosol에 있는 지방합성에 관하는 효소(lipogenic enzymes)들의 유도에 관련된 세포핵 활성 조절에 영향을 끼치고 있음을 시사해 준다.

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멸종위기 식물인 갯봄맞이 최남단 군락의 식생구조 (Vegetation Structure and Management Strategies of Glaux maritima var. obtusifolia Community on the Southernmost Distribution Area in Korea)

  • 임정철;이철호;김의주;최병기
    • 한국습지학회지
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    • 제20권1호
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    • pp.1-13
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    • 2018
  • 갯봄맞이는 한국에서 매우 제한적인 분포를 보여 멸종위기종으로 지정 보호되고 있다. 본 연구는 갯봄맞이의 남방한계지역에 해당하는 당사해안습지의 식생 다양성을 확인하고 식생결정 요인과 서식처 중요성을 평가하는데 목적을 두고 있다. 식생분류를 위해 Z.-M. 학파의 식물사회학적 방법을 활용하였으며, 환경요인과 식생과의 관계 분석을 위해 수리통계분석을 수행하였다. 연구결과 당사해안습지는 갯봄맞이-지채군락 (3개 하위군락), 갯꾸러미풀s.l.군락, 기장대 풀군락, 갈대-꼬마부들군락의 4개 단위식생으로 구성되어 있었다. 이들 식생의 주요 결정요인은 수분환경과 토심, 수위교란정도, 식생고, 군락구조 등인 것으로 확인되었다. 갯봄맞이는 갯봄맞이-지채군락의 전형아군집에서 가장 우세하게 생육하는 것으로 확인되었으며, 인접한 일본의 남방한계지역과도 유사한 종조성 및 우점상황을 보이는 것으로 나타났다. 당사해안습지는 식물지리 및 식생지리학적 측면에서 큰 의미를 지니는 입지이며, 다양한 종의 피난처로서 기여하고 있는 것으로 평가되었다. 당사해안습지의 가치를 다양한 관점에서 정밀하게 파악하고 보호 및 관리하기 위한 보전전략의 수립이 요구된다.

열처리 방법에 따른 가공 인삼 열수추출물의 이화학적 품질 특성 (Physicochemical quality characteristics of hot water extracts of processed ginseng based on different heat treatments)

  • 강윤한;저우뤠이;김효진;김지은;신일식
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.155-163
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    • 2018
  • 본 연구는 고온 고압의 autoclaving 조건에서 2시간 내외로 증삼한 인삼과 그 용출액으로 2단계 열풍건조법으로 제조한 홍삼을 분말로 하여 그 열수추출물에 대한 이화학적 특성을 조사하였다. 즉 시료로 사용한 홍삼의 제조는 고온 고압으로 증삼한 용출액을 건조시 증삼 표면에 바르고 건조하여 외형이 흑삼 모양으로 변하였다. 홍삼 분말로부터 열수추출물의 총 폴리페놀, 총 플라보노이드, 총당, 산성다당체, 조사포닌 등의 함량을 분석하고, 색차계와 전자코를 이용하여 향미 성분을 측정하였다. Autoclave를 이용한 홍삼 열수추출물(ARG)의 총 폴리페놀 함량은 9.06 mg GAE/g, 총 플라보노이드 3.38 mg NE/g, 총당 35.22 g/100 g, 산성다당체 10.90 g/100 g, 조사포닌 10.22 g/100 g으로 나타났다. 본 홍삼제조법에 의해 얻어진 홍삼을 이용한 열수추출물은 총 폴리페놀, 총 플라보노이드, 조사포닌 등의 최종 함량이 다른 홍삼 제조법에 비해 높게 나타났으며, 고온 고압으로 단시간에 얻은 증삼액인 용출액은 진세노사이드 조성이 다양하였다. Rb1을 포함한 인삼의 주요 진세노사이드 총 함량은 ARG에서 가장 낮은 10.69 mg/g으로 나타났으며 가공 조건이 홍삼 특유의 진세노사이드로의 전환에 영향을 주었다. Autoclave로 얻어진 홍삼 및 용출액은 홍삼성분의 저분자량으로의 변환을 통해 색의 강화 등 향미성분이 개선되어 식품 뿐만 아니라 비식품의 소재 및 제품을 위한 수요가 기대된다.

Inhibitory Effect of Amygdalin on Lipopolysaccharide-Inducible TNF-$\alpha$ and IL-l$\beta$ mRNA Expression and Carrageenan-Induced Rat Arthritis

  • Hwang, Hye-Jeong;Lee, Hye-Jung;Kim, Chang-Ju;Shim, In-Sop;Hahm, Dae-Hyun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제18권10호
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    • pp.1641-1647
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    • 2008
  • Amygdalin is a cyanogenic glycoside plant compound found in the seeds of rosaceous stone fruits. We evaluated the anti-inflammatory and analgesic activities of amygdalin, using an in vitro lipopolysaccharide (LPS)-induced cell line and a rat model with carrageenan-induced ankle arthritis. One mM amygdalin significantly inhibited the expression of TNF-$\alpha$ and IL-l$\beta$ mRNAs in LPS-treated RAW 264.7 cells. Amygdalin (0.005, 0.05, and 0.1 mg/kg) was intramuscularly injected immediately after the induction of carrageenan-induced arthritic pain in rats, and the anti-arthritic effect of amygdalin was assessed by measuring the weight distribution ratio of the bearing forces of both feet and the ankle circumference, and by analyzing the expression levels of three molecular markers of pain and inflammation (c-Fos, TNF-$\alpha$, and IL-l$\beta$) in the spinal cord. The hyperalgesia of the arthritic ankle was alleviated most significantly by the injection of 0.005 mg/kg amygdalin. At this dosage, the expressions of c-Fos, TNF-$\alpha$, and IL-l$\beta$ in the spinal cord were significantly inhibited. However, at dosage greater than 0.005 mg/kg, the pain-relieving effect of amygdalin was not observed. Thus, amygdalin treatment effectively alleviated responses to LPS-treatment in RAW 264.7 cells and carrageenan-induced arthritis in rats, and may serve as an analgesic for relieving inflammatory pain.

OH Emission toward Embedded YSOs

  • Yun, Hyeong-Sik;Lee, Jeong-Eun;Lee, Seokho;Evans, Neal J.
    • 천문학회보
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    • 제40권1호
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    • pp.60.1-60.1
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    • 2015
  • High energy photons and mechanical energy produced by the process of star formation result in copious FIR molecular and atomic lines, which are important coolants of the system. Photons thermally or mechanically induced could dissociate water in the dense envelope to change relative abundances among the species of O, OH, and H2O. Here we analyze OH emission lines toward embedded young stellar objects (YSOs) observed as part of the Herschel open time key program, 'Dust, Ice, and Gas In Time (DIGIT)' in order to study the physical conditions of associated gas and the energy budget loaded on the OH line emission. According to our analysis of the Herschel/PACS spectra, OH emission peaks at the central spaxel in most of sources, but several sources show spatially extended emission structures. In the extended emission sources, the distribution of OH emission is correlated with that of [OI] emission and extended along the outflow directions. Considering the diversity of source properties, ratios between detected OH lines are relatively constant among sources. In addition, each OH line has strong correlation with bolometric luminosity. In order to determine the physical conditions of YSOs, we adopt several methods for the analysis of the OH lines: rotational diagram, non-LTE LVG analysis, and a 2-D PDR code. From the simple LVG analysis, we find that the thermal solution with the dense ( > $10^7cm^{-3}$) and warm ( ~ 100 K) OH gas reproduces the ratios of detected OH lines. However, our self-consistent PDR 2-D model, which can deal with the IR-pumping effect from the central protostar as well as the warm dust in situ, cannot fit the observational results, suggesting that an irradiated shock model is necessary for a better interpretation.

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Pyrosequencing을 이용한 하절기 영산강 유역의 Phylum 계층의 세균 군집 조사 (Use of Pyrosequencing for Characterizing Microbial Community at Phylum Level in Yeongsan River Watershed during Early Summer)

  • 정진;박상정;운노타쯔야
    • 미생물학회지
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    • 제49권2호
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    • pp.150-155
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    • 2013
  • Pyrosequencing을 이용하여 영산강 유역의 세균 군집 현황을 조사하였다. 영산강 본류 및 지천 14개 지점을 선정하여 5-7월동안 시료채취를 하였다. 총 42개의 시료를 가지고 총 989,380 reads을 얻었으며 taxonomic 분류와 OTU 분포도 분석을 실시하였다. Phylum 계층의 세균 구조 결과를 통해서 지천의 특성, 토지 이용, 시기적인 요인 등 환경적 요인에 따라 세균 군집 구조가 민감하게 변하는 경향을 나타내었다. 또한, OTU 분석을 근거한 오염원 추적기법(microbial source tracking; MST)을 통해 분변오염을 추적해보았다. Firmicutes가 가장 수질에 영향을 주는 taxa로 관찰되었다. 본 연구를 통해서, 현재 사용하는 수질 지표, BOD, pH 등에 더하여 pyrosequencing을 이용한 세균군집 조사 결과가 보다 효율적인 하천의 물관리 정책을 위해서 유용한 정보가 될 수 있을 것으로 기대한다.