• 제목/요약/키워드: molecular design

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MOLECULAR BASIS OF LUBRICATION

  • Hsu, S.M.
    • 한국윤활학회:학술대회논문집
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    • 한국윤활학회 2002년도 proceedings of the second asia international conference on tribology
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    • pp.49-50
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    • 2002
  • Rapid advancements in analytical instrumentations and techniques in the last several decades offer an unprecedented opportunity to analyze the complex chemistry and probe the surfaces for chemical evidence. Recent developments in nanotechnology provide further ability to examine phenomena and mechanisms at the nanometer level. As a result of these advances, our understanding of the complex lubrication system has improved significantly. This paper will attempt to provide a molecular basis of how lubricant and additives function in lubrication.

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Molecular System Design for the Acetylcholine Fluorescent Chemosensor

  • 고광락
    • 센서학회지
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    • 제6권6호
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    • pp.508-513
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    • 1997
  • We exploited a new molecular system - acetylcholine (neurotransmitter) detection system as a building block for the perfect molecular information system (sensing membrane of the chemical sensor) - using water soluble calix[n]arene-p-sulfonates which are useful even in aqueous (water/methanol) neutral solution. This achievement is due to several outstanding properties of these calix[n]arene derivatives such as low $pK_{a}$ values, cation-interactions, and high water-solubility, etc.

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다양한 유기화합물의 비등점 예측을 위한 QSPR 모델 및 이의 적용구역 (QSPR model for the boiling point of diverse organic compounds with applicability domain)

  • 신성은;차지영;김광연;노경태
    • 분석과학
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    • 제28권4호
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    • pp.270-277
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    • 2015
  • 비등점은 유기물의 물리화학적 성질을 특정하는데 있어 매우 근본적 요소 중 하나이다. 그러나 기존의 정량적 구조-물성 상관관계식들은 고에너지 물질 등과 같은 특정 물질 군에 대한 실험값들의 부족 등으로 인해 제한적인 응용성을 가지고 있었다. 본 연구에서는 서로 다른 출처로부터의 5,923개의 비등점 자료를 확보하였으며, 이에는 일반적 유기화합물과 더불어 특수목적을 가지는 분자들을 포함하였고, 이들 수집된 데이터 셋을 이용하여 새로운 비등점 예측모델을 개발하는데 사용하였다. 다양한 학습 방법을 이용하여 새로이 수집된 데이터 셋을 이용한 2차원 분자 표현자에 기반한 비등점 모델을 도출하였다. 개발된 예측모델의 적정성과 견고성을 확인하였고, 훈련 셋의 표현자에 기반한 비등점 예측모델의 적용구역을 도출하였다.

About the Influence of the Molecular Structure of selected classes of small molecules on their thermal behavior

  • Richter, Andreas M.;Lischewski, Volker;Felicetti, M.
    • 한국정보디스플레이학회:학술대회논문집
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    • 한국정보디스플레이학회 2004년도 Asia Display / IMID 04
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    • pp.812-815
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    • 2004
  • The molecular structure influences the thermal behavior of HTM. For OLED the glass transition temperature and evaporation temperature are critical. We report how changes in structure cause changes on both parameters. The results may be of interest for chemists when they design new molecule structures for OLED.

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The Design of Photobiological Active Molecular Model For Photodynamic Therapy

  • Choi, Chang-Shik
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국정보통신학회 2019년도 춘계학술대회
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    • pp.521-524
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    • 2019
  • The design of photobiological active photosensitizing molecular model for photodynamic therapy has been attracted as a research for the development of cancer treatment, and has been interested in the effective method for cancer treatment and the photosensitizer having more stable wavelength. Furthermore, the development of photosensitizer has been already carried out from the first generation molecule to the third one, and the research of smart photosensitizer as the fourth generation has been requested. As a fact, the selective killing of the only cancer cell is very difficult problem, and the present photodynamic therapy has the problem of killing of the normal cell. So, I have designed the new modelling of photosensitizer having the smart recognizing unit and the magnetic nanoparticle as well as having the several effective recognizing unit. In particular, the new model design of the photosensitizer having lanthanide metal has suggested for the development of photodynamic therapy. The model design of these new photosensitizing molecules will be introduced in the poster section for the new turning point of the development of photosensitizer.

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Binding Model of Amentoflavone to Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ

  • Lee, Jee-Young;Kim, Jin-Kyoung;Lee, So-Jung;Lee, Eun-Jung;Shin, So-Young;Jin, Qinglong;Yoon, Do-Young;Woo, Eun-Rhan;Kim, Yang-Mee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제33권5호
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    • pp.1475-1479
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    • 2012
  • Human peroxisome proliferator-activated receptor gamma ($hPPAR{\gamma}$) has been implicated in numerous pathologies, including obesity, diabetes, and cancer. In this study, we verified that amentoflavone is an agonist of $hPPAR{\gamma}$ and probed the molecular basis of its action. It was demonstrated that amentoflavone bound $hPPAR{\gamma}$ with high (picomolar) affinity and increased the binding between $hPPAR{\gamma}$ and steroid receptor coactivator-1 (SRC-1) by approximately 4-fold. Based on a docking study, for the first time, we propose a model of amentoflavone and $hPPAR{\gamma}$ binding in which amentoflavone forms three hydrogen bonds with the side chains of His323, Tyr327, and Arg280 in $hPPAR{\gamma}$ and participates in two hydrophobic interactions.

SVM 방법을 이용한 hERG 이온 채널 저해제 예측모델 개발 (Development of Classification Model for hERG Ion Channel Inhibitors Using SVM Method)

  • 강신문;김한조;오원석;김선영;노경태;남기엽
    • 대한화학회지
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    • 제53권6호
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    • pp.653-662
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    • 2009
  • 흡수, 분포, 대사, 배설 특성 및 독성을 예측하기 위한 효과적인 툴을 개발하는 것은 신약개발의 초기단계에서 NCE(new chemical entity)에 대한 가장 중요한 업무 중의 하나이다. 최근에 이런 시도중의 하나로서 ADME/T(absorption, distribution, metabolism, excretion, toxicity)관련 성질들의 예측에 support vector machine(SVM)을 이용하고 있다. 그리고 SVM은 ADME/T 성질들을 정확하게 예측하는데 많이 사용 되고 있다. 그러나 SVM 모델링에 두 가지 문제가 있다. 특성 선택(feature selection) 과 매개변수 설정(parameter setting)은 여전히 해결해야 할 과제이다. 이 두 가지 문제들은 SVM 분류의 효율성과 정확도에 결정적인 영향을 끼친다. 특히 특성 선택과 최적화된 SVM 변수의 설정은 서로 영향을 주기 때문에 동시에 다루어져야 한다. 여기서 우리는 genetic algorithm(GA) – 특성 선택에 사용 – 과 grid search(GS) method– 변수최적화에 사용 – 두 가지를 통합하는 효과적인 해결책을 제시하였다. ADME/T관련 성질 중 하나인 심장부정맥을 야기시키는 hERG 이온채널 저해제 분류 모델이 여기서 제안된 GA-GS-SVM을 위해 할당되고 테스트 되었다. 1891개의 화합물을 가지는 트레이닝 셋으로 단일 모델 3개, 앙상블 모델 3개, 총 6개의 모델을 만들었고 175개의 외부 데이터를 테스트 셋으로 사용하여 검증하였다. 데이터의 불균형 문제를 해결하기 위하여 GA-GS-SVM 단일 모델에 의한 예측 정확도와 GA-GS-SVM 앙상블 모델 예측 정확도를 비교하였으며, 앙상블모델을 사용하여 예측의 정확도를 높일 수 있었다.