Attenuated viruses can protect their hosts against challenge to their related viruses. Increasing evidence shows that mutations of the tobamoviral 126/183 kDa protein play a major role in the viral attenuation and contribute to the cross protection mechanism. In this study, four mutants of Pepper mild mottle virus (PMMoV) have been constructed by mutagenesis; two mutants, pTPpoly348 and pTPpoly762, were substituted in the middle of replicase gene, and the others, pTPL3D:: $\Delta$6207 and pTPL3D:: $\Delta$6219, were deletion mutants made by deleting some parts of pseudoknot structures of the 3' noncoding region (NCR) of the virus. Progeny viruses generated from the four mutants were infectious on N. benthamiana plants with symptomless or mild mosaic symptom. Replication efficiency and viral product accumulations of four mutants were assessed by Northern and Western blot analyses on BY-2 protoplast cells. Accumulation of CP for the pTPL3D:: $\Delta$6207 and pTPL3D:: $\Delta$6219 were lower than that of other mutants and wild type virus. These data suggest that the 3'-NCR mutations contribute to the viral gene expression in host tissues, while mutants of replicase gene rather govern the symptom expression.
TMV-OM계통을 접종하여 고온처리시킨 Samsun으로부터 3종의 약독변이계통 Tg 5272, Tw 227 및 Tw 333을 유기시켰다. 이들 약독바이러스는 담배 및 고추에 가벼운 mottling 증상이나 무증징으로 감염되어 TMV-OM에 의한 모자이크, 기형, 위축현상 등을 나타내지 않고 건전식물과 비교하여 생육에 거의 차이를 보이지 않았다. 또한 국부병반기주에 감염되었을 때에도 원주에 비해 전반적으로 미약한 반응을 나타냈고, 특히 Tw 227 및 Tw 333은 N. glutinosa, D. stramonium 및 G. globosa에서 매우 특이한 병징을 나타냈다. 약독바이러스의 물리적 성질 및 TMV-OM 항혈청에 대한 혈청학적 성질의 차는 인정되지 않았다. 한편 약독바이러스를 둔화하였을 때, 약독바이러스의 농도는 TMV-OM에 비해 매우 낮았으나, 이들 바이러스의 자외선흡수 및 전기영동패턴에는 차이를 보이지 않았다.
The determinant factors of an organism's size during animal development have been explored from various angles but remain partially understood. In Caenorhabditis elegans, many genes affecting cuticle structure, cell growth, and proliferation have been identified to regulate the worm's overall morphology, including body size. While various mutations in those genes directly result in changes in the morphological phenotypes, there is still a need for established, clear, and distinct standards to determine the apparent abnormality in a worm's size and shape. In this study, we measured the body length, body width, terminal bulb length, and head size of mutant worms with reported Dumpy (Dpy), Small (Sma) or Long (Lon) phenotypes by plotting and comparing their respective ratios of various parameters. These results show that the Sma phenotypes are proportionally smaller overall with mild stoutness, and Dpy phenotypes are significantly stouter and have disproportionally small head size. This study provides a standard platform for determining morphological phenotypes designating and annotating mutants that exhibit body shape variations, defining the morphological phenotype of previously unexamined mutants.
액독 TMV, Tw 333 RNA 및 외피단백질에 대한 생화학적 특성을 조사하였다. Tw333-RNA는 $2.03\times10^6$dalton의 분자량을 나타냈고, 고기조성은 guanine 25.4, adenine 29.2, cytosine 17.5, uracil 27.9mol이었다. 열처리에서 얻어진 이 RNA의 농색효과는 $25.1\%$를 나타냈고, 이때 Tm치는 $47^{\circ}C$였다. 한편 Tw 333의 외피단백질은 17,500 dalton의 분자량을 보였으며, 16종의 아미노산으로 구성된 158개의 아미노산잔기를 나타냈다. Trypsin으로 분해한 단백질은 9종의 ninhydrin 양성반응 peptide를 형성하였다. 이들 약독 TMV, Tw333-RNA 및 외피단백질의 생화학적 특성은 원주 OM계통과 전반적으로 매우 유사하였다. 그러나 고기조성, 농색효과, 아미노산조성 및 peptide map에서 약간의 차가 인정되었다.
Cucumber mosaic virus(CMV)-Paf 계통에 포함된 satellite RNA(Paf-satRNA)는 CMV의 병징을 완화시키는 약독병징 관련 유전자로 작용하였다(Choi 등, 2001). 이 연구는 Paf-satRNA의 약독병징 관련 유전자의 도메인을 확인하기 위하여, 고추에서 chlorosis 병징을 발현하는 PepY-satRNA와 키메라 satRNA를 구축하여 분석하였다. 두 종의 satRNA의 염기서열을 비교한 결과, 분자크기가 큰 PepY-satRNA에서 10염기의 삽입이 발견되기는 하였지만, 양 말단영역의 염기는 비교적 안정된 conserved sequence를 보였다. 그러나 이들 satRNA의 중간영역에 존재하는 염기서열, 즉 5' 말단의 81번째 염기로부터 113번째, 그리고 183번째 염기부터 265번째 염기까지의 영역에서는 많은 변화를 나타냈다. 약독병징과 관련된 도메인을 확인하기 위하여 구축한 각 satRNA 및 키메라 satRNA의 cDNA로부터 transcript RNA를 전사시키고, 전사된 각 satRNA transcript를 CMV-Fny의 게놈RNA1, RNA2 및 RNA3의 transcript와 혼합한 후 N. benthamiana에 접종하였다. 그 결과 RT-PCR에 의해서 모든 satRNA-cDNA로부터 전사된 transcript의 감염성이 확인되었으며, Paf-satRNA 및 키메라 Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 N. benthamiana에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였다. 이와는 대조적으로 PepY-satRNA 및 키메라 PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이들 각 키메라 satRNA에 감염된 N. benthamiana를 접종원으로 고추에 접종한 결과, Paf-satRNA와 혼합한 CMV-Fny를 접종한 고추에서는 무병징에 가까운 약한 모자이크 증상이 발현되었고, PepY-satRNA를 접종한 고추는 뚜렷한 chlorosis의 모자이크 증상이 발현되었다. 한편 이들 두 종 satRNA의 키메라, Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 고추에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였고, PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 chlorosis의 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이와 같은 결과를 종합해 보았을 때, N. benthamiana에서와 마찬가지로 Paf-satRNA의 약독병징과 관련된 유전자의 도메인은 HpaI-NarI 영역에 존재한다는 것을 나타냈다.
Ruzal, Sandra M.;Bustos, Patricia L.;Sanchez-Rivas, Carmen
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제23권1호
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pp.15-21
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2013
We previously observed that Bacillus subtilis spores from sspE mutants presented a lower germination capacity in media containing high salt concentrations (0.9M NaCl). This deficiency was attributed to the absence of SASP-E (gamma-type small-acid-soluble protein), rich in osmocompatible amino acids released by degradation. Herein we observed that, in addition, this mutant spore presented a reduced capacity to use L-alanine as germinant (L-ala pathway), required longer times to germinate in calcium dipicolinate ($Ca^{2+}$-DPA), but germinated well in asparagine, glucose, fructose, and potassium chloride (AGFK pathway). Moreover, mild sonic treatment of mutant spores partially recovered their germination capacity in L-ala. Spore qualities were also altered, since sporulating colonies from the sspE mutant showed a pale brownish color, a higher adherence to agar plates, and lower autofluorescence, properties related to their spore coat content. Furthermore, biochemical analysis showed a reduced partition in hexadecane and a higher content of $Ca^{2+}$-DPA when compared with its isogenic wild-type control. Coat protein preparations showed a different electrophoretic pattern, in particular when detected with antibodies against CotG and CotE. The complementation with a wild-type sspE gene in a plasmid allowed for recovering the wild-type coat phenotype. This is the first report of a direct involvement of SASP-E in the spore coat assembly during the differentiation program of sporulation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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