Journal of Korean Society of Archives and Records Management
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v.1
no.1
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pp.231-243
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2001
The sterilization method of records by fumigation using mixed gas of methyl bromide(MB) and ethylene oxide(ETO) has been generally used as a way to protect biological deterioration by microorganisms and insects. In this study, we confirmed sterilization effect of MB and ETO [86 : 14(Vol.%)] on and analyzed toxicity on microorganisms isolated from records. To analyze sterilization effect of fumigation on microorganisms and insect, we have fumigated microorganisms and insect with a various amounts mixed gas of MB and ETO, and various exposure time. Insect was sterilized at all experimental conditions. In microorganisms, sterilization effect was detected only when the mixed gas was treated at $120g/m^3$ concentration for at least 24 hrs. To test the possibility of isolated microorganisms as a threat to human health, it was investigated that toxicity test using yeast, radish and cancer cells on microorganisms. Only Aspergillus oryzae had an inhibition effect on growth of yeast. radish and cancer cells, respectively. These results demonstrate that sterilization effect can occur at low concentrations of the mixed gas on insect but requires higher concentrations of the mixed gas on microorganisms. In addition to, it is suspected that the possibility of the microorganism as a threat to human health is little.
This experiment investigates the characteristics of microorganisms isolated from a medium during cultivation process and reveals the relationship between these microorganisms and the growth of Agaricus bisporus. The domestically grown strains of Agaricus bisporus displayed a higher inhibition growth rate against microorganisms isolated from straw, chicken manure, and medium than imported strains. As for inhibition of mycelial growth among mushroom cultivars of the microorganisms separated by each fermentation step from the mushroom medium, the domestic cultivar, 'Saedo,' grew more vigorously among other cultivars. As the fermentation progressed, it was confirmed that inhibitation of microorganisms against Agaricus bisporus was weakened. A total of 21 strains of microorganisms that promote mushroom growth were isolated in the 4th turning process, and the microorganisms isolated from the mushroom medium affect the growth and as yield of the mushroom through secretory substances.
Terminal-restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis was used to monitor inoculated oil-degrading microorganisms during bioremedial treatability tests. A pair of universal primers, fluorescently labeled 521F and 1392R, was employed to amplify small subunit rDNA in order to simultaneously detect two bacterial strains, Corynebacterium sp. IC10 and Sphingomonas sp. KH3-2, and a yeast strain, Yarrowia lipolytica 180. Digestion of the 5'-end fluorescence/labeled PCR products with HhaI produced specific terminal-restriction fragments (T-RFs) of 185 and 442 bases, corresponding to Corynebacterium sp. IC10 and Y. lipolytica 180, respectively. The enzyme NruI produced a specific T-RF of 338 bases for Sphingomonas sp. KH3-2. The detection limit for oildegrading microorganisms that were inoculated into natural environments was determined to be $0.01\%$ of the total microbial count, regardless of the background environment. When three oil-degrading microorganisms were released into oil-contaminated sand microenvironments, strains IC10 and 180 survived for 35 days after inoculation, whereas strain KH3-2 was detected at 8 days, but not at 35 days. This result implies that T-RFLP could be a useful tool for monitoring the survival and relative abundance of specific microbial strains inoculated into contaminated environments.
Kim, Sung-Eun;Moon, Jae-Sun;Kim, Jung-Kyu;Choi, Won-Sik;Lee, Sang-Han;Kim, Sung-Uk
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.20
no.1
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pp.187-192
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2010
In order to monitor the possibility of horizontal gene transfer between transgenic rice and microorganisms in a paddy rice field, the gene flow from a bifunctional fusion (TPSP) rice containing trehalose-6-phosphate synthase and phosphatase to microorganisms in soils was investigated. The soil samples collected from the paddy rice field during June 2004 to March 2006 were investigated by multiplex PCR, Southern hybridization, and amplified fragment length polymorphism (AFLP). The TPSP gene from soil genomic DNAs was not detected by PCR. Soil genomic DNAs did not show homologies on the Southern blotting data, indicating that gene transfer did not occur during the last two years in the paddy rice field. In addition, the AFLP band patterns produced by soil genomic DNAs from both transgenic and non-transgenic rice fields appeared similar to each other when analyzed by the NTSYSpc program. Thus, these data suggest that transgenic rice does not give a significant impact on the communities of soil microorganisms, although long-term observation may be needed.
In order to elucidate the mechanism of red-colored phenomena(RCP) in ginseng(Panax ginseng C.A. Meyer), distribution of inorganic elements of ginseng root and its surrounding soil, and microflora in the soil were investigated. Red brown colored-substances were accumulated in the cell wall of epidermis at early stage of red-colored ginseng (RCG). Cell wall of the late stage of RCG was disordered and microorganisms were shown in the disordered cell wall. Al, Si and Fe contents among inorpanic elements in the epidermis of RCG were higher at two or three times than that of healthy ginseng. On the other hand, K content was higher at three times in healthy ginseng than that of RCG. Especially, Fe content was higher at three times in lateral roots of RCG than that of healthy ginseng. Total 21 strains of microorganisms were isolated on the 523 medium from surface soil, surrounding soil of both healthy and RCG, and RCG. Six strains of microorganisms among them were resistant to 2 mM Fe. Two species in Bacillus app. and Lactobacillus app. , and one species in Micrococcus sp. and Npisseria sp. respectively were identified. It seemed that RCP was closely related with the distribution and uptake of inorganic elements, was also correlated Fe-independent metabolism of microorganisms.
The comparative study on the predominant cultivable periodontopathic bacteria were done 2 weeks after the application of the e-PTFE membrane and collagen membrane in the controlled tissue regeneration procedures. The purpose of the present study also included the antibiotic susceptibility test (ciprofloxacin, tetracycline, clindamycin) of these cultured organisms. 0.1% chlorhexidine mouthwash (10ml twice/day for 6 weeks) and systemic doxycycline (200mg/day for 2 weeks) were administered for supragingival and subgingival plaque control respectively. Four clinical isolates of A.a. from 2 patients were found to be resistant to tetracycline which were susceptible to clindamycin and ciprofloxacin. One isolate of W.r. and two unidcntified microorganisms were resistant only to clindamycin and one isolate of NID BPB and E.c. and two isolates of unidentified microorganisms were resistant only to ciprofloxacin. Overall susceptibility of tested microorganisms to ciprofloxacin, tetracycline and clindamycin were 85%, 77% and 89% respectively. The results indicated no significant differences in the percentage of cultivable periodontopathic bacteria between the two membranes, and also the microorganisms resistant to tetracycline after systemic administration of doxycycline turned out to be susceptible to either ciprofloxacin or clindamycin.
Proceedings of the Korean Society of Soil and Groundwater Environment Conference
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2003.09a
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pp.152-157
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2003
Diesel-contaminated soils were ozonated for different times (0 - 900 min) and incubated for 9 wk to monitor petroleum hydrocarbons (PH)-degradative potential of indigenous microorganisms in the soils. Increased ozonation time decreased not only concentration of PH but also number of microorganisms in the soils. Microorganisms in the ozonated soils increased during 9-wk incubation as monitored by culture- and nonculture-based methods. Higher (1-2 orders of magnitude) cell number was observed by quantitative analysis of soil DNA using probes detecting genes encoding 165 rRNA(rrn), naphthalene dioxygenase (nahA), toluene dioxygenase (todC), and alkane hydroxylase (alkB) than microbial abundance estimated by culture-based methods. Such PH-degraders were relatively a few or under detection limit in 900-min ozonated soil. Further PH-removal observed during the incubation period supported the presence of PH-degraders in ozonated soils. Highest reduction (25.4%) of total PH (TPH) was observed in 180-min ozonated soil white negligible reduction was shown in 900-min ozonated soil during the period, resulting in lowest TPH-concentration in 180-min ozonated soil among the ozonated soils. Microbial community composition in 9-wk incubated soils revealed slight difference between 900-min ozonated and unozonated soils as analyzed by whole cell hybridization using group-specific rRNA-targeted oligonucleotides. Results of this study suggest that appropriate ozonation and subsequent biodegradation by indigenous microorganisms may be a cost-effective and successful remediation strategy for PH-contaminated soils.
About 99% of microorganisms in the environment are unculturable. However, advances in molecular biology techniques allow for the analysis of living microorganisms in the environment without any cultivation. With the advent of new technologies and the optimization of previous methods, various approaches to studying the analysis of living microorganisms in the environment are expanding the field of microbiology and molecular biology. In particular, real-time PCR provides methods for detecting and quantifying microorganisms in the environment. Through the use of the methods, researchers can study the influence of environmental factors such as nutrients, oxygen status, pH, pollutants, agro-chemicals, moisture and temperature on the performances of environmental processes and some of the mechanisms involved in the responses of cells to their environment. This review will also address information gaps in the analysis of the microorganisms using real-time PCR in the environmental process and possible future research to develop an understanding of microbial activities in the environment.
In this study, the distribution of dictyostelid cellular slime molds was investigated from F, H and $A_1$ horizon of pinus, oak forests in Mt. Puk'an, Mt. Nam and Mt. Kwanak. The relationship of cellular slime molds with other soil microorganisms and abiotic factors were analyzed. The six species were isolated as follows: Polysphondlium pallidurn, Dictyostelium purpureum, D. mucoroides, D. crassicaule, D. capitatum, D. implicatum. The dominant species in pinus forests was P. pallidum, and in oak forests it was D. macro ides. In Mt. Nam, D. mucoroides and P. pallidum were isolated at only oak forest. The Correlations of slime mold abundance with bacteria were significant. Even though positive correlations of cellular slime molds with actinomycetes or fungi were not significant, correlations between soil microorganisms were analyzed. Correlation coefficients were high in Mt. Kwanak(r=0.5921) and Mt. Nam(r=0.7243) at significant level P<0.01. There were significant correlations between total slime molds and abiotic factors. It supports that cellular slime molds are limited by foods in nature. In low level of pH, water content and organic matter, that community diversity is more affected by bacteria whose organic degradation capacity is regulated by interactions of soil microorgaisms. Key words: Cellular slime molds, Soil microorganisms, Correlations, Abiotic factors.
Journal of Korean Academy of Fundamentals of Nursing
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v.5
no.1
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pp.143-154
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1998
Background : There have been very few studies conducted on the number and type of microorganisms that remain on the ring finger after handwashing. This study was performed to investigate whether there were changes and differences in the type and number of microorganisms on the ring finger before and after handwashing. Method : The subjects of the study were 15 MICU and SICU staff nurses who were wearing rings. I swabbed two different fingers of the same hand with cotton balls. One finger which had a ring and the other with no ring. I swabbed the fingers of each subject three times(before handwashing, after handwashing with soap, and after handwashing with bethadine solution). After storing them for 48 hours in an incubator, I sent them to the laboratory and recorded the culture results. Results : There was no difference in the type of microorganism, but a major difference in the number of the microorganisms that existed on the finger ring. The results showed that there were much more microorganisms on the ring fingers than on the fingers that did not have rings both before and after handwashing. This tendency was consistent regardless of the handwashing agent. I therefore recommend that all nursing staff who work in general nursing units, as well as nurses who work in the ICU, remove their rings when taking care of the patients.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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