• Journal of Plant Biotechnology
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• 제44권1호
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• pp.69-75
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• 2017

Dormancy-associated protein (DRM)은 식물의 휴면생리에 관여하는 대표적인 단백질로 거의 모든 식물에 보존되어 있다. 최근 DRM 유전자가 비생물적 스트레스 반응에 관여하는 것으로 알려지면서 이 유전자의 특성구명 연구가 여러 식물에서 이루어지고 있다. 그러나 아직까지 나무에서는 DRM 유전자에 대한 연구가 거의 없는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 DRM 유전자를 현사시나무(Populus alba ${\times}$ P. glandulosa)에서 분리하여 이를 PagDRM1이라 명명하고, 유전자의 구조와 발현특성을 조사하였다. PagDRM1 유전자는 123개의 아미노산으로 구성된 단백질을 암호화하며, 2개의 영역(Domain I과 Domain II)이 잘 보존되어 있다. PagDRM1은 현사시나무의 염색체에 1 ~ 2 copy가 존재하며, 줄기에서 가장 높게 발현하였고 성숙 잎, 뿌리 및 꽃에서도 높은 발현 수준을 나타내었다. 현탁배양세포의 생장주기에서는 늦은 지수생장기부터 정지기까지 높게 발현하였다. 또한 PagDRM1은 건조와 염 스트레스에 반응하여 발현이 증가하는 것으로 나타났다. 식물호르몬 처리에 의해서는 ABA와 GA 처리에 의한 발현 증가를 나타내었다. 따라서 PagDRM1은 식물의 휴면유도 과정에서 중요한 역할을 할 뿐만 아니라 환경 스트레스 내성에도 기여하는 것으로 생각된다.

• 한국환경복원기술학회지
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• 제22권5호
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• pp.1-12
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• 2019

It is important to measure the height of trees as an essential element for assessing the forest health in urban areas. Therefore, an automated method that can measure the height of individual tree as a three-dimensional forest information is needed in an extensive and dense forest. Since airborne LiDAR dataset is easy to analyze the tree height(z-coordinate) of forests, studies on individual tree height measurement could be performed as an assessment forest health. Especially in urban forests, that adversely affected by habitat fragmentation and isolation. So this study was analyzed to measure the height of individual trees for assessing the urban forests health, Furthermore to identify environmental factors that affect forest growth. The survey was conducted in the Mt. Bongseo located in Seobuk-gu. Cheonan-si(Middle Chungcheong Province). We segment the individual trees on coniferous by automatic method using the airborne LiDAR dataset of the two periods (year of 2016 and 2017) and to find out individual tree growth. Segmentation of individual trees was performed by using the watershed algorithm and the local maximum, and the tree growth was determined by the difference of the tree height according to the two periods. After we clarify the relationship between the environmental factors affecting the tree growth. The tree growth of Mt. Bongseo was about 20cm for a year, and it was analyzed to be lower than 23.9cm/year of the growth of the dominant species, Pinus rigida. This may have an adverse effect on the growth of isolated urban forests. It also determined different trees growth according to age, diameter and density class in the stock map, effective soil depth and drainage grade in the soil map. There was a statistically significant positive correlation between the distance to the road and the solar radiation as an environmental factor affecting the tree growth. Since there is less correlation, it is necessary to determine other influencing factors affecting tree growth in urban forests besides anthropogenic influences. This study is the first data for the analysis of segmentation and the growth of the individual tree, and it can be used as a scientific data of the urban forest health assessment and management.

• 농업과학연구
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• 제16권1호
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• pp.36-43
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• 1989

Streptomyces의 분류, 분포 및 항생물질 생산특성을 알아보고자 각 토양으로부터 총 826 균주의 Streptomyces를 분리하여 토양별 분포를 조사하고 항생물질 생산능을 검정하였다. 토양별 방선균류의 분포를 조사한 결과 참나무, 잔디, 아카시아, 사과나무, 고추밭, 배추밭, banana 온실 등지에서 $10^{-5}g$ 토양중에 5개 이상의 Streptomyces가 분리되었으며 산림토양에서 평균 4.7개, 과수원 토양에서 2.4개, 경작지 토양에서 2.9개의 분리율을 보였다. 2. Streptomyces의 항균 spectrum을 조사한 결과 Bacillus subtilis, Erwinia carotovora sub-sp. carotovora, Xanthomonas campestis pv. oryzae에 49% 이상의 균주가 항균력을 나타내었으나 Escherichia coli와 Pseudomonas solanacearum에는 항균력을 나타내는 균주가 적었다. 3. 도열병균을 대상으로 Streptomyces의 항진균성 항생물질 생성능을 조사한 결과 강력한 항균력을 나타내는 균주가 40 균주였다. 4. Streptomyces의 분리율이 가장 우수한 배지는 Starch agar 였다. 5. Streptomyces의 항생물질 생성능이 가장 우수한 배지는 potato sucrose agar 였다.

• 미생물학회지
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• 제50권4호
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• pp.372-375
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• 2014

본 연구에서는 백색부후균인 겨울우산버섯의 원형질체 분리 조건과 유전자 형질전환 방법을 확립하였다. 겨울우산버섯 균사에 세포벽 분해효소로 0.5% Usukizyme을 처리하여 ml당 $1{\times}10^7/ml$개의 원형질체를 확보할 수 있었다. 형질전환체의 선별을 위해 hygromycin에 대한 저항성을 갖는 유전자(hph)를 선택표지로 이용하여 형질전환용 벡터(pHYgpt)를 제작하였다. 40% polyethylene glycol 용액과 aurintricarboxylic acid와 heparin, supermidine을 첨가하여 형질전환을 수행 한 결과 벡터 $1{\mu}g$ 당 100-160개의 수율로 형질전환체를 얻었다. 도입된 벡터는 hph 유전자의 PCR 증폭을 통해 형질전환체의 염색체내에 삽입되었음을 확인하였다. 이러한 결과는 polyporus 속의 유전자를 활용한 새로운 균주 개발에 유용한 기술이 될 것이다.

• 터널과지하공간
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• 제33권6호
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• pp.561-573
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• 2023

한국원자력연구원은 심부 암반의 수리/지화학 특성 분석을 위해 KURT (KAERI Underground Research Tunnel)를 건설하였고, 다수의 조사용 시추공을 시추하여 각종 시험을 수행 중이다. 시추공 조사에서 목적에 적합한 조사 구간 선정은 매우 중요하며 수리 유동 파악 및 지하수 채수가 목적인 경우, 유량이 풍부한 구간이 조사 목적에 부합한다. 본 연구에서는 이러한 구간을 수리 이상점으로 정의했으며, 심도 1km 수준의 시추공 물리검층 자료(온도, 전기전도도)를 활용하여 이를 탐지하고자 하였다. 체계적이고 효율적인 이상점 탐지를 위해 기계학습 알고리즘 중 DBSCAN, OCSVM, kNN, isolation forest을 적용하고 그 적용성을 파악하였다. 데이터 전처리와 알고리즘 최적화를 수행했으며, 그 결과 네 가지 알고리즘은 각각 55, 12, 52, 68개의 수리 이상점을 탐지하였다. 본 논문을 통해 기계학습 알고리즘의 활용 가능성을 확인했으나, 학습에 활용된 입력자료가 제한적이었기 때문에, 향후 추가적인 검증과 보완이 바람직한 것으로 판단된다.

• Journal of Forest and Environmental Science
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• 제34권5호
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• pp.376-381
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• 2018

For the control of oak wilt caused by Raffaelea quercus-mongolicae, an antifungal microorganism, Streptomyces blastmyceticus, was used as a potential agent. Culture suspension of S. blastmyceticus was injected into Quercus mongolicae in the research forest of Kangwon National University by $ChemJet^{(R)}$ trunk injection and Macro-infusion at root flare injection. $Alamo^{(R)}$ (a.i., propiconazole 14.5%), a fungicide currently used for the control of oak wilt in USA, was also treated by both methods to compare the efficacy. For preventive efficacy, culture suspension of the pathogen was inoculated at 1 month after injection of either agent. Tested trees were cut at 3 months after treatment, stained with 1% Fuchsin acid, and then non-conductive area (NCA) and re-isolation frequency (RIF) of oak wilt fungus were compared among treatments. While NCA was the highest as 47.3% in pathogen only treatment, it was the lowest as 16.0% in sterilized water treatment by Macro-infusion. NCAs of Alamo treatment by Macro-infusion and ChemJet injection were 25.3% and 32.1%, respectively. NCA of S.blastmyceticus treatment by ChemJet injection was 32.3%, similar with Alamo treatment's by ChemJet injection. All treatments by either injection method showed significantly lower NCA compared to the pathogen only treatment. These results indicate that S. blastmyceticus injection shows the preventive efficacy against oak wilt disease by suppressing the growth of pathogen injected. NCA of Macro-infusion injection of sterilized water was lower as 16.0%, compared to 21.3% of ChemJet injection. It means that Macro-infusion is more effective in translocation of sterilized water than ChemJet injection by even distribution. RIF from wood discs of treated trees showed high in pathogen only treatment, but relatively low in S. blastmyceticus treatment. RIF results were correlated with NCA results. From the above results, it was confirmed that S. blastmyceticus showed preventive efficacy against oak wilt disease by ChemJet trunk or Macro-infusion at root flare injection.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2018년도 추계학술대회
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• pp.100-100
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• 2018

Zoysia japonica Steud.(Zj) is a typical warm-season Korean lawn grass, which is used in many places such as river banks, roadside and soccer fields in Korea. Recently, it has also been used in school yards and the Saemangeum reclaimed land to reduce water pollution. Although the cultivated area of turfgrass is steadily increasing worldwide, it grows fast requiring frequent mowing and is difficult to grow in shady areas and the cold region. Therefore this study aims searching for useful gene(s) to develop abiotic stress tolerant and dwarf zoysiagrass. We isolated Ycf4 gene based on the sequence from Oryza sativa Japonica through RT-PCR and RACE PCR. Ultimately, open reading frame (ORF) of ZjYcf4 was 558bp long, encoding a protein of 186 amino acid residues. NCBI blast results showed that the ZjYcf4 protein is evolutionarily closely related to Ycf4 protein from Zoysia macrantha and Setaria italica (100% and 98%, respectively). To determine whether ZjYcf4 was involved in environmental stress in wild-type zoysiagrass, expression patterns of the gene were analyzed by real-time PCR under salt, cold and dark conditions. They were analyzed after each stress treatment for 3 hours. In salt and cold stresses, the expression was higher compared to control (3-fold and 1.5-fold, respectively), although there was a 1.6-fold decrease in expression under dark stress treatment. As reported previously, we suggest that ZjYcf4 gene affects abiotic stress such as salt, cold and dark.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제46권3호
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• pp.180-188
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• 2019

옥신은 식물의 생장과 발달 과정에서 중요한 조절자로서 기능한다. 옥신 신호전달 과정은 3개의 주요 옥신 반응 전사인자인 Auxin/indole-3-acetic acid (Aux/IAA), Gretchen Hagen 3 (GH3), 그리고 small auxin up RNA (SAUR) 유전자에 의해 조절된다. 특히, Aux/IAA는 옥신 신호에 반응하여 빠르게 축적되는 수명이 짧은 핵 단백질이다. 이 실험에서 우리는 현사시 나무(Populus alba ${\times}$ P. glandulosa)로 부터 PagAux/IAA1 유전자를 분리하고 발현 특성을 분석하였다. PagAux/IAA1 cDNA는 4개의 보존된 도메인과 2개의 nuclear localization sequence (NLS)을 포함한 200개의 아미노산을 암호화하고 있다. Southern blot 분석으로 현사시나무 genome에 PagAux/IAA1 유전자가 single copy로 존재하는 것을 확인하였다. PagAux/IAA1 유전자는 잎과 꽃에서 특이적으로 발현되었다. 그리고 PagAux/IAA1 유전자는 현탁배양세포의 생장 과정에서 초기 지수생장기에 발현되었다. PagAux/IAA1 유전자의 발현을 분석한 결과, 건조와 염 스트레스 및 식물호르몬인 ABA 처리에 의해 발현이 감소된 반면 저온 스트레스, 형성층의 세포 분열 과정 그리고 식물호르몬인 GA와 JA 처리에서 발현이 증가하였다. 따라서 PagAux/IAA1 유전자가 현사시나무에서 저온 스트레스 반응뿐 아니라 생장 과정에 관여할 것으로 판단된다.

• 생약학회지
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• 제37권4호
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• pp.290-293
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• 2006

Phytochemical investigation of the seed extract of Nelumba nucifera Gaerth (Nymphaeaceae) resulted in the isolation of a plant hormon, dihydrophaseic acid (1), a abscisic acid derivative. The chemical structure of 1 was elucidated by 2D-NMR spectroscopic analysis, COSY, DEPT, HMQC and HMBC.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제27권1호
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• pp.44-47
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• 2004

Loranthus tanakae Fr. et Sav. (Loranthaceae) is a species of mistletoe, a semiparasitic plant growing on the branches of Quercus and Betula species as host trees. In our ongoing search for bioactive compounds from endemic species in Korea, we have investigated to isolate the chemical constituents responsible for the antitumor effect of the MeOH extract of L. tanakae. The ethyl acetate soluble part of the MeOH extract demonstrated a marginal inhibition on the proliferation of the tumor cell lines such as A549 (non small cell lung), SK-OV-3 (ovary), SK-MEL-2 (melanoma), XF498 (central nerve system), and HCT-15 (colon) in vitro. Thus, the activity-guided isolation procedure upon the ethyl acetate soluble part of the extract has been carried out and finally four flavonoid rhamnopyranosides (1-4) were isolated as active principle. The structures of 1-4 were elucidated by the physicochemical and spectral data as rhamnetin 3-O-$\alpha$-L-rhamnoside (1), quercetin 3-O-$\alpha$-L-rhamnoside (2), rhamnocitrin 3-O-$\alpha$rhamnoside (3), and kaempferol 3-O-$\alpha$-L-rhamnoside (4).