• 제목/요약/키워드: integrated cell number

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Expanded Bed Adsorption 크로마토그래피를 사용하여 재조합 E. coli 세포 파쇄액으로부터 내포체 단백질을 직접 재접힘하는 공정 (In Vitro Refolding of Inclusion Body Proteins Directly from E. coli Cell Homogenate in Expanded Bed Adsorption Chromatography)

  • 조태훈;서창우;이은규
    • KSBB Journal
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    • 제16권2호
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    • pp.146-152
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    • 2001
  • rhGH-GST 융합단백질을 사용하여 재조합 대장균 세포 파쇄액으로부터 직접적으로 내포체의 solid-phase 재접힘을 수행할 수 있는 새로운 공정을 개발하였다. 그것은 고체 업자를 제거하는 동시에 초기에 목적딴백질을 흡착 포집할 수 있 는 expanded bed adsorption 크로마토그래피의 장점을 이용한 것이다. 세포 파쇄액 내 용해훤 내포체로부터의 풀린 융합단백질은 expanded bed adsorption 원리에 의해 STREAMLINE DEAE resin에 흡착되고 세포 찌꺼기 등 고체 입자물들은 위 방향 흐름에 의해 효과적으로 제거된다. Urea를 접차적으로 제거함으로써 융합단백질은 고체 matrix 표면에서 재접힘 된 후 염 놓도 구배에 의해 용출된다. 이 새로운 EBA-mediat$\xi$d 재접힘 방법은 응집현상을 획기적으로 줄이고 공정수율윤 향상시킬 뿐 아나라 공정단계 수를 줄일 수 있다. 이 공정은 우리가 알고 있는 한 세계에서 최초로 개발된 공정이며, 현재 single-chain polypeptide, affinity-tagged protein 등과 갈은 다른 행태의 단백질에 EBA를 사용한 재접힘 공정올 적용시키가 위한 연구가 진행되고 있다.

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Pichia pastoris에서 Human Lactoferrin의 발현 (Expression of Human Lactoferrin in Pichia pastoris)

  • 임소용;주인선;윤동훈;성창근
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.669-674
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    • 1997
  • 면역활성, 항균성 등의 기능성을 보여 식품첨가물로 전량 수입에 의존하여 사용되는 human lactoferrin을 진핵세포에서의 생산을 시도하였다. 우선, 항균성을 보이는 lactoferrin에 대하여 생육저해가 없는 host cell에 lactoferrin 유전자를 발현시키고자 lactoferrin에 대한 항균력을 실험한 결과 Pichia pastoris는 생육저해를 일으키지 않아 이를 lactoferrin 생산균주로 선정하였다. Pichia를 숙주로 하는 pHIL-SI expression vector에 lactoferrin 유전자를 삽입 하였을 때 genomic DNA에 유전자가 integration 되었다. 즉, transformant JY-1, JY-2는 PCR(polymerase chain reaction)과 southern blotting에 의하여 2.4Kb의 크기의 HLF(human lactoferrin) 유전자가 삽입되었음을 확인하였다. 유전자 발현을 검토한 결과 transformant JY-1는 immunoblotting에 의하여 lactoferrin 단백질 생산을 확인하였다. 배양시간에 따른 HLF의 생산성을 알아본 결과 48시간 이후에 75KDa의 HLF단백질이 분비됨을 확인하였다

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Reduction of fetuin-A levels contributes to impairment of Purkinje cells in cerebella of patients with Parkinson's disease

  • Sunmi Yoon;Napissara Boonpraman;Chae Young Kim;Jong-Seok Moon;Sun Shin Yi
    • BMB Reports
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    • 제56권5호
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    • pp.308-313
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    • 2023
  • Phenotypic features such as ataxia and loss of motor function, which are characteristics of Parkinson's disease (PD), are expected to be very closely related to cerebellum function. However, few studies have reported the function of the cerebellum. Since the cerebellum, like the cerebrum, is known to undergo functional and morphological changes due to neuroinflammatory processes, elucidating key functional factors that regulate neuroinflammation in the cerebellum can be a beneficial therapeutic approach. Therefore, we employed PD patients and MPTP-induced PD mouse model to find cytokines involved in cerebellar neuroinflammation in PD and to examine changes in cell function by regulating related genes. Along with the establishment of a PD mouse model, abnormal shapes such as arrangement and number of Purkinje cells in the cerebellum were confirmed based on histological finding, consistent with those of cerebellums of PD patients. As a result of proteome profiling for neuroinflammation using PD mouse cerebellar tissues, fetuin-A, a type of cytokine, was found to be significantly reduced in Purkinje cells. To further elucidate the function of fetuin-A, neurons isolated from cerebellums of embryos (E18) were treated with fetuin-A siRNA. We uncovered that not only the population of neuronal cells, but also their morphological appearances were significantly different. In this study, we found a functional gene called fetuin-A in the PD model's cerebellum, which was closely related to the role of cerebellar Purkinje cells of mouse and human PD. In conclusion, morphological abnormalities of Purkinje cells in PD mice and patients have a close relationship with a decrease of fetuin-A, suggesting that diagnosis and treatment of cerebellar functions of PD patients might be possible through regulation of fetuin-A.

Comparison of Non-amplified and Amplified DNA Preparation Methods for Array-comparative Gnomic Hybridization Analysis

  • Joo, Hong-Jin;Jung, Seung-Hyun;Yim, Seon-Hee;Kim, Tae-Min;Xu, Hai-Dong;Shin, Seung-Hun;Kim, Mi-Young;Kang, Hyun-Mi;Chung, Yeun-Jun
    • Molecular & Cellular Toxicology
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    • 제4권3호
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    • pp.246-252
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    • 2008
  • Tumor tissue is usually contaminated by normal tissue components, which reduces the sensitivity of analysis for exploring genetic alterations. Although microdissection has been adopted to minimize the contamination of tumor DNA with normal cell components, there is a concern over the amount of microdissected DNA not enough to be applied to array-CGH reaction. To amplify the extracted DNA, several whole genome amplification (WGA) methods have been developed, but objective comparison of the array-CGH outputs using different types of WGA methods is still scarce. In this study, we compared the performance of non-amplified microdissected DNA and DNA amplified in 2 WGA methods such as degenerative oligonucleotide primed (DOP)-PCR, and multiple strand displacement amplification (MDA) using Phi 29 DNA polymerase. Genomic DNA was also used to make a comparison. We applied those 4 DNAs to whole genome BAC array to compare the false positive detection rate (FPDR) and sensitivity in detecting copy number alterations under the same hybridization condition. As a result microdissected DNA method showed the lowest FPDR and the highest sensitivity. Among WGA methods, DOP-PCR amplified DNA showed better sensitivity but similar FPDR to MDA-amplified method. These results demonstrate the advantage and applicability of microdissection for array-CGH analysis, and provide useful information for choosing amplification methods to study copy number alterations, especially based on precancerous and microscopically invaded lesions.

가변길이 고속 RSA 암호시스템의 설계 및 하드웨어 구현 (Design and Hardware Implementation of High-Speed Variable-Length RSA Cryptosystem)

  • 박진영;서영호;김동욱
    • 한국통신학회논문지
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    • 제27권9C호
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    • pp.861-870
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    • 2002
  • 본 논문에서는 RSA 암호 알고리즘의 연산속도 문제에 초점을 맞추어 동작속도를 향상시키고 가변길이 암호화가 가능하도록 하는 새로운 구조의 1024-비트 RSA 암호시스템을 제안하고 이를 하드웨어로 구현하였다. 제안한 암호시스템은 크게 모듈러 지수승 연산 부분과 모듈러 곱셈 연산 부분으로 구성되었다. 모듈러 지수승 연산은 제곱 연산과 단순 곱셈 연산을 병렬적으로 처리할 수 있는 RL-이진 방법을 개선하여 적용하였다. 그리고 모듈러 곱셈 연산은 가변길이 연산과 부분 곱의 수를 감소하기 위해서 Montgomery 알고리즘에 4 단계 CSA 구조와 기수-4Booth 알고리즘을 적용하였다. 제안한 RSA 암호시스템은 하이닉스 0.35$\mu\textrm{m}$ Phantom Cell Library를 사용하여 하드웨어로 구현하였고 최대 1024-비트까지 가변길이 연산이 가능하였다. 또한 소프트웨어로 RSA 암호시스템을 구현하여 하드웨어 시스템의 검증에 사용하였다. 구현된 하드웨어 RSA 암호시스템은 약 190K의 게이트 수를 나타내었으며, 동작 클록 주기는 150MHz이었다. 모듈러스 수의 가변길이를 고려했을 때, 데이터 출력률은 기존 방법의 약 1.5배에 해당한다. 따라서 본 논문에서 제안한 가변길이 고속 RSA 암호시스템은 고속 처리를 요구하는 각종 정보보호 시스템에서의 사용 가능성을 보여주었다.

Production of Thrombopoietin Gene Targeted Clones by Homologous Recombination at $\beta$-casein Locus of Primary Bovine Ear Skin Fibroblasts

  • Mira Chang;Oh, Keon-Bong;Lee, Kyung-Kwang;Han, Yong-Mahn
    • 한국발생생물학회:학술대회논문집
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    • 한국발생생물학회 2003년도 제3회 국제심포지움 및 학술대회
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    • pp.86-86
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    • 2003
  • Research has been in progress for more than a decade to production of useful proteins by genetic modification in cattle. However, the levels of protein production in transgenic cattle have been reported very low. To enhance protein production in transgenic animal, we tried homologous recombination to donor cells for production of transgenic clone cattle through nuclear transfer procedure. Thus, we constructed the two targeting vectors of human thrombopoietin (TPO) at bovine $\beta$-casein locus using homologous recombination with 13.6 kb and 9.6 kb homology. In two targeting vectors, positive selection was through the neomycin resistance gene and negative selection was by the diphtheria toxin (DT). Gene targeting was attempted in bovine embryonic fibroblasts (bEF) and bovine ear skin fibroblasts (bESF). To determine the most appropriate concentration of neomycin for bEF and bESF, G4l8 resistance was confirmed by culturing the cells in various concentrations of the drug and both of the cells were optimally selected at $900 \mu g/ml$ of neomycin. The transfected bEF and bESF by the targeting vectors were colonized efficiently at the ratio of DNA to transfection reagent such as $4 \mu g$:2 ${mu}ell$ and $1 \mu g$:$2 \mu l$. Comparing number of healthy clones from passage 4 to passage 8, bESF (17%) persist in culture for much longer than bEF (6%). The two gene-targeted bESF clones of 30 random-integrated clones with 9.6 kb homology length were confirmed, however, nothing was out of 72 random integration clones with 13.6 kb homology length, The DT also worked more efficiently in clones transfected with the vector of 9.6 kb homology length. Our data suggests that the choice of donor cell for long culture period should be considered to obtain targeted cell clone, and the gene-targeting frequency and the DT working efficiency are dependent on the length of target homology.

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소용량 및 대용량의 ATM시스템에 적합한 스위칭 망의 구성 방안 (Construction Methods of Switching Network for a Small and a Large Capacity AMT Switching System)

  • 양충렬;김진태
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제3권4호
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    • pp.947-960
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    • 1996
  • 우수한 성능의 ATM 스위칭 시스템 개발을 위한 주요 목표가 셀 손실, 셀지연 및 처리율의 저하를 최소화하는데 있으며, 이러한 목적에 가장 적합한 ATM스위치 소자가 램덤 액세스 메모리 및 제어 논리에 의해 수행되는 공유 버퍼 메모리 스위치(shared buffer memory switch)이다. 이 스위치는 입력 포트의 수가 증가할 수록 VLSI의 제조가 어렵기 때문에 최근의 소용량 및 대용량의 ATM 스위치는 8$\times$8,600 b/s 또는 16$\times$16,150 Mb/s의 단위 스위치를 사용하여 32$\times$32(4.9 Gb/s), 150Mb/s의 스위치를 구현하는 스위치 모듈 방법을 사용하고 있다. 본 논문에서는 단위 공유 버퍼 메모리 스위치의 버퍼 공유에가 위한 전체 메모리 감소 효과를 만족하는 버퍼 용량을 해석적 으로 평가하고, 트래픽 조건에 따른 셀 손실율을 컴퓨터 시뮬레이션한 결과를 제시 하며 또한, 스위치 모듈 방법을 이용하는 소용량 및 대용량 ATM 스위치 마의 특징을 분석,이 결과를 바탕으로 현재 각국에서 연구중인 32$\times$32, 150Mb/s의 스위치 구조를 제시하며, 궁극적으로 위 주요 목표들을 만족하는 소용량 및 대용량의 ATM 스위칭 시 스템을 위한 고속 스위칭 망 구조를 제시한다.

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Compositional analysis by NIRS diode array instrumentation on forage harvesters

  • Andreashaeusler, Michael Rode;Christian, Paul
    • 한국근적외분광분석학회:학술대회논문집
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    • 한국근적외분광분석학회 2001년도 NIR-2001
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    • pp.1619-1619
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    • 2001
  • Ourwork aims to assess the content of dry matter, protein, cell wall parameters and water soluble carbohydrates in forages without having to handle samples, transport them to a laboratory, dry, grind and chemically analyze them. for this purpose, the concept of fresh forage analysis under field conditions by means of compact integrated NIRS InGaAs-diode array instruments on small plot harvesters is being evaluated for plant breeding trials. This work was performed with the world first commercial experimental forage plot harvester equipped with a NIRS module for the collection, compression, and scanning of forage samples (including automatic referencing and dark current measure ments). It was used for harvesting and analyzing a number of typical forage grass and forage legume plot trials. After NIRS measurements in the field each sample was again analyzed in the laboratory by means of a conventional grating spectrometer equipped with Si-and PbS-detectors. Conventional laboratory analysis of the samples was restricted to dry matter (DM) content by means of oven drying at 105. Routine chemometric procedures were then employed to assess the comparative accuracy and precision of the DM assessments in the spectral range between 950 and 1650nm by the NIRS diode array as well as by the conventional NIRS scanning instrument. The results of this study confirmed that the type of NIRS diode array instrument employed here functioned well even in rugged field operations. further refinements proved to be necessary for optimizing the automatic filling of the sample compartment to adjust for the wide variation in forage material under conditions of extremely low or high harvest yields. The error achieved in calibrating the apparatus for forages of typical DM content proved to be satisfactory (SECV < 1.0). Possibly as a consequence of higher sampling errors, its performance in atypical forages with elevated DM contents was less satisfactory. The error level obtained on the conventional grating NIR spectrometer was similar to that of the diode array instrument for both types of forage.

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Efficient and Low-Cost Metal Revision Techniques for Post Silicon Repair

  • Lee, Sungchul;Shin, Hyunchul
    • JSTS:Journal of Semiconductor Technology and Science
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    • 제14권3호
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    • pp.322-330
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    • 2014
  • New effective techniques to repair "small" design errors in integrated circuits are presented. As semiconductor chip complexity increases and the design period becomes tight, errors frequently remain in a fabricated chip making revisions required. Full mask revision significantly increases the cost and time-to-market. However, since many "small" errors can be repaired by modifying several connections among the circuit blocks and spare cells, errors can frequently be repaired by revising metal layers. Metal only revision takes significantly less time and involves less cost when compared to full mask revision, since mask revision costs multi-million dollars while metal revision costs tens of thousand dollars. In our research, new techniques are developed to further reduce the number of metal layers to be revised. Specifically, we partition the circuit blocks with higher error probabilities and extend the terminals of the signals crossing the partition boundaries to the preselected metal repair layers. Our partitioning and pin extension to repair layers can significantly improve the repairability by revising only the metal repair layers. Since pin extension may increase delay slightly, this method can be used for non-timing-critical parts of circuits. Experimental results by using academia and industrial circuits show that the revision of the two metal layers can repair many "small" errors at low-cost and with short revision time. On the average, when 11.64% of the spare cell area and 24.72% of the extended pins are added to the original circuits, 83.74% of the single errors (and 72.22% of the double errors) can be corrected by using two metal revision. We also suggest methods to use our repair techniques with normal commercial vender tools.

휴대폰 SMS를 위한 SVM 기반의 스팸 필터링 시스템 (A SVM-based Spam Filtering System for Short Message Service (SMS))

  • 조인휘;심혜택
    • 한국통신학회논문지
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    • 제34권9B호
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    • pp.908-913
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    • 2009
  • 휴대 전화는 이제 우리의 일상생활에서 없어서는 안 될 중요한 가전 기기로 자리 잡았다. 이러는 와중에 휴대폰에서 사용하는 문자 메시지 사용량 역시 꾸준하게 증가하여 현재는 음성 통화 이용량의 1.5배에서 2배에 이르고 있다. 문자 메시지의 사용량이 증가함에 따라 스팸 문자 메시지도 따라서 증가하였는데 기존의 모바일 기기에서의 스팸 필터링 방식은 단순 문자열 비교나 특정 번호 차단과 같은 아주 기초적인 수준으로 스팸 메시지를 필터링하고 있는 실정이다. 본 논문에서는 SVM(Support Vector Machine)과 시소러스(thesaurus) 사전을 이용하여 좀 더 강력하고 적응적인 스팸 필터링 시스템을 제안하였다. 제안한 시스템은 샘플 문자 메시지로부터 전처리 기를 이용하여 문자 메시지 속에 담겨 있는 단어를 추출 한 후, 추출된 단어를 시소러스 사전을 이용하여 해당 의미가 가지는 대표 단어로 변경하였다. 변경된 단어들에서 카이 제곱 통계량을 계산하여 그 값이 높은 단어들을 특징 단어로 선정하였고 선정된 특징 단어들을 가지고 SVM 분류기로 학습을 진행하였다. 그 후 학습된 분류기를 이용하여 테스트 문자 메시지의 스팸 여부를 분류하였으며 평균 92%의 인식률을 보였다. 제안된 시스템은 PC에서 구현되어 있으며 실험을 통하여 그 성능을 확인하였다.