• 제목/요약/키워드: infectious disease outbreaks

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다중 웹 데이터와 LSTM을 사용한 전염병 예측 (Prediction of infectious diseases using multiple web data and LSTM)

  • 김영하;김인환;장백철
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제21권5호
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    • pp.139-148
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    • 2020
  • 전염병은 오래전부터 인류를 괴롭혀 왔으며 이를 예측 하고 예방하는 것은 인류에게 있어 큰 과제였다. 이러한 이유로 지금까지도 전염병을 예측하기 위해 다양한 연구가 진행되고 있다. 초기의 연구 중 대부분은 CDC(Centers for Disease Control and Prevention)의 역학 데이터에 의존한 연구였으며, CDC에서 제공하는 데이터는 일주일에 한 번만 갱신돼 실시간 질병 발생 건수를 예측하기 어렵다는 문제점을 갖고 있었다. 하지만 최근 IT 기술의 발전으로 여러 인터넷 매체들이 등장하면서 웹 데이터를 통해 전염병의 발생을 예측하고자 하는 연구가 진행되었고 이 중 우리가 조사한 연구 중 대부분은 단일 웹 데이터를 사용하여 질병을 예측하는 연구였다. 하지만 단일 웹 데이터를 통한 질병 예측은 "COVID-19" 같이 최근에 등장한 전염병에 대해서는 많은 양의 학습 데이터를 수집하기 어려우며 이러한 모델을 통해 정확한 예측을 하기 어렵다는 단점을 가지고 있다. 이에 우리는 전염병 발생을 LSTM 모델을 통해 예측할 때 여러 개의 웹 데이터를 사용하는 모델이 단일 웹 데이터를 사용하는 모델보다 정확도가 더 높음을 실험을 통해 증명하고 전염병 예측에 적절한 모델을 제안하고자 한다. 본 실험에서는 단일 웹 데이터를 사용하는 모델과 우리가 제안하는 모델을 사용하여 "말라리아"와 "유행성이하선염"의 발생을 예측했다. 우리는 2017년 12월 31 일부터 2019년 12월 28일까지 총 104주 분량의 NEWS, SNS, 검색 쿼리 데이터를 수집했는데, 이 중 75주는 학습 데이터로, 29주는 검증 데이터로 사용됐다. 실험 결과 우리가 제안한 모델의 예측 결과와 단일 웹 데이터를 사용한 모델의 예측 결과를 비교했을 때 검증 데이터에 대해서 피어슨 상관계수가 0.94, 0.86로 가장 높았고 RMSE 또한 0.19, 0.07로 가장 낮은 오차를 보여주었다.

간호사의 개인보호장비에 대한 지식, 태도 및 인식: 메르스 대응을 중심으로 (Knowledge, Attitudes and Perceptions of Nurses on Personal Protective Equipment: Response to the Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus)

  • 김경남;이옥철
    • 기본간호학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.402-410
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    • 2016
  • Purpose: Personal protective equipment (PPE) is critical to protect healthcare workers from pandemic outbreaks. This study was designed to identify nurses' knowledge, attitude and perceptions on PPE. Methods: Data were collected from 154 nurses working at a tertiary general hospital, where positively diagnosed and suspected patients were accepted and admitted during the Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus outbreak in 2015. The PPE tool consists of 20 items for knowledge, and 5 each for attitudes and perceptions. Results: Overall, knowledge for PPE was higher than moderate (76.95/100), but there was a lack for items related to powered air purifying respirator (PAPR). For attitudes, willingness to work in pandemic outbreaks was the most positive (4.04/5.00). Goggles and PAPR were perceived as the most uncomfortable barriers to work. There was no correlation between knowledge, attitude and perceptions, despite a strong positive correlation between attitude and perceptions. PPE training was identified as a factor to improve knowledge and attitudes on PPE. Conclusion: To respond to pandemic influenza, nurses need to expand their knowledge on PPE up to Level C, and be updated through regular training. Study findings suggest that repetitive studies targeting nurses and other healthcare workers at various hospital settings are necessary.

A Study on the Construction of Moving Route Information Sharing System of COVID-19 Confirmed Cases

  • Kim, Byungkyu;You, Beom-Jong;Shim, Hyoung-Seop
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제25권12호
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    • pp.155-163
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    • 2020
  • 본 논문에서는 COVID-19 확진자의 이동경로 정보를 데이터 표준화 및 품질관리 기반으로 구축 및 관리하고 활용 할 수 있는 체계 개발을 위한 연구 수행 내용과 실제 시스템을 통해 구축한 데이터에 대한 분석 결과를 제시하였다. 해외 국가들과는 달리 우리나라는 적극적인 감염병 방역을 위해 감염병 예방법을 근거로 확진환자에 대한 빠른 역학조사와 함께 확진자의 이동경로 정보를 지방자치단체별로 적극 공개하고 있다. 하지만 국내 지자체별 제공 정보의 비표준화로 정보의 통합적인 관리와 공유 및 활용이 쉽지 않은 상황이다. 이에 본 연구에서는 COVID-19 확진자 이동경로 DB 구축 및 제공 절차를 재난안전정보 공유 플랫폼을 기반으로 정립하고 데이터 가공 지침, 표준 항목이 적용된 데이터 입력시스템, 데이터 제공 오픈 API 서비스 개발을 통해 COVID19 확진자 이동경로 정보 공유 체계를 구축하였다. 플랫폼 기반의 COVID-19 확진자 이동경로 정보 공유 체계는 다른 감염병 사례에도 적용 가능하므로 지속적으로 발생하는 감염병 재난 대응 및 예방에 활용 및 보탬이 되길 기대한다.

Clinical Features and Risk Factors of Post-COVID-19 Condition in Korea

  • Myungwon Jang;Dongkwon Choi;Jonghyuk Choi;Ho-Jang Kwon
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • 제56권5호
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    • pp.431-439
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    • 2023
  • Objectives: Numerous studies have explored the causes and spread of outbreaks, yet there is a lack of research on post-coronavirus disease 2019 condition (PCC) in Korea. The goal of this study was to identify the various types of PCC and associated factors in discharged patients and to provide directions for the ongoing health management of confirmed patients. Methods: A telephone survey was conducted among 680 coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients diagnosed between July 7, 2021 and August 26, 2021, in Dangjin, Chungnam, Korea. A descriptive analysis of characteristics, univariate analysis, and regression were performed using data from basic epidemiological surveys conducted at the time of diagnosis and post-discharge questionnaires. Results: Of the 585 patients who responded, 159 (27.2%) developed PCC. Of the 211 patients with no initial symptoms, 27 (12.8%) developed PCC, versus 132 (35.3%) of the 374 patients with initial symptoms. Among the initial symptoms, fever or chills, cough or sputum, loss of smell, and sore throat were associated with PCC. Compared to patients with less than 10 days of hospitalization, those with a hospitalization period of 21 days to 30 days (odds ratio [OR], 2.3; 95% confidence interval [CI], 1.0 to 5.2) and 31 days or more (OR, 5.8; 95% CI, 1.9 to 18.1) had a higher risk of PCC. Conclusions: More than a quarter of COVID-19 patients, including those who had no initial symptoms, experienced PCC in Korea. People with the initial symptoms of fever, chills, and respiratory symptoms and those who had prolonged hospital stays had a high risk of PCC.

Retrospective study of the medical status of 34 Formosan sika deer (Cervus nippon taiouanu) at the Taipei Zoo from 2003 to 2014

  • Kang, Chu-Lin;Yu, Jane-Fang;Lai, Hsueh;Guo, Jun-Cheng;Wang, Lih-Chiann
    • 대한수의학회지
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    • 제55권3호
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    • pp.169-173
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    • 2015
  • The Formosan sika deer (Cervus nippon taiouanus) is an endemic subspecies in Taiwan. The original wild deer has been extinct since the late 1960s. The largest captive population is located at the Taipei Zoo. Except for infectious disease outbreaks, no systemic medical research has been reported for this subspecies. This study was conducted to analyze the medical status of the captive Formosan sika deer population, including the hematological and serum chemistry characteristics. To accomplish this, medical records for 34 Formosan sika deer from January 2003 to January 2014 were acquired and analyzed. The most common illness and cause of death was trauma, followed by gastrointestinal and respiratory disease, respectively. The hematologic and serum chemical values of healthy adults were quite different from those of sika deer (Cervus nippon yesoensis). This study provides a closer medical understanding of this subspecies and the results will facilitate its management.

Multilocus Sequence Typing of Pasteurella multocida Isolates from Acute Fowl Cholera Outbreak in Layer

  • Lai, Van Dam;Kim, Jong-Seung;Mo, In-Pil
    • 한국가금학회지
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    • 제47권2호
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    • pp.115-119
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    • 2020
  • Fowl cholera is an infectious disease caused by Pasteurella multocida that contributes to high economic loss in the commercial chicken industry. Three Pasteurella multocida strains were isolated from outbreaks of acute fowl cholera in the Korean layer farms from 2018 to 2019. One strain was identified and serotyped using capsular PCR typing. This strain was also genotyped by lipopolysaccharide (LPS) PCR typing as A: L3, whereas other strains were non-typable. The multilocus sequence typing (MLST) result showed that the A: L3 strain is sequence type (ST) 134; the non-typable strains were recorded as the following new STs: ST 366 and ST 374. Using phylogenetic tree analysis based on MLST sequences, we determined that ST 366 and ST 374 are closely related to the reference strains that were previously isolated from duck and chicken in Korea, and they were highly prevalent within the Korean cluster. In conclusion, Pasteurella multocida strains were identified and isolated in this study. Furthermore, this is the first report of using MLST to determine the prevalence of fowl cholera in Korea.

<사례보고> 코로나바이러스감염증-19 유행과 로컬 거버넌스 - 2020년 대구광역시 유행에 대한 대응을 중심으로 - (<Field Action Report> Local Governance for COVID-19 Response of Daegu Metropolitan City)

  • 이경수;이중정;김건엽;김종연;황태윤;홍남수;황준현;하재영
    • 농촌의학ㆍ지역보건
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    • 제49권1호
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    • pp.13-36
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    • 2024
  • 이 사례보고의 목적은 1) 대구광역시의 코로나바이러스감염증-19 감염병 위기 대응 사례를 통해 지역사회의 감염병 대응 전략과 성과를 분석하고, 2) 거버넌스 이론과 감염병을 이용한 대응 거버넌스 프레임워크를 활용하여 이번 사례를 해석하는 것이다. 3) 향후 지역사회 감염병 발생에 대비하기 위한 전략적 모델을 제안하고자 하는 것이다. 연구자의 참여적 관찰, 대구광역시 코로나바이러스감염증-19 백서, 대구광역시의사회 코로나바이러스감염증-19 백서, 국내외 거버넌스에 관한 문헌고찰, 행정자료를 통해 대구광역시의 감염병 위기 대응 사례를 분석하였다. 연구자의 참여관찰과 문헌고찰을 통해 1) 대구광역시 감염병 위기 대응을 위한 리더십 및 지휘체계 확립, 2) 범시민대응위원회를 통한 시민참여 및 소통전략, 3) 시민 간 협력 대구시 및 민관의료기관 거버넌스, 4) 대구광역시의료협회, 메디시티대구협의회, 민간 전문가의 참여와 소통을 통한 의사결정 및 위기대응, 5) 증상모니터링 및 환자 중증도 분류 전략 6) 효과적이고 효율적인 의료 대응 역량, 7) 지역 감염병 위기대응 정보시스템 구축 및 활용을 위한 전략 및 시사점을 도출하였다. 이 연구 결과는 시민, 민간 전문가, 지역사회의료기관 등이 참여하는 지역사회의 협력적 거버넌스가 감염병 위기에 효과적으로 대응하기 위한 핵심 요소임을 실증적으로 보여주었다.

서울지역 집단식중독 환자에서 검출된 노로바이러스의 유행양상 (Prevalence of Human Noroviruses Detected from Outbreaks of Gastroenteritis Patients in Seoul, Korea)

  • 김은정;김무상;채영주;천두성
    • 미생물학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.102-108
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    • 2012
  • 2003년부터 2007년까지 서울지역 집단식중독 환자에 대하여 RT-PCR을 이용하여 노로바이러스를 검출하였으며, 총 4,685건 중 노로바이러스가 383건(8.2%)이 검출되었다. 식중독 발생 사례는 2003년부터 2007년까지 57사례가 발생하였다. 계절별 유행양상은 겨울철에 가장 많이 검출되었다. 섭취장소별 유행양상은 학교급식 중 위탁경영에 의한 발생이 32%로 나타났으며, 일반음식점에 의한 발생이 29%로 나타났다. 본 연구는 서울지역 노로바이러스성 식중독 관리를 위한 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

GIS 공간분석 기술을 이용한 국내 고병원성 조류인플루엔자 발생 고위험지역 분류 (A GIS-Based Spatial Analysis for Enhancing Classification of the Vulnerable Geographical Region of Highly Pathogenic Avian Influenza Outbreak in Korea)

  • 박선일;정원화;이광녕
    • 한국임상수의학회지
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    • 제36권1호
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    • pp.15-22
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    • 2019
  • Highly pathogenic avian influenza (HPAI) is among the top infectious disease priorities in Korea and the leading cause of economic loss in relevant poultry industry. An understanding of the spatial epidemiology of HPAI outbreak is essential in assessing and managing the risk of the infection. Though previous studies have reported the majority of outbreaks occurred clustered in what are preferred to as densely populated poultry regions, especially in southwest coast of Korea, little is known about the spatial distribution of risk areas vulnerable to HPAI occurrence based on geographic information system (GIS). The main aim of the present study was to develop a GIS-based risk index model for defining potential high-risk areas of HPAI outbreaks and to explore spatial distribution in relative risk index for each 252 Si-Gun-Gu (administrative unit) in Korea. The risk index was derived incorporating seven GIS database associated with risk factors of HPAI in a standardized five-score scale. Scale 1 and 5 for each database represent the lowest and the highest risk of HPAI respectively. Our model showed that Jeollabuk-do, Chungcheongnam-do, Jeollanam-do and Chungcheongbuk-do regions will have the highest relative risk from HPAI. Areas with risk index value over 4.0 were Naju, Jeongeup, Anseong, Cheonan, Kochang, Iksan, Kyeongju and Kimje, indicating that Korea is at risk of HPAI introduction. Management and control of HPAI becomes difficult once the virus are established in domestic poultry populations; therefore, early detection and development of nationwide monitoring system through targeted surveillance of high-risk spots are priorities for preventing the future outbreaks.

재조합 baculovirus에 의한 아프리카 돼지콜레라바이러스 p12 단백질의 발현과 진단적 적용 (Expression and diagnostic application of p12 protein of African swine fever virus by recombinant baculovirus)

  • 최강석;최정업;김용주
    • 대한수의학회지
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    • 제45권1호
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    • pp.63-70
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    • 2005
  • African swine fever (ASF) is an infectious disease of domestic and wild pigs for which there is no vaccine in the world. A proper surveillance of viral activity and a timely response to ASF outbreaks depend upon the rapid diagnosis of ASF viral infection. Internationally prescribed enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) is a fast, sensitive test routinely used in the diagnosis of the ASF. However, inactivated whole ASF virus antigen used in this test is a tedious to prepare and has a risk of outside exposure of infectious virus by laboratory accident during the preparation. An ASF virus noninfectious recombinant antigen is a safe and easily produced alternative antigen for use in diagnostic assay. We have cloned the ORF O61R gene of the ASF virus to generate a recombinant baculovirus producing the p12 protein in insect cells under control of the polyhedrin promoter as non-fusion protein. When used in an indirect ELISA, the p12 antigen showed reactivity with all known ASF positive pig sera but not with negative pig sera. Our results indicated that the p12 protein would be one of alternative antigens for diagnosis of the ASF.