• Title/Summary/Keyword: independent patterns

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한국 재배종 낙동벼에서 임성 형질전환식물체의 재분화 (Regeneration of Fertile Transgenic Rice Plane from a Korean Cultivar, Nakdongbyeo)

  • Soo In LEE;Hyun Jin CHUN;Chae Oh LIM;Jeong Dong BAHK;Moo Je CHO
    • 식물조직배양학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.175-182
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    • 1995
  • 벼는 임성 식물체의 재분화 뿐만 아니라 유전적으로 안정된 형질전환 식물체를 얻을 수 있는 가장 성공적인 단자엽 식물중 하나이다. 그러나 우리나라에서는 아직 유전적으로 안정된 임성 형질전환 벼품종에 대한 보고가 없었다. 본 연구에서 우리나라의 재배종인 낙동벼로부터 임성 형질전환식물체를 얼을 수 있음을 증명하였다. 현탁뱅양세포로부터 분리된 원형질체를 이용하여 PEG로 HPT와 GUS Plasmids늘 함께 형질전환시켰다. 다섯번의 실험을 통하여 hygromycin 저항성 캘러스는 평균 1.73%이였다. 소식물체는 항생제 저항성 캘러스로부터 재분화되었고 식물체 재분화효율은 약 27%이었다. 항생제에 저항성이 있는 캘러스에서 GUS 유전자가 발현되는 캘러스는 평균 35%였다. R0형질전환식물체는 성숙 개화하여 Rl 종자를 생성하였다. Rl 종자와 유모의 해부학적 GUS 활성을 분석하여 CaMV35S 프로모터 의해 GUS 유전자가 적절히 발현되는 것을 확인하였다. 또한 우리는 Rl세대에서 HPT유전자가 멘델 법칙에 따라 유전됨을 확인하였다

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베이지안 망을 이용한 통행발생 모형의 설계 및 구축 (Design and Implementation of Trip Generation Model Using the Bayesian Networks)

  • 김현기;이상민;김강수
    • 대한교통학회지
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    • 제22권7호
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    • pp.79-90
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    • 2004
  • 베이지안 망(Bayesian Networks)은 인공 신경망, 유전자 알고리즘, 전문가시스템 퍼지이론 등과 더불어 데이터마이닝의 중요한 기법 중의 하나로서, 베이지안 통계 이론(Bayesian Statistics Theory)을 적용하여 변수들간의 확률적인 관계를 기호화함으로써, 설명변수들과 종속변수들간의 인과관계를 파악할 수 있다. 이 연구는 2002년도 수도권 가구통행실태조사 자료의 가구, 개인 및 통행 특성(가구수입, 승용차 보유대수, 주택규모, 통행목적 등)을 반영하여, 베이지안 망을 이용한 통행발생 모형을 처음으로 설계 구축하여, 각 변수들간의 상관관계와 인과관계를 분석함으로써, 설명변수인 가구수입의 구성비가 변하였을 때 승용차 보유대수와 주택규모 구성비의 변화율(확률)을 예측한다. 그리고 승용차 보유대수와 주택규모의 구성비가 변하였을 때 통행목적 구성비의 확률을 예측한다. 또한 동행목적의 발생량이 변화였을 때, 가구 특성 구성비의 변화에 따른 발생량을 예측한다. 따라서, 이 연구는 현실에는 존재하지만 설명변수들간의 복잡한 상관성을 배제하고 설명변수와 통행목적간의 단순한 직선관계를 가정하는 기존 통행발생 모형의 한계를 극복할 수 있는 가능성을 제시한다. 또한 선택되지 않은 통행목적에 대한 정보의 부족으로 인한 통행발생 모형 구축의 어려움을 극복한다. 또한 통행목적의 변화를 실시간으로 모의실험(Simulation) 할 수 있는 방법론을 개발하여 다양한 교통정책에 확대 적용할 수 있을 것이다.

Loss of p15INK4b Expression in Colorectal Cancer is Linked to Ethnic Origin

  • Abdel-Rahman, Wael Mohamed;Nieminen, Taina Tuulikki;Shoman, Soheir;Eissa, Saad;Peltomaki, Paivi
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권5호
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    • pp.2083-2087
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    • 2014
  • Colorectal cancers remain to be a common cause of cancer-related death. Early-onset cases as well as those of various ethnic origins have aggressive clinical features, the basis of which requires further exploration. The aim of this work was to examine the expression patterns of $p15^{INK4b}$ and SMAD4 in colorectal carcinoma of different ethnic origins. Fifty-five sporadic colorectal carcinoma of Egyptian origin, 25 of which were early onset, and 54 cancers of Finnish origin were immunohistochemically stained with antibodies against $p15^{INK4b}$ and SMAD4 proteins. Data were compared to the methylation status of the $p15^{INK4b}$ gene promotor. $p15^{INK4b}$ was totally lost or deficient (lost in ${\geq}50%$ of tumor cell) in 47/55 (85%) tumors of Egyptian origin as compared to 6/50 (12%) tumors of Finnish origin (p=7e-15). In the Egyptian cases with $p15^{INK4b}$ loss and available $p15^{INK4b}$ promotor methylation status, 89% of cases which lost $p15^{INK4b}$ expression were associated with $p15^{INK4b}$ gene promotor hypermethylation. SMAD4 was lost or deficient in 25/54 (46%) tumors of Egyptian origin and 28/48 (58%) tumors of Finnish origin. 22/54 (41%) Egyptian tumors showed combined loss/deficiency of both $p15^{INK4b}$ and SMAD4, while $p15^{INK4b}$ was selectively lost/deficient with positive SMAD4 expression in 24/54 (44%) tumors. Loss of $p15^{INK4b}$ was associated with older age at presentation (>50 years) in the Egyptian tumors (p=0.04). These data show for the first time that $p15^{INK4b}$ loss of expression marks a subset of colorectal cancers and ethnic origin may play a role in this selection. In a substantial number of cases, the loss was independent of SMAD4 but rather associated with $p15^{INK4b}$ gene promotor hypermethylation and old age which could be related to different environmental exposures.

Integrating market chain assessments with zoonoses risk analysis in two cross-border pig value chains in Lao PDR

  • Okello, Anna L;Tiemann, Tassilo T;Inthavong, Phouth;Khamlome, Boualam;Phengvilaysouk, Ammaly;Keonouchanh, Soukanh;Keokhamphet, Chattouphone;Somoulay, Virasack;Blaszak, Kate;Blacksell, Stuart D;Okello, Walter O;Allen, John
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권11호
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    • pp.1651-1659
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    • 2017
  • Objective: Lao PDR's recent accession to the World Trade Organization necessitates a greater understanding of the patterns and risk of livestock production in order to better align national policy with the Agreement on the Application of Sanitary and Phytosanitary Measures. This eco-health study was conducted to improve understanding of the interrelations between market chains and zoonotic infection risks at two strategic cross border points between Lao PDR, Thailand and Viet Nam. Methods: Information gained from smallholder farmer/trader interviews was integrated with serological surveys for pig-associated zoonoses-including hepatitis E virus (HEV), Taenia solium (T. solium) and trichinella-to identify potential linkages between disease risk and pig production and slaughter in low input systems common across the country. Results: Trichinella and HEV exposure was high in both humans and pigs in both study areas, significantly associated with pig slaughter and the subsequent consumption and handling of raw pork products. T. solium demonstrated a strong geographical and ethnic association with the northern study area bordering Vietnam. With the right knowledge and accessible, affordable inputs, the majority of smallholder farmers indicated a willingness to invest more in pig production, which could simultaneously improve livelihoods and decrease exposure to HEV, Trichinella, and T. solium through increased access to formal markets and an improved slaughter processes. Conclusion: The linkages identified when assessing disease risk in the context of potential economic and cultural drivers of transmission highlight the importance of a systems-based approach for the detection and control of zoonotic disease, and contributes to an improved understanding of the Lao PDR livestock sector.

하천환경의 정량적 평가 및 활용에 관한 연구 (A Study on the Quantified Evaluation and Application of Stream Environment)

  • 김종오;김옥선;김선혜
    • 한국습지학회지
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    • 제6권3호
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    • pp.83-93
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    • 2004
  • 본 연구의 목적은 하천환경의 정량적 평가기법을 통해 하천 관리 전략의 틀을 개발하는데 있다. 연구 대상지는 경남 진주시를 관통하여 남강으로 유입되는 6개의 지방 하천이다. 하천환경 평가는 세 가지의 현장 조사를 통해 수행되었다. 첫째, 대상 하천의 제방선으로부터 좌우 50m, 길이 500m 간격을 단위구간으로 하여 20개의 평가항목에 대해서 하천 자연도를 조사하여 5등급으로 평가하였다. 둘째, 수질 및 유량을 8회 조사하여 5등급으로 평가하였다. 셋째, 해당 하천 유역의 토지이용도를 주거지 비율을 따라 5등급으로 평가하였다. 이상의 하천환경의 세 가지 부문인자인 자연도, 수질 그리고 토지이용도를 통합하여 다시 5등급으로 분류하여 최종적인 하천 환경을 평가하였으며 그 결과에 따라 각 하천별 관리 전략을 제시하였다. 하천별 적용 결과를 살펴보면, 판문천과 가좌천은 적극적인 환경복원이 필요한 IV등급으로 평가되었고, 나불천과 용아천은 부분적 복원이 필요한 II등급으로 평가되었으며, 영천강과 독산천은 현 상태 유지가 바람직한 I등급으로 평가되었다. 이상의 대상 하천별 환경 평가는 향후 하천관리 계획수립이나 하천 복원을 위해 중요한 참고자료가 될 것으로 기대된다.

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16S rDNA-RFLP에 의한 Spirastrella abata와 Spirastrella panis 해면에 서식하는 배양가능한 공생세균 군집의 비교 (Comparative Analysis of the Community of Culturable Bacteria Associated with Sponges, Spirastrella abata and Spirastrella panis by 16S rDNA-RFLP)

  • 조현희;박진숙
    • 미생물학회지
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    • 제45권2호
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    • pp.155-162
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    • 2009
  • 계통적으로 근연하며 지리적 분포가 유사한 두 종의 Spirastrella 속의 해양 해면, S. panis와 S. abata의 배양 가능한 공생세균 군집구조를 16S rDNA-RFLP 방법에 의해 분석하였다. 공생세균의 배양은 해면추출물 3%를 포함하는 MA 배지를 사용하였다. 증폭된 16S rDNA의 RFLP (restriction fragment length polymorphism) 분석을 위한 제한효소로 HaeIII와 MspI을 이용하였으며, 그 결과 24개의 RFLP type을 구별할 수 있었다. 각 패턴별로 1~5개의 분리균주를 선별하여 부분 염기서열 분석 결과, 알려진 세균 종과 98.4% 이상의 유사도를 나타내었으며 2종의 Spirastrella 해면으로부터 분리된 세균들은 모두 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria 4개의 강(class)에 포함되었다. Alphaproteobacteria는 S. abata에서 39.3%, S. panis에서 47.6%가 관찰되어 두 해면에서 우점하는 세균 군집이었다. Gammaproteobacteria의 경우 S. abata에서 38.5%로 관찰된 반면 S. panis에서 1.6%의 아주 적은 비율로 관찰되었다. 또한 Bacillus (phylum Firmicutes) 종은 S. abata에서 9.7%를 나타낸 반면, S. panis에서는 44.3%의 분포를 나타내었다. Planococcus maritimus (8.1%, phylum Firmicutes)와 Psychrobacter nivimaris (28.9%, phylum Gammaproteobacteria)는 S. abata에서만 관찰되어 이들은 S. abata에 특이적인 세균 종임을 알 수 있었다. 같은 장소에 서식하는 계통적으로 근연한 두 종의 해면에서 공생세균의 군집 구조는 차이가 큰 것으로 나타났다.

패널 데이터모형을 적용한 국내일반은행 연체율 결정요인 추정에 관한 연구 (Estimating the Determinants for Rate of Arrearage in Domestic Bank: A Panel Data Model Approach)

  • 김희철;박형근
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제11권1호
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    • pp.272-277
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    • 2010
  • 국내일반은행 연체율은 그룹(대출형태)별로 다양한 원인에 의해서 연체율 결정이 이루어지고 있어 복잡성을 띠고 있다. 본 연구에서는 복잡성을 띠고 있는 연체율의 제 변인들을 파악하기 위해 패널 데이터 모형을 이용한 연구모형을 설정하고 이를 통해 연체율에 결정적으로 영향을 미치는 제 변인에 대하여 조사, 분석, 검증한다. 본 연구는 3 그룹(기업대출, 가계대출, 신용카드 대출)을 분석대상으로 하였다. 분석기간은 2005년 1월부터 2009년 6월 까지 자료를 이용하였고. 국내은행 연체율을 종속변수로 설정하고 소비자물가지수, 종합주가지수, 환율, 동행(경기)종합지수, 국민주택채권, 고용률을 독립 변수로 투입하였다. 국내일반은행 연체율 요인을 추정한 결과 소비자물가 지수는 정(+)의 영향을 미치는 유의한 변수로 나타나고 동행(경기)종합지수와 종합주가지수는 음(-)의 영향을 나타내는 유의적인 변수이지만 환율, 국민주택채권 그리고 고용률은 각각 음(-)의 영향을 나타내는 비유의적인 변수로서 연체율에 큰 영향을 주지는 않은 것으로 나타났다.

출산 후 경과한 날에 따른 한국인 산모의 모유 단백체 분석 (Proteomic analysis of Korean mothers' human milk at different lactation stages; postpartum 1, 3, and 6 weeks)

  • 박종문;이후근;송승현;한원호;김미정;이주현;강남미
    • 분석과학
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    • 제30권6호
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    • pp.348-354
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    • 2017
  • 이 연구는 출산 후 1, 3, 6주가 경과한 산모에서 얻은 모유의 단백체 발현 양상과 과 발현 단백질을 검출하는 것을 목적으로 하였다. 샷 건 정량 단백체 분석법을 이용하여 모유 중의 단백질을 동정하였고, 각 수유단계 간에 정량적 비교를 하였다. 각 주의 모유 샘플은 두 명의 산모로부터 얻어진 모유를 혼합하였고, 각 샘플 마다 3회 반복 실험을 하였다. Casein은 모유 내에 가장 많이 존재하는 단백질로서 실험의 정확성을 위하여 제거하였고, 트립신을 이용한 절편 화로 모유 단백질들을 펩타이드로 변환하였다. 처리된 펩타이드들은 역상 C18 미세관 크로마토그래피 및 이온-트랩 질량분석기를 이용하여 분석하였으며, Spectra Counting으로 단백질의 정량적 비교를 하였다. 각 샘플 당, 80-109 개의 단백질을 중복 제거한 후 동정하였다. 당화 단백질, metabolic enzyme, 및 lactoferrin, Carboxylic ester hydrolase, Clusterin을 포함하는 chaperon 효소들이 주로 검출되었다. 각 반복실험에서 재현성 있게 검출되는 63개의 단백질에 대한 정량적 비교분석 결과 25개의 단백질이 통계적으로 유의하게 수유단계에 따라 변화하는 것을 확인할 수 있었고, 특히 Ig lambda-7 chain C region과 Tenascin은 시간에 따라 현저하게 감소하였다. 향후 이와 같은 수유 단계에 따른 모유 내 단백의 변화가 생리적으로 가지는 의미에 관하여 추가적인 연구가 필요하다 생각된다.

제주브로일러 산업의 유사경제 통합에 관한 사례연구 (A Case Study on Quasi-Economic Integration in the Cheju Broiler Industry.)

  • 박영인
    • 한국가금학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.53-60
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    • 1988
  • The purpose of this presentation is to review the situation of the Cheju broiler industry peculiarized with the integrated production and marketing system to some degree, which is not prevailed in the whole broiler industry in Korea, so as to study the case of the Cheju industry from the viewpoint of an economic integration. The economic integration in the broiler industry is grouped into three patterns: non-integration, quasi-integration and complete integration, which generally exist under the different type of market competition. The quasi-integration tends to be formed at all phases where the complete integration is not fully implemented, but the non-integration has begun to change its nature into partially integrated structure. The Cheju broiler industry is characterized by the geographical location of isolated market so that factor supplies and broiler products are marketed in the different conditions from those of mainland Korea, somewhat in an oligopolistic pattern. It was since early 1980's that the industry successfully had three dressing plants merged into one by virtue of entire growers ownership, which opened an era of an integrated industry centered on the function of dressing birds. The case of Cheju broiler industry today is to be referred to as a typical quasi-integration which is coordinated the function between growing and dressing birds directly and extended the functional cooperation to distribution of products indirectly, while factor supplies are traded independently. As a result of a quasi-integration, the growers are able to receive a fixed price set by the dressing plant of growers that has the power to adjust the supply of and demand for broilers produced and consumed in the Island. There are some problems, however, in the integration of the Cheju broiler industry, stemming mainly from the process of the structure change, : 1) the difficulty of controlling the production of broilers, 2) continuing pressure on the integration by non-integrated sectors, 3) the challenge on the stabilized broiler market from the mainland, 4) limited effectiveness of consumer education activities, and 5) lack of leadership for the industry development through integration. It is projected that the partially integrated Cheju broiler industry will be continually developed toward the direction of a complete integration in due course, as the currently independent supply sectors are to be backward integrated. The case of the Cheju broiler integration, therefore, could be used as a reference for making the whole broiler industry in Korea develop toward the integrated structure in the future.

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고령자 보행자립도(능력) 측정모형 개발 (Development of Elderly Walking Independence Index Model)

  • 노창균;박범진;문병섭
    • 대한교통학회지
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    • 제33권4호
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    • pp.348-356
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    • 2015
  • 앞으로 10년 뒤인 2026년 우리나라는 초고령화 사회(super aged society)로 진입할 것으로 예상되며, 이로 인해 사회 전반적인 모든 분야에서 고령자 분석 및 대책 마련에 심혈을 기울이고 있다. 교통 분야에서도 고령자의 보행 교통사고가 급격히 증가하고 있는 점을 고려하여 이를 줄이기 위한 연구개발과 정책적 보완을 위한 노력을 기울이고 있다. 그러나 고령자의 보행행태, 보행능력, 보행영향 요인 등의 기초적인 연구가 전무하여 어려움을 겪고 있다. 이에 본 연구에서는 기존 논문 검토를 통해 보행능력(보행속도)을 일반, 건강, 운동요인 등 3개 분야로 구분하였다. 평균나이 72.6세의 고령자 52명을 대상으로 면접, 국민체력 100, SPBB, Cybex 등의 다양한 방법과 측정도구를 종합하여 3개 분야 총 12개의 세부 요인에 대한 측정을 시행하였다. 그 결과 일반요인인 연령, 체격 등은 보행속도에 미치는 영향이 적었으며, 건강요인 중에는 하지 신근, 운동요인 중에는 평형성, 협응성, SPPB가 가장 보행속도에 가장 많은 영향이 있음을 도출하였다. 이를 활용하여 고령자의 보행능력을 측정하는 보행자립도 모형을 개발하였다. 개발된 모형은 고령자의 보행능력의 진단하여 교통 분야 고령자 보행 연구의 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 기대한다.