• 제목/요약/키워드: increasing subsequences

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Mining Regular Expression Rules based on q-grams

  • Lee, Inbok
    • 스마트미디어저널
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    • 제8권3호
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    • pp.17-22
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    • 2019
  • Signature-based intrusion systems use intrusion detection rules for detecting intrusion. However, writing intrusion detection rules is difficult and requires considerable knowledge of various fields. Attackers may modify previous attempts to escape intrusion detection rules. In this paper, we deal with the problem of detecting modified attacks based on previous intrusion detection rules. We show a simple method of reporting approximate occurrences of at least one of the network intrusion detection rules, based on q-grams and the longest increasing subsequences. Experimental results showed that our approach could detect modified attacks, modeled with edit operations.

극대 증가 부분서열을 찾는 선형 알고리즘 (Linear-time algorithms for computing a maximal increasing subsequence)

  • 나중채
    • 스마트미디어저널
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    • 제12권6호
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    • pp.9-14
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    • 2023
  • 최장 증가 부분서열(longest increasing subsequence)은 컴퓨터 과학 분야에서 오랫동안 연구되어온 주요 문제이다. 본 논문에서는 최장 조건을 극대로 완화한 극대 증가 부분서열(maximal increasing subsequence) 문제를 고려한다. 본 논문에서는 두 가지 버전의 증가 개념(단조증가, 순증가)에 대해, 알파벳 Σ 에 대한 서열의 극대 증가 부분서열을 구하는 선형시간 알고리즘을 제안한다. 극대 단조증가 부분서열을 구하는 알고리즘은 O(1) 공간을 사용하고, 극대 순증가 부분서열을 구하는 알고리즘은 O(|Σ|) 공간을 사용한다.

단백질 구조 예측을 위한 서열 연관 규칙 탐사 (Discovering Sequence Association Rules for Protein Structure Prediction)

  • 김정자;이도헌;백윤주
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제8D권5호
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    • pp.553-560
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    • 2001
  • 바이오정보학(bioinformatic)은 생물학 분야 특히 분자 수준의 유전체 연구에서 발생하는 데이터를 저장, 관리, 분석하여 실험 프로젝트를 지원함은 물론, 기능 예측 및 조절에 대한 실험 설계를 가능하게 하는 제반 컴퓨터 기술을 의미한다. 유전체 연구의 다양한 접근 방식 중 단백체학(proteomics)는 유전체의 최종 산물인 단백질을 직접적으로 다룬다는 측면에서 그 효용성에 대해 많은 기대를 모으고 있다. 본 논문에서는 단백질의 기능을 결정하는 가장 중요한 요소 중 하나인 단백질의 구조를 예측하기 위한 데이터 마이닝 기법을 제안한다. 단백질의 일차 구조인 아미노산 서열에 타나나는 부서열간의 연관성이 해당 단백질의 이차 혹은 삼차 구조를 결정하는 중요한 단서임을 설명하고, 아미노산 부서열간의 연관성을 표현하기 위한 모델로서 서열 연관 규직을 정의한다. 서열 연관 규칙의 유용성을 평가하기 위한 지지도와 신뢰도를 새롭게 정의하고, 주어진 단백질 집단으로부터 유용한 서열 연관 규칙을 발견하기 위한 기법을 제안한다. 아울러, SWISS-PROT 단백질 데이터베이스로부터 입수한 단백질 서열 데이터를 이용하여 제안한 기법의 성능을 평가한다.

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