• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제16권1호
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• pp.47-51
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• 2012

Genomic DNAs (gDNAs) were isolated from the hard clam ($Meretrix$ $lusoria$, Roding, 1798) populations of Gunsan located in the Yellow Sea of the Korean peninsula. Genetic distances among different individuals of the LSCP (light shell color population) population of the hard clam (lane 1-11), GSCP (grey shell color population) population of the hard clam (lane 12-22) and DSCP (dark shell color population) population of the hard clam (lane 23-33), respectively, were generated using Systat version 10 according to the bandsharing values and similarity matrix. The dendrogram, generated by seven reliable oligonucleotides primers, indicates 3 genetic clusters. LSCP population could be evidently discriminated with the other two populations among three populations. The longest genetic distance (0.801) was found to exist between individuals in the two populations, between individuals' no. 33 of the DSCP population and no. 06 of the LSCP population. The higher fragment sizes (>2,000 bp) are much more observed in the GSCP population. Three hard clam populations can be clearly distinguished, especially, by their morphological characters and PCR-based approach.

• Journal of Species Research
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• 제7권4호
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• pp.354-362
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• 2018

Population genetic assessment is essential for the conservation and management of endangered and rare plants. Neofinetia falcata is endangered epiphyte orchid and protected by law in Korea. In Korea, this species is only found on islands in the South Sea of Korea (including Jeju-do) and the southern coast of the Korean Peninsula. We developed nine microsatellite makers to assess the genetic diversity and population genetic structure of three populations of N. falcata. The genetic diversity at the species level was low, which can be attributed to inbreeding or fragmentation into small, isolated populations. A recent bottleneck was detected in one population, likely due to overcollection. N. falcata exhibited moderated levels of differentiation among populations, with the three populations were divided into two clusters based on genetic structure. The genetic diversity and structure of N. falcata are affected by restricted gene flow by pollen or seeds due to isolation and geographic distance. Strategies for in situ and ex situ conservation of this species are been proposed based on the results of our study.

• 전기학회논문지
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• 제60권2호
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• pp.245-251
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• 2011

Quantities of data in the DMS (Distribution management system) or SCADA (Supervisory control and data acquisition) system is enormously large as illustrated by the usage of term flooding of data. This enormous quantity of data is transmitted to the status data or event data of the on-site apparatus in real-time. In addition, if GIS (Geographic information system) and AMR (Automatic meter reading), etc are integrated, the quantity of data to be processed in real-time increases unimaginably. Increase in the quantity of data due to addition of system or increase in the on-site facilities cannot be handled through the currently used Single Thread format of data processing technology. However, if Multi Thread technology that utilizes LF-POOL (Leader Follower -POOL) is applied in processing large quantity of data, large quantity of data can be processed in short period of time and the load on the server can be minimized. In this Study, the actual materialization and functions of LF POOL technology are examined.

• 한국산업정보학회논문지
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• 제18권3호
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• pp.35-46
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• 2013

국내 전력 수요량 예측을 위한 정확한 분석 모델을 개발하기 위하여 고차원 데이터 군집 분석에 적합한 차원 축소 개념의 부분공간 군집 기법과 SMO 분류 기법을 결합한 전력 수요 패턴 예측 방법을 제안하였다. 전력 수요 패턴 예측은 무선부하감시 데이터 뿐 아니라 소지역 단위의 센서스 정보를 통합하여 시간대별 전력 부하 패턴 분석과 인구통계학 및 지리학적 특성 분석이 가능하다. 서울지역 대상의 센서스 정보 및 전력 부하를 이용한 소지역 전력 수요 패턴 예측 결과 총 18개의 특성 군집을 구성하였으며, 전력 수요 패턴 예측 정확도는 약 85%를 보였다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제23권3호
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• pp.297-304
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• 2019

The higher fragment sizes (>2,100 bp) are not observed in the two C. spp. populations. The six oligonucleotides primers OPA-11, OPB-09, OPB-14, OPB-20, OPC-14, and OPC-18 were used to generate the unique shared loci to each tonguesole population and shared loci by the two tonguesole populations. The hierarchical polar dendrogram indicates two main clusters: Gunsan (GUNSAN 01-GUNSAN 11) and the Atlantic (ATLANTIC 12-ATLANTIC 22) from two geographic populations of tonguesoles. The shortest genetic distance displaying significant molecular difference was between individuals' GUNSAN no. 02-GUNSAN no. 01 (genetic distance=0.038). In the long run, individual no. 02 of the ATLANTIC tonguesole was most distantly related to GUNSAN no. 06 (genetic distance=0.958). These results demonstrate that the Gunsan tonguesole population is genetically different from the Atlantic tonguesole population. The potential of PCR analysis to identify diagnostic markers for the identification of two tonguesole populations has been demonstrated. As a rule, using various oligonucleotides primers, this PCR method has been applied to identify polymorphic/specific markers particular to species and geographical population, as well as genetic diversity/polymorphism in diverse species of organisms.

• Mycobiology
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• 제49권1호
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• pp.24-45
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• 2021

The occurrence of Austroboletus subflavidus and Fistulinella gloeocarpa is documented from the Dominican Republic. The latter species is reported for the first time outside its original locality in Martinique, extending the geographic range for this uncommon pinkish-spored bolete. A detailed morphological description is provided for each species and accompanied by color pictures of fresh basidiomes in habitat and line drawings of the main anatomical features. Both species represent independent lineages within their respective genera based on phylogenetic inference. In addition, A. subflavidus clusters in a sister lineage to the core Austroboletus clade (Austroboletus clade I) here named as Austroboletus clade II. In order to confirm the accuracy of species identification, their identity and relationships were subjected to multilocus phylogenetic analyses of three gene markers (ITS, nrLSU, RPB2) including genetic material already available in public databases. Austroboletus subflavidus is a widely distributed species in North and Central America, whereas F. gloeocarpa is apparently highly localized and seems to appear sparingly in the Dominican Republic, Martinque, and southern Florida. Comparisons with morphologically similar and molecularly inferred allied species are also presented and discussed.

• 한국지리정보학회지
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• 제20권4호
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• pp.1-14
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• 2017

본 연구에서는 퇴적암 유래 농경지 토양의 카테나의 정량적, 객관적인 해석을 위해 세부정밀토양도(축적 1:5,000)의 속성자료 중 토양통자료를 이용하여 지리정보시스템(ArcGIS, ESRI, US)과 R 통계분석프로그램을 이용하여 분석하였다. 분석에 사용된 토양통의 인접한 토양통 길이 산정을 위해 GIS 프로그램의 Buffer 기능을 이용하여 각 토양통에 폭 1m의 buffer을 형성하고 인접한 토양통들의 buffer 면적과 이를 이용하여 길이를 산출하였다. R 통계분석프로그램을 이용하여 각각의 토양통별로 인접한 토양통의 면적을 비율로 환산하고, 그 값을 기준으로 입체군집기준(Cubic Clustering Criterion)을 이용해 군집의 개수를 선정하였다. 군집의 수를 선정 후 인접 토양통의 비율을 이용해 군집분석을 수행하여 퇴적암 유래 농경지 토양들의 유사성 분석을 시도하였다. 군집분석 결과 퇴적암 지대별로 암석의 종류에 따라 입경분포가 다르게 나타나 사양질 토양은 주로 사암 모재, 식양질 토양은 혈암 모재, 미사식양질 내지 식질의 토양은 석회암 모재로 구별되어, 석회암 < 혈암 < 사암의 순이었다. 한편, 혈암유래 농경지 토양은 적색혈암과 회색혈암으로 구분되고, 적색혈암은 사양질과 식양질, 회색혈암은 식양질과 미사식양질이 주로 분포하는 것으로 나타났다. 토양연접군에 대한 정량적인 해석을 의미하며, 이러한 분석방법들을 통한 해석으로 토양통들의 입경분포, 특히 점토함량에 따른 연관성 분석을 할 수 있었고, 분포위치와 모암에 대한 연관성에 대해서는 보다 심도있는 연구가 필요할 것으로 보여진다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권1호
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• pp.455-460
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• 2014

Background: The purpose of the present study was to determine geographic clustering of breast cancer incidence in Kanagawa Prefecture, using cancer registry data. The study also aimed at examining the association between socio-economic factors and any identified cluster. Materials and Methods: Incidence data were collected for women who were first diagnosed with breast cancer during the period from January to December 2006 in Kanagawa. The data consisted of 2,326 incidence cases extracted from the total of 34,323 Kanagawa Cancer Registration data issued in 2011. To adjust for differences in age distribution, the standardized mortality ratio (SMR) and the standardized incidence ratio (SIR) of breast cancer were calculated for each of 56 municipalities (e.g., city, special ward, town, and village) in Kanagawa by an indirect method using Kanagawa female population data. Spatial scan statistics were used to detect any area of elevated risk as a cluster for breast cancer deaths and/or incidences. The Student t-test was performed to examine differences in socio-economic variables, viz, persons per household, total fertility rate, age at first marriage for women, and marriage rate, between cluster and other regions. Results: There was a statistically significant cluster of breast cancer incidence (p=0.001) composed of 11 municipalities in southeastern area of Kanagawa Prefecture, whose SIR was 35 percent higher than that of the remainder of Kanagawa Prefecture. In this cluster, average value of age at first-marriage for women was significantly higher than in the rest of Kanagawa (p=0.017). No statistically significant clusters of breast cancer deaths were detected (p=0.53). Conclusions: There was a statistically significant cluster of high breast cancer incidence in southeastern area of Kanagawa Prefecture. It was suggested that the cluster region was related to the tendency to marry later. This study methodology will be helpful in the analysis of geographical disparities in cancer deaths and incidence.

• 한국지리정보학회지
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• 제10권4호
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• pp.75-86
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• 2007

부산시의 도심(축)에 속하는 15개 동을 대상으로 2000년, 2005년 두 개 연도를 LQ지수와 군집분석을 통해 도심의 공간기능에 대하여 연구하였다. 2000년도의 LQ지수를 분석한 결과 2차산업은 재래시장과 대규모 상권이 형성된 지역에 특화되어 나타나고 있으며, 3차산업은 금융권이 집중되어 있는 지역에서 특화되어 나타나고 있다. 2005년도의 LQ지수는 2000년도의 LQ지수와 거의 변화가 없었으나, 3차산업에 속하는 도심의 중심업무기능이 구도심에서 급격히 쇠퇴하고 신도심으로 대변되는 서면지역에서 높게 나타나 특화되고 있었다. 이는 과거 구도심의 중심업무기능이 신도심으로 이동함에 따라, 구도심의 도심의 성격을 지닌 주요 기능이 쇠퇴하고 있음을 나타낸다. 그 다음으로 LQ지수를 이용하여 군집분석을 실시한 결과, 3개 군집으로 분류 할 수 있었다. 먼저 1군집은 도심 쇠퇴현상이 나타나는 구도심지역이고, 2군집은 주거기능이 강하게 나타나는 지역이며, 3군집은 현재, 도심의 공간기능이 매우 활발히 일어나고 있는 지역이다. 이에 본 연구에서는 다음과 같은 결과가 도출되었다. 첫째, 구도심의 쇠퇴를 억제할 수 있는 다양한 도심재생방안 수립과 신도심에 대한 종합적이고 체계적인 계획의 수립이 필요할 것이다. 둘째, 산업별 특화도에 따라서 도심 공간기능이 배치되므로 이에 지역에 적합한 산업의 도입과 함께 발전을 할 수 있는 기반의 조성이 필요할 것이다.

• 한국산림과학회지
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• 제102권1호
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• pp.122-128
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• 2013

우리나라에 분포하는 가침박달 9개 집단의 유전다양성과 유전구조를 ISSR 표지자를 이용하여 분석하였다. 선발된 6개 ISSR primer에서 다형성 band는 35개로 primer당 평균 5.8개(S.D.=2.32), 집단별 다형적 유전자좌의 비율은 평균 78.7%로 나타났다. AMOVA에서 전체 유전변이의 27.8%는 집단간 차이에 기인하며, 72.2%는 집단내 개체 간 차이로 설명할 수 있었다. 베이즈 방법에 따른 유전분화는 ${\theta}^{11}$와 $G_{ST}$가 각각 0.249와 0.227로 추정되었으며, 전체 집단에 대한 근친교배율은 0.412로 계산되었다. 집단간의 지리적 거리와 유전적 거리에 대한 상관성 분석에서 지리적 거리가 멀수록 유전적으로 상이한 것으로 나타났다. 베이즈 군집분석에서 가침박달 집단은 유전변이 분포에 따라서 1) 대구 지역의 2집단 및 안동, 청송, 예천 집단이 하나의 구역으로, 그리고 2) 단양, 영월 집단과 3) 임실, 청주 집단이 각각 하나의 구역으로 묶여서 총 3개 구역으로 나눌 수 있었다. 구역의 유전변이는 백두대간과 정맥의 산줄기를 경계로 분포하는 것으로 생각되며, AMOVA에서 전체 유전변이량의 10.0%는 구역간, 19.7%는 집단간, 나머지 70.3%는 집단내 개체간 차이로 설명되었다. 아울러 가침박달의 현지내 유전자원보존을 위한 유전다양성 평가와 유전구조 분석결과의 적용에 대하여 살펴보았다.