• Molecules and Cells
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• 제26권3호
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• pp.265-269
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• 2008

Calumenin, a multiple EF-hand $Ca^{2+}$ binding protein is located in the SR of mammalian heart, but the functional role of the protein in the heart is unknown. In the present study, an adenovirus gene transfer system was employed for neonatal rat heart to examine the effects of calumenin over-expression (Calu-OE) on $Ca^{2+}$ transients. Calu-OE (8 folds) did not alter the expression levels of DHPR, RyR2, NCX, SERCA2, CSQ and PLN. However, Calu-OE affected several parameters of $Ca^{2+}$ transients. Among them, prolongation of time to 50% baseline ($T_{50}$) was the most outstanding change in electrically-evoked $Ca^{2+}$ transients. The higher $T_{50}$ was due to an inhibition of SERCA2-mediated $Ca^{2+}$ uptake into SR, as tested by oxalate-supported $Ca^{2+}$ uptake. Furthermore, co-IP study showed a direct interaction between calumenin and SERCA2. Taken together, calumenin in the cardiac SR may play an important role in the regulation of $Ca^{2+}$ uptake during the EC coupling process.

• Molecules and Cells
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• 제42권10호
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• pp.721-728
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• 2019

Non-structural protein 1 (NS1) of influenza virus has been shown to inhibit the innate immune response by blocking the induction of interferon (IFN). In this study, we isolated two single-stranded RNA aptamers specific to NS1 with $K_d$ values of $1.62{\pm}0.30nM$ and $1.97{\pm}0.27nM$, respectively, using a systematic evolution of ligand by exponential enrichment (SELEX) procedure. The selected aptamers were able to inhibit the interaction of NS1 with tripartite motif-containing protein 25 (TRIM25), and suppression of NS1 enabled retinoic acid inducible gene I (RIG-I) to be ubiquitinated regularly by TRIM25. Additional luciferase reporter assay and quantitative real-time PCR (RT-PCR) experiments demonstrated that suppression of NS1 by the selected aptamers induced IFN production. It is noted that viral replication was also inhibited through IFN induction in the presence of the selected aptamers. These results suggest that the isolated aptamers are strongly expected to be new therapeutic agents against influenza infection.

• BMB Reports
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• 제54권12호
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• pp.614-619
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• 2021

Hepatitis B virus (HBV) infection is a major cause of hepatocellular carcinoma (HCC), which is a highly aggressive cancer. HBV X protein (HBx), one of four HBV gene products, plays pivotal roles in the development and metastasis of HCC. It has been reported that HBx induces liver cancer cell migration and reorganizes actin cytoskeleton, however the molecular basis for actin cytoskeleton reorganization remains obscure. In this study, we for the first time report that HBx promotes actin polymerization and liver cancer cell migration by regulating calcium modulated protein, calmodulin (CaM). HBx physically interacts with CaM to control the level of phosphorylated cofilin, an actin depolymerizing factor. Mechanistically, HBx interacts with CaM, liberates Hsp90 from its inhibitory partner CaM, and increases the activity of Hsp90, thus activating LIMK1/cofilin pathway. Interestingly, the interaction between HBx and CaM is calcium-dependent and requires the CaM binding motif on HBx. These results indicate that HBx modulates CaM which plays a regulatory role in Hsp90/LIMK1/cofilin pathway of actin reorganization, suggesting a new mechanism of HBV-induced HCC metastasis specifically derived by HBx.

• 공업화학
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• 제34권1호
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• pp.1-8
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• 2023

폴리에틸렌이민(polyethylenimine, PEI)은 양이온성 고분자로서 핵산(nucleic acid)와 같이 음전하를 띄는 생체 물질과 강한 정전기적 상호작용으로 결합할 수 있다. 이러한 특성을 바탕으로 PEI는 효율적인 약물전달체로 오랜 기간 활용되었다. 하지만 PEI의 강한 양이온성은 체내에서 음이온을 띄는 생체 물질과 비특이적으로 상호작용하여 세포독성을 띄는 문제점을 가지고 있다. 그 동안 많은 연구자들은 PEI의 단점을 극복하기 위하여 다양한 종류의 생체 적합 PEI 기반 물질을 개발하였다. 본 리뷰에서는 기능성 PEI의 개발과 이를 활용한 생의학적 연구 동향에 대하여 소개하고자 한다.

• 치위생과학회지
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• 제15권2호
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• pp.209-219
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• 2015

치주질환과 관련된 세균인 S. gordonii, F. nucleatum 및 P. gingivalis의 상호작용이 군집 형성에 미치는 영향을 알아보고자 trypticase soy hemin menadione broth에 단독 및 열처리한 사균과 혼합 분주하여 혐기성 균배양조를 통해 $37^{\circ}C$ $CO_2$ 배양기에서 anearobic gas pack 하에 7일간 배양하였다. 군집 형성 정도를 확인하기 위해 흡광도를 측정하였으며, 군집 구조 및 형태를 확인하기 위해 주사전자현미경으로 관찰하였다. P. gingivalis의 병원성에 미치는 영향을 확인하기 위해 real-time RT-PCR를 통해 gingipain인 HRgpA를 생성하는 rgpA 유전자에 대한 발현 분석을 시행하여 다음과 같은 결론을 얻었다. S. gordonii와 P. gingivalis의 군집 형성은 다른 사균들에 의해 증가하였다. F. nucleatum의 경우 P. gingivalis 사균에 의해 증가하는 양상을 보였으나 S. gordonii 사균에 의해서는 군집 형성이 감소되었다. 따라서 본 실험에 사용된 균주는 군집 형성 시 상호작용 인자뿐 아니라 세균 입자 그 자체 등을 통해서도 서로 영향을 주는 것으로 생각된다.

• 한국환경성돌연변이발암원학회지
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• 제26권4호
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• pp.125-132
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• 2006

Previous studies showed that epigallocatechin gallate(EGCG) have substantial effects of suppressing the N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine(MNNG)-initiated cell transformation process on the bases of foci formation frequency and loss of anchorage dependency. In this study we tried to clarify the molecular mechanism of suppressing the cell transformation process. Mouse cell line balb/c 3T3 A31-1-1 was exposed 2 days to MNNG followed by 15 days 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate(TPA) treatment for our transformation process. EGCG was added after the time point of 24 hours exposure to TPA and incubated for 19 days. 2029 genes were selected in our transformation process that showed fold change value of 1.5 or more in the microarray gene expression analysis covering the mouse full genome. These genes were found to be involved mainly in the cell cycle pathway, focal adhesion, adherens junction, TGE-$\beta$ signaling, apoptosis, lysine degradation, insulin signaling, ECM-receptor interaction. Among the genes, we focused on the 631 genes(FC>0.5) reciprocally affected by EGCG treatment. Our study suggest that EGCG down-regulate the gene expressions of up stream signaling factors such as nemo like kinase with MAPK activity and PI3-Kinase, Ras GTPase and down stream factors such as cyclin D1, D2, H, T2, cdk6.

• 한국육종학회지
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• 제41권3호
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• pp.252-260
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• 2009

1. 본 연구에서는 공동배양 배지에 Agrobacterium 성장 억제물질인 silver nitrate를 첨가하고 변온과 여과지처리를 추가하여 공동배양 기간을 7일로 늘였으며, 또한 항산화 물질 3종을 공동배양 배지에 첨가하여 세포의 oxidative burst를 최소화함으로써 벼 형질전환효율을 높일 수 있었다. 또한 이 방법을 적용하여 형질전환이 어려운 품종을 대상으로도 형질전환 식물체를 작성할 수 있었다. 2. 벼 형질전환체의 70%에서 도입유전자 수가 1copy인 것으로 나타나, 적은 수의 유전자가 안정적으로 도입됨을 확인 하였다. 3. 이러한 결과를 바탕으로, 새로운 공동배양 방법을 사용하여 우수한 농업적 형질을 가진 벼 육종 소재 및 품종을 신속하게 개발할 수 있을 것으로 기대된다.

• 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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• 제33권3호
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• pp.157-165
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• 2006

세포는 환경 변화 및 자극으로부터 자신을 보호하기 위해 유전자가 발현하여 생명을 유지 시스템을 갖고 있다. 유전자의 발현은 비정상적인 상태의 세포를 환경을 조절, 변화시켜 정상으로 바꾸기 위한 기능, 발달단계에 필요한 기능 등 생명현상에 필요한 특수 역할을 수행한다. 따라서 각 유전자의 기능을 아는 것은 생물학적으로 상당히 의미 있는 일이다. 본 논문에서는 유전자 기능을 알아보기 위해 발현 패턴을 통해 같을 때, 유사한 형태 혹은 시차를 갖고 동일한 형태로 발현하는 유전자들은 같은 기능을 한다는 가정을 하였다. 이 가정에 기반하여 각 유전자들을 기능에 따라 분류하였다. (1) IFSA선형 모델을 적용하여 데이타를 잘 나타내 줄 수 있는 특징 패턴을 찾았으며 (2) 이 특징 패턴으로부터 본 논문에서 제안한 Membership Scoring Function을 이용하여 유전자를 필터링(filtering) 하였다. 이 유전자들은 기존의 ICA(Independent Component Analysis) 방법에서 보다 IFSA 방법이 더 효과적으로 각 기능에 따른 유전자 그룹을 찾아내줌을 GO(Gene Ontology)에서 확인할 수 있었다. 이는 시차 혹은 위상 변화에 상관없이 데이타를 잘 나타낼 수 있는 IFSA의 특성이, ICA보다. 생물학적인 변수를 더 고려해 줄 수 있기 때문이라고 생각된다[1]. 이 논문의 또 다른 주요 작업은 유전자의 상호작용 관계로부터 유전자 네트웍을 얻어내는 것이다. 유전자 네트웍은 같은 그룹 내에서 유전자간의 상관 계수를 구하고 가장 높은 상관도를 보이는 유전자쌍을 연결시켜 얻게되었다. 이 네트웍 역시 GO 해석에서 그 유효성을 확인하였다.를 평균 66.02에서 58.98로 줄이면서 계산시간은 평균 71ms에서 44ms 으로 빠르게 됨을 알 수 있었다.적외선 분광법을 이용한 사일리지의 화학적 조성분 함량 측정은 적은 오차 범위 내에서 신속하고 정확한 분석법이 될 수 있음을 확인 할 수 있었다. 비록 원물 생시료(IF)에 대한 직접적인 측정은 다소 예측 정확성이 떨어지지만 현장 적용성과 편리성을 높이기 위해서는 생시료의 측정시 오차를 줄일 수 있는 스펙트럼의 수처리 방법이나 산란보정 방법과 같은 데이터 처리기법에 대한 더 많은 연구가 앞으로 진행되어야 한다고 생각되어진다.상자의 50% 이상이 매일 생선 콩 및 콩제품과 채소류를 먹고 있었고, 인스턴트나 패스트푸드는 정상 체중군이 저체중군이나 과체중보다 매일 섭취하는 빈도가 낮았다(p<0.0177). 7. 가장 낮은 영양 섭취 상태를 보여준 영양소(% RDA< 75%)는 철분과 칼슘으로 조사 대상자의 3/4에 해당하는 조사 대상자가 영양 부족 상태였다. 칼슘 섭취의 경우 정상 체중군이 과체중군과 저체중군보다 섭취율이 낮았으나(p<0.0257) 철분은 군간 유의차는 없었다. 8. 칼슘의 경우 과체중군이 저체중군이나 정상 체중군에 비해 영양소 적정비율(NAR) 값이 높았으며(p<0.0257) 철분, 단백질, 비타민 $B_1$과 $B_2$, 나이아신의 경우도 통계적으로 유의하지는 않으나 과체중군이 저체중군 또는 정상 체중군의 NAR 값이 높은 경향을 보여주었다. 9가지 영양소의 NAR을 평균한 MAR 값은 군간 유의적이지는 않으나 과체중군(0.76)이 정상체중(0.73) 또는 저체중군(0.73)에 비해 높은 값은 보여주었다. 9.

• Genomics & Informatics
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• 제6권1호
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• pp.36-43
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• 2008

Radiotherapy would be the choice of treatment for human cancers, because of high cost-effectiveness. However, a certain population of patients shows a resistance to radiotherapy and recurrence. In an effort to increase the efficacy of radiotherapy, many efforts were driven to find the genes causing the unresponsiveness to ionizing radiation. In this paper, we compared the gene expression profiles of two lung cancer cell lines, H460 and H1299, which showed differential responses to ionizing radiations. Each cell were irradiated at 2 Gy, and harvested after 0, 2, 4, 8, 12 and 24 hours to examine the expressions. Two-way ANOVA analysis on time-series experiments of two cells could select 2863 genes differentially expressed upon ionizing radiation among 32,321 genes in microarray (p<0.05). We classified these genes into 21 clusters by SOM clustering according to the interaction between cell types and time. Two SOM clusters were enriched with apoptosis-related genes in pathway analysis. One cluster contained higher levels of phosphatidyl inositol 3-phosphate kinase (PI3K) subunits in H1299, radio-resistant cells than H460, radiosensitive cells. TRAIL receptors were expressed in H460 cells while the decoy receptor for TRAIL was expressed in H1299 cells. From these results, we could characterize the differential responsiveness to ionizing radiation according to their differential expressions of apoptosis-related genes, which might be the candidates to increase the power of radiotherapy.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제22권1호
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• pp.29-38
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• 2018

In the multicellular tissue, cell-cell interaction is important for a precise control of its function. The exchange of signaling molecules between adjacent cells via connexon allows the functional harmony of cells in the tissue. The present research was to determine the presence and expressional patterns of connexin (Cx) isoforms in the rat epididymal fat during postnatal development using quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) analysis. Of 13 Cx isoforms examined, expression of 11 Cx isoforms in the epididymal fat during postnatal development was detected. These Cx isoforms include Cx26, Cx31, Cx31.1, Cx32, Cx33, Cx36, Cx37, Cx40, Cx43, Cx45, and Cx50. Expressional levels of all Cx isoforms at 1 and 2 years of age were significantly higher than those at the early postnatal ages, such as 7 days, 14 days, and 24 days of ages. Except Cx33 and Cx43, the transcript levels of rest Cx isoforms at 1 year of age were significantly lower than that at 2 years of age. In addition, expressional patterns of Cx isoforms between 7 days and 5 months of ages generally varied according to the isoform. The existence of various Cx isoforms in the rat epididymal fat has been identified and expression of each Cx isoform in the epididymal fat during postnatal development has shown a particular pattern, distinguishable from the others. To our knowledges, this is the first report showing expressional patterns of Cx isoforms at transcript level in the epididymal fat at various postnatal ages.