A total of 16 Staphylococcus epidermidis isolates collected from 14 dogs admitted to the Veterinary Medicial Teaching Hospital in Seoul National University over eleven months were examined for in vitro antibiotic susceptibility pattern with minimum inhibitory concentration (MIC) and slime production, a virulence-associated phenotype, and were genetically characterized by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). The frequency of resistance to antimicrobial agents tested was not high, with a susceptibility ranging from 56.3% to 100%. Three strains exhibited multiple drug resistance against amikacin (MIC, $32-64{\mu}g/ml$), ampicillin ($32{\mu}g/ml$), fosfomycin ($32-128{\mu}g/ml$) and gentamicin ($16{\mu}g/ml$). Vancomycin, ciprofloxacin and rifampin were effective antibiotics against the isolates. All isolates were slime producers ; strains isolated from dogs which died of bacteremia were more likely to produce slime than those isolated from dogs which survived. Chromosomal DNA fingerprinting of the isolates yielded 16 different genomic types with few common bands, indicating a variety of clones of S epidermidis were prevalent in the hospital. This study revealed that PFGE is an useful method for the genotype characterization of S epidermidis strains and this organism could probably be pathogenic in some dogs with severe disorders. Further works on a larger number of epidemiologically defined strains are required to assess these results.
본 연구에서는 유전자 검사자료에서 각 유전자좌내 및 유전자좌간의 대립형질들간의 관계를 파악하기 위한 탐색적 방법을 고려하였다. 이를 위해 유전자데이터를 재배열한 후 대응분석 및 다중대응분석의 알고리즘을 적용하여 이를 수량화, 그래프화하는 방법 및 대응행렬도를 적용한 방법을 제안하였다 이러 한 수량화 및 그래프 결과가 하디-와인버그 평형검정 및 연관균형검정 결과와 어떤 관계가 있는지 알아보고 실제 한국인 집단에 대한 STR 유전자좌 자료를 이용하여 결과를 비교하였다.
Radix Angelicae Gigantis is sweet and pungent in flavor, warm in property. Its effects are tonifying the blood, promoting blood circulation, relieving pain and moistening the bowels. Its indications are blood deficiency syndrome characterized by sallow complexion, dizziness, irregular menstruation, amenorrhea, pains due to blood stasis, and rheumatic arthralgia. Using genes of A. gigas, A. acutiloba, and A. sinensis, the origin of which is identified, as criteria, we analysed many kinds of Angelica with RAPD and RFLP on ITS region, in order to compare and discriminate genes extracted from crude drugs ‘Dang-gui’, that are produced in Korea on the one hand and imported on the other hand. We reached the following conclusion. 1. We could extract DNA from both original plant and dried plant. 2. Especially Uniprimer #1, Uniprimer #2, Uniprimer #4 and Uniprimer #9 were useful. 3. Among the restriction enzymes Sma I, Msp I, Hae III, and Hinf I, used in this experiment, four restriction enzymes except Hinf I could be used properly in discriminating all samples used as A. gigas. We think that this result can be used as a method of discriminating crude drug of Angelica L. related drugs, and used in controlling quality and circulation.
A Lactobacillus isolate was collected from the feces of a healthy Korean individual and named as Lactobacillus ruminus SPM0211. It was further characterized by subjecting it to an antibiotic resistance test and genetic analysis. In the antibiotic resistance test, all tested Lactobacillus spp. were classified as 'high resistance' for multiple antibiotics, such as isoniazid, ethambutol, cycloserine, and vancomycin. L. ruminus SPM0211 was classified as 'high resistance' for streptomycin also, while the other tested Lactobacillus spp. were classified as low resistance. This suggests that the antimicrobial spectra may be a good indicator in the discrimination of this strain among the tested Lactobacillus spp. In a polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNA (PCR-RAPD) analysis using the Microbial Uniprimer kit, L. ruminus SPM0211, and L. suebicus were clustered as a group with a 74.3% similarity level, suggesting that these two species are genetically related. Thus, our data suggest that the PCR-RADP method using the Microbial Uniprimer kit may be valuable in discriminating L. ruminus SPM0211 from other Lactobacillus spp.
표절과 관련된 이슈가 주목받고 있는 상황에서 표절을 검출하는 방법에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. 일반적으로 표절구간 검출을 위해 복잡한 자연어처리와 같은 의미론적 접근방법이 아닌 비교적 단순한 어휘기반의 문자열 처리 방법을 사용한다. 대표적인 방법으로는 지문법 (Fingerprinting)과 서열정렬 (Sequence alignment) 등이 있다. 하지만 이 방법들을 이용하여 대용량 문서에 대한 표절검사를 수행하기에는 시공간적 복잡도의 문제가 발생한다. 본 논문에서는 이러한 단점을 극복하기 위해 NGS (Next Generation Sequencing)에서 사용하는 BWT (Burrows-Wheeler Transform)[1]를 이용한 탐색방법을 응용한다. 또한 부분표절구간을 검출하고 정확도를 향상시키기 위해 질의문서를 분할하여 작은 조각으로 만든 뒤, 조각들에 대한 질의탐색을 수행한다. 본 논문에서는 질의문서를 분할하는 두 가지 방법을 소개한다. 두 가지 방법은 k-mer analysis를 이용한 방법과 random-split analysis를 이용한 방법으로, 각 방법의 장단점을 실험을 통해 분석하고 실제 부분표절구간의 검출 정확도를 측정하였다.
실내 환경에서 사용자의 위치를 측위하는 다양한 기법들이 있다. 그중 와이파이 핑거프린트 기법은 데이터 수집 단계와 측위 단계로 구분된다. 데이터 수집 단계에서는 해당 위치 주변의 모든 와이파이 신호를 수집하여 리스트 형태로 관리한다. 수집된 데이터가 많을수록 실내측위 정확도가 향상된다. 기존 고품질 데이터 수집 및 관리 방법은 많은 시간과 비용이 소모되고, 기계학습에 필요한 데이터를 추출해 생성할 때 많은 연산이 필요하다. 따라서 한정된 자원 안에서 많은 데이터를 수집 및 관리할 수 있는 방법을 연구한다. 본 논문은 효율적인 데이터 수집 기법과 기계학습에 필요한 학습 데이터 관리 및 생성 기법을 제안한다.
본 논문에서는 스펙트럼의 주파수 및 시간 방향의 특성을 결합한 오디오 인식 방법을 제안하였다. 특히 스펙트럼의 형태를 모사하기 위해 부밴드로 나누고 주파수와 시간 방향의 무게중심을 구하고 정규화하여 인식기에 사용하였다. 무게중심 값은 스펙트럼의 형태적 특징을 잘 나타내면서도 간결하여 인식기에 사용되는 특징 DB의 크기를 줄여줄 수 있는 장점이 있다. 수 천곡 규모의 오디오에 대해서, 부밴드 스펙트럼의 주파수와 시간 방향 무게중심의 인식 성능을 비교하였다. 실험 결과 주파수와 시간 방향 특징을 결합하면 상보적으로 인식 성능을 높일 수 있음을 발견하고, 선형 변환을 이용하여 주파수와 시간 방향 특징을 하나로 결합하는 방법을 제안하였다.
실시간으로 특정 대상의 위치를 추적하는 것은 특히 u-헬스 서비스에 있어서는 이용자가 자율적인 통제가 어려운 상황에 처할 수 있음에 따라 중요하게 요구되는 사항이다. 지금까지 위치를 인식하는 대표적 방법으로 삼각측량법이 제시되어 왔는데, 이는 세 개의 고정된 기준점에 의하여 대상노드와의 거리를 측량하여 위치를 추정하는 방법이다. 그러나 특히 u-헬스 서비스에서 이용자는 위치인식을 위한 기준 수신장치로부터 멀어지거나 또는 수신장치의 장애, 고장, 부재 등과 같은 통신 도달성이 결여된 여건에 처할 수 있다. 본 논문에서는 이러한 특수한 여건이나 상황에 적용 가능한 위치인식 방안과 이를 실시간으로 추적할 수 있는 방법을 연구하여 제시한다.
범죄수사에서 지문인식은 개인 식별을 위한 가장 중요한 기술 중 하나이다. 그러나 다양한 방법으로 각각 현출된 지문을 비교하는 객관적이고 공정한 평가 방법은 존재하지 않는다. 따라서 객관적이고 정량적인 방법의 개발을 위하여 농도계 이미지 분석(densitometric image analysis) 프로그램(CP Atlas 2.0)과 Automated Fingerprint Identification System (AFIS)을 이용하여 다공성 표면에서 현출된 지문을 비교, 평가하였다. 먼저 시료지문 채취 상 최적의 압력과 유류시간 조건을 찾기 위하여 두 가지 조건을 변화시켜 날인을 한 비교적 균일한 품질을 가진 잉크지문(Inked fingerprint)을 분석하였다. AFIS 분석을 통해 얻은 특징점(minutia)수와 이미지 분석을 통해 얻은 융선 peaks의 면적 결과를 계산하여 비교한 결과 1.0 kg.f 의 압력으로 5초(sec.) 동안 유류 한 잉크지문이 육안 상 가장 선명한 융선을 보였으며 가장 많은 수의 특징점 수, 가장 넓은 융선의 peaks 면적을 갖는 것을 확인 할 수 있었다. 또한, 잠재지문 현출에 응용하기 위하여 감열지에 날인 된 잠재재문을 iodine fuming법으로 현출시켜 분석한 결과 1.0 kg.f/5 sec의 조건에서 특징점 수가 가장 많고 융선의 peaks 면적도 가장 넓게 나오는 것을 확인하였다. 추가적으로 프린트 용지에 날인한 잠재지문을 0.5 %와 5 %의 ninhydrin용액으로 현출하여 비교한 결과 2.0 kg.f/5 sec의 조건으로 날인하여 5 %의 ninhydrin용액으로 현출하였을 때 가장 좋은 결과를 갖는 것을 확인하였다. 전반적으로 이미지분석을 통하여 얻은 peaks의 평균면적이 클수록 AFIS를 통해 확인되는 특징점수가 많아진다는 것이 확인되었으며 농도계 이미지 분석을 이용한 지문 평가의 추가적인 연구를 통해 본 방법은 지문 현출 평가에 대한 객관적이고 정량적인 새로운 시험방법이 될 수 있을 것으로 사료된다.
Kim, Tae-Woon;Jung, Sang-Hoon;Lee, Ji-Yeon;Choi, Sun-Kyu;SUN-HEE-PARK;JAE-SUN-JO
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제13권1호
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pp.119-124
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2003
This study was conducted to evaluate the practical usefulness of the sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PACE) fingerprinting of whole cell proteins far the identification of lactic acid bacteria in Kimchi. SDS- PACE of whole cell proteins of the reference strains and lactic acid bacteria isolated from Kimchi yielded differential banding patterns that were highly specific fingerprints, thus making it possible to identify. Identification of the isolates from Kimchi was achieved by comparing the SDS-PAGE fingerprints of isolates to those of reference strains. In addition, the reliability of SDS-PAGE was examined by comparing the results with those of the APL 50 CHL system assay and 16S rRNA gene sequence. SDS-PACE assay showed a different identity to reference strains, while the APL 50 CHL system and 16S rRNA gene sequence could not distinguish a few strains. Therefore, SDS-PAGE of the whole cell proteins is a specific and a reliable method that will be useful for the identification of lactic acid bacteria in Kimchi to the species level, and can be used as an alternative or complementary identification method.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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