New HMG-CoA reductase inhibitors, in which 3-substituted 4, 5-polymethylenepyrazoles are employed as a hydrophobic anchor connected to tetrahydro-4-hydroxy-2H-pyran-2-one by a two-carbon bridge, were designed and synthesized to exhibit significant inhibitory activity comparable to mevinolin. The most potent enzyme inhibitor $(11cc, IC_{50}=0.01{\mu}M)$ is 4-fold more potent than lovastatin.
Ki, Mi-Ran;Yun, Soon-Kyu;Lim, Wang-Jin;Hong, Bum-Shik;Hwang, Se-Young
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제9권4호
/
pp.414-421
/
1999
Helicobacter pylori were found to be resistant to azide but sensitive to vanadate, suggesting that defect in the P-type ATPase activity rather than F-type ATPase would be lethal to cell survival or growth. To elucidate the relationship between this enzyme inhibition and H. pylori death, we determined the effect of omeprazole (OMP) plus vanadate on enzyme activity and cell growth. The minimum inhibitory concentration (MIC; ca. 0.8$\mu$mol/disk) of vanadate for H. pylori growth was lowered over l0-fold with the aid of OMP, whereby its inhibitory potential toward the P-type ATPase activity was diametrically increased. Alternatively, we found that this enzyme activity was essential for active transport in H. pylori. From these observations, we strongly suggest that the immediate cause of the growth inhibition of H. pylori cells with OMP and/or vanadate might be defective in the cell's active transport due to the lack of P-type ATPase activity. From the spectral data with circular dichroism (CD) spectroscopy, we found that activated OMP (OAS) at concentration below MIC did not disrupt helical structures of membrane proteins. Separately, we determined the cytopathic effect of OAS by SDS-PAGE, indicating the change in the production of cytoplasmic protein but not cell membrane.
This study describes the characterization of a new angiotensin I-converting enzyme (ACE) inhibitory peptide from a Korean traditional rice wine. After purification of the ACE inhibitor peptides with ultrafiltration, Sephadex G-25 column chromatography, and successively $C_{18}$ and SCX solid-phase extraction, reverse-phase HPLC, and size exculsion chromatography, two types of the purified ACE inhibitors with $IC_{50}$ values of 0.34 mg/ml and 1.23 mg/ml were finally obtained. The two purified ACE inhibitors (F-1 and F-2) were found to have two kinds of novel oligopeptides, showing very little similarity to other ACE inhibitory peptide sequences. The amino acid sequences of the two purified oligopeptides were found to be Gln-Phe-Tyr-Ala-Val (F-1) and Ala-Gly-Pro-Val-Leu-Leu (F-2), and their molecular masses were estimated to be 468.7 Da (F-1) and 357.7 Da (F-2), respectively. They all showed a clear antihypertensive effect on spontaneously hypertensive rats at a dosage of 500 mg/kg.
Minh, Nguyen Truong Cong;Thanh, Bui Tho;Truong, Le Xuan;Suong, Nguyen Thi Bang;Thao, Le Thi Xuan
전기전자학회논문지
/
제21권3호
/
pp.309-319
/
2017
The research investigates the inhibition of fatty acid biosynthesis of the human Acetyl-CoA Carboxylase enzyme by the aromatic-structure inhibitors (also known as ligands) containing variables of substituents, contributing an important role in the treatment of fatty-acid metabolic syndrome expressed by the group of cardiovascular risk factors increasing the incidence of coronary heart disease and type-2 diabetes. The effective interoperability between ligand and enzyme is characterized by a 50% concentration of enzyme inhibitor ($IC_{50}$) which was determined by experiment, and the factor of geometry structure of the ligands which are modeled by quantum mechanical methods using HyperChem 8.0.10 and Gaussian 09W softwares, combining with the calculation of quantum chemical and chemico-physical structural parameters using HyperChem 8.0.10 and Padel Descriptor 2.21 softwares. The result data are processed with the combination of classical statistical methods and modern bioinformatics methods using the statistical softwares of Department of Pharmaceutical Technology - Jadavpur University - India and R v3.3.1 software in order to accomplish a model of the quantitative structure - activity relationship between aromatic-structure ligands inhibiting fatty acid biosynthesis of the human Acetyl-CoA Carboxylase.
A serine proteinase of molecular weight 60 kd was purified from culture supernatant of P. aeruginosa using DEAE-Trisacryl M ion-exchange and AcA 54 gel filtration column chromatography, and the properties of serine proteinase were characterized. By means of SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, the molecular weight of the enzyme was 55 kd. The optimal pH for the activity of purified enzyme was 7.5. The activity of the purified enzyme was completely inhibited by Di-isopropylfluorophosphate(DFP) and N-.alpha.-p-tosyl-L-lysine choloromethyl detone(TLCK) but not by other proteinase inhibitors such as E-64, pepstatin A, 1, 10-phenanthroline. The purified enzyme was capable of degrading type I and type IV collagen. Antisera obtained from hymans infected with Pseudomonas aeruginosa reacted to the purified serine proteinase in immunoblots. These results indicate that the purified enzyme is trypsin-like serine proteinase and this enzyme of P. aeruginosa may play an important role in tissue damage as a spreading factor and may be useful for serodiagnosis of Pseudomonas infections.
Steroid $9{\alpha}$-hydroxylase is an enzyme found in nocardioform microorganisms which can utilize steroids as a sole carbon source. After fractional centrifugation of the cell homogenates, the enzyme activity in Nocardia and Rhodococcus was found in cytoplasmic membrane fraction. On the contrary, Mycobacterium had its 9.alpha.-hydroxylation activity in cytosolic fraction. To characterize the enzyme in these microorganisms, several potential inhibitors of 9.alpha.-hydroxylase were tested and the cofactor requirement for the same enzyme was also examined. The inhibitory effect of ferrous ion chelators indicated involvement of iron containing proteins in the 9.alpha.-hydroxylase system. On the other hand, metyrapone, an inhibitor known to be specific for cytochrome P450 interfered with the enzyme in Mycobacterium, but didn't inhibit the enzyme activity in Nocardia and Rhodococcus. While the $9{\alpha}$-hydroxylase system in Nocardia and Rhodococcus required NADPH, NADH was required as an election donor in Mycobacterium.
Histone deacetylases (HDACs) are enzymes involved in the remodelling of chromatin, and have a key role in the epigenetic regulation of gene expression. Histone deacetylase (HDAC) inhibitors are emerging as an exciting new class of potential anti-cancer agents. In recent years, a number of structurally diverse HDAC inhibitors have been identifi ed and these HDAC inhibitors induce growth arrest, differentiation and/or apoptosis of cancer cells in vitro and in vivo. However, the underlying molecular mechanisms remain unclear. This study aimed at investigating the anti-tumor activity of various HDAC inhibitors, IN-2001, using T47D human breast cancer cells. Moreover, the possible mechanism by which HDAC inhibitors exhibit anti-tumor activity was also explored. In estrogen receptor positive T47D cells, IN-2001, HDAC inhibitor showed anti-proliferative effects in dose-and time-dependent manner. In T47D human breast cancer cells showed anti-tumor activity of IN-2001 and the growth inhibitory effects of IN-2001 were related to the cell cycle arrest and induction of apoptosis. Flow cytometry studies revealed that IN-2001 showed accumulation of cells at $G_2$/M phase. At the same time, IN-2001 treatment time-dependently increased sub-$G_1$ population, representing apoptotic cells. IN-2001-mediated cell cycle arrest was associated with induction of cdk inhibitor expression. In T47D cells, IN-2001 as well as other HDAC inhibitors treatment significantly increased $p21^{WAF1}$ and $p27^{KIP1}$ expression. In addition, thymidylate synthase, an essential enzyme for DNA replication and repair, was down-regulated by IN-2001 and other HDAC inhibitors in the T47D human breast cancer cells. In summary, IN-2001 with a higher potency than other HDAC inhibitors induced growth inhibition, cell cycle arrest, and eventual apoptosis in human breast cancer possibly through modulation of cell cycle and apoptosis regulatory proteins, such as cdk inhibitors, cyclins, and thymidylate synthase.
Bacterial UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase (MurA) catalyzes the transfer of enolpyruvate from phosphoenolpyruvate (PEP) to uridine diphospho-N-acetylglucosamine (UNAG), which is the first step of bacterial cell wall synthesis. We identified thimerosal, thiram, and ebselen as effective inhibitors of Haemophilus influenzae MurA by screening a chemical library that consisted of a wide range of bioactive compounds. When MurA was preincubated with these inhibitors, their 50% inhibitory concentrations ($IC_{50}s$) were found to range from 0.1 to $0.7\;{\mu}M$. In particular, thimerosal suppressed the growth of several different Gram-negative bacteria such as Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, and Salmonella typhimurium at a concentration range of $1-2\;{\mu}g/ml$. These inhibitors covalently modified the cysteine residue near the active site of MurA. This modification changed the open conformation of MurA to a more closed configuration, which may have prevented the necessary conformational change from occurring during the enzyme reaction.
한국생물정보시스템생물학회 2004년도 The 3rd Annual Conference for The Korean Society for Bioinformatics Association of Asian Societies for Bioinformatics 2004 Symposium
/
pp.210-218
/
2004
Poly(ADP-ribose)polymerase-1 (PARP-1) is a nuclear enzyme involved in various physical functions related to genomic repair, and PARP inhibitors have therapeutic application in a variety of neurological diseases. Docking and the QSAR (quantitative structure-activity relationships) studies for 52 PARP-1 inhibitors were conducted using FlexX algorithm, comparative molecular field analysis (CoMFA), and hologram quantitative structure-activity relationship analysis (HQSAR). The resultant FlexX model showed a reasonable correlation (r$^{2}$ = 0.701) between predicted activity and observed activity. Partial least squares analysis produced statistically significant models with q$^{2}$ values of 0.795 (SDEP=0.690, r$^{2}$=0.940, s=0.367) and 0.796 (SDEP=0.678, r$^{2}$ = 0.919, s=0.427) for CoMFA and HQSAR, respectively. The models for the entire inhibitor set were validated by prediction test and scrambling in both QSAR methods. In this work, combination of docking, CoMFA with 3D descriptors and HQSAR based on molecular fragments provided an improved understanding in the interaction between the inhibitors and the PARP. This can be utilized for virtual screening to design novel PARP-1 inhibitors.
분지아미노산 생합성 과정에 관여하는 첫 번째 효소인 acetolactate synthase (ALS)를 대상으로 수행할 수 있도록 고효율 검색방법(High Throughput Screening, HTS)을 개발하였고, 이를 이용하여 식물특이적 효소 저해제로 알려진 107개의 기존 화합물 중에서 새로운 ALS 저해 화합물을 선발하였다. 기존의 방법과 비교할 경우 한사람이 1회 수행한다고 하면 8 배 효율이지만 연속적으로 수행한다고 할 경우 1/10 이하의 양, 동일한 재료의 적용, 측정 결과의 계산, enzyme kinetics 등을 감안하면 최소 100 배 이상의 효과를 얻을 수 있다. 새로운 ALS 저해제로 탐색된 화학물질은, ammooxyacetic acid, azelaic acid, citric acid, cyanuric fluoride, glyoxylic acid, itaconic acid, malonic acid, niclosamid, oxalic acid, 2-oxoglutaric acid, suramin 등이었다. 앞으로 이들을 기본 구조로 하여 신규 ALS 저해 제초제의 개발을 위한 유도체의 합성에 이용되었으면 한다.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.