• 한국산학기술학회논문지
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• 제22권4호
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• pp.287-294
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• 2021

삽교호로 유입하는 곡교천 유역의 홍수시 유출량을 추정하기 위해서 Tensorflow를 활용하여 파이썬 기반의 LSTM 모형을 구축하였다. 층의 깊이가 성능에 미치는 영향을 분석하기 위해, 은닉층의 깊이를 2, 4, 6층으로 증가시키면서, 선행시간 1시간부터 5시간까지 예측을 수행하였으며, 은닉층의 개수가 4개일 때가 가장 우수한 성능을 나타내었다. 학습에 사용하는 입력자료의 길이 즉, 시퀀스길이가 모형의 성능에 미치는 영향을 파악하고자 시퀀스길이를 3시간, 5시간, 7시간으로 증가시키면서 모형을 실행한 결과, 시퀀스길이가 3시간 일 때, 전 시간대에 걸쳐 예측 성능이 우수한 것으로 분석되었다. 모형 검증에서 극한 강우 3건에 대하여 예측을 수행한 결과 선행시간 1시간에 대하여 평균 NSE 0.96 이상의 높은 정확도를 나타내었으며, 선행시간 2시간 이상에 대하여 정확도는 점차적으로 낮아지는 것으로 확인되었다. 결론적으로 시퀀스길이 3시간을 사용하여 선행시간 1시간에 대한 예측을 수행한다면 곡교천 강청 관측소의 홍수위를 높은 수준의 정확도로 예측할 수 있음을 확인하였다.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2002년도 추계학술대회
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• pp.180-182
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• 2002

Substantial genomic diversity has been expected among clinical isolates of H. pylori. We have suggested that the two complete H. pylori genomes already sequenced may be insufficient for providing a discriminatory tool for typing clinical isolates as well as an insight into the genomic diversity, which enable to establish strategy for control of H. pylori infection. In this study, we determine the nucleotide sequence of the entire genome of Korean strain 51 and compare it with two reported genomic sequences to suggest validity for extensive genomic sequencing of H. pylori. The genome of H. pylori 51 consists of a circular chromosome with a size of 1,591,297 bp, which is corresponding to $95.4\%\;and\;96.8\%$ of the 26695 and J99 chromosome length, respectively. We predict that there are 1,454 open reading frames (ORFs) in 51, representing $91.4\%\;and\;97.2\%$ of the reported numbers of ORF of 26695 and J99, respectively. In contrast to 26695 and J99 that have 123 and 65 strain-specific genes, respectively, of the 1,454 genes, only 39 genes are unique to 51. Differences in genomic organization between 51 and each foreign strain were greater than between 2 foreign strains in pair wise entire sequence alignments by BLASTN. Particularly, the extent of genomic rearrangement observed between 51 and 26695 is higher than between 51 and J99. Multiple sequence alignment of orthologous genes among 3 strains showed that 51 is genetically closer to 26695 rather than J99. Phylogenetic analysis of nonsynonymous and synonymous mutation indicated J99 has the longest branch length in the unrooted phylogenetic tree, suggesting that J99 has higher mutation rate than the other 2 strains.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제26권1호
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• pp.23-33
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• 1998

고초균 유전체 전체 염기서열을 밝히는 연구가 1997년 5월에 종료되어 전체 4,214,810bp의 염기서열이 SubtiList 데이터베이스에 공식적으로 입력되었다. 과제의 진행은 약 8년 동안 국제적인 협력에 의하여 이루어져 왔으며, 유럽의 25개 연구팀, 일본의 7개 연구팀, 두 개의 회사 연구팀 그리고 한국의 본 연구팀이 참여했다. 고초균 유전체 염기서열 해독을 위한 국제협력과제의 일환으로 본 연구팀은 odhA 유전자(181 $^{\circ}$) 상류지역 53, 289bp 부위의 염기서열을 해독하였다. 할당된 부위의 양 끝 부분에 위치한 sspC와 odhA 유전자의 알려진 염기 서열을 시점으로하여, plasmid rescue와 long-range PCR 방법을 써서 염색체 DNA 단편을 획득하였다. 본 연구팀이 염기서열을 밝힌 염색체 DNA 부위에는 이미 보고된 9개 유전자(sspC, cge cluster, orfE5, orfRMl 및 odhA)를 포함하여 모두 65개의 ORF가 들어 있음이 밝혀졌다. 이 부위에서 얻은 흥미로운 결과 중 하나는 인트론으로 여겨지는 한 ORF의 발견인데 세균의 염색체 상에서 인트론이 발견된 예는 흔치 않다. DNA복제 종결 단백질의 결합이 예상되는 염기서열이 세 곳에서 새로이 발견되었는데 이 역시 흥미로운 결과이다. 한편 이 부위 전체의 염기서열 해독을 통하여 기존의 유전자 지도상에 실제와는 매우 다르게 표시되어 온 여러 유전자들의 위치를 바로잡을 수 있었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제16권11호
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• pp.1565-1571
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• 2003

Physiological mechanisms, involved in unusual ovulatory sequences in domestic hen are remaining undefined. One hundred individually caged white leghorn birds were divided into two equal groups viz. control and treatment, and 2-bromo-$\alpha$-ergocryptine, was administered to birds in the treatment group to modulate prolactin (PRL) secretion from anterior pituitary gland. The effect of modulation of PRL concentrations on egg production, sequence length and intersequence pause length were studied by analysis of oviposition records of the birds from 24 to 72 weeks of age. The surviving 48 birds in the control and treatment groups averaged $34.58{\pm}1.7$ and $25.67{\pm}1.15$ sequences of oviposition, with a mean sequence length of $9.92{\pm}0.63$ and ${\pm}1.12$ days respectively. Most of the birds had a single characteristically long sequence during the entire reproductive cycle, which averaged $46.04{\pm}3.09$ days in the control birds and $59.33{\pm}4.44$ days in the treated birds. 2-bromo-$\alpha$-ergocriptine treatments had significantly decreased (p$\leq$0.01) the circulating concentrations of PRL compared to the birds of the control group. This resulted in a significant increase (p$\leq$0.01) in the number of laying days in birds of the treatment group with a concomitant decrease in the intersequence pause length. The decreased PRL levels during prime sequences in birds of the both groups, reveals the negative role of the circulating PRL levels on egg production with concomitant shorter intersequence pause length. Hence, modulation of PRL with dopamine agonist may enhance the reproductive efficiency of hens later in life.

• 한국시조학회지:시조학논총
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• 제21집
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• pp.5-22
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• 2004

시조를 문으로 짜여진 text라고 보고, 그 짜임 (textuality)을 1) 각 장의 수사적 표현 2) 각 장끼리의 연결성 3) 각 장의 통사적 짜임의 측면에서 고시조와 현대시조를 살펴보았다. 고시조에 있어서 1)은 논리 정연한 문장으로 되어 있고 논리를 방해할 수 있는 수식어를 극도로 배제하고 있음을 알았다. 2)는 각 장끼리의 응집성 혹은 응결성을 확보하여 확실한 연결을 이루고 있음을 알았다. 3)은 통사적으로 안정된 짜임을 갖고 있어 3장 6구의 형식을 취하고 있음을 알았다. 현대시조에 있어서 1)은 수식어를 남용하여 정연한 논리로서의 시조가되지 못 할 뿐더러 3장 구성까지도 만들어지지 않는 경우가 있었다. 2)는 각 장끼리의 연결성이 애매하여 장과 장끼리의 유기적 결합이 이루어지지 않는 경우가 있었다. 3)은 3장 6구를 이루는 통사적 짜임을 몰각하여 시조형식을 파괴하는 경우가 있었다. 이와 같은 현대시조의 경향은 현대시조의 존립근거를 위태롭게 만든다고 생각한다.

• 전기전자학회논문지
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• 제15권2호
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• pp.171-178
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• 2011

본 논문에서는 레이더의 반대응 능력을 개선하기 위한 의사 랜덤 M 시퀀스 코드 기반의 새로운 펄스반복간격 (PRI) 지터 코더를 제안한다. 제안된 256개의 지터 PRI 코드 각각은 256 코드 칩의 유일한 조합으로 이루어져 있어서, 임의의 코드에서 선택된 어떠한 3개의 연속된 코드 칩(4개의 펄스)의 조합이라도 코드들의 모든 코드 칩 시퀀스들 중에서 오직 한 번만 존재한다. 이는 4개의 펄스만 수신하면 전송된 코드 식별은 물론이고 반대응을 위해 요구되는 수신 펄스열(또는 코드 시퀀스)의 정확한 타이밍을 결정할 수 있다는 것을 의미한다. 제안된 아이디어를 실험적으로 입증하기 위해, 상기 지터 PRI 코더를 구현하고 시연한다.

• 대한화학회지
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• 제40권1호
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• pp.87-95
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• 1996

이성분계 rendom copolyeseters인 Poly(butylene succinate-co-butylene terephthalate)(PBS/PBT)를 합성하고 $^1H$ NMR spectroecopy를 이용하여 전 조성범위에 걸쳐 sepuence distribution을 조사하였다. PBS/PBT 공중합물의 융점(Tm)은 공중합물내 dimethyl terephthalate(DMT)의 함량이 증가함에 따라 점차적으로 감소하는 현상을 나타냈고 ST3(DMT 65.8mol%)에서 최저융점(eutetic point) 거동을 보였다. 이러한 공중합물의 융점거동은 공중합물의 몰분율(Xa)보다는 triad fraction으로 계산된 sequence propagation probability(P)에 더욱 의존하는 경향을 보였다. 또한 succinate unit(또는 terephthalate unit)의 함량이 많은 공중합물들은 terephthalate unit(또는 succinate unit)를 완전히 배제시키면서 단지 PBS(또는PBT)만의 결정을 형성하였다.

• 한국동물위생학회지
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• 제42권4호
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• pp.245-250
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• 2019

Newcastle disease (ND) is an infectious poultry disease that caused high mortality and reduced egg production. NDVs are regularly present in the domestic duck population. And ducks play a possible role in the maintenance and transmission of NDVs. While we were monitoring the Avian Influenza, NDVs were isolated from field samples by accident. So we analysed the biological and genetic characteristics of these viruses. Lentogenic NDVs were isolated from two farms among twenty breeder duck farms. The ages of ducks were 39 weeks old in the 'A' farm and 3~72 weeks old in the 'B' farm. And they were not inoculated with the NDVs vaccine. In the biological characteristics, the both viruses which separated from the farm 'A' and 'B' were thermostable. The amino acid sequence of a site from 112 to 119 in the fusion (F) protein was 'GKQGRLIG' which has monobasic motif in the samples of both farms. And this means the separated NDVs are lentogenic. Phylogenetic analysis was performed by entire nucleotide sequence of F protein. The virus strains from the A farm (MN095239) and the B farm (MN095240) belonged to class II genotype I. Using the analysis of whole F protein nucleic acid sequence, the MN095239 (GenBank) had homology with Ulster strain about 99.95% and the MN095239 (GenBank) had homology with KR/CK/KU_LBM255/09 strain about 99.89%. NDV surveillance is needed to investigate epidemiological relationship of domestic breeder duck isolates in Korea.

• 한국잠사학회:학술대회논문집
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• 한국잠사학회 1997년도 Progress and Future Development of Sericultural Science and Technology 40th Anniversary Commemoration Symposium
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• pp.73-101
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• 1997

Baculoviruses are characterized by large double-stranded circular DNA genomes and rod-shaped enveloped virions. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus(BmNPV) is a major pathogen, which causes severe damage in sericulture. Currently, BmNPV is recogtnized as an improtant tool in molecular biology, especially for expression of useful genes in B.mori cells and silkworm larvae. Our laboratories have focused on the studies of the molecular mechanisms of BmNPV replication and the application of BmNPV to agriculture and medicine. The entire nucleotide sequence of the BmNPV genome has recently determined. The BmNPV genome possessed 135 putative genes and 7 homologous repeated sequence (hrs) regions. Relatively little space, a few to a few hundred base-pairs, was observed between the open reading frames and hrs. Termination codons often overlapped. These results showed a compactly packde BmNPV genome. Based on comparative sequence analyses, we speculated that the ancestor of BmNPV was a baculovirus similar to Autographa californica NPV(AcNPV). The function of the BmNPV genes were characterized by gene deletion analysis; p35 was found to be involved in blocking apoptosis and cysteine proteinase was found to be involved in horizontal virus transmission by degrading viral-infected larval host. By AcNPV and BmNPV coinfection experiments, we identified a BmNPV gene involved in expanding host specificity of AcNPV. The identified gene was likely encoded a DNA helicase based on the amino acid sequence analysis; a few amino acid substitutions in the putative DNA helicase gene resulted in the expansion of host range of AcNPV. These findings indicate that BmNPV evolved within a short period from an AcNPV-like ancestral virus due to rapid evolution including specific amino acid substitutions and gene deletions/insertions.

• Mycobiology
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• 제47권2호
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• pp.200-206
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• 2019

Allelic differences in A and B mating-type loci are a prerequisite for the progression of mating in the genus Pleurotus eryngii; thus, the crossing is hampered by this biological barrier in inbreeding. Molecular markers linked to mating types of P. eryngii KNR2312 were investigated with randomly amplified polymorphic DNA to enhance crossing efficiency. An A4-linked sequence was identified and used to find the adjacent genomic region with the entire motif of the A locus from a contig sequenced by PacBio. The sequence-characterized amplified region marker $7-2_{299}$ distinguished A4 mating-type monokaryons from KNR2312 and other strains. A BLAST search of flanked sequences revealed that the A4 locus had a general feature consisting of the putative HD1 and HD2 genes. Both putative HD transcription factors contain a homeodomain sequence and a nuclear localization sequence; however, valid dimerization motifs were found only in the HD1 protein. The ACAAT motif, which was reported to have relevance to sex determination, was found in the intergenic region. The SCAR marker could be applicable in the classification of mating types in the P. eryngii breeding program, and the A4 locus could be the basis for a multi-allele detection marker.