• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권3호
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• pp.465-472
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• 2018

Our aim was to determine the detection rate of respiratory viruses (RVs) in feces of patients with acute viral respiratory infection (AVRI) and the detection rate of diarrheal viruses (DVs) in nasopharyngeal samples from patients with acute viral gastroenteritis. The relationships between the presence of fecal RVs or nasopharyngeal DVs and their impacts on the clinical severity were also investigated. A total of 144 fecal specimens were collected from AVRI patients and 95 nasopharyngeal specimens were collected from acute viral gastroenteritis patients. Clinical characteristics and laboratory profiles were compared between subgroups on the basis of the presence or absence of virus in the specimens. The detection rate of RVs in feces was 17.4% (25/144), whereas the detection rate for viruses identical to the respiratory pathogen was 10.4% (identical group, 15/144). Within the identical group, adenovirus (86.7%, 13/15) was most commonly found. Patients in the identical group showed statistically higher values for C-reactive protein, mean age, increased frequency of vomiting, and decreased frequency of chest film involvement and cough (p < 0.05). The detection rate of nasopharyngeal DVs among acute viral gastroenteritis patients was 19.0% (18/95), and in the identical group it was 15.8% (15/95). Norovirus group II and enteric adenovirus were the major pathogens detected in the identical group. There were no significant differences in clinical characteristics and laboratory profiles between the subgroups. In conclusion, the major pathogens of fecal RV and nasopharyngeal DV were adenovirus and norovirus group II, respectively. However, their relationship with the clinical symptoms or disease severity is unclear.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2000년도 International Meeting 2000
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• pp.94-101
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• 2000

We investigated the viral contamination of water environment including tap water in Korea. River water used for source water was analyzed about monthly between 1997 and 1999 over a period 26 months. A total of 22 tap water samples were collected in 10 sites in 2 urban areas between 1997 and 1998 over a 11 months. All samples were examined for infectious enteroviruses and adenoviruses by a cell culture technique followed by PCR amplification. To identify the recovered viruses from tap water, sequence analysis of PCR products was performed. Infectious viral particles were detected in river water all year round, ranging from 0.93 to 17.3 Most Probable Number of Infectious Unit (MPNIU) /100L. Tap water samples also contained infectious viral particles. The frequency of enteroviruses and adenoviruses in tap water were $50.0\%$ (11/22) and $36.7\%$ (8/22), respectively. Both enteroviruses and adenoviruses were detected in five tap water samples $(22.7\%)$. The level of viral contamination in tap water was quite high, ranging from 0.2 to 2.9 MPNIU/100L, far above the recommended virus level in drinking water set by the U.S. EPA. Poliovirus type 1 derived from vaccine was frequently detected and the remainder comprised coxsackievirus B type or echovirus type 6, which were causative agents of aseptic meningitis in Korea in 1997 and 1998, respectively. Several types of adenovirus were detected in tap water samples and some water samples were found to contain adenoviruses which were closely related to enteric adenovirus type 40 and 41. This stusy shows that surface water and tap water in Korea may be exposed to the risk of viral contamination, especially from recently recognized viruses and this constitutes a potential public health hazard.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제47권2호
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• pp.317-322
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• 2019

Gastroenteritis with diarrhea is one of the most infectious diseases in the world following respiratory infections. Notably, diarrhea-causing viruses (DVs) cause more than 70% of such cases. In this study, 3,065 stool specimens from patients with diarrhea (median age, 1.1 years; range, 0.0-91.1 years), who were admitted to the DanKook University Hospital, were examined using multiplex reverse transcription PCR (mRT-PCR). The target viruses were astrovirus (AstV), enteric adenovirus (EAdV), group A rotavirus (RotV), norovirus GI (NoV-GI), and norovirus GII (NoV-GII). The mRT-PCR results were analyzed based on various factors such as seasonality, age, presence of co-infection, and analyzed trends. The detection rate of the DVs during the study period was found to be 30.8% (n = 943/3,065). When the detection rate was analyzed monthly, the DV detection rate was found to be highest between December to January. Of the detected DVs, NoV-GII was the most common, accounting for 45.5% of the detected viruses (n = 446/980). Notably, 86.5% (n = 848/980) of the pathogens were detected in individuals who were less than 5 years of age. During the study period, NoV-GII and RotV showed alternating trends. In addition, both the number and rate of co-infections increased.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제9권2호
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• pp.139-146
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• 2006

목 적: Human astrovirus (HAstV)는 전세계적으로 영아 연령에서 중요한 위장관염의 중요 병원체로 알려지고 있지만 국내에서 HAtV 감염의 유병률에 대한 연구는 드문 편이다. 이에 저자들은 분자 유전학적 방법을 이용하여 위장관염으로 입원한 5세 이하의 소아에서 HAstV의 유병률과 유전형을 알아보기 위하여 본 연구를 시행하였다. 방 법: 2004년 2월부터 2005년 1월까지 12개월간 인제의대 상계백병원 소아과에 급성 위장관염으로 입원한 5세 이하의 소아에게서 수집된 대변 검체 812건을 대상으로 하였다. 대변 검체에 대해서 enzymeimmunoassay(EIA) 또는 RT-PCR을 이용하여 rotavirus, enteric adenovirus와 norovirus 감염여부를 진단하였다. HAstV 특이적인 시발체를 이용하여 RTPCR을 시행한 다음 염기서열 분석을 시행하였다. 결 과: 총 812건의 검체에서 rotavirus 양성률은 16.9% (138/812), norovirus 양성률은 11.5% (94/812), adenovirus 양성률은 4.0% (33/812)였다. HAstV의 유병률은 RT-PCR 방법에 의해 4.0% (33/812)였다. HAstV 양성인 환아의 연령은 생후 12개월 미만 82.0%, 1~2세 미만 6.0%, 2~3세 미만 6.0%, 3~5세 이하가 6.0%였다. HAstV의 월별 분포는 각각 4월 3건, 5월 5건, 6월 4건, 8월 12건, 9월 4건, 10월 2건, 11월 2건, 12월 1건으로 8월에 가장 높은 발생률을 보였다. 염기서열 분석이 가능하였던 HAstV 양성 검체 22건 중에서 유전형-1이 20건, 유전형-8이 2건이었다. 결 론: 2004년 2월부터 2005년 1월까지 12개월간 급성 위장관염으로 입원한 소아에서 HAstV 감염 유병률은 4.0%였으며, 영아기 연령에서 주로 발생하였다. 국내 HAstV 감염의 정확한 역학적 특성을 파악하기 위해서는 장기간에 걸친 추가 연구가 필요할 것으로 생각된다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제55권5호
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• pp.523-532
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• 2017

A field survey studying intestinal parasites in humans and microbial pathogen contamination at environment was performed in a Laotian rural village to identify potential risks for disease outbreaks. A parasitological investigation was conducted in Ban Lak Sip village, Luang Prabang, Lao PDR involving fecal samples from 305 inhabitants as well as water samples taken from 3 sites of the local stream. Water analysis indicated the presence of several enteric pathogens, i.e., Aeromonas spp., Vibrio spp., E. coli H7, E. coli O157: H7, verocytotoxin-producing E. coli (VTEC), Shigella spp., and enteric adenovirus. The level of microbial pathogens contamination was associated with human activity, with greater levels of contamination found at the downstream site compared to the site at the village and upstream, respectively. Regarding intestinal parasites, the prevalence of helminth and protozoan infections were 68.9% and 27.2%, respectively. Eight helminth taxa were identified in fecal samples, i.e., 2 tapeworm species (Taenia sp. and Hymenolepis diminuta), 1 trematode (Opisthorchis sp.), and 5 nematodes (Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Strongyloides stercoralis, trichostrongylids, and hookworms). Six species of intestinal protists were identified, i.e., Blastocystis hominis, Cyclospora spp., Endolimax nana, Entamoeba histolytica/E. dispar, Entamoeba coli, and Giardia lamblia. Questionnaires and interviews were also conducted to determine risk factors of infection. These analyses together with a prevailing infection level suggested that most of villagers were exposed to parasites in a similar degree due to limited socio-economic differences and sharing of similar practices. Limited access to effective public health facilities is also a significant contributing factor.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제55권5호
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• pp.513-521
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• 2017

Infectious diarrhea is endemic in most developing countries. We aimed to investigate the protozoan, viral, and bacterial causes of acute diarrhea in Taif, Saudi Arabia. A cross-sectional prospective 1-year study was conducted on 163 diarrheal patients of various ages. Stool samples were collected, 1 per patient, and tested for 3 protozoa, 3 viruses, and 9 bacteria with the Luminex Gastrointestinal Pathogen Panel. Overall, 53.4% (87/163) of samples were positives (20.8% protozoa, 19.6% viruses, 2.8% bacteria, and 9.8% mixed). Rotavirus (19.6%), Giardia duodenalis (16.5%), and Cryptosporidium spp. (8.5%) were the mostly detected pathogens. Adenovirus 40/41 (4.2%), Salmonella (3%), Shiga toxin-producing Escherichia coli (3%), and Entamoeba histolytica (2.4%) were also detected. Norovirus GI/II, Vibrio cholerae, Yersinia enterocolitica, and Clostridium difficile toxin A/B were not detected in any patients. All pathogens were involved in coinfections except E. histolytica. Giardia (5.5%) and rotavirus (3%) were the most commonly detected in co-infections. Enterotoxigenic E. coli (2.4%), Campylobacter spp. (2.4%), E. coli 0157 (1.8%), and Shigella spp. (1.2%) were detected in patients only as co-infections. Infections were more in children 0-4 years, less in adults <40 years, and least >40 years, with statistically significant differences in risk across age groups observed with rotavirus (P<0.001), Giardia (P=0.006), and Cryptosporidium (P=0.036) infections. Lastly, infections were not significantly more in the spring. This report demonstrates the high burden of various enteropathogens in the setting. Further studies are needed to define the impact of these findings on the clinical course of the disease.

• Journal of Dairy Science and Biotechnology
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• 제41권3호
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• pp.87-102
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• 2023

Globally, acute gastroenteritis is responsible for two million pediatric deaths. In particular, viral gastroenteritis is the most common cause of acute diarrhea, and most children aged <5 years are infected at least once. The common symptoms include profuse watery diarrhea, vomiting, abdominal pain, and fever. Viral gastroenteritis is generally caused by rotavirus, norovirus, astrovirus, and adenovirus. Recently, probiotics use has increased rapidly worldwide due to its inhibitory effect against viral gastroenteritis. In addition, probiotics are known to have anti-inflammatory and anti-allergic effects and enhance immunity without any side effects. Therefore, this review focuses on the anti-viral effects of probiotics on viral gastroenteritis. Furthermore, this review would provide basic data that could be used for developing new products that have improved functionality by addition of probiotics to milk and dairy food.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제50권9호
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• pp.855-861
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• 2007

목 적 : 신생아기에 발생하는 급성 바이러스 장염의 원인중 가장 흔한 4종의 바이러스에 의한 장염의 임상적 특징, 증상, 양성률, 발생분포 등을 알아보고, 생활장소, 수유형태에 따른 차이점을 살펴보고자 하였다. 방 법 : 2004년 9월부터 2005년 8월까지 을지병원 소아과에 설사를 주증상으로 내원하여 급성 바이러스성 장염이 의심되어 입원하였던 이전에 건강했던 생후 4주 미만의 만삭 신생아 중에서 대변의 바이러스 검사가 가능했던 112명을 대상으로 하였다. 환아의 출생력, 임상적 특징, 임상 증상, 수유종류, 생활장소 등을 문진을 통해서 알아보고, 혈액검사, 소변검사, 방사선 검사, 대변에서 로타바이러스, 아스트로바이러스, 노로바이러스, 아데노바이러스 검사를 실시하였다. 결 과 : 112명의 입원 시 평균 나이는 $11.4{\pm}5.4$일, 평균 체중 감소는 $5.9{\pm}5.1%$, 평균 입원 기간은 $6.3{\pm}3.4$일이었고, 중등도 이상의 탈수는 51.7%, 대사성 산증을 동반한 경우는 13.4%였으며 입원 전까지 생활했던 장소는 조리원이 74.1%였고 수유 종류로는 혼합수유가 64.3%로 많았다. 대변에서 4종 바이러스 양성률은 33% 였고, 이중에서 로타바이러스가 59.5%, 아스트로바이러스가 29.7%, 노로바이러스가 10.8%를 차지하였고 아데노바이러스는 검출되지 않았다. 장소에 따른 바이러스 양성률에는 차이가 없었고, 두 곳 모두에서 로타바이러스가 주된 장염 바이러스로 확인되었고, 아스트로바이러스는 산후조리원에서, 노로바이러스는 집에서 각각 의미 있게 많이 검출되었다. 수유 종류에 따른 바이러스 양성률에는 차이가 없었다. 급성 장염의 발생분포는 대부분이 11월에서 12월에 집중되어서 발생하였고, 바이러스가 검출되었던 경우도 전체 분포와 유사한 양상을 보였다. 결 론 : 신생아시기에 바이러스 장염을 일으키는 흔한 4종의 바이러스 양성률은 33%였고, 이중 로타바이러스가 대부분을 차지하였으며, 생활장소나 수유형태에 따른 양성율의 차이는 보이지 않았고, 각 바이러스 간에 임상적 특징에도 차이가 없었다.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제12권2호
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• pp.183-193
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• 2009

목 적: 로타바이러스, 노로바이러스, 아스트로바이러스, 장 아데노바이러스는 소아에서 급성 위장관염을 일으키는 주요 원인 바이러스이다. 일부 소아에서는 급성 위장관염 경과 중에 무열성 경련을 보이는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 급성 위장관염 및 급성 위장관염에 병발하는 양성 무열성 경련(BIS-MG) 소아 환자의 대변에서 검출한 바이러스와 바이러스 유전자형을 분석하고자 하였다. 방 법: 2004년 8월에서 2005년 7월까지 분당서울대병원 소아청소년과에 급성 위장관염으로 입원한 311명 소아 환자를 대상으로 하였다. 모든 대상 환자의 대변에서 로타바이러스, 노로바이러스, 아스트로바이러스, 아데노바이러스에 대한 검사를 실시하여 장염 원인 바이러스를 검출하였고, 217명의 소아에서 분자유전학적 검사에 의하여 각 바이러스의 유전자형을 분석하였다. 결 과: 급성 위장관염 소아 환아 217명(남아 121명, 여아 96명, 평균 연령 20.6${\pm}$15.4개월) 중에서 로타바이러스가 109명(50.2%), 노로바이러스가 28명(12.9%), 아데노바이러스가 13명(6.0%), 아스트로바이러스가 2명 (0.9%)에서 검출되었다. 로타바이러스의 유전자형 분석결과 P[8]G3가 36명, P[4]G2 21명, P[6]G4 10명, P[4]G4 9명, P[8]G9과 P[8]G1 6명, P[4]G3 4명, P[4]G93명, P[6]G2 2명이었다. 노로바이러스의 유전자형은 GII-4가 27명, GII-6 1명이었다. 16명의 소아가 급성 위장관염에 병발하는 양성 무열성 경련으로 진단되었으며, 로타바이러스가 13명, 노로바이러스가 2명에서 검출되었고, 나머지 1명은 아무런 바이러스도 발견되지 않았다. BIS-MG군에서 검출된 로타바이러스 유전자형은 P[8]G3 6명, P[4]G2 2명, P[4]G9 1명이었으며, 노로바이러스 유전자형은 2명 모두 GII-4였다. 결 론: 급성 위장관염에 병발하는 양성 무열성 경련을 보인 소아 환자의 대변에서 시행한 바이러스 분석결과 로타바이러스와 노로바이러스가 중요한 원인 바이러스였으며, 향후 이에 대한 지속적인 연구가 필요할 것이다.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제21권1호
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• pp.43-52
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• 2014

목적: 급성 위장관염으로 입원한 소아 환자들의 중증도를 여러 척도로 평가하여 각 척도간의 차이를 비교하고, 원인 바이러스가 밝혀진 예를 따로 분류하여 원인 병원체에 따른 임상양상 및 중증도의 차이를 알아보고자 하였다. 방법: 전향적으로 전국 8개 지역 9개 의료기관의 소아청소년과에 급성 위장관염으로 진단받아 입원한 5세 미만의 환자를 대상으로 Vesikari 척도, Clark 척도, 수정 Flores 척도로 중증도를 평가하였다. 연구군으로부터 수집된 분변 검체로 로타바이러스, 장 아데노바이러스는 효소면역법으로, 노로바이러스, 아스트로바이러스, 사포바이러스는 RT-PCR 방법으로 검출하였다. 결과: 최종 연구 대상군은 총 214례로 남녀비는 1.58:1이고, 연령층은 6개월 미만이 35명(16.4%), 6-23개월이 105명(49.1%), 24-59개월이 74명(34.5%)이었다. Vesikari 척도와 Clark 척도간 일치율은 0.521 (P<0.001)이고, '중증'인 경우가 Vesikari 척도는 60.7%, Clark 척도는 2.3%로 Clark 척도가 '중증' 평가에 더욱 엄격하였다. 결론: 급성 위장관염의 중증도를 평가하는 각 척도들간에는 차이가 있었다. 각 연구자들의 결과를 객관적으로 비교하기 위해서는 척도를 하나로 통일하거나 각 척도들의 평가기준을 모두 조사하여 각 척도의 중증도를 동시에 얻는 것이 필요하다.