This study was conducted to investigate the geochemical factors governing the distribution of heavy metals(Co, Cr, Cu, Fe, Mn, Ni, Pb, and Zn) in the marine surface sediment samples collected from the Samcheonpo coal-fired power plant. Variations of absolute metal concentrations were related to those in textural and/or carbonate and organic matter content. Most elements, except for Pb, showed generally lower contents compared with the average shale concentration, and the effect of anthropogenic input appeared to be minimal in the sediments. Computations of LF%(labile fraction) and EF(enrichment factor) based on all trace metal data indicated the presence of mineralogical control for Co, Cr, Cu, Ni, and Zn, and anthropogenic contamination for Pb, which needs to be considered in the design of long term monitoring programmes.
Kim, In-Young;Cho, Dong-Keun;Lee, Jongyoul;Choi, Heui-Joo
방사성폐기물학회지
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제18권spc호
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pp.37-50
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2020
In this paper, an overview of the scoping calculation results is provided with respect to criticality and radiation shielding of two KBS-3V type PWR SNF disposal systems and one NWMO-type CANDU SNF disposal system of the improved KAERI reference disposal system for SNFs (KRS+). The results confirmed that the calculated effective multiplication factors (keff) of each disposal system comply with the design criteria (< 0.95). Based on a sensitivity study, the bounding conditions for criticality assumed a flooded container, actinide-only fuel composition, and a decay time of tens of thousands of years. The necessity of mixed loading for some PWR SNFs with high enrichment and low discharge burnup was identified from the evaluated preliminary possible loading area. Furthermore, the absorbed dose rate in the bentonite region was confirmed to be considerably lower than the design criterion (< 1 Gy·hr-1). Entire PWR SNFs with various enrichment and discharge burnup can be deposited in the KRS+ system without any shielding issues. The container thickness applied to the current KRS+ design was clarified as sufficient considering the minimum thickness of the container to satisfy the shielding criterion. In conclusion, the current KRS+ design is suitable in terms of nuclear criticality and radiation shielding.
수동적 감마선분석에 의해 U-235의 농축도를 비파괴적으로 측정하였다. 측정차상이 되는 선원은 U-235의 알파붕괴시 방출되는 185.7 keV 감마선이다. 농축도 측정에 영향을 미치는 인자, 즉 시료구성, 시료용기의 두께변화에 따른 감쇠효과, 감마선의 집속 및 검출효율 등을 평가하였다. 최적계측시스템하에서 측정된 상대오차는 95%신뢰구간에서 Tag값과 비교했을 때 감손 UF$_{6}$ 실린더에 대해서는 ~8%, 감손 및 천연 $UO_2$분말에 대해서는 ~8%, ~1%로 각각 나타났다.
In an effort to characterize temporal and spatial variability of $PM_{10}$ and to quantitatively estimate contribution of sea salt aerosol to $PM_{10}$ mass in Busan area, twenty four-hour averaged concentration of $PM_{10}$ were measured in two distinct areas, Gwaebeopdong(inland) and Dongsamdong(seashore), Busan for summer and fall, 2007. It was found that sea salt accounted for 2.9% and 9.5% of $PM_{10}$ mass in Gwaebeopdong and Dongsamdong, respectively for the study period, indicating that contribution of sea salt to $PM_{10}$ mass and total ion concentration in seashore area were consistently higher by a factor of three compared to inland area. Temporal analysis suggested that sea salt contributions to $PM_{10}$ in Dongsamdong were higher in summer due to the southerly sea breeze while there was no significant fluctuation of sea salt contribution for the summer and fall months in Gwaebeopdong. Sea salt enrichment factors($EF_{sea}$) of $K^+$$Ca^{2+}$ and ${SO_4}^{2-}$ (>10) indicated major contributions from anthropogenic sources and EFs of $Mg^{2+}$ and $Cl^-$ exhibited strong association with oceanic origins for both areas.
We have previously reported that NS-398, a cyclooxygenase-2 (COX-2)-selective inhibitor, inhibited replicative cellular senescence in human dermal fibroblasts and skin aging in hairless mice. In contrast, celecoxib, another COX-2-selective inhibitor, and aspirin, a non-selective COX inhibitor, accelerated the senescence and aging. To figure out causal factors for the senescence-modulating effect of the inhibitors, we here performed cDNA microarray experiment and subsequent Gene Set Enrichment Analysis. The data showed that several senescence-related gene sets were regulated by the inhibitor treatment. NS-398 up-regulated gene sets involved in the tumor necrosis factor ${\beta}$ receptor pathway and the fructose and mannose metabolism, whereas it down-regulated a gene set involved in protein secretion. Celecoxib up-regulated gene sets involved in G2M checkpoint and E2F targets. Aspirin up-regulated the gene set involved in protein secretion, and down-regulated gene sets involved in RNA transcription. These results suggest that COX inhibitors modulate cellular senescence by different mechanisms and will provide useful information to understand senescence-modulating mechanisms of COX inhibitors.
Although considerable effort has been devoted in the mass spectrometric analysis of phosphorylated peptides, successful identification of multi-phosphorylated peptides in enzymatically digested protein samples still remains challenging. The ionization behavior of multi-phosphorylated peptides appears to be somewhat different from that of mono- or di-phosphorylated peptides. In this study, we demonstrate increased sensitivity of detection of multi-phosphorylated peptides of beta casein without using phosphopeptide enrichment techniques. Proteinase K digestion alone increased the detection limit of beta casein multi-phosphorylated peptides in the LC-MS analysis almost 500 fold, compared to conventional trypsin digestion (~50 pmol). In order to understand this effect, various factors affecting the ionization of phosphopeptides were investigated. Unlike ionizations of phosphopeptides with minor modifications, those of multi-phosphorylated peptides appeared to be subject to effects such as selectively suppressed ionization by more ionizable peptides and decreased ionization efficiency by multi-phosphorylation. The enhanced detection limit of multi-phosphorylated peptides resulting from proteinase K digestion was validated using a complex protein sample, namely a lysate of HEK 293 cells. Compared to trypsin digestion, the numbers of phosphopeptides identified and modification sites per peptide were noticeably increased by proteinase K digestion. Non-specific proteases such as proteinase K and elastase have been used in the past to increase detection of phosphorylation sites but the effectiveness of proteinase K digestion for multi-phosphorylated peptides has not been reported.
Morchella is a genus of fungi with the ability to concentrate Cd both in the fruit-body and mycelium. However, the molecular mechanisms conferring resistance to Cd stress in Morchella are unknown. Here, RNA-based transcriptomic sequencing was used to identify the genes and pathways involved in Cd tolerance in Morchella spongiola. 7444 differentially expressed genes (DEGs) were identified by cultivating M. spongiola in media containing 0.15, 0.90, or 1.50 mg/L Cd2+. The DEGs were divided into six sub-clusters based on their global expression profiles. GO enrichment analysis indicated that numerous DEGs were associated with catalytic activity, cell cycle control, and the ribosome. KEGG enrichment analysis showed that the main pathways under Cd stress were MAPK signaling, oxidative phosphorylation, pyruvate metabolism, and propanoate metabolism. In addition, several DEGs encoding ion transporters, enzymatic/non-enzymatic antioxidants, and transcription factors were identified. Based on these results, a preliminary gene regulatory network was firstly proposed to illustrate the molecular mechanisms of Cd detoxification in M. spongiola. These results provide valuable insights into the Cd tolerance mechanism of M. spongiola and constitute a robust foundation for further studies on detoxification mechanisms in macrofungi that could potentially lead to the development of new and improved fungal bioremediation strategies.
Kang, Byeonggeun;Kang, Byunghee;Roh, Tae-Young;Seong, Rho Hyun;Kim, Won
Molecules and Cells
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제45권5호
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pp.343-352
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2022
The advent of the assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq) has shown great potential as a leading method for analyzing the genome-wide profiling of chromatin accessibility. A comprehensive reference to the ATAC-seq dataset for disease progression is important for understanding the regulatory specificity caused by genetic or epigenetic changes. In this study, we present a genome-wide chromatin accessibility profile of 44 liver samples spanning the full histological spectrum of nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). We analyzed the ATAC-seq signal enrichment, fragment size distribution, and correlation coefficients according to the histological severity of NAFLD (healthy control vs steatosis vs fibrotic nonalcoholic steatohepatitis), demonstrating the high quality of the dataset. Consequently, 112,303 merged regions (genomic regions containing one or multiple overlapping peak regions) were identified. Additionally, we found differentially accessible regions (DARs) and performed transcription factor binding motif enrichment analysis and de novo motif analysis to determine new biomarker candidates. These data revealed the gene-regulatory interactions and noncoding factors that can affect NAFLD progression. In summary, our study provides a valuable resource for the human epigenome by applying an advanced approach to facilitate diagnosis and treatment by understanding the non-coding genome of NAFLD.
본 연구에서는 도시 하수관거시스템의 침수위험순위 평가를 위하여 엔트로피(Entropy) 기법 및 다기준 의사결정기법의 하나인 프로메티(Preference Ranking Organization METHod for Enrichment Evaluations, PROMETHEE)를 적용하였다. 엔트로피와 프로메티를 이용한 침수위험순위 산정에 있어서 평가 대상이 되는 항목들은 두 가지의 접근방식으로 선정되었다. 먼저 침수발생 및 피해 규모에 영향을 미치는 인자로 지형 환경적 요인으로써 유역의 평균고도, 평균경사, 유역폭, 인구수 및 관밀도를 선정하였다. 또한 각 시스템별 침수가 가장 크게 발생하는 초과강우사상을 선정 및 적용하여 시스템내 월류발생량 및 발생지점 두 가지를 이용한 치수안전성 지수를 추가적으로 고려하였다. 본 논문에서 적용된 엔트로피기법과 프로메티에 의한 도시 하수관거시스템 침수위험순위 평가는 추후 하수관거 정비사업의 계획 및 추진에 있어서 각 시스템별 위험도에 따른 개량우선순위 결정 및 평가지표로서 활용될 수 있을 것이다.
To characterize the elemental composition of fine particles in urban area, $PM_{2.5}$ was collected by a 3-stage DRUM impactor at Gwangju during spring and summer. Time and size resolved concentrations for 19 trace elements were obtained by synchrotron X-Ray fluorescence analysis. Trace elements in summer were distributed in smaller size range compared to those in spring. Almost trace element concentrations in fine particles were highly increased during the Asian dust. In spring, soil elements such as Si, K, Ca, Ti and Fe had low enrichment factors indicating the dominant influence of soil dust. However, all elements had high enrichment factors in summer implying that these elements could be emitted from the anthropogenic sources. Factor analysis was conducted with the elemental composition data in order to identify anthropogenic sources of aerosols in urban area during spring and summer. Fine particles in spring have several sources such as soil dust originating from China continental region, coal and oil combustion, biomass burning, sea salt, ferrous and nonferrous metal sources. On the other hand, fine particles in summer were influenced by road dust, gasoline vehicle as well as coal and oil combustion, sea salt, ferrous and nonferrous metal sources.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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