• 제목/요약/키워드: e-Pedigree

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Estimation of Genetic Parameters for Milk Production Traits Using a Random Regression Test-day Model in Holstein Cows in Korea

  • Kim, Byeong-Woo;Lee, Deukhwan;Jeon, Jin-Tae;Lee, Jung-Gyu
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제22권7호
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    • pp.923-930
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    • 2009
  • This study was conducted to compare three models: two random regression models with and without considering heterogeneity in the residual variances and a lactation model (LM) for evaluating the genetic ability of Holstein cows in Korea. Two datasets were prepared for this study. To apply the test-day random regression model, 94,390 test-day records were prepared from 15,263 cows. The second data set consisted of 14,704 lactation records covering milk production over 305 days. Raw milk yield and composition data were collected from 1998 to 2002 by the National Agricultural Cooperative Federation' dairy cattle improvement center by way of its milk testing program, which is nationally based. The pedigree information for this analysis was collected by the Korean Animal Improvement Association. The random regression models (RRMs) are single-trait animal models that consider each lactation record as an independent trait. Estimates of covariance were assumed to be different ones. In order to consider heterogeneity of residual variance in the analysis, test-days were classified into 29 classes. By considering heterogeneity of residual variance, variation for lactation performance in the early lactation classes was higher than during the middle classes and variance was lower in the late lactation classes than in the other two classes. This may be due to feeding management system and physiological properties of Holstein cows in Korea. Over classes e6 to e26 (covering 61 to 270 DIM), there was little change in residual variance, suggesting that a model with homogeneity of variance be used restricting the data to these days only. Estimates of heritability for milk yield ranged from 0.154 to 0.455, for which the estimates were variable depending on different lactation periods. Most of the heritabilities for milk yield using the RRM were higher than in the lactation model, and the estimate of genetic variance of milk yield was lower in the late lactation period than in the early or middle periods.

Advancement and Application of Somatic Cell Nuclear Transfer Technique in Dog

  • Oh, H.J.;Hong, S.G.;Park, J.E.;Kim, M.J.;Gomez, M.N.;Kim, M.K.;Kang, J.T.;Kim, J.E.;Jang, G.;Lee, B.C.
    • 한국발생생물학회:학술대회논문집
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    • 한국발생생물학회 2009년도 특별 Symposium
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    • pp.49-57
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    • 2009
  • The cloning of canids was succeeded in 2005, several years after the birth of Dolly the sheep and also after the cloning of numerous other laboratory and farm animal species. The delay of successful somatic cell nuclear transfer (SCNT)was due to the unique reproductive characteristics of the female dogin comparison to other domestic mammals, such as ovulation of immature canine oocyte and a requirement of 25 days for the completion of meiosis within the oviduct (Holst & Phemister, 1971). When the technology for the recovery of in vivo matured oocyte was established, the application of cloning also became possible and cloned dog offspring were obtained. This report summarizes the progress of technical procedures that are required for cloning canids and the application of this technique. The first cloned dog, Snuppy, was achieved using an in vivo-matured oocyte which was enucleated and transferred with an adult skin cell of male Afghan hound. After establishment of a criterion of well-matured oocyte for the improvement of SCNT efficiency, we obtained three cloned female Afghan hound and a toy poodle cloned from 14 year-old aged Poodle using SCNT through this factor. To date, cloned dogs appeared to be normal and those that have reached puberty have been confirmed to be fertile. Through application of canine SCNT technique, first, we demonstrated that SNCT is useful for conserving the breed of endangered animal from extinction through cloning of endangered gray wolves using inter-species SCNT and keeping the pure pedigree through the cloning of Sapsaree, a Korean natural monument. Secondly, we showed possibility of human disease model cloned dog and transgenic cloned dog production through cloning of red fluorescent protein expressing dog. Finally, SCNT can be used for the propagation of valuable genotypes for making elite seed stock and pet dog. In summary, dog cloning is a reproducible technique that offers the opportunity to preserve valuable genetics and a potential step towards the production of gene targeted transgenic cloned dogs for the study of human diseases.

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한우 아포지단백질 E (APOE) 유전자의 SNP Marker가 육량 및 육질형질에 미치는 영향 (Effects of SNP Markers of the Apolipoprotein E (APOE) Gene on Meat Quantity and Quality Traits in Korean Cattle)

  • 신기현;신성철;정구용;정의룡
    • 한국축산식품학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.108-113
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    • 2009
  • 포유동물의 혈장 지단백의 일종인 apolipoprotein E (APOE)는 인지질 및 트리글리세라이드와 같은 지질과 콜레스테롤의 대사와 운반에 중요한 기능을 담당한다. 본 연구는 지질대사조절 관련 후보유전자로서 APOE 유전자를 대상으로 한우에서 이 유전자의 SNP를 탐색 발굴하고 SNP 유전자형이 육량 및 육질 등 도체형질에 미치는 영향을 분석하기 위하여 수행하였다. 먼저 혈연관계가 없는 한우 60두의 pooled DNA를 제작하여 APOE 유전자의 exon 4 영역을 포함하는 primer를 설계하여 PCR로 증폭한 결과 exon 4 영역내 2034번째 T>C 염기치환에 의한 SNP를 검출하였다. 후대검정우 총 309두에 대한 검정 개체별 SNP 유전자형을 판정하기 위하여 Acc I 제한효소를 이용하여 PCR-RFLP기법으로 분석한 결과 SNP 유전자형 출현빈도는 TT형 10.9%, TC형 46.9% 및 CC형 42.2%로 나타났으며, T와 C 대립유전자빈도는 각각 0.344와 0.656으로 추정되었다. 또한 APOE 유전자의 SNP 유전자형과 육량 및 육질 등 도체형질과의 연관성을 통계 분석한 결과 도체율 및 육색형질과의 유의적 연관성이 입증되었다. 즉, TT형을 가진 개체들이 CC형을 가진 개체들에 비해 도체율 값이 유의적으로 높았다(p<0.05). 또한 육색에서도 TT형을 가진 개체들이 CC형을 가진 개체들에 비해 좀 더 바람직한 육색을 나타내었다. 따라서 본 연구에서 검출한 한우 APOE 유전자의 SNP 유전자형은 한우의 육량지수 평가 및 도체율이 높은 개체선발을 위한 DNA marker로 활용 가능할 것으로 기대된다.

Genetic correlations between behavioural responses and performance traits in laying hens

  • Rozempolska-Rucinska, Iwona;Zieba, Grzegorz;Kibala, Lucyna;Prochniak, Tomasz;Lukaszewicz, Marek
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권12호
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    • pp.1674-1678
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    • 2017
  • Objective: The aim of the study was to evaluate genetic correlations between the behavioural profile and performance in laying hens as an indirect answer to the question whether the observed behavioural responses are associated with increased levels of stress in these birds. Methods: The assessment of birds' temperament was carried out using the novel objects test. The behavioural test was conducted in two successive generations comprising 9,483 Rhode Island White (RIW) birds (approx. 4,700 individuals per generation) and 4,326 Rhode Island Red (RIR) birds (approx. 2,100 individuals per generation). Based on the recorded responses, the birds were divided into two groups: a fearful profile (1,418 RIW hens and 580 RIR hens) and a brave/curious profile (8,065 RIW hens and 3,746 RIR hens). The birds were subjected to standard assessment of their performance traits, including SM, age at sexual maturity; ST, shell thickness; SG, egg specific gravity; EW, mean egg weight; IP, initial egg production; and HC, number of hatched chicks. The pedigree was three generations deep (including two behaviourrecorded generations). Estimation of the (co)variance components was performed with the Gibbs sampling method, which accounts for the discrete character of the behavioural profile denotation. Results: The analyses revealed negative correlations between the performance traits of the laying hens and the behavioural profile defined as fearful. In the group of fearful RIW birds, delayed sexual maturation (0.22) as well as a decrease in the initial egg production (-0.30), egg weight (-0.54), egg specific gravity (-0.331), shell thickness (-0.11), and the number of hatched chicks (-0.24) could be expected. These correlations were less pronounced in the RIR breed, in which the fearful birds exhibited a decline in hatchability (-0.37), egg specific gravity (-0.11), and the number of hatched chicks (-0.18). There were no correlations in the case of the other traits or they were positive but exhibited a substantial standard error, as for the egg weight. Conclusion: To sum up the results obtained, it can be noted that behavioural responses indicating fearfulness, i.e. escape, avoidance, and approach-avoidance may reflect negative emotions experienced by birds. The negative correlations with performance in the group of fearful hens may indirectly indicate a high level of stress in these birds, especially in the white-feathered birds, where stronger performance-fearfulness correlations were found. Fearful birds should be eliminated from breeding by inclusion of the behavioural profile in the selection criterion in the case of laying hens.

시설재배용 흑색 토마토 '헤이-G' 육성 (Breeding of Black Tomato 'Hei-G' Suitable for Protected Cultivation)

  • 서종분;신길호;이야성;장미향;손동모;윤봉기;이진우;최경주
    • 원예과학기술지
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    • 제32권6호
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    • pp.917-921
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    • 2014
  • '헤이-G(Hei-G)'는 2007년 '카메(Kame)'에서 분리한 고정 계통(TKUI-3)을 모본으로 하고, '알리'에서 분리한 고정 계통(AL-1)을 부본으로 인공교배하여 육성된 품종이다. 과실은 둥근 형태로 크기가 균일하며, 검붉은색(흑색)으로 광택을 띤다. 2010년부터 2012년까지 봄 재배에서 특성 검정과 생산력 검정을 거쳐 'JTB026(전남2호)'로 계통명을 부여하였고, '헤이-G'로 명명하였다. '헤이-G'의 초형은 무한형으로 초세가 강하고 성숙과실과 과육은 검붉은색을 띤다. 과실 평균 과중은 43.4g이며, 상품수량은 $4,944kg{\cdot}10a^{-1}$이다. 과실에 함유된 라이코펜 함량은 $11.8mg{\cdot}100g^{-1}$으로 일반토마토(품종: 라피도, 3.1mg)에 비해 많았으며, 흰가루병에 비교적 강하여 친환경재배에 알맞은 품종이다.

국내 품종 재래돼지 산자수에 대한 근친퇴화 효과 (Effects of inbreeding depression on litter size of Korean native pig)

  • 김영신;조규호;이미진;김정아;조은석;홍준기
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제20권6호
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    • pp.514-520
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    • 2019
  • 근친에 따른 개체의 능력저하 현상은 다양한 식물과 동물에서 밝혀져 왔다. 재래돼지는 국내 유일 품종이며 소규모 집단으로 유지되고 있어 국가차원에서 중요한 유전자원이다. 본 연구의 목적은 총산자수와 생존산자수에 대한 근교계수, 유전모수 및 근친퇴화 효과를 분석하는 것이다. 국립축산과학원에서 보유한 재래돼지 혈통 2,806두와 483개(1~5산차)의 번식성적을 보유한 모돈 303두의 자료를 활용하였다. 각 형질에 대한 유전모수 추정 후 혼합모형으로 근교계수에 대한 근친퇴화 효과를 분석하였다. 유전모수 추정결과, 총산자수와 생존산자수는 고도의 유전력을 유지하였다. 근교계수는 1998년에서 2017~2018년까지 꾸준히 증가하였으나, 각 형질에 대해 1998년 대비 2017~2018년의 능력감소는 확인되지 않았다. 근교계수 증가에 따라 총산자수의 유의적인 근친퇴화(p=0.03)가 확인되었지만, 생존산자수에서는 유의적인 근친퇴화가 없었다(p=0.41). 또한 두 형질 모두 근교계수와 육종가의 긍정적 상호작용이 확인되었다(p<0.05). 본 연구 결과, 재래돼지 산자수에 대한 근친퇴화 효과가 일부 확인되었지만, 세대가 지남에 따라 명확한 표현형 감소는 확인되지 않았다. 이는 현재까지 높은 유전효과로 근친퇴화를 극복할 수 있음을 시사한다.

제주재래돼지 집단서 집단특이적 mtDNA Haplotype과 유전적 다양성 (Genetic Variation and Population Specific Mitochondrial DNA Haplotype Found in the Jeju Native Pig Population)

  • 한상현;조인철;이종언;이성수;강승률;최유림;오윤용;성필남;고서봉;오문유;고문석
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권6호
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    • pp.917-924
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    • 2004
  • 미토콘드리아 ND2 유전자와 세 가지 tRNA (tRNA-M앙, tRNA-Trp, tRNA-Ala)들이 포함}는 mtDNA 절펀의 PCR-RFLP haplotyping 기법으로 제주도에서 사육하는 한국 재래돼지를 포함하는 5개 품종에 대한 유전적 다양성을 조사하였다. 몇몇 돼지 품종에서 mtDNA 상의 제한절편 길이의 다형성이 관찰되었다. HaeIll-와 Hinf1RFLP에서는 두 가지 제한절편 유형, Tsp509IRFLP에서는 네 가지 유형으로 각각 구분되었다. 발견된 제한절편 유형들을 조협하여 mtDNA haplotype으로 구분했을 때, 모두 네 가지 haplotype들이 발견되었고 집단에 따라 각기 다른빈도를 나타내였다. 하나의 동일한 haplotype mtWB가 한반도 야생멧돼지와 Large White 집단에서 관찰되었다. Duroc과 Landrace 품종들은 여러 모계 선조에서 유래되었을 것으로 추정되는 두 가지의 haplotype들을 가지고 있었다. 제주도에서 사육되고 있는 한국재래돼지 집단에서는 muD와 mtJN haplonpe들이 관찰되었는데, 이 중 mtJN은 빈도가 높고 집단 특이적이었다. 본 연구의 결과는 제주 돼지 집단의 형성에 적어도 둘 이상의 모계 선조가 참여했으며, 이후 동아시아 언근 돼지 품종들과의 인위적인 교잡아 이루어졌을 것으로 추정된다. 연구진의 예상과는 달리 한반도 야생멧돼지가 제주 재래돼지 집단의 모계 선조라는 증거는 확인되지 않았다. MtDNA haplotype과 돼지 계통간의 관계 에서의 특이성은 돼지 육종에 있어 모계 확인과 계보 구성에 매우 유용한 정보를 제공할 것으로 사료된다.