• 제목/요약/키워드: dsDNA

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등온증폭법을 이용한 고감도 JC polyomaviruses 진단법 개발 (Diagnostic Method for the Detection of JC Polyomavirus Using Loop-mediated Isothermal Amplification)

  • 조규봉
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.414-419
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    • 2019
  • JC polyomavirus (JCPyV)는 viral group I, Polyomaviridae로 분류되는 사람 병원성 바이러스 이다. JCPyV는 최근 하수 등 수질오염 지표로 제안됨에 따라 수질환경에서 모니터링 필요성이 제기되고 있다. 임상 및 환경 시료 중 JCPyV 검출을 위해서 PCR 시스템이 사용되어 왔다. 그러나 신속하고 높은 검출 민감도를 가진 방법의 필요성에 따라 이번 연구에서는 등온증폭 프라이머 조합을 개발하였다. 이번에 개발한 방법은 기존 PCR 시스템에 비해 더욱 신속 및 약 10배 더 높은 검출 민감도를 보여주었다. 또한 본 연구에서 개발한 검출 방법의 재 검정을 위해서 HaeIII 제한효소를 이용한 방법을 함께 고안하였다. 따라서 이번 연구는 임상, 환경 등의 시료에서 JCPyV를 모니터링 하기 위한 방법으로 활용이 기대된다.

First Korean case of a STAT1 gene mutation: chronic mucocutaneous candidiasis, hypothyroidism, chronic hepatitis and systemic lupus erythematosus

  • Kim, Kang-in;Lee, Hanbyul;Jung, So Yoon;Lee, Dong Hwan;Lee, Jeongho
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제15권2호
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    • pp.92-96
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    • 2018
  • Chronic mucocutaneous candidiasis (CMC) is characterized by increased susceptibility to chronic and recurrent infections of the skin, mucous membranes, and nails by Candida species. It is a primary immunodeficiency disorder that is difficult to diagnose because of its heterogeneous clinical manifestations and genetic background. A 20-month-old boy who did not grow in height for 3 months was diagnosed as having hypothyroidism and he had hepatitis which was found at 5 years old. He presented with persistent oral thrush and vesicles on the body, the cause of which could not be identified from laboratory findings. No microorganism was detected in the throat culture; however, the oral thrush persisted. Immunological tests showed that immunoglobulin (Ig) subclass IgG and cluster of differentiation (CD)3, CD4, and CD8 levels were within normal limits. We prescribed oral levothyroxine and fluconazole mouth rinse. The patient was examined using diagnostic exome sequencing at the age of 6 years, and a c.1162A>G (p.K388E) STAT1 gene mutation was identified. A diagnosis of CMC based on the STAT1 gene mutation was, thus, made. At the age of 8 years, the boy developed a malar-like rash on his face. We conducted tests for detection of antinuclear antibodies and anti-dsDNA antibodies, which showed positive results; therefore, systemic lupus erythematosus (SLE) was also suspected. Whole exome sequencing is important to diagnose rare diseases in children. A STAT1 gene mutation should be suspected in patients with chronic fungal infections with a thyroid disease and/or SLE.

경부 림프병증으로 발현된 전신홍반루푸스 1예 (A Case of Systemic Lupus Erythematosus Presenting as Cervical Lymphadenopathy)

  • 강현석;박재선;김태환;이상혁
    • 대한두경부종양학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.23-27
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    • 2022
  • Systemic lupus erythematosus(SLE) is a multisystemic disorder of autoimmune etiology. SLE can occur commonly in young women, and the early symptoms include fever, myalgia, arthralgia, weight loss, lymphadenopathy and these nonspecific symptoms develop into skin rash, splenomegaly, serositis and encephalopathy. Diagnosis of SLE requires clinical and serologic criteria, and treatment choices are hydroxyquinolone and NSAIDs for mild disease, corticosteroids and immunosuppressant for severe disease. In lupus patient, the prevalence of lymphadenopathy is 12~59%. Although lymphadenopathy is common finding in SLE, it is hard to distinguish in early phase of SLE. A 38-year-old woman visited our hospital for cervical lymphadenopathy with polyarthritis and malaise. Multiple cervical lymph nodes enlargement was found on Neck CT, and serologic laboratory test including ANA, antiphospholipid antibody, and anti-dsDNA was positive. For excluding lymphoma, PET-CT and excisional biopsy were performed. The patient finally diagnosed with SLE, and got regular follow-up without complication.

Serological and molecular prevalence of lumpy skin disease virus in Korean water deer, native and dairy cattle in Korea

  • Ko, Young-Seung;Oh, Yeonsu;Lee, Taek Geun;Bae, Da-Yun;Tark, Dongseob;Cho, Ho-Seong
    • 한국동물위생학회지
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    • 제45권2호
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    • pp.133-137
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    • 2022
  • Lumpy skin disease (LSD) is a severe cross-border infectious disease that causes fever, skin and visceral nodules in cattle. LSD is caused by the lumpy skin disease virus (LSDV), a dsDNA virus that belongs to the genus Capripoxvirus. Although LSD has been found only in Southern Africa traditionally, in the last decade it is spreading very quickly through the Middle East and into Eastern Europe and China. It usually affects cattle and water buffalos being transmitted by blood-feeding insects. As it causes a huge economic impact, LSD is a notifiable disease by World Organisation for Animal Health, and managed as the legal infectious disease class I in Korea. Therefore, the purpose of this study was to confirm the existence of LSDV antigens or antibodies in Korean livestock. We collected 1,200 blood samples from cattle (Korean native and dairy cattle) and Korean water deer in 4 major provinces of the country, then tested the existence of LSDV antigen and antibody. None (0.0%) of the 1,200 blood samples were positive for both antigen and antibody of LSDV. To the best of our knowledge, this is the first study that examines the prevalence of LSDV in Korea. Our study aims to report the LSDV occurrence situation obtained by surveillance in Korea and provide information that may help prevention of LSD epidemics.

Mitochondria Activity and CXCR4 Collaboratively Promote the Differentiation of CD11c+ B Cells Induced by TLR9 in Lupus

  • Sung Hoon Jang;Joo Sung Shim;Jieun Kim;Eun Gyeol Shin;Jong Hwi Yoon;Lucy Eunju Lee;Ho-Keun Kwon;Jason Jungsik Song
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제24권4호
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    • pp.25.1-25.14
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    • 2024
  • Lupus is characterized by the autoantibodies against nuclear Ags, underscoring the importance of identifying the B cell subsets driving autoimmunity. Our research focused on the mitochondrial activity and CXCR4 expression in CD11c+ B cells from lupus patients after ex vivo stimulation with a TLR9 agonist, CpG-oligodeoxyribonucleotide (ODN). We also evaluated the response of CD11c+ B cells in ODN-injected mice. Post-ex vivo ODN stimulation, we observed an increase in the proportion of CD11chi cells, with elevated mitochondrial activity and CXCR4 expression in CD11c+ B cells from lupus patients. In vivo experiments showed similar patterns, with TLR9 stimulation enhancing mitochondrial and CXCR4 activities in CD11chi B cells, leading to the generation of anti-dsDNA plasmablasts. The CXCR4 inhibitor AMD3100 and the mitochondrial complex I inhibitor IM156 significantly reduced the proportion of CD11c+ B cells and autoreactive plasmablasts. These results underscore the pivotal roles of mitochondria and CXCR4 in the production of autoreactive plasmablasts.

소아에서 전신성 낭창의 임상적 고찰 (A clinical study of systemic lupus erythematosus in children)

  • 김지태;남영미;이재승;김동수
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제50권1호
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    • pp.74-78
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    • 2007
  • 목 적 : 전신성 홍반성 낭창(systemic lupus erythematosus, SLE)은 장기간에 걸쳐 다양한 임상경과를 나타내며 여러장기를 침범하는 자가 면역성 질환으로 유전적, 환경적, 면역학적 요인 등에 의한 면역 조절계의 이상으로 생각되고 있다. 소아에서는 갑작스럽게 발병하며, 경과가 빠르게 악화되며 여러 장기를 동시에 침범한다. 따라서 소아에서 조기 진단하여 조기 치료하는 것이 SLE의 예후 개선에 더욱 중요한 점으로 생각된다. 이에 저자들은 소아에서 발생한 SLE 환아의 임상 양상, 검사 소견, 예후에 대해 전반적으로 고찰하여 질환의 진단 및 예후의 향상을 기대하고자 한다. 방 법 : 1996년 1월부터 2005년 12월까지 10년간 신촌 세브란스 병원 소아과에서 전신성 홍반성 낭창으로 진단받은 45례의 환아를 대상으로 의무기록을 후향적으로 고찰하였다. 결 과 : 진단 당시 평균발병 연령은 $10.8{\pm}3.8$(0-15)세였으며 10-15세 사이에서 호발(68.9%)했으며 환아의 남녀비는 1:4였다. 진단시 초기증상으로 안면 부종(51.1%), 나비모양 홍반(44.4%), 발열(28.9%), 관절통(15.6%), 빈혈(13.3%) 및 광과민성(11.1%)순 이였다. SLE의 ARA 진단 기준중 항목별 양성률은 형광항핵항체(97.8%), 항ds DNA항체(82.2%), 루프스 신염(71.1%), 나비형 홍반(71.1%) 및 혈액학적 이상(66.7%)의 순이었다. 진단 당시 루프스 신염이 동반 되었던 경우는 45례 중 23례(51.1%)였으며 치료 중 8례가 루프스 신염으로 새로 진단되어 그 빈도가 71.1%로 조사되었고 신생검상 WHO class IV 병변인 미만성 증식성 사구체 신염(43.8%)이 가장 많았다. 2례는 완치되었으며, 2례 모두 신생아 루프스였다. 우리나라 아동에서 외국에 비하여 발열, 광과민성, 입궤양, 관절통, 늑막염은 적게 관찰되는 양상을 보였다. 결 론 : 소아에서 전신성 홍반성 낭창의 임상 양상과 예후는 다양하다. 장기적인 추적 관찰이 필요하며 예후의 향상을 위해 조기 진단과 적극적인 치료가 중요하며, 향후 이 질환에 대한 심도 있는 연구가 지속되어야 할 것이다.

한국식물분류학회 50년사: 인력양성과 연구활동 (The 50-year history of the Korean Society of Plant Taxonomists: Professional manpower training and research activity)

  • 이남숙
    • 식물분류학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.363-369
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    • 2018
  • 한국식물분류학회가 1968년 12월 13일에 설립된 이래, 전문인력 양성과 학회지 논문에 나타난 연구활동에 대해 분석하였다. 조사 방법은 한국식물분류학회 홈페이지와 식물분류학회지에 나타난 자료를 이용하였으며, 전문인력 분석은 각 대학에서 제공한 자료를 바탕으로 하였다. 지난 50년 동안 식물분류학의 전문인력은 총 680명이 양성되었으며, 그 중 석사학위 소지자는 30개 대학에서 약 537명(남성 274명, 여성 263명) 이고, 박사학위 소지자는 26개 대학에서 143명(남성 97명, 여성 46명)이 양성되었으며, 그 수는 특히 1998년 부터 크게 증가하였다. 연구분야의 변화를 10년 단위로 보면, 분류군 실험논문은 1988-1997년에 72%로 가장 많았으나, 최근 10년에는 51%로 감소하였다 반면, 미기록종 논문이 28%로 높아졌다. 학회지에 게재된 전체 연구논문들 중 분류군을 검토한 논문이 629편이며, 그 중 49%를 차지하는 논문의 대상 분류군들은 국화과, 미나리아재비과, 사초과, 백합과, 장미과, 콩과, 미나리과, 꿀풀과, 난과, 물푸레나무과, 대극과, 마디풀과, 수선화과로 나타났다. 10년 단위로 연구방법의 변화를 볼 때 형태논문은 6%에서 51%로 증가되었고, 화분논문은 20%에서 최근에 2%로 낮아졌다. 염색체 연구는 약 3-4%, 성분연구는 약 2%로 낮고, DNA연구의 비율도 3-16%로 낮았다. 10년 단위별 전체 논문 수중 영문논문의 비율은 최근에 43% 정도로 향상되었는데, 이는 주로 미기록 분류군들의 논문이 증가한 데 기인한다.

급성 로타바이러스 장염 소아에서 질환의 중증도와 로타바이러스 VP7 & VP4 유전형의 분포에 대한 연구 (Distribution of Disease Severity and Group A Rotavirus Genotypes (VP7 & VP4) in Children with Acute Rotavirus Gastroenteritis)

  • 오현주;강현식;강기수;김연우;홍정연;신경수;이진숙;이수현;이근화;조문제;서동인
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제14권2호
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    • pp.148-154
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    • 2011
  • 목적: 저자들은 지역사회에서, 로타바이러스 장염에 걸린 소아들에서 질환의 중증도와 로타바이러스 VP7 유전형과 VP4 유전형의 분포에 대해 알아보고자 하였다. 방법: 2007년 12월부터 2008년 6월까지 로타바이러스 장염으로 병원에 입원한 156명의 소아들에서 대변 샘플을 수집하였다. 모든 환자들에 대한 질환 중증도는 Vesikari 점수를 이용하여 평가하였다. 로타바이러스 ds-RNA를 분리한 후, 역전사 중합효소 연쇄반응과 다중 중합효소 연쇄반응을 이용하여 cDNA를 합성하였다. 마지막으로 유전형을 확인하였다. 결과: 156명의 환자 샘플에서, VP7(G)는 147명(94.2%)에서 확인되었고 VP4(P)는 140명(89.7%)에서 확인되었다. G1 유전형(147명 중 116명; 78.9%)과 P[8] 유전형(140명 중 137명)이 각각 가장 많았다. VP7과 VP4 조합형은 138명에서 확인할 수 있었는데, G1P[8] 조합형이 111명(80.4)으로 가장 많았다. 다른 조합형들은 종류가 다양하였고 분포가 낮았다. 전체 조합형 중 9.4%가 새로운 로타바이러스 백신에 포함되지 않은 것이었다. 로타바이러스 장염의 질환 중중도는 $11.8{\pm}3.3$ ($mean{\pm}2SD$)였다. 전체 환자에서 경증 내지 중등도가 37.8%였고, 중증은 62.2%였다. 결론: 로타바이러스 유전자 조합형 중 가장 흔한 것은 G1P[8]이었다. 새로운 백신에 포함되지 않은 유전자 조합형은 9.4%였다. 로타바이러스 장염으로 입원한 소아들의 질환 중증도분포는 경증과 중등도보다 중증에서 높게 나타났다.

교반식 축분 퇴비화 및 톱밥 탈취처리 시스템의 퇴비화 암모니아 제거 성능 (Performance Characteristics of Agitated Bed Manure Composting and Ammonia Removal from Composting Using Sawdust Biofiltration System)

  • 홍지형;박금주
    • 한국축산시설환경학회지
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    • 제13권1호
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    • pp.13-20
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    • 2007
  • 퇴비화 목적은 축분을 오물감과 악취 없이 살균처리 하고, 토양과 작물에 무해한 유기성 자원의 순환이용이다. 퇴비화 호기성 미생물의 이분해성 유기물 (영양원: 탄질비)분해 적정조건은 수분, 공기, 온도, 퇴비화 기간 등이며, 퇴비화 부숙 목적은 이분해성 유기물분해 및 생육저해 물질분해 등에 있다. 부숙도 판정법은 퇴적물의 온도변화(이분해성유기물분해 검사) 및 발아시험(생육저해물질 검사)등이 바람직하다. 본 연구는 퇴비화 온도, 퇴비화 암모니아가스 농도와 악취물질의 탈취처리, 종자 발아율, 퇴비재료 성분 및 EC 농도 등의 퇴비화 부숙도 주요 요인에 대한 3회 반복 실험성과는 다음과 같다. 본 연구결과로서 퇴비화 주발효 및 후숙 6주간 전반기에서 이분해성 유기물 분해와 취기물질 제거에 관련된 퇴비화 온도, 암모니아 농도, 탄질비 및 염류농도, 후반기 후숙 기간에 작물생육저해물질 제거에 연관된 발아율과 탄산가스 발생량 등을 실측조사 분석한 결과는 다음과 같으며, 안정된 숙성 퇴비의 적정 범위를 유지하여 양질 퇴비 생산이 가능하였다. 1. 축사저류조의 돼지배설물의 고액분리 고형분과 착즙액 정화처리 잉여오니 및 톱밥혼합물의 퇴비화 온도가 $55\sim65^{\circ}C$를 2일 이상 유지하여 병원균과 잡초 종자를 사멸하고, 악취가 미미한 44ppm 이하수준의 비교적 낮은 암모니아농도 및 50% 내외의 저수분의 양질 퇴비 생산이 가능하였다. 2. 퇴비화 실험결과는 퇴비화 온도가 $55\sim65^{\circ}C$로서 1주간 이상, 퇴비재료 수분 50%, 종자 발아율 70% 이상 및 EC농도 5ds/m 이하 등의 수준을 유지하고 있어 완숙퇴비 조건을 구비하고 있었다.상관관계가 비교적 높았으나, 음수량과 분 배설량$(R^2=0.2950)$, 사료 섭취량과 뇨 배설량$(R^2=0.1985)$, 산유량과 뇨 배설량$(R^2=0.2335)$의 상관관계는 낮게 나타났다. 6. 따라서 산유량과 음수량, 산유량과 사료 섭취량의 상관관계식은 $Y=0.1919X_1+11.181(R^2=0.7742),\;Y=0.8568X_2+9.3067(R^2=0.7459)$(Y=milk yield $X_1=water$ consumption, $X_2=feed$ intake)로 추정할 수 있다.. 이상(以上)의 결과(結果)로서 통일(統一)벼가 일반품종(一般品種)에 비(比)하여 저장성(貯藏性)이 우수(優秀)함을 인정(認定)할수 있어 장기저장(長期貯藏)을 위(爲)한 미곡(米穀)으로 활용(活用)할 수 있는 가능성(可能性)을 암시(暗示)하고 있다.록 Lact. plantarum ATCC 8014, Lact. fermenti ATCC 9338균주(菌株)의 산생성(酸生成)을 촉진(促進)하는 경향(傾向)을 보였다.V또는 ara-A의 동시첨가는 GCV또는 ara-A를 단독으로 첨가했을 경우보다 단백질의 합성을 더욱 억제하였다. 이상의 실험결과로 보아 GCV와 ara-A의 동시사용은 HSV-1 혹은 ACV저항 DNA polymerase변이주인 $PAA^r5$에 대해서 상승적인 억제작용을 나타냈으며 이 효과는 virus DNA 합성 억제에 의한 것으로 생각된다. ACV저항 thymidine kinase 변이주인 $ACV^r$$IUdR^r$

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Cortisol, $25OHD_3$ 추출 후 원심 분리시 온도가 검사결과에 미치는 영향 (Effect of the Centrifugation Temperature on Cortisol, $25OHD_3$ Values After Extraction)

  • 김외정;천준홍;유선희;조시만
    • 핵의학기술
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    • 제13권3호
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    • pp.143-146
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    • 2009
  • Purpose: We use the centrifugation of refrigeration state in separation of blood serum, Anti-ds-DNA, Vitamin $B_{12}$/Folate and GAD-Ab assay. However, Cortisol urine and 25-Hydroxyvitamin $D_3$ ($25OHD_3$) are conducted centrifuge at room temperature. This is troublesome that change centrifugation temperature into room temperature due to using of most assays at cold temperature. Therefore when using centrifuge after extraction of Cortisol urine and $25OHD_3$, we conducted researches on effect of the centrifugation temperature in assay results. Materials and Methods: In Cortisol urine, add dichloromethane 1.0 mL in urine $500\;{\mu}L$, mix for 15 minutes, and then centrifuge for 8 minutes at 2600rpm. In $25OHD_3$ add acetonitrile 0.5 mL in serum $200\;{\mu}L$, and then centrifuge for 8 minutes at 2600rpm. Those experiments were conducted centrifuge at room temperature and $4^{\circ}C$. And experiments conducted immediately after centrifugation at $4^{\circ}C$ and standing for 20 minutes after centrifugation $4^{\circ}C$. Results: In Cortisol urine, room temperature result in 1.93, 2.18, 2.43, 9.45, 14.2 (${\mu}g/dL$). Experiments of performing immediately after centrifuge at $4^{\circ}C$ result in 1.8, 2.0, 2.3, 8.1, 13.7 (${\mu}g/dL$). Experiments of performing after 20 minutes result in 2.1, 2.1, 2.7, 9.95, 14.35 (${\mu}g/dL$). On the other hand, the $25OHD_3$ tests conducted at room temperature result in 7.13, 26.6, 35.8, 48.2, 74.8 (ng/dL). Experiments were conducted immediately by pipetting after $4^{\circ}C$ centrifugation result in 7.53, 30.9, 40.3, 61.5, 89.1 (ng/dL) as results are higher than experiments at room temperature. The experiments that conducted centrifuge at $4^{\circ}C$ and then left at room temperature for 20 minutes result in 7.40, 32.4, 41.3, 51.6, 85.6 (ng/dL). Conclusions: Experiments were conducted by using centrifuge at $4^{\circ}C$ are higher or lower than room temperature. The differences between results of standing for 20 minutes after centrifuge at $4^{\circ}C$ and those of centrifuge at room temperature are less than conducting immediately. It is concerned that experiments conducted immediately after centrifuge at $4^{\circ}C$ are incorrect, because tubes become dim due to temperature differences between $4^{\circ}C$ and room temperature. Therefore, it is desirable to centrifuge at room temperature as manual and we should pipet promptly without stopping.

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